Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

Μικροί οπτικοί χαρτογραφικοί δορυφόροι υψηλής ανάλυσης

87 σ.Μεταπτυχιακή Εργασία - - Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Διεπιστημονικό - Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) "Γεωπληροφορική"Στην παρούσα διπλωµατική εργασία γίνεται προσπάθεια να παρουσιαστούν τα κύρια γενικά χαρακτηριστικά των µικρών δορυφόρων, ενώ δίνεται ιδιαίτερη έµφαση στους µικρούς οπτικούς χαρτογραφικούς δορυφόρους υψηλής ανάλυσης.At this diploma thesis we tried to present the most important general characteristics of small satellites. Furthermore, we focus on high resolution small optical mapping satellites.Κατερία Ι. Κατωπόδ

Design of a commercial metallic building

108 σ.Η παρούσα διπλωματική εργασία έχει ως αντικείμενο μελέτης τον σχεδιασμό –ανάλυση και διαστασιολόγηση – ενός μονώροφου εμπορικού κτιρίου, μεγάλης έκτασης σε κάτοψη και περιορισμένο εσωτερικό σύμμικτο μεσοπάτωμα, με φέρων οργανισμό από χάλυβα, με πλήρη εφαρμογή των διατάξεων των Ευρωκωδίκων (EN 1990, 1991,1993, 1994 και 1998). Η επίλυση του κτιρίου έγινε με χρήση του λογισμικού SAP2000 v.14.2.2, ενώ ο έλεγχος επάρκειας της σύμμικτης πλάκας με τη χρήση του προγράμματος SymDeck Designer. Αναλυτικότερα, η δομή της εργασίας είναι η εξής: Στο πρώτο κεφάλαιο αναφέρονται το αντικείμενο μελέτης, οι κανονισμοί που χρησιμοποιήθηκαν, καθώς και γενικά στοιχεία που αφορούν το χάλυβα ως δομικό υλικό και τις μεταλλικές κατασκευές. Στο δεύτερο κεφάλαιο γίνεται η περιγραφή του κτιρίου και δίνονται πληροφορίες για τη γεωμετρία, τις διαστάσεις και τα δομικά του στοιχεία. Αναλύεται η αρχιτεκτονική και η κατασκευή του έργου και παρατίθενται στοιχεία σχετικά με τον φέροντα οργανισμό του. Στο τρίτο κεφάλαιο παρουσιάζονται τα υλικά που χρησιμοποιήθηκαν, γίνεται εκτενής αναφορά στον προσδιορισμό των φορτίων που καταπονούν την κατασκευή, ενώ παρατίθενται και οι συνδυασμοί δράσεων με βάση τους οποίους έγινε η ανάλυση και η διαστασιολόγηση. Στο τέταρτο κεφάλαιο περιγράφεται η ανάλυση και η διαστασιολόγηση του φορέα μας. Αρχικά, διατυπώνονται οι απαιτούμενοι έλεγχοι σύμφωνα με τον Ευρωκώδικα 3. Στη συνέχεια παρουσιάζεται το πρόγραμμα που χρησιμοποιήθηκε για την επίλυση του κτιρίου, το οποίο είναι το SAP2000, και το μοντέλο – προσομοίωμα του κτιρίου όπως εισήχθη στο πρόγραμμα. Ακολούθως, παρουσιάζονται τα αποτελέσματα της ανάλυσης και επιβεβαιώνεται η επάρκεια των διατομών τόσο στην οριακή κατάσταση αστοχίας όσο και λειτουργικότητας. Κλείνοντας, γίνεται ενδεικτικός ικανοτικός έλεγχος κατακόρυφου συνδέσμου δυσκαμψίας και έλεγχος της σύμμικτης πλάκας. Στο πέμπτο κεφάλαιο περιγράφονται ο σχεδιασμός και ο έλεγχος των συνδέσεων των μελών του φορέα. Ενδεικτικά, παρουσιάζονται συνδέσεις κατακόρυφου συνδέσμου δυσκαμψίας, κύριας δοκού- δευτερεύουσας δοκού, αποκατάσταση συνέχειας δοκού και έδραση υποστυλώματος. Τέλος, στο έκτο κεφάλαιο παρουσιάζονται τα συμπεράσματα που προέκυψαν από την εκπόνηση της εργασίας.This diploma thesis deals with the study -analysis and design – of a single-storey commercial building, large scaled in plan, with a structural system of steel and an interior, composite, mezzanine, under the requirements of Eurocodes (EN 1990, 1991,1993 , 1994 and 1998). The resolution of the building was performed using SAP2000 v.14.2.2 software, whereas the control of adequacy of the composite slab using SymDeck Designer. More specifically, the structure of this paper is given below: In the first chapter, the case study, the web of regulations, as well as general information on steel as a building material and steel constructions are described. The second chapter contains the description of the building and provides information about its geometry, dimensions and structural elements. It analyzes the architecture and construction of the project and provides information about its structural system. In the third chapter, the properties of the materials that were used and the loads acting on the construction are described. Moreover, the load combinations, on which the analysis and dimensioning are based, are determined. The fourth chapter describes the analysis and dimensioning of our structure. Initially, are described the necessary checks according to Eurocode 3. Subsequently, the software used to analyze the dynamic modal response spectrum analysis of the structure, which is SAP2000, is presented, as well as the model of the building used in SAP2000. Then, the results of checks at the Ultimate Limit State and Serviceability are presented. Finally, a check of the composite slab is made. In the fifth chapter typical joints are tested, such as the joints between column- beam, beam- secondary beam etc. Finally, in the sixth and conclusive chapter of the thesis, the results are summarized and conclusions are mentioned.Καλλιρρόη Ι. Κατωπόδ

Sediment transport measurements in combined wave-current flows

A series of experiments were carried out in the Large Oscillating Water Tunnel of Delft Hydraulics in the end of 1993. The aim of the investigation was to study the behaviour of the sediment and water flow in the wave-current boundary layer in the sheet flow regime. Four conditions with sinusoidal waves and net currents were realized. A selected part of the new experimental data is presented. The attention is focused on vertical profiles of time-averaged and time-dependent suspended sediment concentrations and velocities as well as net sediment transport rates

Intra wave sediment transport in an oscillatory flow superimposed on a mean current.

Report H 1684 on LIP 1570 experiment, Delft Hydraulics Laboratory, The Netherlands