Locality-Aware Parallel Sparse Matrix-Vector and Matrix-Transpose-Vector Multiplication on Many-Core Processors

Sparse matrix-vector and matrix-transpose-vector multiplication (SpMMTV) repeatedly performed as z ← ATx and y ← A z (or y ← A w) for the same sparse matrix A is a kernel operation widely used in various iterative solvers. One important optimization for serial SpMMTV is reusing A-matrix nonzeros, which halves the memory bandwidth requirement. However, thread-level parallelization of SpMMTV that reuses A-matrix nonzeros necessitates concurrent writes to the same output-vector entries. These concurrent writes can be handled in two ways: via atomic updates or thread-local temporary output vectors that will undergo a reduction operation, both of which are not efficient or scalable on processors with many cores and complicated cache-coherency protocols. In this work, we identify five quality criteria for efficient and scalable thread-level parallelization of SpMMTV that utilizes one-dimensional (1D) matrix partitioning. We also propose two locality-aware 1D partitioning methods, which achieve reusing A-matrix nonzeros and intermediate z-vector entries; exploiting locality in accessing x -, y -, and -vector entries; and reducing the number of concurrent writes to the same output-vector entries. These two methods utilize rowwise and columnwise singly bordered block-diagonal (SB) forms of A. We evaluate the validity of our methods on a wide range of sparse matrices. Experiments on the 60-core cache-coherent Intel Xeon Phi processor show the validity of the identified quality criteria and the validity of the proposed methods in practice. The results also show that the performance improvement from reusing A-matrix nonzeros compensates for the overhead of concurrent writes through the proposed SB-based methods. © 2015 IEEE

Contributions to the knowledge of the Lixinae (Coleoptera: Curculionidae) from Turkey

Summary In this study, the new localities of 60 species belonging to Lixinae subfamily of Curculionidae has been determined. Material from the different parts of Turkey have been collected during the years of 1933-1996. Amongst those Larinus latus (Herbst) and Lixus cardui Olivier are more widespread compared to the others

Leptinotarsa Decemlineata (SAY) (Coleoptera: Chrysomelidae) (patates böreği)'nın patates bitkisinde beslenme davranışı ve zarar miktarı üzerine araştırmalar

Bu çalışmada Leptinotarsa decemlineata (Say) (Coleoptera: Chrysomelidae)’nın beslenme davranışının ve birey sayısı ile zarar miktarı arasındaki ilişkinin ortaya konması amaçlanmıştır. Denemeler L. decemlineata bireyleri kullanılarak, sıcaklığın 25±1°C, orantılı nemin %55±5 olduğu ve 16 saat aydınlık 8 saat karanlık koşullarının sabit tutulduğu iklim odasında yapılmıştır. L. decemlineata’nın beslenme davranışı ile ilgili denemeler böceğin tüm larva dönemleri ile genç erkek bireyler, preovipozisyon dönemindeki dişi bireyler ve ovipozisyon dönemindeki dişi bireyler için patates bitkisi üzerinde ayrı ayrı ve tek birey ile yapılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre 1 saatlik gözlem süresi içerisinde, toplam beslenme süresi en uzun süren, ortalama 3.284,00±1,03 sn ile dördüncü dönem larvalar olmuştur. Ovipozisyon dönemindeki dişiler ortalama 786,00±1,12 sn ile bu süreyi en kısa sürede tamamlayan bireyler olmuştur. Bir beslenmenin süresi ortalama 716,06±85,93 sn süreyle en uzun olarak ikinci larva dönemindeki bireylerde görülmüştür. Bu süre en kısa olarak ortalama 257,52±24,24 sn ile birinci larva dönemindeki bireylerde sürmüştür. Beslenme sayısı değerlerine bakıldığında bu sayı ortalama 5,00±0,07 ile en fazla birinci larva döneminde görülmüştür. En az beslenme sayısı ise ortalama 1,70±0,10 ile ovipozisyon dönemindeki dişi bireylerde kaydedilmiştir. Zarar miktarı çalışmalarında L. decemlineata’nın farklı biyolojik dönemlerindeki bireylerinin patates bitkisinin koparılmış yaprakları üzerinde 4 saat tutulması sonucu tükettikleri alanlar hesaplanmıştır. Bu çalışmalardan elde edilen sonuçlara göre tüketilen alan bakımından 328,39±41,21 mm2 ile dördüncü dönem larvalar ilk sırada yer almıştır. Bu biyolojik dönemdeki bireyleri 317,54±36,40 mm2 ile preovipozisyon, 281,75±16,51 mm2 ile ovipozisyon, 280,41±26,01 mm2 ile genç erkek ve 119,02±20,26 mm2 ile üçüncü larva dönemindeki bireyler takip etmiştir. Tükettiği alan 20,94±2,99 mm2 olan ikinci dönemdeki larvalardan sonra, 7,47±0,79 mm2 alan tüketen birinci larva dönemindeki bireyler en az alan tüketen bireyler olmuşlardır. Ayrıca zarar miktarı ile ilgili çalışmalar sonucunda L. decemlineata’nın birey sayısı ile yaptığı zarar miktarı arasında bir korelasyon olduğu ortaya konulmuştur.The study aimed to find out the feeding behavior, correlation among number of individuals and the amount of damage by Leptinotarsa decemlineata (Say) (Coleoptera: Chrysomelidae). Experiments conducted in a controlled climate room conditions at temperature 25±1ºC, relative humidity 55 ± 5% and photoperiod 16:8 h, using L. decemlineata individuals. Experiments on the feeding behavior of L. decemlineata were carried out with all individual larvae periods and female individuals during the preoviosition period, female individuals during the oviposition period and young male individuals seperately and individually on the potato plant. In terms of results, within the period of observation of 1 hour, the total feeding period completed by the fourth-stage larvae with the longest average of 3.284,00±1,03 seconds. The female individuals in the oviposition period were individuals who completed this period in the shortest time with an average of 786,00±1,12 seconds. The duration of a feeding period was the longest for an average of 716,06±85,93 seconds in the individuals of the second-stage larvae. This period lasted at least 257,52±24,24 seconds on the average in the first-stage larvae. When the feeding number was taken into consideration, this number was found mostly in the first larval period with an average of 5,00±0,07. The minimum number of feeding was recorded in female individuals in the oviposition period with an average of 1,70±0,10. In the studies of amount of damage, the areas where L. decemlineata individuals consumed at different biological periods for 4 hours on the leaves of the potato plant were calculated. According to the results obtained from these studies, with the area consumed 328,39±41,21 mm2, the fourth-stage larvae took the first place. The individuals in this biological period followed the female individuals during the preoviosition period with 317,54±36,40 mm2, female individuals during the oviposition period with 281,75±16,51 mm2, young male individuals with 280,41±26,01 mm2 and the third-stage larvae with 119,02±20,26 mm2. After the second-stage larvae, which consumed 20,94±2,99 mm2, the individuals in the first-stage consuming 7,47±0,79 mm2 area consumed the least amount of area. Also, a correlation was found between number of individuals and the amount of damage caused by them

Pamuk zararlılarına karşı savaş yöntemlerinin uygulanmasında dikkat edilmesi gereken ana konular

Pests, during growing season of cotton, could cause significant crop losses. Measurement costs can cause increased yield cost. There are 7 main topics to be followed for successfulness in plant protection. Those are given below; right identification, right control method, right application time, right pesticide, right application equipment, right application and control. For beginning plant protection it is likely to be successful control the pests when followed in orderly. Any, wrong or misused practices, or not following the procedures, may result in unsuccessful control or may be successful by chance. The significance of these topics and necessary procedures to be considered are dealt with some examples.Pamuk üretiminde zararlılar önemli ürün kayıplarına neden olmaktadır. Bunlara karşı alınacak önlemler ürün maliyetinin yükselmesine neden olmaktadır. Zararlılara karşı uygulanacak mücadele işlemlerinde başarılı olabilmek için uyulması gereken 7 ana konu vardır. Bunlar sırasıyla; doğru teşhis, doğru savaş yöntemi, doğru uygulama zamanı, doğru pestisit seçimi, doğru alet seçimi, doğru uygulama ve kontrol'dur. Uygulanacak bir bitki koruma işleminde bunlar, veriliş sırasına göre uygulandığı zaman başarıya ulaşmak kolaylıkla mümkün olmaktadır. Herhangi birisinde yapılacak olan yanlış veya eksik uygulama, sırasına uymama gibi bir hata ise başarısızlığı getirmekte veya başarının tesadüfle yakalanmasına neden olmaktadır. Pamuk tarımı sırasında sorun olan zararlılarla mücadelede bu konuların önemi ve dikkat edilmesi gereken noktalar bazı örnekleriyle açıklanmıştır

ŞEV STABİLİTESİ KAZIKLARI İLE ŞEV STABİLİTE ANALİZİ: VAKA İNCELEMESİ

Slope stability is one of the most critical issues in geotechnical engineering due to disastrous effects on the environment and human health and economic losses in case of failure. There are various stabilization methods where mostly stabilizing piles are widely used to maintain stability. These piles are mainly subjected to lateral pressure caused by the horizontal movement of the sliding mass on the slope. In this research, the effects of the piles on stabilizing slopes are studied with the help of an actual case by means of monitoring data. Afterward, a parametric study was carried out to determine the impact of the following parameters: a. The effect of center-to-center pile spacing and pile diameter ratio b. The embedment depth of the piles into the sound layers c. Location of the piles on the slope. The safety factors after the installation of piles of parameter variations under static and earthquake conditions were compared. The analyses were carried out using the finite element method (FEM) (2D and 3D) and the limit equilibrium software. For the given case study, soil arching and the effect of pile parameters on the design and soil behavior around piles were also evaluated for the stabilized slope. Calculated results were compared with the field inclinometer readings for the case study. It is seen that the ratio of the pile spacing to diameter and the location of the pile affected the factor of safety. The data concludes that based on the orientation of the weak layers, failure can occur even with the existence of the stabilization systems. It is seen that the lateral swelling pressure of soil is crucial for the pile design due to potential failure.Şev stabilitesi, göçme durumunda yarattığı ekonomik kayıpların yanı sıra çevre ve insan sağlığı üzerindeki olumsuz etkileri nedeniyle geoteknik mühendisliğinin en önemli konularından biridir. Şev stabilite kazıkları, şevlerin stabilitesini sağlamak için yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu kazıklar ana olarak şev hareketi sebebiyle oluşan yanal yüklere maruz kalır. Bu çalışmada kazıkların şev stabilitesi üzerindeki etkisi incelenmektedir. Aşağıdaki değişkenlerin şev stabilitesi üzerindeki etkilerini belirlemek için parametrik çalışma yapılmıştır: a. Merkezden merkeze kazık aralığının kazık çapına oranının etkisi b. Kazıkların sağlam birimler içerisindeki soket boyu c. Kazıkların şev üzerindeki yerleşimi. Değişken parametrelerdeki kazık yerleşimleri sonrası için, statik ve dinamik koşullar altında elde edilen güvenlik sayıları karşılaştırılmıştır. Analiz, sonlu elemanlar yöntemi (FEM) yazılımları (2D ve 3D) kullanılarak yapılmıştır. Vaka çalışması kapsamında, kazık tasarım parametrelerinin güvenlik sayısına etkisi, zemin kemerlenmesi ve kazıkların etrafındaki zeminin davranışı da değerlendirilmiştir. Analiz sonuçları, sahada alınan inklinometre okumaları ile karşılaştırılmıştır. Kazık aralığının çapa oranının ve kazık konumunun emniyet faktörünü etkilediği, görülmektedir. Çalışma, zemin profilindeki zayıf katmanların oryantasyonuna bağlı olarak, stabilizasyon sistemlerinin mevcudiyetinde bile başarısızlığın meydana gelebileceği sonucuna varmaktadır. Sonuçlara göre, zeminin yanal şişme basıncı, potansiyel yenilme nedeniyle kazık tasarımı için çok önemlidir.M.S. - Master of Scienc

Ancyrosoma leucogrammes (Gmelin) (Heteroptera: Pentatomidae)'in bazı biyolojik özellikleri üzerine sıcaklığın etkisi

The laboratory experiments were done in climatic chamber with 55;plusmn;5% relative humidity and 3500 lux illumination during 16 hours per day constantly. The effect of temperature was examined by rearing the insect at 25;plusmn;1$\circ$C and 30+1$\circ$C each. Ancyrosoma leucogrammes was fed on the seeds of anis, carrot, celery, dill, parsley and distilled water. Ratio of eggs viality, egg incubation periods, survival rates and development periods of each nymphal instar, preoviposition periods, oviposition periods, postoviposition periods, adult survival periods and the mean number of eggs per females were determined at 25$\circ$C and 30$\circ$C temperatures. The developmental threshold and the thermal constant of A. leucogrammes were calculated. Development of the egg was completed in 5.64 and 3.43 days at 25 and 3O0C, respectively. Besides, total development periods of nymphs were found as 21.84 and 14.96 days at the same temperatures. During laboratory rearings, it was calculated that 8.85 and 10.68% of the eggs did not hatch at 25 and 30$\circ$C, respectively. The immature individuals could reached to adult stage 83.05% ratio at 25$\circ$C and 73.11% ratio at 30$\circ$C temperature. The females survival period were found as 37.14 and 30.80 days at 25 and 30$\circ$C, respectively. The survival period of males were determined at the same temperatures 32.90 days and 27.06 days respectively.Preoviposition periods were found as 9.95 and 7.19 days in adults reared at 25 and 30$\circ$C, respectively. Oviposition periods were lasted 24.15 and 21.16 days and post-oviposition periods took about 3.04 and 2.45 days at the same temperatures, respectively. Total egg production of females was counted as 224.92 and 180.90 at the 25 and 30$\circ$C, respectively. One generation takes 37.43 days at 250C and 25.58 days at 30$\circ$C. According to these results, development threshold was calculated as 14.20C and thermal constant as 404.2 days degrees for one generation of A. leucogrammes.Ancyrosoma leucogrammes'm bazı biyolojik özellikleri, 25±1$\circ$C ve 30±1$\circ$C sıcaklıklara ayarlanmış iklim odalarında araştırılmıştır. Odaların orantılı nemi %55±5 ve günlük aydınlanma süresi 16 saat olarak sabit tutulmuştur. Deneme süresince bireylere besin olarak anason, dereotu, havuç, kereviz ve maydanoz tohumları verilmiş, su ihtiyaçları saf su ile karşılanmıştır. Her iki sıcaklıkta, A, leucogrammes'ın yumurtalarının açılma süreleri, her nimf dönemindeki bireylerin gelişme süreleri, preovipozisyon, ovipozisyon, yarıovipozisyon, post-vipozisyon, ömür süreleri ve her bir dişinin bıraktığı ortalama yumurta sayısı saptanmıştır. Yumurtaların açılma oranları ve her nimf dönemindeki ölüm oranlan bulunmuştur. Erkek ve dişi bireylerin canlı kalma eğrileri çizilmiştir. Ayrıca böceğin gelişme eşiği ve sıcaklık sabitesi hesaplanmıştır