The other side of the coin : Functional and structural versatility of ADF/cofilins

Several cellular processes rely on the fine tuning of actin cytoskeleton. A central component in the regulation of this cellular machinery is the ADF-H domain proteins. Despite sharing the same domain, ADF-H domain proteins produce a diverse functional landscape in the regulation of the actin cytoskeleton. Recent findings emphasize that the functional and structural features of these proteins can differ not only between ADF-H families but even within the same family. The structural and evolutional background of this functional diversity is poorly understood. This review focuses on the specific functional characteristics of ADF-H domain proteins and how these features can be linked to structural differences in the ADF-H domain and also to different conformational transitions in actin. In the light of recent discoveries we pay special attention to the ADF/cofilin proteins to find tendencies along which the functional and structural diversification is governed through the evolution

Contribution of proline to the pre-structuring tendency of transient helical secondary structure elements in intrinsically disordered proteins

Background IDPs function without relying on three-dimensional structures. No clear rationale for such a behavior is available yet. PreSMos are transient secondary structures observed in the target-free IDPs and serve as the target-binding "active" motifs in IDPs. Prolines are frequently found in the flanking regions of PreSMos. Contribution of prolines to the conformational stability of the helical PreSMos in IDPs is investigated. Methods MD simulations are performed for several IDP segments containing a helical PreSMo and the flanking prolines. To measure the influence of flanking-prolines on the structural content of a helical PreSMo calculations were done for wild type as well as for mutant segments with Pro → Asp, His, Lys, or Ala. The change in the helicity due to removal of a proline was measured both for the PreSMo region and for the flanking regions. Results The α-helical content in ~ 70% of the helical PreSMos at the early stage of simulation decreases due to replacement of an N-terminal flanking proline by other residues whereas the helix content in nearly all PreSMos increases when the same replacements occur at the C-terminal flanking region. The helix destabilizing/terminating role of the C-terminal flanking prolines is more pronounced than the helix promoting effect of the N-terminal flanking prolines. General significance This work represents a novel example demonstrating that a proline is encoded in an IDP with a defined purpose. The helical PreSMos presage their target-bound conformations. As they most likely mediate IDP-target binding via conformational selection their helical content can be an important feature for IDP function. © 2013 Elsevier B.V

High turnover rate revealed by non-invasive genetic analyses in an expanding Eastern Imperial Eagle population

L

A növényvédő szer kijuttatás csökkentésének alkalmazástechnológiai lehetőségei = Reduction of the pesticide use by applicationstechnology methods

A teljes kutatási időszak fontosabb tézisszerű eredményei, megállapításai a következők szerint foglalhatók össze: - A korábbiaktól eltérő körülmények mellett végzett technológiai összehasonlító kísérletek is igazolták, hogy az elektrosztatikus cseppfeltöltéses technológia kedvezőbb fedettségi jellemzőket eredményez a hagyományos hidraulikus cseppképzéshez és axiálventillátoros permettovábbításhoz képest. Az elektrosztatikus cseppfeltöltéssel a hagyományos kijuttatásnál alacsonyabb dózissal is elérhetők hagyományos gépekhez hasonló fedettségi jellemzők. - A különféle kialakítású technikai megoldású csökkentett hatóanyagdózissal, csökkentett permetlé kijuttatással, ill. permetvisszanyerő rendszerrel ellátott gépekkel alacsonyabb hatóanyag kijuttatás mellett is elérhető a hagyományos gépekéhez hasonló célfelületi fedettség, így a korszerű növényvédő gépek alkalmazásával a biológiailag hatásos védekezés csökkentett növényvédő-szer mennyiség kijuttatása mellett is megvalósítható. - A változó ültetvény-jellemzőkhöz illeszthető technikai megoldásokkal, gépbeállításokkal kísérletileg igazoltan is növényvédő szer megtakarítás érhető el az általánosan alkalmazott műszaki technikai megoldásokhoz és gépbeállításokhoz képest. | More significant thesis-like results and establishment of the whole research period can be summed up as follow: -the technological comparable experiments carried out besides the conditions differing from the earlier ones also certify that electrostatic charged spray-drops technology produces more favourable coverage characteristics than the traditional hydraulic spraying and axial fan spraying. Coverage characteristics similar to the traditional machines can also be achieved with lower doses by electrostatic spraying against the traditional method. -Coverage of the target surface similar to the traditional machines' can be achieved as well besides the letting out of lower agent performed with machines furnished with spray recovering system or with reduced spray liquid release, with reduced agent dose of various developed technical solutions; thus with the application of up-to-date plant protective machines biologically effective protection can also be realised besides the release of reduced insecticide quantity. -With technical solutions and machine adjustment adaptable to the variable plantation-characteristics, it is experimentally certified that insecticide saving can be obtained compared to the generally applied technical solutions and machine adjustment

Az éhség és a gastrointestinális hormontermelés változásának vizsgálata totális gastrectomizált, valamint kóros kövérségben szenvedő betegekben = Evaluation of satiation, satiety and GI hormone production in patients after total gastrectomy and in morbidly obese

1.Két total gastrectomia utáni rekonstrukciós típust hasonlítottunk össze, melyek a pótgyomor helyében (oralis vagy aborális) különböztek egymástól. A vizsgált paraméterekben nem találtunk szignifikáns különbséget. 2.Gastrointestinalis panaszokat és egyéb életminőségi paramétereket hasonlítottunk össze két rekonstrukciós típusban, ahol a duodenumbekötés jelenlétében volt csak különbség. Megtartott duodenalis passzázs mellett a korai dumpinges panaszok szignifikánsan ritkábban jelentkeztek. 3.Vizsgáltuk a plazma cholecystokinin, ghrelin és leptin szintet éhomra és tesztétel fogyasztása után és egészséges egyedekhez hasonlítottuk. Az éhomi CCK és ghrelin szint szignifikánsan magasabb volt a duodenum visszakötésnél és magasabb maradt tesztétel elfogyasztása után is. A leptin szintekben nem találtunk különbséget. 4.Állatkísérletekben a ghrelin szint alacsonyabb, a leptin szint, a táplálékfelvétel, a súlygyarapodás magasabb volt a duodenum bekötésnél. 5.Anti CCK adásával mindkét csoportban szignifikáns táplálékfelvételt igazoltunk. Az anti CCK fokozza az éhségérzetet. 6. Funkcionális MRI-vel vizsgáltuk az aktivitásváltozást a kórosan kövér és normális testsúlyú betegeknél tesztétel elfogyasztás után. Számos agyi régióban észleltünk jelentős aktivitás különbséget a két csoport között kellemes és kellemetlen íz hatására. Az eredmények segíthetnek megtalálni a központi idegrendszer szerepét a kóros kövérség kialakulásában, új módszerek kifejlesztésében a súlycsökkentés elérésére. | 1.We compared two types of reconstructions after total gastrectomy, an aboral and an oral pouch with preserved duodenal passage, differing only in the site of the pouch. The site of the reservoir does not influence the outcome.2.We investigated different alimentary symptoms and QOL parameters in correlation with the reconstruction type. Preservation of the duodenal passage reduces the prevalence of early dumping syndrome.3.Fasting and postalimentary plasma CCK, ghrelin and leptin levels were measured in the two different reconstruction types and compared to healthy contols. Fasting leves of CCK and ghrelin were significantly higher after preservation of the duodenal passage and remained higher postprandially as well. There were no significant differences in leptin levels between the groups.4.In a rat model the level of ghrelin was lower, the level of leptin, the food intake and body weight gain was higher after duodenal preservation.5.Administration of anti-CCK significantly increases food intake in both groups in animal model. Anti-CCK increases apetite.6.We studied the brain functional MRI (fMRI) activity changes of normal and obese persons, triggered by gustatory stimulation. Our current fMRI investigations revealed different activations of numerous brain regions of normal and obese individuals, triggered by pleasant and unpleasant gustation. This method can help to recognize the role of the central nervous system in obesity, and to develop new therapies for weight loss

Intrinsically Disordered Linkers Impart Processivity on Enzymes by Spatial Confinement of Binding Domains

(1) Background: Processivity is common among enzymes and mechanochemical motors that synthesize, degrade, modify or move along polymeric substrates, such as DNA, RNA, polysaccharides or proteins. Processive enzymes can make multiple rounds of modification without releasing the substrate/partner, making their operation extremely effective and economical. The molecular mechanism of processivity is rather well understood in cases when the enzyme structurally confines the substrate, such as the DNA replication factor PCNA, and also when ATP energy is used to confine the succession of molecular events, such as with mechanochemical motors. Processivity may also result from the kinetic bias of binding imposed by spatial confinement of two binding elements connected by an intrinsically disordered (ID) linker. (2) Method: By statistical physical modeling, we show that this arrangement results in processive systems, in which the linker ensures an optimized effective concentration around novel binding site(s), favoring rebinding over full release of the polymeric partner. (3) Results: By analyzing 12 such proteins, such as cellulase, and RNAse-H, we illustrate that in these proteins linker length and flexibility, and the kinetic parameters of binding elements, are fine-tuned for optimizing processivity. We also report a conservation of structural disorder, special amino acid composition of linkers, and the correlation of their length with step size. (4) Conclusion: These observations suggest a unique type of entropic chain function of ID proteins, that may impart functional advantages on diverse enzymes in a variety of biological contexts