Luminal and Tumor-Associated Gut Microbiome Features Linked to Precancerous Lesions Malignancy Risk: A Compositional Approach

Colorectal cancer is the third most commonly diagnosed cancer worldwide. Human gut microbiome plays important roles in protecting against it, as well as contributing to its onset and progression. Identification of specific bacterial taxa associated with early stages of colorectal cancer may help develop effective microbiome-based diagnostics. For precancerous lesions, links of their characteristics to luminal and tumor-associated microbiome composition are to be elucidated. Paired stool and tumor brush biopsy samples were collected from 50 patients with precancerous lesions and early forms of colon cancer; their microbial communities were profiled using high-throughput 16S rRNA sequencing. We showed that the microbiome differences between stool and biopsy samples can be to a high extent computationally corrected. Compositionality-aware statistical analysis of microbiome composition revealed its associations with the number of lesions, lesion type, location and malignization pathway. A major determinant of precancerous lesions malignancy risk—the number of lesions—was positively associated with the abundance of H2S-producing taxa. Our results contribute to the basis for developing early non-invasive colorectal cancer diagnostics via identifying microorganisms likely participating in early stages of cancer pathogenesis

Валлериитсодержащая руда Кингашского месторождения (Сибирь, Россия): Мессбауэровская и рентгенофотоэлектронная спектроскопия, термические и межфазные свойства

Valleriite, (Cu,Fe)S2×n(Mg,Al,Fe)(OH)2, and related layered minerals are of interest due to their unusual two-dimensional structure, formation mechanisms, physical and chemical properties, and potential involvement into mineral processing and materials science applications. Here, we have studied Kingash Cu-Ni ore samples containing 10–25% of valleriite in association with serpentines (lizardite and chrysotile) and magnetite using scanning electron microscopy and electron microprobe analysis, Mössbauer spectroscopy, X-ray photoelectron spectroscopy (XPS), thermal analysis and zeta potential measurement. The data are compared with those for Al-doped valleriite synthesized via a hydrothermal route. It was found that the Kingash valleriite contains excessive iron relative to CuFeS2 stoichiometry, which mainly occurs, leaving aside magnetite, as Fe3+-OH species in hydroxide layers of valleriite and minor Fe centers in serpentines. Thermal dehydroxylation of hydroxide layers of valleriites occurs near 500oC in inert atmosphere; in air, sulfide sheets oxidize with an exothermal peak at 447oC, and sulfur oxides don’t volatilize but react with hydroxide groups of valleriite rather than serpentines. Zeta potential measurements of coarse ore particles using the flow potential technique suggested that the surface of valleriite is negatively charged in a wide pH range while the positive values at low pHs for fine particles are inflicted by serpentine. The findings demonstrate close resemblance of the natural and synthetic Al-doped valleriites, and the key role of valleriite, despite its moderate content, for the interfacial characteristics of the valleriite-bearing oresВаллериит, (Cu, Fe)S2×n(Mg, Al, Fe)(OH)2 и родственные ему слоистые минералы представляют интерес в связи с их необычной двумерной структурой, механизмами образования, физическими и химическими свойствами и возможностью применения в процессах переработки полезных ископаемых и материаловедения. В настоящей работе с помощью сканирующей электронной микроскопии и электронного микрозондового анализа, мессбауэровской спектроскопии, рентгеновской фотоэлектронной спектроскопии (РФЭС), термического анализа и измерения дзета-потенциала нами были изучены образцы медно-никелевых руд Кингашского месторождения, содержащие 10–25 % валлериита в ассоциации с серпентинами (лизардит и хризотил) и магнетитом. Было проведено сравнение полученных данных с результатами измерений легированного алюминием валлериита, синтезированного гидротермальным способом. Установлено, что валлериит Кингашского месторождения содержит избыточное железо по отношению к стехиометрии CuFeS2, которое представлено в основном, не считая магнетита, в виде центров Fe3+-OH, расположенных в гидроксидных слоях валлериита и небольшого числа примесей Fe в серпентинах. Термическое дигидроксилирование гидроксидных слоев валлериитов происходит около 500 °C в инертной атмосфере; на воздухе сульфидные слои окисляются с экзотермическим пиком при 447 °C, а оксиды серы не улетучиваются, а реагируют скорее с гидроксидными группами валлериита, чем с серпентинами. Измерения дзета-потенциала крупных частиц руды с использованием метода потенциала протекания показали, что поверхность валлериита отрицательно заряжена в широком диапазоне рН, в то время как положительные показатели при низких значениях рН для более мелких частиц обусловлены присутствием серпентина. Полученные данные демонстрируют близкое сходство природного и синтетического валлериитов, легированного алюминием, и его ключевую роль для межфазных характеристик валлериитсодержащих руд, даже при его умеренном содержани