Editorial

-

Non-tuberculous mycobacteria

Danas je poznato oko 150 vrsta netuberkuloznih mikobakterija. Ovi okolišni patogeni, premda niskog patogenog potencijala, mogu u čovjeka uzrokovati niz bolesti. Općenito uzrokuju četiri klinička entiteta: plućnu bolest, limfadenitis, kožne promjene te diseminiranu bolest, najčešće kod imunokompromitiranih osoba. Postavljanje dijagnoze mikobakterioze nije nimalo jednostavno te su u tu svrhu razrađeni kriteriji koji uključuju kliničku prezentaciju, mikrobiološke nalaze te radiološke promjene. Samo liječenje ovih bolesti dugotrajno je i komplicirano. Preporučuje se primjena kombinacije lijekova, ovisno o vrsti mikobakterije, te trajanje liječenja najmanje 12 mjeseci od negativizacije kulture. U Hrvatskoj se danas godišnje otkriva između 150–450 izolata te oko dvadesetak bolesnika s mikobakteriozom. Od ukupnog broja izolata prevladava M. gordonae, saprofitna mikobakterija koja samo iznimno dovodi do razvoja bolesti. Od patogenih mikobakterija, uzročnika mikobakterioze, u Hrvatskoj su najznačajnije M. avium, M. intracellulare, M. xenopi, M. kansasii, M. chelonae i M. abscessus.Currently, there are approximately 150 Mycobacterium species identified. Despite their low pathogenic potential, these organisms are able to cause a variety of diseases in humans including lung disease, lymphadenitis, cutaneous infections and disseminated disease, most commonly in immunocompromised persons. The diagnosis of mycobacteriosis is challenging and includes criteria that combine clinical presentation of disease, microbiological findings and radiographic appearance. The treatment of non-tuberculous mycobacteria infections is also troublesome and long lasting. Current guidelines propose the specific drug regimens depending on the species isolated and duration of therapy for at least 12 months after culture conversion. In Croatia, about 150–450 isolates of non-tuberculous mycobacteria are detected per year, but the number of patients is significantly lower, around 20 per year. The most frequently isolated species is M. gordonae, a saprophytic organism that rarely causes disease. In Croatia, the most significant non-tuberculous mycobacteria causing disease are M. avium, M. intracellulare, M. xenopi, M. kansasii, M. chelonae and M. abscessus

Plućna infekcija izazvana organizmom Nocardia asteroides: prikaz slučaja

Presentation is made of a 53-year-old woman with pulmonary infection caused by Nocardia asteroides. Tracheal aspirate was obtained and examined microbiologically. Direct smear of the tracheal aspirate stained with Gram stain revealed gram-positive branched filamentous hyphae and numerous leukocytes. Pure culture of colonies of a chalky white appearance grew on the blood agar after prolonged incubation. The Gram stained direct slide prepared from the culture showed gram-positive branching filaments. The microorganism was identified as Nocardia asteroides by standard methods.Prikazana je 53-godišnja bolesnica s plućnom infekcijom uzrokovanom mikroorganizmom Nocardia asteroides. Uzet joj je trahealni aspirat i pretražen je mikrobiološki. U direktnom mikroskopskom preparatu iz aspirata traheje bojenom po Gramu vidljive su gram pozitivne razgranate filamentne hife uz puno leukocita. Na krvnom agaru nakon duže inkubacije porasla je čista kultura kolonija bijelog, kredastog izgleda. Preparat iz kulture bojen po Gramu pokazao je gram pozitivne razgranate filamente. Primjenom standardnih metoda mikroorganizam je identificiran kao Nocardia asteroides

Molecular epidemiology – what have we learned in TB transmission follow-up

Molekularno-epidemiološke studije, zasnovane na genotipizaciji kliničkih izolata M. tuberculosis, daju novu dimenziju metodama deskriptivne epidemiologije i omogućavaju praćenje prijenosa infekcije na globalnoj, nacionalnoj ili lokalnoj razini. Genotipizacija svih kliničkih izolata izoliranih u novooboljelih bolesnika u Hrvatskoj provodi se od 2007. godine. Koristi se metoda MIRU-VNTR, a rezultat genotipizacije je 15-člani numerički kod koji se pohranjuje u nacionalnu bazu genotipova M. tuberculosis. U ovom radu prikazan je presjek mogućnosti primjene rezultata genotipizacije u praćenju prijenosa tuberkuloze kao što su dokaz postojanja mikroepidemije ili lažno pozitivnih kultura, otkrivanje prijenosa koji nije uočen metodama deskriptivne epidemiologije, prijenos tuberkuloze sa čovjeka na životinju i obrnuto te ostalo.Molecular epidemiology studies, based on M. tuberculosis strains genotyping, add new dimension to descriptive epidemiology approach by enabling the follow-up of spread of tuberculosis on local, national and global level. In Croatia, all M. tuberculosis clinical strains isolated in newly diagnosed patients are genotyped since 2007. The MIRU-VNTR method is used, and the result is in the form of a 15-digit numerical code that is stored in the national database of M. tuberculosis genotypes. In this paper, various possibilities of using genotyping results in tuberculosis follow-up are presented, such as confirming the existence of an outbreak, revealing false positive cultures, transmission that was unnoticed by descriptive epidemiology approach, transmission from human to animal host and vice versa, etc

DETERMINATION OF THE RESISTANCE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS AGAINST ISONIAZID BY MULTIPLEX PCR METHOD

SAŽETAK Cilj: Ispitati mutacije u katG i inhA genima kliničkih izolata vrste Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis), otpornih na izoniazid (INH). Metode: Za to su ispitivanje izdvojena ukupno 103 klinička izolata vrste M. tuberculosis, prikupljena u razdoblju od 1999. do 2006. na području Hrvatske, kojima je fenotipskom metodom proporcije prema Canettiju, na Löwenstein-Jensen podlozi, utvrđena otpornost na INH. Ispitivanje mutacija u katG i inhA genima, provedeno je multipleks PCR metodom. Ta se metoda zasniva na otkrivanju mutacije AGC→ACC u katG genu, te inhAC-15T mutacije u regulatornoj regiji mabA-inhA operona. Rezultati: Za 76 sojeva (75%) od ukupno 103 ispitivana soja vrste M. tuberculosis, utvrđena je genetska osnova otpornosti na INH. Ustanovljena je povezanost između mutacije u kodonu 315 katG gena, te razvoja otpornosti na druge antituberkulotike. Zaključak: Potrebno je ispitati genetske osnove otpornosti na INH, jer se katG mutacija pokazuje kao pretkazivač mogućega razvoja otpornosti na druge antituberkulotike.ABSTRACT Aim: To detect mutations in katG and inhA genes in Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) clinical isolates resistant to isoniazid (INH). Methods: A total of 103 isolates collected from 1999 to 2006 in Croatia and identified as INH-resistant M. tuberculosis strains by standard susceptibility testing proportion method according to Canetti were investigated. Multiplex PCR method was used to detect an AGC to ACC mutation in the katG gene and an inhAC-15T mutation in the regulatory region of the mabA-inhA operon. Results: Genetic basis of INH resistance was found for 76 (75%) of total 103 M. tuberculosis strains investigated. There was a correlation between mutation in 315 codon of katG gene and acquisition of resistance to other antituberculous drugs. Conclusions: Mutation in katG gene in INH resistant M.tuberculosis strains is highly predictive for acquisition of resistance to other antituberculous drugs

Kako danas dijagnosticirati i pratiti tuberkulozu u Hrvatskoj

Sažetak Tuberkuloza je kao bolest u Hrvatskoj prisutna već stoljećima. Uz kliničara i epidemiologa u kontroli bolesti ključna je i uloga laboratorija te mikrobiologa koji mora u što kraćem vremenu javiti pozitivan nalaz. Uz laboratorijske metode stare i preko sto godina, kao što je bojanje po Ziehl-Neelsenu, danas nam je na raspolaganju cijeli niz novih tehnika; od kultivacije na tekućim podlogama pa sve do niza brzih molekularnih testova za detekciju mikrobakterija i otkrivanje rezistencije. Jedan od najvažnijih testova novije generacije je GeneXpert, automatizirani sistem koji omogućuje otkrivanje bacila direktno u uzorku za manje od dva sata. Postoji napredak i u obuhvatu kontakata u vidu IGRA testova koji imaju značajno bolju osjetljivost i specifičnost od do sada korištenog PPD testa. Kao pomoć epidemiološkom praćenju prijenosa tuberkuloze osobito je korisna MIRU-VNTR metoda kojom možemo potvrditi, odbaciti ili ukazati na mogućnost prijenosa infekcije

Microbiological diagnostics of tuberculosis from Koch to "point-of-care" test

Prema podacima Svjetske zdravstvene organizacije trećina svjetske populacije inficirana je s M. tuberculosis te je bolest koju on uzrokuje, tuberkuloza, jedna od najvažnijih infektivnih bolesti današnjice. Brza, dostupna i pouzdana dijagnostika izrazito je važna u prekidanju lanca prijenosa te suzbijanju zaraze. Klasična laboratorijska dijagnostika, koja se sastoji od direktne mikroskopije, kultivacije te testa osjetljivosti, u posljednjih je desetak godina dobila značajnu podršku u novim molekularnim testovima. Nakon brojnih hibridizacijskih testova, pravu je revoluciju 2010. godine donio test Xpert MTB/RIF, automatizirani sistem koji u dva sata direktno iz kliničkog uzorka može detektirati M. tuberculosis te rezistenciju na rifampicin. U novije vrijeme umjesto kožnog testa sve se više koriste IGRA testovi za otkrivanje latentne infekcije. Trenutno se najviše radi na brzom, pouzdanom i jeftinom "point-of-care" testu kojim bi se tuberkuloza mogla dijagnosticirati kod prvog susreta bolesnika s liječnikom.According to the World Health Organization, one third of the world\u27s population is infected with M. tuberculosis, making tuberculosis, the disease it causes, one of the most significant infectious diseases. Quick, accessible and reliable diagnostics is a key in breaking transmission chains and preventing infection. In the last 10 years, new molecular tests have considerably supported classical laboratory diagnostics that include microscopy, cultivation and drug susceptibility testing. In 2010, a revolutionary new test Xpert MTB/RIF was introduced. This closed system simultaneously detects M. tuberculosis and its resistance to rifampicin directly in clinical samples. Recently, there has been an increase in using IGRA tests (instead of skin test) to detect latent infection. The current focus of interest is the development of a rapid, reliable and inexpensive point-of-care test that could enable diagnosis of tuberculosis during the patient\u27s first visit to the doctor

Kako danas dijagnosticirati i pratiti tuberkulozu u Hrvatskoj

Sažetak Tuberkuloza je kao bolest u Hrvatskoj prisutna već stoljećima. Uz kliničara i epidemiologa u kontroli bolesti ključna je i uloga laboratorija te mikrobiologa koji mora u što kraćem vremenu javiti pozitivan nalaz. Uz laboratorijske metode stare i preko sto godina, kao što je bojanje po Ziehl-Neelsenu, danas nam je na raspolaganju cijeli niz novih tehnika; od kultivacije na tekućim podlogama pa sve do niza brzih molekularnih testova za detekciju mikrobakterija i otkrivanje rezistencije. Jedan od najvažnijih testova novije generacije je GeneXpert, automatizirani sistem koji omogućuje otkrivanje bacila direktno u uzorku za manje od dva sata. Postoji napredak i u obuhvatu kontakata u vidu IGRA testova koji imaju značajno bolju osjetljivost i specifičnost od do sada korištenog PPD testa. Kao pomoć epidemiološkom praćenju prijenosa tuberkuloze osobito je korisna MIRU-VNTR metoda kojom možemo potvrditi, odbaciti ili ukazati na mogućnost prijenosa infekcije

Mycobacterium marinum infection of the hand in an immunocompromised aquarium hobbyist

M. marinum, a nontuberculous mycobacterium, is a rare human pathogen widely distributed in the aquatic environment. In the previous century, epidemics took place due to inadequately chlorinated swimming pool water. Nowadays the majority of infections are acquired through contact of previously damaged skin with contaminated fish tank water. We present a case of M. marinum infection of the hand in an aquarium hobbyist which stayed unrecognized for 2 years. After confirming the correct diagnosis, the patient was successfully treated with a regiment containing clarithromycin and rifampicin. The aim of this paper is to raise the awareness of the possibility of M. marinum infection when encountered with non-healing nodular/verrucous/ulcerative lesions of the extremities. ly: MyriadPro-Bold;color:black;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:HR; mso-bidi-language:TA\u27&gt;   </p