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Dynamique de lâoccupation des sols dans le parc national de Bouhedma (Tunisie)
La prĂ©sente Ă©tude a Ă©tĂ© effectuĂ©e dans le Parc national de Bouhedma, dans les zones arides tunisiennes. Il constitue une zone protĂ©gĂ©e avec des caractĂ©ristiques Ă©cologiques particuliĂšres et une dynamique importante de lâoccupation des espaces. Le Parc abrite lâunique steppe arborĂ©e Ă Acacia tortilis en Tunisie. Dans un but de prĂ©servation et de gestion du Parc, une meilleure connaissance de la rĂ©partition et de la dynamique de la vĂ©gĂ©tation de cette zone permet dâenvisager des programmes de restauration et de gestion durable du milieu naturel. LâĂ©tude a Ă©tĂ© consacrĂ©e, grĂące Ă lâinterprĂ©tation des donnĂ©es de la tĂ©lĂ©dĂ©tection et lâutilisation des SIG, Ă lâĂ©laboration et Ă la comparaison de deux cartes, lâune relative aux systĂšmes Ă©cologiques prĂ©sents en 2008 et lâautre qui concerne lâoccupation des terres de la mĂȘme zone en 1985
A Network Biology Approach Identifies Molecular Cross-Talk between Normal Prostate Epithelial and Prostate Carcinoma Cells
© 2016 The Authors. Published by Public Library of Science. This is an open access article available under a Creative Commons licence.
The published version can be accessed at the following link on the publisherâs website: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004884The advent of functional genomics has enabled the genome-wide characterization of the molecular state of cells and tissues, virtually at every level of biological organization. The difficulty in organizing and mining this unprecedented amount of information has stimulated the development of computational methods designed to infer the underlying structure of regulatory networks from observational data. These important developments had a profound impact in biological sciences since they triggered the development of a novel data-driven investigative approach. In cancer research, this strategy has been particularly successful. It has contributed to the identification of novel biomarkers, to a better characterization of disease heterogeneity and to a more in depth understanding of cancer pathophysiology. However, so far these approaches have not explicitly addressed the challenge of identifying networks representing the interaction of different cell types in a complex tissue. Since these interactions represent an essential part of the biology of both diseased and healthy tissues, it is of paramount importance that this challenge is addressed. Here we report the definition of a network reverse engineering strategy designed to infer directional signals linking adjacent cell types within a complex tissue. The application of this inference strategy to prostate cancer genome-wide expression profiling data validated the approach and revealed that normal epithelial cells exert an anti-tumour activity on prostate carcinoma cells. Moreover, by using a Bayesian hierarchical model integrating genetics and gene expression data and combining this with survival analysis, we show that the expression of putative cell communication genes related to focal adhesion and secretion is affected by epistatic gene copy number variation and it is predictive of patient survival. Ultimately, this study represents a generalizable approach to the challenge of deciphering cell communication networks in a wide spectrum of biological systems.Cancer research UK, BBSRC, NI
Dynamique de lâoccupation des sols dans le parc national de Bouhedma (Tunisie)
International audienc
Effect of thinning on Pinus pinea L. development and physico-chemical soil characteristics in northwestern Tunisia: modeling of radial growth under thinning intensity
In this study, the potential beneficial impacts that the thinnings intensity on stand behavior and
soil properties are also studied. This study was designed to test the hypothesis that thinning to various
stand densities at young age enhance productivity of wood, cones and the physicochemical characteristics
of the soil in Pinus pinea stands. We based our study on four thinning intensity (30, 40, 50 and 65%) in
comparison with the control plot. The study was supplemented by a haracterization of radial growth of
trees under the four thinning intensity. It was based on a complete randomized experimental field installed
in 1994 in Tabarka forest, in Tunisia. For the radial growth analysis, three cores were taken from 125 trees
at a rate of one tree per plot.The study showed that thinning has a significant effect on all dendrometric
parameters. They revealed that a thinning intensity of 65% produces the best wood production (180.710
m3/ha), in annual growth in volume (4.634 m3/ha/year) and cone production (1211 cones/ha) compared
to other thinning and control plot. Associated vegetation was also influenced by thinning intensities. The
physicochemical characteristics of the soil were improved by thinning compared with the control. Signif-
icant radial growth thinning was recorde especially in a thinning of 65% intensity (increases of 3.5 to 6.1
mm/year) compared to the control (1.1 to 2 mm/year). A strong relationship between radial growth and
age was recorded at Thinning 4 (R2 = 0.923). These results can be used as an initial basis to refine silvicul-
ture of pinion pine in order to improve stand productivity in Tunisia in wood and especially in cones given
their importance on the world market
ProductivitĂ© en semences dans la steppe arborĂ©e dâAcacia tortilis - Parc national de Bouhedma (Tunisie)
Acacia tortilis subsp. raddiana est une espĂšce ligneuse arborĂ©e de la famille des lĂ©gumineuses. Ses populations forment la steppe arborĂ©e Ă gommier des zones arides tunisiennes, comme dans le Parc national de Bouhedma. Cette espĂšce aux usages multiples rencontre cependant des problĂšmes de rĂ©gĂ©nĂ©ration. Cette Ă©tude a Ă©tĂ© entreprise pour Ă©valuer la production de graines dâAcacia tortilis. Le choix s'est portĂ© sur cinq parcelles (50 arbres par parcelle) rĂ©parties dans le Parc Ă cinq niveaux dâaltitudes. Les rĂ©coltes ont Ă©tĂ© effectuĂ©es deux fois par mois, durant trois annĂ©es successives. Les rĂ©sultats montrent que lâaltitude nâa pas dâeffet significatif sur la production de graines. La production estimĂ©e pour l'Acacia tortilis varie trĂšs fortement dans les diffĂ©rentes parcelles du Parc et varie dâune façon significative suivant les annĂ©es. Les rĂ©sultats montrent une faible production de graines Ă cause du taux dâavortement constatĂ© pendant le stade de floraison, qui peut ĂȘtre liĂ© Ă un manque dâagents pollinisateurs et Ă la chute des gousses avant quâelles aient atteint leur phase de maturation, Ă cause du vent fort enregistrĂ© dans la rĂ©gion. Il est Ă signaler que le taux dâattaque des graines par les bruchidĂ©s au stade de maturation peut atteindre 85 %, ce qui provoque par la suite dâĂ©normes problĂšmes pour la rĂ©gĂ©nĂ©ration naturelle de lâespĂšce
Survie et transmission des bactĂ©ries Ă intĂ©rĂȘt sanitaire dans les plantes et le sol irriguĂ©s par les eaux usĂ©es traitĂ©es
La plupart des stations d'Ă©puration installĂ©es dans les villes tunisiennes rejettent les eaux usĂ©es traitĂ©es dans l'environnement (mer, cours d'eau...), 15 % seulement de ces eaux sont utilisĂ©es dans l'agriculture. La valorisation de ces eaux demeure donc une nĂ©cessitĂ© particuliĂšrement durant les saisons sĂšches mais elle est limitĂ©e car les eaux usĂ©es jouent un rĂŽle de vecteurs des germes entĂ©riques susceptibles d'ĂȘtre pathogĂšnes et dont la prĂ©sence dans l'environnement constitue un risque sanitaire important.
Nous avons essayé de voir au cours de ce travail le devenir des cellules de Salmonella typhimurium incubées dans le sol irrigué par les eaux usées ainsi que leur résistance à certains facteurs de stress.
Cinq pots renfermant du sol ont été ensemencés par trigonelle et irrigués par les eaux usées contaminées par les bactéries à étudier: Salmonella typhimurium, Aeromonas hydrophila, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens et Escherichia coli.
Au cours de la croissance de ces plantes, nous avons suivi l'évolution de différentes souches dans le sol et les plantes. Les résultats obtenus ont permis de voir que seules les deux souches de Pseudomonas passent au niveau des feuilles et que les autres bactéries restent adsorbées au niveau des racines et de la partie inférieure de la tige.
Les cellules de salmonelles stressées subissent des modifications biochimiques et perdent certains de leurs caractÚres clefs. Elles donnent des formes naines capables de traverser les membranes de 0,45 ” de porosité