Multivariate analysis of oestrogen receptor alpha, pS2, metallothionein and CD24 expression in invasive breast cancers

Determination of oestrogen receptor alpha (ER) represents at present the most important predictive factor in breast cancers. Data of ours and of other authors suggest that promising predictive/prognostic factors may also include pS2, metallothionein (MT) and CD24. Present study aimed at determining prognostic and predictive value of immunohistochemical determination of ER, pS2, MT, and CD24 expression in sections originating from 104 patients with breast cancer. An univariate and multivariate analysis was performed. Both univariate and multivariate analyses demonstrated that cytoplasmic-membranous expression of CD24 (CD24c-m) represents a strong unfavourable prognostic factor in the entire group and in most of the subgroups of patients. In several subgroups of the patients also a prognostic value was demonstrated of elevated expression of pS2 and of membranous expression of CD24. Our studies demonstrated that all patients with good prognostic factors (higher ER and pS2 expressions, lower MT expression, CD24c-m negativity) survived total period of observation (103 months). The study documented that cytoplasmic-membranous expression of CD24 represented an extremely strong unfavourable prognostic factor in breast cancer. Examination of the entire panel of the studied proteins permitted to select a group of patients of an exceptionally good prognosis

Physiological and cell ultrastructure disturbances in wheat seedlings generated by Chenopodium murale hairy root exudate.

Chenopodium murale L. is an invasive weed species significantly interfering with wheat crop. However, the complete nature of its allelopathic influence on crops is not yet fully understood. In the present study, the focus is made on establishing the relation between plant morphophysiological changes and oxidative stress, induced by allelopathic extract. Phytotoxic medium of C. murale hairy root clone R5 reduced the germination rate (24% less than control value) of wheat cv. Nataša seeds, as well as seedling growth, diminishing shoot and root length significantly, decreased total chlorophyll content, and induced abnormal root gravitropism. The R5 treatment caused cellular structural abnormalities, reflecting on the root and leaf cell shape and organization. These abnormalities mostly included the increased number of mitochondria and reorganization of the vacuolar compartment, changes in nucleus shape, and chloroplast organization and distribution. The most significant structural changes were observed in cell wall in the form of amoeboid protrusions and folds leading to its irregular shape. These structural alterations were accompanied by an oxidative stress in tissues of treated wheat seedlings, reflected as increased level of H2O2 and other ROS molecules, an increase of radical scavenging capacity and total phenolic content. Accordingly, the retardation of wheat seedling growth by C. murale allelochemicals may represent a consequence of complex activity involving both cell structure alteration and physiological processes.This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in Protoplasma. The final authenticated version is available online at: [http://dx.doi.org/10.1007/s00709-018-1250-0

Wpływ systemu uprawy i odchwaszczania na plon i jakość włókna lnianego

Fibrous flax, despite its many different uses, is currently growing within a relatively small area, mainly because of the low production margin. This study shows possible approaches to the reduce production costs of flax fibre by 424 PLN per hectare as a result of no-tillage cultivation and direct sowing. No such research on flax fibre production has been conducted so far. The study (carried in 2011-2012) covered highly differentiated temperature and precipitation conditions. The yields of homomorphic fibre in a dry year were higher than in a year with optimum precipitation in the no-till system comparing to conventional tillage. The application of Chisel 75WG increased the yield of fibre regardless of the weather and cultivation system and was the result of both straw yield and fibre content increase. Tillage systems and herbicides differentiated the length and linear density of homomorphic fibre and impurity content, whereas the elongation at break and tenacity did not depend on the cultivation method.Len włóknisty mimo wielostronnych walorów użytkowych jest aktualnie uprawiany w Polsce na niewielkiej powierzchni. Wynika to z małej opłacalności jego produkcji. Omawiana praca wskazuje na możliwość obniżenia kosztów produkcji włókna lnianego oraz określa wpływ systemów uprawy i odchwaszczania na jego jakość. Obniżenie kosztów produkcji włókna upatruje się w zaniechaniu najbardziej energo i czasochłonnego zabiegu jakim jest orka i stosowanie systemów bezpośrednich, zwalczenie chwastów oraz zamianę przerobu słomy metodą mniej kosztowną z wytwarzaniem włókna jednopostaciowego zamiast dwupostaciowego. Dotychczas nie prowadzono takich badań przy produkcji włókna lnianego. Omawiane badania prowadzono w latach 2011-2012 przy dużym zróżnicowaniu przebiegu temperatury i opadów co pozwalało określić interakcję przebiegu pogody z czynnikami badawczymi na plon włókna. Plony włókna jednopostaciowego w roku suchym były wyższe a w roku o optymalnych opadach niższe w uprawie bezorkowej niż tradycyjnej. Stosowanie herbicydu Chisel 75W9 niezależnie od wysokości opadów i sposobu uprawy przyczyniło się do wzrostu plonu włókna. Wzrost ten wynikał zarówno ze wzrostu plonu słomy jak i procentowej zawartości włókna. Systemy uprawy oraz herbicydy różnicowały długość, masę liniową i podzielność włókna jednopostaciowego oraz jego zanieczyszczenie

Advanced analyses of aerial photography used to determine the range of risk zones for stem base diseases

Celem pracy jest przedstawienie zawansowanych metod analizy obrazu, pozwalających na wektoryzację zdjęć lotniczych. W pracy scharakteryzowano problematykę doboru parametrów pozwalających na najlepsze dopasowanie procesu fragmentacji obrazu do rzeczywistego zagrożenia chorobami podstawy źdźbła, stwierdzonego na polu w uprawie pszenicy ozimej.This study aimed at presenting the methods of advanced image analysis, which enable vectorisation of multispectral aerial photographs. Paper characterized the methodology of selecting the parameters to best matching process of image fragmentation and vectorization to actual risks of culm base diseases, which may be found in a field of winter wheat standing crop. Low altitude aerial photographs are characterized by high resolution; thus, a large scale analysis of the spatial diversity for spectral properties of standing crop within a field were possible. Image vectorization of the aerial photographs by segmentation method, based on registered spectral reflection, showed high efficiency in mapping the stem base disease risk zones. Presented work revealed that the strongest impact on obtained results had an appropriate selection of segmentation parameters; it decides upon the generalization level of maps zones. Depending on the need of detailed study, it is possible to control this parameter. Moreover, the image vectorisation makes possible the elimination of non-plant factor (e.g. technological paths) effect on the mapping process

Cultivation of industrial hemp accelerating reclamation of land degraded by open mining of lignite

Jednym z podstawowych surowców energetycznych w Polsce jest węgiel brunatny. Wydobycie węgla odbywa się metodą odkrywkową. Powoduje to ogromne negatywne zmiany w środowisku naturalnym. Po wydobyciu węgla pozostaje martwe wyrobisko, które w miarę posuwania się odkrywki za złożem wydobywanego węgla, zasypywane jest materiałem z nakładu. Powierzchnia po odkrywce zostaje wyrównana, lecz powstała w ten sposób wierzchnia warstwa terenu cechuje się znikomą zawartością próchnicy. Do rekultywacji obszarów poodkrywkowych można wykorzystać konopie włókniste, których uprawa, a następnie przyorywanie, przyspiesza procesy glebotwórcze. W 2012 r. Instytut Włókien Naturalnych i Roślin Zielarskich wspólnie ze Spółdzielnią Kółek Rolniczych w Kazimierzu Biskupim, rozpoczął realizację projektu pt. „Rekultywacja terenów zdegradowanych w rejonie KWB Konin z zastosowaniem uprawy konopi włóknistych”. Projekt współfinansowany jest przez Unię Europejską w ramach mechanizmu Life+ oraz przez Narodowy Fundusz Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej.One of the main energy sources in Poland is lignite. Lignite is excavated by strip mining method. Unfortunately this method caused huge negative transformations in natural environment. When lignite seam is exhausted, a dead excavations site is left which is next filled with the material initially taken away when accessing the lignite seam – an overburden. In the result, the surface is levelled but the top layer is not normally formed soil, as it contains only trace amounts of humus. Remediation of such land can be done by cultivation of industrial hemp and ploughing the hemp plant matter down which leads to remediation of degraded land. In 2012, the Institute of Natural Fibres and Medicinal Plants, in cooperation with Farmers’ Cooperative in Kazimierz Biskupi initiated a project „Reclamation of Degraded Land in the Region of Lignite Mine in Konin by Cultivation of Industrial Hemp”. The Project is subsidized by the European Commission and the National Fund for Environmental Protection and Water Management. The objective of the Project is reclamation of land by cultivation of two crops in a crop rotation – hemp and alfalfa. At the end of vegetation period plants are ploughed down to supply organic matter and accelerate the formation of soil humus layer

Results of monitoring agricultural drought in winter wheat crops in Poland in the yeras 2008-2010

Celem pracy jest analiza wyników monitoringu suszy w latach 2008-2010 w zasiewach pszenicy ozimej, uzyskanych w Systemie Monitoringu Suszy Rolniczej (SMSR) w Polsce, który jest prowadzony przez Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa - Państwowy Instytut Badawczy (IUNG-PIB) w Puławach. Wynikiem opracowania jest ocena zasięgu obszarów występowania warunków suszy na poziomie gminy. Wykazano, że w latach 2008-2010 największy zasięg występowania suszy w uprawie pszenicy ozimej wystąpił w 2008 r. Oszacowany zasięg odniesiono do strat plonów w województwach.The aim of this study was to analyse the results of drought monitoring in the years 2008-2010 in winter wheat crops obtained from the Agricultural Drought Monitoring System carried out by the Institute of Crops, Fertilisation and Soil Sciences - State Research Institute in Puławy, Poland. This study resulted is the assessment of the range of drought occurrence at a commune level. It was shown that the largest extent of drought occurrences in winter wheat crops was noted in 2008. Estimated range was related to yield losses in voivodships

The Direction of the Antibacterial Effect of Rutin Hydrate and Amikacin

The aim of the presented study was to examine the in vitro antimicrobial activity of rutin hydrate (RH) alone and in combination with amikacin against 12 reference strains of Gram-positive and Gram-negative bacteria. The antibacterial activity assay was evaluated in the concentration range of 2–2048 µg/mL. A serial microdilution method was used to determine the minimal inhibitory concentration (MIC) of the examined compound against reference strains. RH showed varying potential against the tested strains with MICs ranging from 128 to 1024 µg/mL. In order to examine the combinatory profile of RH and amikacin, the fractional inhibitory concentrations (FICs) were determined. The RH–amikacin combination was more active against Gram-negative bacteria where four synergism and two additive interactions were noted. For four out of six Gram-positive isolates, an indifferent effect of RH and amikacin was demonstrated, and for two strains, the tested combination had an additive effect. The results of this study showed that RH possesses antimicrobial potential in vitro towards the tested reference isolates. Moreover, it shows a promising combined effect with amikacin against Gram-negative bacteria

Fundamentals of the agricultural drought monitoring system

Susza w Polsce występuje w ostatnich latach coraz częściej, zwłaszcza od 1992 roku. Jest bardzo ważnym problemem gospodarczym dla całego kraju z powodu dużych strat w plonach, a tym samym przychodów rolnika i przyczyną wzrostu cen artykułów żywnościowych. Większa częstość występowania suszy jest wynikiem obserwowanych w ostatnich latach zmian klimatycznych. W systemie monitoringu suszy rolniczej warunki meteorologiczne, powodujące suszę, są określane za pomocą klimatycznego bilansu wodnego. System został opracowany i wdrożony przez IUNG-PIB na wniosek Ministerstwa Rolnictwa i Rozwoju Wsi. Opracowany system zawiera aplikacje komputerowe, integrujące dane meteorologiczne, potrzebne do obliczenia klimatycznego bilansu wodnego oraz dane z cyfrowej mapy glebowo-rolniczej, obrazującej przestrzenne zróżnicowanie retencji wodnej różnych kategorii agronomicznych gleb. System zawiera narzędzia, służące do oceny suszy dla poszczególnych grup i gatunków roślin uprawnych. Wyniki analiz są prezentowane na stronie internetowej w postaci map oraz tabel. Dla monitorowanych upraw rolniczych opracowywane są dane, przedstawiające zagrożenie suszą dla wszystkich gmin Polski w okresie wegetacyjnym. System monitoringu suszy składa się z bazy danych pogodowych, glebowych, aplikacji GIS do przetwarzania i integracji danych przestrzennych oraz internetowego systemu prezentacji wyników.Drought in Poland appears more frequently in the recent years, particularly since 1992. It is an important economic problem for the whole country since it may bring substantial yield losses, diminished farmers' incomes and a rise of the prices of food products. Increased frequency of droughts is an outcome of climate changes observed recently. In the System of Agricultural Drought Monitoring weather conditions resulting in drought are defined by the climatic water balance. The system ordered by the Ministry of Agriculture and Rural Development was prepared and implemented by the IUNGPIB. It contains computer applications that integrate meteorological data needed for calculating the climatic water balance and data from the digital soil-agricultural map that illustrates spatial differentiation of water retention in soils of different agronomic categories. The system contains tools that are used to assess drought for particular groups and species of crop plants. Results of analyses are presented at a web site in a form of maps and tables. The data presenting the risk of drought during vegetation season are prepared for monitored agricultural crops in all communes of Poland. The system of drought monitoring consists of weather and soil database, of GIS applications to process and integrate spatial data and of the internet system of data presentation