4 research outputs found
Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas
- Author
- A. Abeshouse
- A. Ally
- A. Antenucci
- A. Arnaout
- A. Berchuck
- A. Bergeron
- A. Bossler
- A. Boussioutas
- A. Breggia
- A. Burnette
- A. Chen
- A. Clipca
- A. Davis
- A. De Rienzo
- A. De Rose
- A. Fehrenbach
- A. Gillis
- A. Gimenez-Roqueplo
- A. Gopalan
- A. Haddad
- A. Hartmann
- A. Iavarone
- A. Jimeno
- A. Kastl
- A. Kendler
- A. Kibel
- A. Korkut
- A. Longatto-Filho
- A. Luna
- A. Luna
- A. Malykh
- A. Mariamidze
- A. Mes-Masson
- A. Noss
- A. Ochoa
- A. Ochoa
- A. Perin
- A. Piché
- A. Pickens
- A. Rao
- A. Sankarankuty
- A. Secord
- A. Sepulveda
- A. Shabunin
- A. Sharp
- A. Sood
- A. Spillane
- A. Tam
- A. Tischler
- A. Tsao
- A. Unterberg
- A. Vicha
- A. von Deimling
- A.C. Berger
- A.C. de Carvalho
- A.D. Cherniack
- A.D. Cherniack
- A.D. Tward
- A.E. Sloan
- A.G. Robertson
- A.H. Berger
- A.H. Bryce
- A.H. Perou
- A.J. Kovatich
- A.J. Lazar
- A.J. Lazar
- A.J. Mungall
- A.K. Godwin
- A.L. Carvalho
- A.L. Guillermo
- A.M. Hegde
- A.M.A. Gonzalez
- A.P. Hoyle
- A.R. Metwalli
- B. Bernard
- B. Campos
- B. Czerniak
- B. Deyarmin
- B. Drake
- B. Esmaeli
- B. Gross
- B. Hermes
- B. Hernandez
- B. Kohl
- B. Kumar
- B. Pollo
- B. Rabeno
- B. Robinson
- B. Singh
- B. Tê
- B. Van Tine
- B. Wullich
- B.D. Phu
- B.E. Gross
- B.M. Broom
- B.P. O’
- B.S. Taylor
- B.Y. Karlan
- C. Adebamowo
- C. Andry
- C. Behrens
- C. Benz
- C. Bifulco
- C. Bradford
- C. Brewer
- C. Calatozzolo
- C. Carter
- C. Chen
- C. Cibulskis
- C. Fan
- C. Farver
- C. Feltmate
- C. Goparaju
- C. Guo
- C. Herold-Mende
- C. Hovens
- C. Huang
- C. Jungk
- C. Kandoth
- C. Kandoth
- C. Larson
- C. Logothetis
- C. Mcpherson
- C. Mirsaidi
- C. Moran
- C. Morrison
- C. Moser
- C. Sander
- C. Sander
- C. Scapulatempo-Neto
- C. Schilero
- C. Shelton
- C. Shipman
- C. Stoehr
- C. Wang
- C. Yau
- C.A. Miller
- C.C. Fronick
- C.D. Jones
- C.D. Shriver
- C.D. Vocke
- C.G. Carlotti
- C.H. Hagedorn
- C.J. Creighton
- C.K. Wong
- C.M. Cebulla
- C.M. Hutter
- C.M. Perou
- C.N. Landen
- C.P. Raut
- C.S. Greene
- C.S. Shelley
- C.W. Seder
- D. Alvaro
- D. Aziz
- D. Beer
- D. Bell
- D. Bigner
- D. Brooks
- D. Chakravarty
- D. Chakravarty
- D. Chesla
- D. Crain
- D. Cramer
- D. Hoon
- D. Huntsman
- D. Lee
- D. Mallery
- D. Morton
- D. Murawa
- D. Muzny
- D. Nagorney
- D. O’
- D. Raymond
- D. Rice
- D. Schadendorf
- D. Tan
- D. Tcaciuc
- D. Tirapelli
- D. Voet
- D.A. Levine
- D.A. Wheeler
- D.I. Heiman
- D.J. Brat
- D.J. Van Den Berg
- D.J. Weisenberger
- D.L. Liu
- D.M. Rassl
- D.M. Shin
- D.N. Hayes
- D.O. Vidal
- D.T. Maglinte
- E. Baudin
- E. Campo
- E. Castle
- E. Chuah
- E. Curley
- E. Gaudio
- E. Giné
- E. Kebebew
- E. Korpershoek
- E. Lipp
- E. Reznik
- E. Shinbrot
- E. Swisher
- E. Thompson
- E. Zmuda
- E.C. Zwarthoff
- E.G. Van Meir
- E.L. Appelbaum
- E.M. Godwin
- E.M. Van Allen
- E.M.M. Pinero
- E.R. Duffy
- E.R. Mardis
- F. Beuschlein
- F. Brimo
- F. Carey
- F. Cheng
- F. Daian
- F. Dimeco
- F. Facciolo
- F. Giuliante
- F. Khuri
- F. Mccormick
- F. Meric-Bernstam
- F. Moiseenko
- F. Que
- F. Saad
- F. Sanchez-Vega
- F. Sanchez-Vega
- F. Valdivieso
- F. Williams
- F. Zhao
- G. Barnett
- G. Bubley
- G. Carpino
- G. Ciriello
- G. Finocchiaro
- G. Getz
- G. Gorincioi
- G. Grazi
- G. Long
- G. Manikhas
- G. Mann
- G. Mcarthur
- G. Mckercher
- G. Petersen
- G. Saksena
- G. Sauter
- G. Setdikova
- G. Sica
- G. Thomas
- G. Wolf
- G.B. Mills
- G.D. Hammer
- G.F. Gao
- G.P. Way
- H. Al-Ahmadie
- H. Colman
- H. Dinh
- H. Doddapaneni
- H. Fan
- H. Gabra
- H. Gavin
- H. Hai
- H. Hibshoosh
- H. Huland
- H. Jianhong
- H. Juhl
- H. Kakavand
- H. Liang
- H. Liang
- H. Noushmehr
- H. Pass
- H. Sekhon
- H. Shen
- H. Shen
- H. Stoop
- H. Taubert
- H. Thai
- H. Timmers
- H. Yang
- H. Zaren
- H. Zhang
- H. Zhang
- H. Zhang
- H. Zhang
- H.C.S. Silveira
- H.G. Rosenthal
- H.J. Sofia
- H.K. Schmidt
- H.S. Kantheti
- I. Alexopoulou
- I. Bahceci
- I. Caraman
- I. Chemencedji
- I. de Bruijn
- I. Felau
- I. Forgie
- I. Shmulevich
- I. Shmulevich
- I. Stancul
- I. Wistuba
- I. Yang
- J. Armenia
- J. Armenia
- J. Bartlett
- J. Bennett
- J. Bondaruk
- J. Bowen
- J. Catto
- J. Chabot
- J. Cheville
- J. Cho
- J. Creaney
- J. Dipersio
- J. Drummond
- J. Eckman
- J. Engel
- J. Eschbacher
- J. Fujimoto
- J. Fulop
- J. Galbraith
- J. Gao
- J. Gao
- J. Gardner
- J. Gershenwald
- J. Harr
- J. Henderson
- J. Hess
- J. Hilty
- J. Houck
- J. Kim
- J. Kocher
- J. Lang
- J. Liu
- J. Luketich
- J. Marks
- J. Martin
- J. Melamed
- J. Miller
- J. Moyer
- J. Myers
- J. Parfitt
- J. Park
- J. Paulauskis
- J. Phillips
- J. Powers
- J. Roach
- J. Santibanez
- J. Shih
- J. Simko
- J. Slotta-Huspenina
- J. Smith
- J. Stretch
- J. Thompson
- J. Waldmann
- J. Walker
- J. Wang
- J. Wang
- J. Wilmott
- J. Zhang
- J. Zhenlin
- J.(. Zhang
- J.A. Ajani
- J.A. Borgia
- J.A. Copland
- J.A. Demchok
- J.A. Hooke
- J.A. Martignetti
- J.B. Elder
- J.C. Zenklusen
- J.D. Yang
- J.E. Schein
- J.H. Fregnani
- J.I. Lee
- J.J. Olson
- J.L. Fantacone-Campbell
- J.M. Chan
- J.M. Gastier-Foster
- J.M. Stuart
- J.N. Weinstein
- J.S. Barnholtz-Sloan
- J.S. Dos Santos
- J.S. Parker
- J.T. Auman
- J.V. Simons
- K. Agnew
- K. Ahn
- K. Becker
- K. Birsoy
- K. Chang
- K. Chung
- K. Covington
- K. Delman
- K. Devine
- K. Evason
- K. Janssen
- K. Junker
- K. Kasaian
- K. Kopp
- K. Lau
- K. Lee
- K. Leinonen
- K. Magliocca
- K. Moore
- K. Moxley
- K. Mungall
- K. Pacak
- K. Rai
- K. Roggin
- K. Senecal
- K. Shannon
- K. Shimmel
- K. Smith-McCune
- K. Smolenski
- K. Tse
- K. Tucker
- K.A. Hoadley
- K.C. Sexton
- K.E. van Kessel
- K.J. Kang
- K.M. Fong
- K.M. Leraas
- L. Cope
- L. Cuppini
- L. Danilova
- L. Dervishi
- L. Desjardins
- L. Ding
- L. Ding
- L. Haydu
- L. Jacobus
- L. Jun
- L. Konnor
- L. Konnor C.
- L. Kvecher
- L. Lacombe
- L. Landrum
- L. Lewis
- L. Lolla
- L. Looijenga
- L. Mattei
- L. Omberg
- L. Peterson
- L. Ramondetta
- L. Roberts
- L. Rozek
- L. Scarpace
- L. Schoenfield
- L. Wang
- L. Wei
- L. Wise
- L. Xuan
- L. Yang
- L. Yiling
- L. Zhang
- L.A. Donehower
- L.A. Fulton
- L.A. Zach
- L.E. Mose
- L.N. Kwong
- L.S. Schmidt
- M. Albert
- M. Aymerich
- M. Bailey
- M. Balasundaram
- M. Behera
- M. Bellair
- M. Birrer
- M. Borad
- M. Carney
- M. Cernat
- M. Couce
- M. Deqin
- M. Dinkin
- M. Dubina
- M. Farnell
- M. Fassnacht
- M. Feldman
- M. Gerken
- M. Goodman
- M. Graefen
- M. Iacocca
- M. Ittmann
- M. Kasapi
- M. Kendrick
- M. Knudson
- M. Ladanyi
- M. Latour
- M. Mannelli
- M. Marino
- M. Mayo
- M. Mcgraw
- M. Meyerson
- M. Meyerson
- M. Milhem
- M. Miller
- M. Mina
- M. Moncrieff
- M. Morgan
- M. Muto
- M. Nelson
- M. Peto
- M. Pirtac
- M. Pool
- M. Prados
- M. Prince
- M. Quinn
- M. Quintero-Aguilo
- M. Rivera
- M. Ryan
- M. Schiffman
- M. Sherman
- M. Sheth
- M. Stanton
- M. Stern
- M. Synott
- M. Tavobilov
- M. Torbenson
- M. Wang
- M. Wiznerowicz
- M. Yussanne
- M.A. Marra
- M.A. Rubin
- M.C. Bragazzi
- M.D. Mclellan
- M.D. Wilkerson
- M.G. Cordes
- M.G. Nissan
- M.G. Soloway
- M.H. Abdel-Rahman
- M.H. Bailey
- M.H. Kucherlapati
- M.J. Frederick
- M.J. Liptay
- M.L. Anderson
- M.L. Ferguson
- M.S. Bootwalla
- M.S. Lawrence
- M.S. Noble
- N. Botnariuc
- N. Chambwe
- N. Corcoran
- N. Dhalla
- N. Gehlenborg
- N. Giama
- N. Girard
- N. Hayward
- N. Horowitz
- N. Kwok-Shing
- N. Schultz
- N. Schultz
- N. Thiessen
- N. Van Bang
- N. Wentzensen
- N.A. Pennell
- N.C. Ramirez
- N.D. Aredes
- N.L. Lehman
- N.P. Hung
- N.V. Tien
- O. Bathe
- O. Mariani
- O. Olabode
- O. Paklina
- O. Potapova
- O. Voronina
- P. Anur
- P. Disaia
- P. Drwiega
- P. Glenn
- P. Hansen
- P. Hersey
- P. Lin
- P. Lohavanichbutr
- P. Nair
- P. Nguyen
- P. Sipahimalani
- P. Spellman
- P. Swanson
- P. Tamboli
- P. Tennstedt
- P. Troncoso
- P. Wakely
- P. Westervelt
- P. Yena
- P.A. Mieczkowski
- P.A. Pinto
- P.D. Castro
- P.H. Lai
- P.R. Carroll
- P.R. Dottino
- P.T. Hanh
- P.W. Laird
- P.W. Laird
- Q. Gao
- Q. Sun
- Q.T. Ostrom
- R. Akbani
- R. Berkowitz
- R. Beroukhim
- R. Bowlby
- R. Bowman
- R. Broaddus
- R. Bueno
- R. Carlsen
- R. de Krijger
- R. Dhanasekaran
- R. Dhir
- R. Duell
- R. Ghossein
- R. Glenn
- R. Govindan
- R. Holt
- R. Kefford
- R. Kemp
- R. Korst
- R. Kramer
- R. Kundra
- R. Kundra
- R. Lechan
- R. Madan
- R. Mandt
- R. Mannel
- R. Mclendon
- R. Merola
- R. Naresh
- R. Penny
- R. Pilarski
- R. Postier
- R. Saw
- R. Scolyer
- R. Sheridan
- R. Sigmund
- R. Simon
- R. Singh
- R. Smallridge
- R. Steele
- R. Stoehr
- R. Tamakawa
- R. Tarnuzzer
- R. Thorp
- R. Warnick
- R. Worrell
- R. Zuna
- R.A. Gibbs
- R.A. Moore
- R.C. Rintoul
- R.H. Thompson
- R.J. Mural
- R.K. Kelley
- R.K. Wilson
- R.M. Reis
- R.S. Fulton
- R.S. Kanchi
- R.S. Kucherlapati
- S. Balu
- S. Baylin
- S. Bell
- S. Chevalier
- S. Chudamani
- S. Cottingham
- S. Cuzzubbo
- S. Dimitriadoy
- S. Doruc
- S. Force
- S. Frazer
- S. Gilbert
- S. Heath
- S. Kalkanis
- S. Kendall
- S. Lee
- S. Ling
- S. Maithel
- S. Mccall
- S. Meier
- S. Meng
- S. Morris
- S. Mura
- S. Porten
- S. Ramalingam
- S. Reynolds
- S. Roman-Roman
- S. Sadeghi
- S. Saghafinia
- S. Sifri
- S. Signoretti
- S. Singer
- S. Somiari
- S. Stepa
- S. Tao
- S. Vandenberg
- S. Wach
- S.B. Gabriel
- S.E. Schumacher
- S.J. Caesar-Johnson
- S.J.M. Jones
- S.L. Asa
- S.M. Foltz
- S.M. Phillips
- S.M. Staugaitis
- S.N. Adebamowo
- S.O. Sumer
- S.R. Jefferys
- T. Akeredolu
- T. Bocklage
- T. Bodenheimer
- T. Broudy
- T. Carey
- T. Costello
- T. Defreitas
- T. Flotte
- T. Giordano
- T. Giordano
- T. Hinoue
- T. Knijnenburg
- T. Knutson
- T. Ley
- T. Mikkelsen
- T. Naska
- T. Owonikoko
- T. Patel
- T. Pihl
- T. Schlomm
- T. Shelton
- T. Skelly
- T. Smyrk
- T. Thompson
- T. Wang
- T. Wong
- T. Zelinka
- T.A. Chan
- T.G. Bivona
- T.M. Lichtenberg
- U. Dogrusoz
- U. Veluvolu
- V. Cardinale
- V. Chandan
- V. Dhankani
- V. Jakrot
- V. Korchina
- V. Lyadov
- V. Reuter
- V. Thorsson
- W. Barrett
- W. Eijckenboom
- W. Hale
- W. Kycler
- W. Liang
- W. Liu
- W. Oosterhuis
- W. Urba
- W. Ye
- W. Zhang
- W. Zhou
- W. Zhou
- W.E. Grizzle
- W.G. Richards
- W.J. Edenfield
- W.K. Chatila
- W.K. Chatila
- W.K. Rathmell
- W.M. Linehan
- X. Liu
- X. Liu
- X. Sastre
- Y. Han
- Y. Liu
- Y. Shi
- Y. Sun
- Y. Tang
- Y. Wan
- Y. Wolinsky
- Y. Xiao
- Z. Heins
- Z. Wang
- Z.J. Heins
- Publication venue
- 'Elsevier BV'
- Publication date
- 05/04/2018
- Field of study
Genetic alterations in signaling pathways that control cell-cycle progression, apoptosis, and cell growth are common hallmarks of cancer, but the extent, mechanisms, and co-occurrence of alterations in these pathways differ between individual tumors and tumor types. Using mutations, copy-number changes, mRNA expression, gene fusions and DNA methylation in 9,125 tumors profiled by The Cancer Genome Atlas (TCGA), we analyzed the mechanisms and patterns of somatic alterations in ten canonical pathways: cell cycle, Hippo, Myc, Notch, Nrf2, PI-3-Kinase/Akt, RTK-RAS, TGFb signaling, p53 and beta-catenin/Wnt. We charted the detailed landscape of pathway alterations in 33 cancer types, stratified into 64 subtypes, and identified patterns of co-occurrence and mutual exclusivity. Eighty-nine percent of tumors had at least one driver alteration in these one alteration potentially targetable by currently available drugs. Thirty percent of tumors had multiple targetable alterations, indicating opportunities for combination therapy
Watchful waiting versus active surveillance: Appropriate patient selection
- Author
- A. Bill-Axelson
- A.R. Vashi
- A.V. D’Amico
- A.W. Partin
- C. Hardie
- Christopher J. Kane
- D.E. Bailey
- D.M. Latini
- E.W. Steyerberg
- G. Draisma
- H.B. Carter
- H.B. Carter
- I. Rullis
- J. Walz
- J. Walz
- J.D. Tward
- J.E. Johansson
- J.I. Epstein
- J.I. Epstein
- J.L. Mohler
- K.L. Greene
- L. Klotz
- M.A. Dall’Era
- M.A. Dall’Era
- M.I. Patel
- M.R. Cooperberg
- M.R. Cooperberg
- M.S. Litwin
- M.S. Soloway
- M.W. Kattan
- M.W. Kattan
- Marc A. Dall’Era
- P. Emiliozzi
- P.C. Albertsen
- R. Venkitaraman
- R. Yatani
- S. Roemeling
- S. Roemeling
- S.J. Freedland
- T.J. Wilt
- Y. Kakehi
- Y.N. Wong
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Paraoxonase 1 (PON1), A Junction Between the Metabolisms of Homocysteine and Lipids
- Author
- A. Kamudhamas
- A. Tward
- A. Undas
- A. Undas
- A. Undas
- A. Undas
- A.B. Lawrence de Koning
- A.M. Spence
- A.N. Makheja
- B. Mackness
- B. Mackness
- C. Gouedard
- C. Maestro de las Casas
- C.N. Roybal
- D. Liao
- D. Qujeq
- D.K. Hansen
- D.L. Sauls
- D.M. Reuben
- D.M. Shih
- D.M. Shih
- D.S. Wald
- E. Lonn
- G. Chwatko
- G. Chwatko
- G. Ferretti
- G.K. Marathe
- G.P. Jarvik
- G.P. Jarvik
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- H. Jakubowski
- J. Beltowski
- J. Folbergrova
- J. Perla
- J. Zimny
- J.D. Spence
- J.F. Teiber
- J.F. Teiber
- J.L. Anderson
- J.O. Sass
- K. Robert
- K.H. Bonaa
- K.S. McCully
- L.A. Aerts Van
- L.A. Harker
- L.A. Kluijtmans
- L.G. Mikael
- L.S. Rozek
- M. Kerkeni
- M. Lacinski
- M. Langmeier
- M. Mackness
- M. Rosenblat
- M. Stefani
- M. Tomas
- M.I. Mackness
- M.J. Stampfer
- N. Endo
- N.D. Greene
- O. Khersonsky
- P. Mercie
- P.W. Connelly
- R. Clarke
- R. Glowacki
- R.F. Huang
- R.W. James
- S. Deakin
- S. Donahue
- S. Najib
- S. Yap
- S.H. Mudd
- S.R. Lentz
- T.B. Domagala
- T.H. Rosenquist
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- 01/01/2008
- Field of study
Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas
- Author
- Abdel-Rahman M.H.
- Abeshouse A.
- Adebamowo C.
- Adebamowo S.N.
- Agnew K.
- Ahn K.
- Ajani J.A.
- Akbani R.
- Akeredolu T.
- Al-Ahmadie H.
- Albert M.
- Alexopoulou I.
- Ally A.
- Alvaro D.
- Anderson M.L.
- Andry C.
- Antenucci A.
- Anur P.
- Appelbaum E.L.
- Aredes N.D.
- Armenia J.
- Armenia J.
- Arnaout A.
- Asa S.L.
- Auman J.T.
- Aymerich M.
- Aziz D.
- Bahceci I.
- Bailey M.
- Bailey M.H.
- Balasundaram M.
- Balu S.
- Barnett G.
- Barnholtz-Sloan J.S.
- Barrett W.
- Bartlett J.
- Bathe O.
- Baudin E.
- Baylin S.
- Becker K.-F.
- Beer D.
- Behera M.
- Behrens C.
- Bell D.
- Bell S.
- Bellair M.
- Bennett J.
- Benz C.
- Berchuck A.
- Berger A.C.
- Berger A.H.
- Bergeron A.
- Berkowitz R.
- Bernard B.
- Beroukhim R.
- Beuschlein F.
- Bifulco C.
- Bigner D.
- Birrer M.
- Birsoy K.
- Bivona T.G.
- Bocklage T.
- Bodenheimer T.
- Bondaruk J.
- Bootwalla M.S.
- Borad M.
- Borgia J.A.
- Bossler A.
- Botnariuc N.
- Boussioutas A.
- Bowen J.
- Bowlby R.
- Bowman R.
- Bradford C.
- Bragazzi M.C.
- Brat D.J.
- Breggia A.
- Brewer C.
- Brimo F.
- Broaddus R.
- Brooks D.
- Broom B.M.
- Broudy T.
- Bryce A.H.
- Bubley G.
- Bueno R.
- Burnette A.
- Caesar-Johnson S.J.
- Calatozzolo C.
- Campo E.
- Campos B.
- Caraman I.
- Cardinale V.
- Carey F.
- Carey T.
- Carlotti C.G.
- Carlsen R.
- Carney M.
- Carpino G.
- Carroll P.R.
- Carter C.
- Carvalho A.L.
- Castle E.
- Castro P.D.
- Catto J.
- Cebulla C.M.
- Cernat M.
- Chabot J.
- Chakravarty D.
- Chakravarty D.
- Chambwe N.
- Chan J.M.
- Chan T.A.
- Chandan V.
- Chang K.
- Chatila W.K.
- Chatila W.K.
- Chemencedji I.
- Chen A.
- Chen C.
- Cheng F.
- Cherniack A.D.
- Cherniack A.D.
- Chesla D.
- Chevalier S.
- Cheville J.
- Cho J.
- Chuah E.
- Chudamani S.
- Chung K.
- Cibulskis C.
- Ciriello G.
- Clipca A.
- Colman H.
- Cope L.
- Copland J.A.
- Corcoran N.
- Cordes M.G.
- Costello T.
- Cottingham S.
- Couce M.
- Covington K.
- Crain D.
- Cramer D.
- Creaney J.
- Creighton C.J.
- Cuppini L.
- Curley E.
- Cuzzubbo S.
- Czerniak B.
- Daian F.
- Danilova L.
- Davis A.
- de Bruijn I.
- de Carvalho A.C.
- de Krijger R.
- De Rienzo A.
- De Rose A.
- DeFreitas T.
- Delman K.
- Demchok J.A.
- Dervishi L.
- Desjardins L.
- Devine K.
- Deyarmin B.
- Dhalla N.
- Dhanasekaran R.
- Dhankani V.
- Dhir R.
- DiMeco F.
- Dimitriadoy S.
- Ding L.
- Ding L.
- Dinh H.
- Dinkin M.
- DiPersio J.
- Disaia P.
- Doddapaneni H.
- Dogrusoz U.
- Donehower L.A.
- Doruc S.
- Dos Santos J.S.
- Dottino P.R.
- Drake B.
- Drummond J.
- Drwiega P.
- Dubina M.
- Duell R.
- Duffy E.R.
- Eckman J.
- Edenfield W.J.
- Eijckenboom W.
- Elder J.B.
- Engel J.
- Eschbacher J.
- Esmaeli B.
- Evason K.
- Facciolo F.
- Fan C.
- Fan H.
- Fantacone-Campbell J.L.
- Farnell M.
- Farver C.
- Fassnacht M.
- Fehrenbach A.
- Felau I.
- Feldman M.
- Feltmate C.
- Ferguson M.L.
- Finocchiaro G.
- Flotte T.
- Foltz S.M.
- Fong K.M.
- Force S.
- Forgie I.
- Frazer S.
- Frederick M.J.
- Fregnani J.H.
- Fronick C.C.
- Fujimoto J.
- Fulop J.
- Fulton L.A.
- Fulton R.S.
- Gabra H.
- Gabriel S.B.
- Galbraith J.
- Gao G.F.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao Q.
- Gardner J.
- Gastier-Foster J.M.
- Gaudio E.
- Gehlenborg N.
- Gerken M.
- Gershenwald J.
- Getz G.
- Ghossein R.
- Giama N.
- Gibbs R.A.
- Gilbert S.
- Gillis A.
- Gimenez-Roqueplo A.-P.
- Gine E.
- Giordano T.
- Giordano T.
- Girard N.
- Giuliante F.
- Glenn P.
- Glenn R.
- Godwin A.K.
- Godwin E.M.
- Gonzalez A.M.A.
- Goodman M.
- Gopalan A.
- Goparaju C.
- Gorincioi G.
- Govindan R.
- Graefen M.
- Grazi G.
- Greene C.S.
- Grizzle W.E.
- Gross B.
- Gross B.E.
- Guillermo A.L.
- Guo C.
- Ha G.
- Haddad A.
- Hagedorn C.H.
- Hale W.
- Hammer G.D.
- Han Y.
- Hanh P.T.
- Hansen P.
- Harr J.
- Hartmann A.
- Haydu L.
- Hayes D.N.
- Hayward N.
- Heath S.
- Hegde A.M.
- Heiman D.I.
- Heins Z.
- Heins Z.J.
- Henderson J.
- Hermes B.
- Hernandez B.
- Herold-Mende C.
- Hersey P.
- Hess J.
- Hibshoosh H.
- Hilty J.
- Hinoue T.
- Ho T.
- Hoadley K.A.
- Holt R.
- Hooke J.A.
- Hoon D.
- Horowitz N.
- Houck J.
- Hovens C.
- Hoyle A.P.
- Hu H.
- Hu J.
- Huang C.
- Huland H.
- Hung N.P.
- Huntsman D.
- Hutter C.M.
- Iacocca M.
- Iavarone A.
- Ittmann M.
- Jacobus L.
- Jakrot V.
- Janssen K.-P.
- Jefferys S.R.
- Jimeno A.
- Jones C.D.
- Jones S.J.M.
- Ju Z.
- Juhl H.
- Jungk C.
- Junker K.
- Kakavand H.
- Kalkanis S.
- Kanchi R.S.
- Kandoth C.
- Kandoth C.
- Kang K.J.
- Kantheti H.S.
- Karlan B.Y.
- Kasaian K.
- Kasapi M.
- Kastl A.
- Kebebew E.
- Kefford R.
- Kelley R.K.
- Kemp R.
- Kendall S.
- Kendler A.
- Kendrick M.
- Khuri F.
- Kibel A.
- Kim J.
- Knijnenburg T.
- Knudson M.
- Knutson T.
- Kocher J.-P.
- Kohl B.
- Kopp K.
- Korchina V.
- Korkut A.
- Korpershoek E.
- Korst R.
- Kovatich A.J.
- Kramer R.
- Kucherlapati M.H.
- Kucherlapati R.S.
- Kumar B.
- Kundra R.
- Kundra R.
- Kvecher L.
- Kwong L.N.
- Kycler W.
- La K.
- La K.C.
- Lacombe L.
- Ladanyi M.
- Lai P.H.
- Laird P.W.
- Laird P.W.
- Landen C.N.
- Landrum L.
- Lang J.
- Larson C.
- Latour M.
- Lau K.
- Lawrence M.S.
- Lazar A.J.
- Le X.
- Lechan R.
- Lee D.
- Lee J.I.
- Lee K.
- Lee S.
- Lehman N.L.
- Leinonen K.
- Leraas K.M.
- Levine D.A.
- Lewis L.
- Ley T.
- Li J.
- Li W.
- Liang H.
- Liang H.
- Liang W.-W.
- Lichtenberg T.M.
- Lin P.
- Linehan W.M.
- Ling S.
- Lipp E.
- Liptay M.J.
- Liu D.L.
- Liu J.
- Liu W.
- Liu X.
- Liu Y.
- Logothetis C.
- Lohavanichbutr P.
- Lolla L.
- Long G.
- Longatto-Filho A.
- Looijenga L.
- Lu Y.
- Luketich J.
- Luna A.
- Luna A.
- Lyadov V.
- Ma D.
- Ma Y.
- Madan R.
- Maglinte D.T.
- Magliocca K.
- Maithel S.
- Mallery D.
- Malykh A.
- Mandt R.
- Manikhas G.
- Mann G.
- Mannel R.
- Mannelli M.
- Mardis E.R.
- Mariamidze A.
- Mariani O.
- Marino M.
- Marks J.
- Marra M.A.
- Martignetti J.A.
- Martin J.
- Mattei L.
- Mayo M.
- McArthur G.
- McCall S.
- McCormick F.
- McGraw M.
- McKercher G.
- McLellan M.D.
- McLendon R.
- McPherson C.
- Meier S.
- Melamed J.
- Meng S.
- Meric-Bernstam F.
- Merola R.
- Mes-Masson A.-M.
- Metwalli A.R.
- Meyerson M.
- Meyerson M.
- Mieczkowski P.A.
- Mikkelsen T.
- Milhem M.
- Miller C.A.
- Miller J.
- Miller M.
- Mills G.B.
- Mina M.
- Mirsaidi C.
- Moiseenko F.
- Moncrieff M.
- Moore K.
- Moore R.A.
- Moran C.
- Morgan M.
- Morris S.
- Morrison C.
- Morton D.
- Mose L.E.
- Moser C.
- Moxley K.
- Moyer J.
- Mungall A.J.
- Mungall K.
- Mura S.
- Mural R.J.
- Murawa D.
- Muto M.
- Muzny D.
- Myers J.
- Nagorney D.
- Nair P.
- Naresh R.
- Naska T.
- Nelson M.
- Ng K.-S.
- Nguyen P.
- Nissan M.G.
- Noble M.S.
- Noss A.
- Noushmehr H.
- O'Brien D.
- O'Neill B.P.
- Ochoa A.
- Ochoa A.
- Olabode O.
- Olson J.J.
- Omberg L.
- Oosterhuis W.
- Ostrom Q.T.
- Owonikoko T.
- Pacak K.
- Paklina O.
- Parfitt J.
- Park J.-W.
- Parker J.S.
- Pass H.
- Patel T.
- Paulauskis J.
- Pennell N.A.
- Penny R.
- Perin A.
- Perou A.H.
- Perou C.M.
- Petersen G.
- Peterson L.
- Peto M.
- Phillips J.
- Phillips S.M.
- Phu B.D.
- Piche A.
- Pickens A.
- Pihl T.
- Pilarski R.
- Pinero E.M.M.
- Pinto P.A.
- Pirtac M.
- Pollo B.
- Pool M.
- Porten S.
- Postier R.
- Potapova O.
- Powers J.
- Prados M.
- Prince M.
- Que F.
- Quinn M.
- Quintero-Aguilo M.
- Rabeno B.
- Rai K.
- Ramalingam S.
- Ramirez N.C.
- Ramondetta L.
- Rao A.
- Rassl D.M.
- Rathmell W.K.
- Raut C.P.
- Raymond D.
- Reis R.M.
- Reuter V.
- Reynolds S.
- Reznik E.
- Rice D.
- Richards W.G.
- Rintoul R.C.
- Rivera M.
- Roach J.
- Roberts L.
- Robertson A.G.
- Robinson B.
- Roggin K.
- Roman-Roman S.
- Rosenthal H.G.
- Rozek L.
- Rubin M.A.
- Ryan M.
- Saad F.
- Sadeghi S.
- Saghafinia S.
- Saksena G.
- Sanchez-Vega F.
- Sanchez-Vega F.
- Sander C.
- Sander C.
- Sankarankuty A.
- Santibanez J.
- Sastre X.
- Sauter G.
- Saw R.
- Scapulatempo-Neto C.
- Scarpace L.
- Schadendorf D.
- Schein J.E.
- Schiffman M.
- Schilero C.
- Schlomm T.
- Schmidt H.K.
- Schmidt L.S.
- Schoenfield L.
- Schultz N.
- Schultz N.
- Schumacher S.E.
- Scolyer R.
- Secord A.
- Seder C.W.
- Sekhon H.
- Senecal K.
- Sepulveda A.
- Setdikova G.
- Sexton K.C.
- Shabunin A.
- Shannon K.
- Sharp A.
- Shelley C.S.
- Shelton C.
- Shelton T.
- Shen H.
- Shen H.
- Sheridan R.
- Sherman M.
- Sheth M.
- Shi Y.
- Shih J.
- Shimmel K.
- Shin D.M.
- Shinbrot E.
- Shipman C.
- Shmulevich I.
- Shmulevich I.
- Shriver C.D.
- Sica G.
- Sifri S.
- Sigmund R.
- Signoretti S.
- Silveira H.C.S.
- Simko J.
- Simon R.
- Simons J.V.
- Singer S.
- Singh B.
- Singh R.
- Sipahimalani P.
- Skelly T.
- Sloan A.E.
- Slotta-Huspenina J.
- Smallridge R.
- Smith J.
- Smith-McCune K.
- Smolenski K.
- Smyrk T.
- Sofia H.J.
- Soloway M.G.
- Somiari S.
- Sood A.
- Spellman P.
- Spillane A.
- Stancul I.
- Stanton M.
- Staugaitis S.M.
- Steele R.
- Stepa S.
- Stern M.-H.
- Stoehr C.
- Stoehr R.
- Stoop H.
- Stretch J.
- Stuart J.M.
- Su T.
- Sumer S.O.
- Sun Q.
- Sun Y.
- Swanson P.
- Swisher E.
- Synott M.
- Tam A.
- Tamakawa R.
- Tamboli P.
- Tan D.
- Tang Y.
- Tarnuzzer R.
- Taubert H.
- Tavobilov M.
- Taylor B.S.
- Tcaciuc D.
- Tennstedt P.
- Tetu B.
- Thiessen N.
- Thomas G.
- Thompson E.
- Thompson J.
- Thompson R.H.
- Thompson T.
- Thorp R.
- Thorsson V.
- Tien N.V.
- Timmers H.
- Tirapelli D.
- Tischler A.
- Torbenson M.
- Troncoso P.
- Tsao A.
- Tse K.
- Tucker K.
- Tward A.D.
- Unterberg A.
- Urba W.
- Valdivieso F.
- Van Allen E.M.
- Van Bang N.
- Van Den Berg D.J.
- van Kessel K.E.
- Van Meir E.G.
- Van Tine B.
- VandenBerg S.
- Veluvolu U.
- Vicha A.
- Vidal D.O.
- Vocke C.D.
- Voet D.
- von Deimling A.
- Voronina O.
- Wach S.
- Wakely P.
- Waldmann J.
- Walker J.
- Wan Y.
- Wang C.
- Wang J.
- Wang J.
- Wang L.
- Wang M.
- Wang T.
- Wang Z.
- Warnick R.
- Way G.P.
- Weinstein J.N.
- Weisenberger D.J.
- Wentzensen N.
- Westervelt P.
- Wheeler D.A.
- Wilkerson M.D.
- Williams F.
- Wilmott J.
- Wilson R.K.
- Wise L.
- Wistuba I.
- Wiznerowicz M.
- Wolf G.
- Wolinsky Y.
- Wong C.K.
- Wong T.
- Worrell R.
- Wu Y.
- Wullich B.
- Xi L.
- Xiao Y.
- Yang H.
- Yang I.
- Yang J.D.
- Yang L.
- Yau C.
- Yena P.
- Zach L.A.
- Zaren H.
- Zelinka T.
- Zenklusen J.C.
- Zhang H.
- Zhang H.
- Zhang H.
- Zhang H.
- Zhang J.
- Zhang J.J.
- Zhang L.
- Zhang W.
- Zhao F.
- Zhou W.
- Zhou W.
- Zmuda E.
- Zuna R.
- Zwarthoff E.C.
- Publication venue
- 'Elsevier BV'
- Publication date
- 01/01/2018
- Field of study
Genetic alterations in signaling pathways that control cell-cycle progression, apoptosis, and cell growth are common hallmarks of cancer, but the extent, mechanisms, and co-occurrence of alterations in these pathways differ between individual tumors and tumor types. Using mutations, copy-number changes, mRNA expression, gene fusions and DNA methylation in 9,125 tumors profiled by The Cancer Genome Atlas (TCGA), we analyzed the mechanisms and patterns of somatic alterations in ten canonical pathways: cell cycle, Hippo, Myc, Notch, Nrf2, PI-3-Kinase/Akt, RTK-RAS, TGF\u3b2 signaling, p53 and \u3b2-catenin/Wnt. We charted the detailed landscape of pathway alterations in 33 cancer types, stratified into 64 subtypes, and identified patterns of co-occurrence and mutual exclusivity. Eighty-nine percent of tumors had at least one driver alteration in these pathways, and 57% percent of tumors had at least one alteration potentially targetable by currently available drugs. Thirty percent of tumors had multiple targetable alterations, indicating opportunities for combination therapy. An integrated analysis of genetic alterations in 10 signaling pathways in >9,000 tumors profiled by TCGA highlights significant representation of individual and co-occurring actionable alterations in these pathways, suggesting opportunities for targeted and combination therapies