Keskustatoimintojen kortteli osana julkista kaupunkitilaa:suunnitelma Seinäjoen asemakorttelista

Tiivistelmä. Diplomityöni Keskustatoimintojen kortteli osana julkista kaupunkitilaa — Suunnitelma Seinäjoen asemakorttelista on suunnitelmapainotteinen työ, jonka tavoitteena on luoda luonnostasoinen suunnitelma Seinäjoelle rakennettavasta asemakorttelin uudisrakennusten kokonaisuudesta. Lähestyn suunnittelutyötä korttelin julkisuushierarkian näkökulmasta tutkien uudisrakenteisen keskustatoimintojen korttelin roolia julkisen kaupunkitilan jatkeena. Pohdin arkkitehtisuunnittelun näkökulmasta kortteliin sijoittuvien tilojen toiminnallisuutta, ja suunnitteluratkaisuja, jotka palvelevat julkisen kaupunkitilan muodostumista ja siihen liittyvien yksityisempien tilojen tarpeita. Laatimani suunnitelma on henkilökohtainen ehdotukseni asemakorttelin uudisrakentamisesta ja sen tarkoitus on luoda puitteet diplomityöni aiheen tutkimiselle suunnittelutyön kautta. Suunnitelma sisältää asemakeskuksen lisäksi siihen liittyvän perhepalvelukeskuksen, liike- ja toimitilaa sekä asuinrakentamista. Suunnittelutehtävä pohjautuu Seinäjoen kaupungin järjestämään KVR-kilpailuun. Suunnitelmaosuuden lisäksi työni sisältää kirjallisen, suunnitelmaa taustoittavan osan.City block as part of public cityscape : concept plan of Seinäjoki station block. Abstract. My diploma thesis is a plan-focused work which aim is to create a concept design for the new buildings of Seinäjoki railwaystation city block. My concept plan revolves around the theme of public and private spaces and how a city block could be designed to enrich its surrounding public cityscape. I reason my design solutions on functionality and placement of spaces and how theses aspects affect the actualization of public and private space. This design project is a personal proposal for the staton cityblock and it serves as a platform to study and create architectural plan on the theme of public and private space. The station city block includes spaces of a healthcare center, business and office spaces and housing. This design project is based on a joint architecture-contractee competition oraganized during summer 2021 by city of Seinäjoki. I have included a written theory section that discusses the themes of pulic space and its functional aspects that my plan tries to utilise and realise

Asuinkerrostalo Rovaniemelle

Tiivistelmä. Kandidaatintyönäni suunnittelin asuinkerrostalon Rovaniemen keskustan alueelle. Suunnitelma toteutettiin osana yhteisprojektia, joka koostui asemakaavasuunnittelun kurssilla tehdystä aluesuunnitelmasta ja asuntosuunnittelun kurssilla toteutetusta asuinkerrostalon suunnitelmasta, jota jatkotyöstettiin rakennusopin näkökulmasta kerrostalosuunnittelun kurssilla. Kandidaatintyöni keskittyy rakennusopin osuuteen, jossa yhdyskuntasuunnittelu ja nykyaikainen arkkitehtuuri ovat vahvasti mukana. Yhdyskuntasuunnittelun osuus käsittelee Rovaniemen vanhan torin ja linja-autoaseman aluetta, jota Rovaniemen kaupunki tulee kehittämään ja täydennysrakentamaan tulevina vuosina. Aluesuunnitelma toteutettiin ryhmätyönä. Omaan ryhmääni kuuluivat itseni lisäksi Oona Länsisalmi, Erika Salomäki sekä Ossi Hintsala. Aluesuunnitelmamme tavoitteita olivat rakennuskannan tiivistäminen asuinkerrostalokortteleilla, joiden yhteyteen sijoitettiin liiketiloja ja muita palveluita kuten kulttuurikeskus sekä kahvila. Alueen identiteettiä virkistyspaikkana korostettiin lisäämällä puistoalue, joka tarjoaa liikunta- ja ulkoilumahdollisuuksia. Viimeisenä, kulmakiveksi muodostuneeksi tavoitteeksi nimesimme julkisen- ja kevyenliikenteen väylien kehittämisen. Alueen rooli kaupunkia yhdistävänä läpikulkuväylänä on suuri, jonka vuoksi suunnittelimme tarpeelliset pyöräkaistat, alikulut ja sillat lisäämään sujuvaa liikkumista kaupunginosien ja palveluiden välillä. Suunnitelma toteutettiin säilyttävällä otteella ja tukemaan ekologisia vaihtoehtoja kaupungissa liikkumiselle. Aluesuunnitelman valmistuttua siirryttiin yksilötyövaiheeseen asuntosuunnittelun kurssille. Valitsin asuinkerrostaloni paikaksi tontin, jota rajaavat Hallituskatu, Lapinkävijäntie, sekä Valtatie 4. Paikka on keskeisten kulkuväylien ympäröimä ja tarjosi loistavan mahdollisuuden tutkia näkymiä sekä rakennuksen yhtymistä ympäröiviin kulkuväyliin. Asuntosuunnittelun tavoitteena oli tuottaa kerrostalo, johon sisältyy eri kokoisia huoneistoja ja niitä palvelevia säilytys- sekä aputiloja. Halusin toteuttaa modernin, kokonaisvaltaisesti asukkaita palvelevan, asuinkerrostalon. Valitsin kerrostaloni kantavaksi rakenteeksi betonin, sillä uskon sen tuottavan laajasti hyödynnettävän ja helposti sovellettavan ymmärryksen asuntorakentamisesta tulevaisuutta varten. Rakennuksen ulkoverhouksena on ruskeankirjava tiili sekä valkoinen betonikuitulevy, jotka jakavat rakennuksen kattokerroksen kohdalla kahteen selvästi erotettavaan osaan. Detaljit, kuten kaiteet, ovat mustaksi maalattua terästä. Halusin korostaa julkisivuissa monipuolista ja yhdistelevää materiaalien käyttöä yksiaineisen rakentamisen sijasta. Asuntojakauma koostuu 1–4 huoneen huoneistoista, jotka ovat pinta-alaltaan 26–98 m² väliltä. Tavallisten asuntojen lisäksi rakennukseen suunniteltiin myös asuntotyyppi liikuntaesteisille, joka voidaan tilausvaiheessa vaihtaa 3H+K+KH asunnon tilalle. Jokaisessa asunnossa on vähintään sisennetty parveke tai ranskalainen parveke. Ikkuna aukotus on lattiapinnasta alkavaa ja korkeaa tarjoten näkymiä sekä runsaasti luonnonvaloa. Tärkeänä osana suunnitelmaa olivat myös pelastusreitit sekä turvallinen asuminen. Rakennusopin vaiheessa syvennyttiin jatkotyöstämään suunnitelma työkuviksi ja osapiirustuksiksi. Rakennukselle laadittiin myös pihasuunnitelma pelastusteineen. Asuntosuunnittelun kurssilla luomani pohjatyö koki runsaasti muutoksia ja kehitystä tehdessäni teknisiä tilanvarauksia rakennuksessa kulkevalle roiloille, viemäri ja vesiputkille. Ymmärtäessäni kokonaisvaltaisemmin kerrostaloni rakenteellisia vaatimuksia myös asuntojeni toimivuus parani silti samaan aikaan pysyen uskollisena alkuperäiselle konseptilleni. Perehdyin asuinkerrostalon palo- ja ääniteknisen toimivuuteen, sekä rakenne osien liittymiin. Rakennuksesta laadittiin työpiirustukset sekä niitä täydentävät 1:10 detaljikuvat oleellisimmista liittymistä. Pyrin työ- ja osapiirustuksissa selkeään ratkaisuun ja esitykseen. Lopputuloksena kandidaatintyöni tarjoaa laatulähtöisen suunnitelman betonirunkoisen asuinkerrostalon toteutukseen, jossa yhdistyvät rakennusopillinen toimivuus sekä moderni kaupunkikuvallinen arkkitehtuuri. Lukemisen iloa

Dielectrophoresis of nanoscale dsDNA and humidity effects on its electrical conductivity

The dielectrophoresis method for trapping and attaching nanoscale double-stranded DNA between nanoelectrodes was developed. The method gives a high yield of trapping single or a few molecules only which enables transport measurements at the single molecule level. Electrical conductivity of individual 140-nm-long DNA molecules was measured, showing insulating behavior in dry conditions. In contrast, clear enhancement of conductivity was observed in moist conditions, relating to the interplay between the conformation of DNA molecules and their conductivity.Comment: 4 pages, 2 figure

2D-IR Study of a Photoswitchable Isotope-Labeled α-Helix

A series of photoswitchable, α-helical peptides were studied using two-dimensional infrared spectroscopy (2D-IR). Single-isotope labeling with 13C18O at various positions in the sequence was employed to spectrally isolate particular backbone positions. We show that a single 13C18O label can give rise to two bands along the diagonal of the 2D-IR spectrum, one of which is from an amide group that is hydrogen-bonded internally, or to a solvent molecule, and the other from a non-hydrogen-bonded amide group. The photoswitch enabled examination of both the folded and unfolded state of the helix. For most sites, unfolding of the peptide caused a shift of intensity from the hydrogen-bonded peak to the non-hydrogen-bonded peak. The relative intensity of the two diagonal peaks gives an indication of the fraction of molecules hydrogen-bonded at a certain location along the sequence. As this fraction varies quite substantially along the helix, we conclude that the helix is not uniformly folded. Furthermore, the shift in hydrogen bonding is much smaller than the change of helicity measured by CD spectroscopy, indicating that non-native hydrogen-bonded or mis-folded loops are formed in the unfolded ensemble

Wireless Communication Textile Based on Passive UHF RFID

We present a prototype system of a user scenario created in ideation workshops organized for experienced speech therapists working with Augmentative and Alternative Communication (AAC). The goal of the workshops was to create concrete user scenarios for people using AAC, by using the possibilities of Radio Frequency Identification Technology (RFID). Out of the created user scenarios, one was selected to be prototyped and wirelessly evaluated. In this user scenario, a young child with Cerebral Palsy (CP) is sitting in a wheelchair. The child is using Wireless Communication Textile (WCT) patches on the wheelchair table tray to communicate with mother during eating. These WTC patches will create spoken words via a mobile phone application. In this study, we prototyped the user scenario by fabricating the patches with passive Ultra-High Frequency (UHF)RFID technology. Through versatile wireless measurements, we concluded that passive UHFRFID technology with a mobile RFID reader can be used to create a mobile AAC solution for wheelchair users.acceptedVersionPeer reviewe

Spectral Reflectance Processing via Local Wavelength-Direction Correlations

The spectral bidirectional reflectance distribution function (BRDF) maps incident radiation of a surface to its outgoing counterpart at different wavelengths. This function plays a fundamental role in characterizing the various types of earth surfaces. Due to its high dimensionality, the measurements, analysis, and simulation of spectral BRDF are challenging. In this letter, we introduce a new method for processing spectral reflectance using the so-called data-adjacency, i.e., the correlation between adjacent wavelengths and viewing directions. The results show that the benefits of efficient representation, noise reduction, and analysis capability can all be integrated to the data. © 2019 IEEE.This work was supported by the Academy of Finland Consortium Project Albedo under Project 298137 and Project 298139

Excitons in a Photosynthetic Light-Harvesting System: A Combined Molecular Dynamics/Quantum Chemistry and Polaron Model Study

The dynamics of pigment-pigment and pigment-protein interactions in light-harvesting complexes is studied with a novel approach which combines molecular dynamics (MD) simulations with quantum chemistry (QC) calculations. The MD simulations of an LH-II complex, solvated and embedded in a lipid bilayer at physiological conditions (with total system size of 87,055 atoms) revealed a pathway of a water molecule into the B800 binding site, as well as increased dimerization within the B850 BChl ring, as compared to the dimerization found for the crystal structure. The fluctuations of pigment (B850 BChl) excitation energies, as a function of time, were determined via ab initio QC calculations based on the geometries that emerged from the MD simulations. From the results of these calculations we constructed a time-dependent Hamiltonian of the B850 exciton system from which we determined the linear absorption spectrum. Finally, a polaron model is introduced to describe quantum mechanically both the excitonic and vibrational (phonon) degrees of freedom. The exciton-phonon coupling that enters into the polaron model, and the corresponding phonon spectral function are derived from the MD/QC simulations. It is demonstrated that, in the framework of the polaron model, the absorption spectrum of the B850 excitons can be calculated from the autocorrelation function of the excitation energies of individual BChls, which is readily available from the combined MD/QC simulations. The obtained result is in good agreement with the experimentally measured absorption spectrum.Comment: REVTeX3.1, 23 pages, 13 (EPS) figures included. A high quality PDF file of the paper is available at http://www.ks.uiuc.edu/Publications/Papers/PDF/DAMJ2001/DAMJ2001.pd

Excitation energy transfer in native and unstacked thylakoid membranes studied by low temperature and ultrafast fluorescence spectroscopy

In this work, the transfer of excitation energy was studied in native and cation-depletion induced, unstacked thylakoid membranes of spinach by steady-state and time-resolved fluorescence spectroscopy. Fluorescence emission spectra at 5 K show an increase in photosystem I (PSI) emission upon unstacking, which suggests an increase of its antenna size. Fluorescence excitation measurements at 77 K indicate that the increase of PSI emission upon unstacking is caused both by a direct spillover from the photosystem II (PSII) core antenna and by a functional association of light-harvesting complex II (LHCII) to PSI, which is most likely caused by the formation of LHCII-LHCI-PSI supercomplexes. Time-resolved fluorescence measurements, both at room temperature and at 77 K, reveal differences in the fluorescence decay kinetics of stacked and unstacked membranes. Energy transfer between LHCII and PSI is observed to take place within 25 ps at room temperature and within 38 ps at 77 K, consistent with the formation of LHCII-LHCI-PSI supercomplexes. At the 150-160 ps timescale, both energy transfer from LHCII to PSI as well as spillover from the core antenna of PSII to PSI is shown to occur at 77 K. At room temperature the spillover and energy transfer to PSI is less clear at the 150 ps timescale, because these processes compete with charge separation in the PSII reaction center, which also takes place at a timescale of about 150 ps. © 2007 Springer Science+Business Media B.V

Discovering study-specific gene regulatory networks

This article has been made available through the Brunel Open Access Publishing Fund.Microarrays are commonly used in biology because of their ability to simultaneously measure thousands of genes under different conditions. Due to their structure, typically containing a high amount of variables but far fewer samples, scalable network analysis techniques are often employed. In particular, consensus approaches have been recently used that combine multiple microarray studies in order to find networks that are more robust. The purpose of this paper, however, is to combine multiple microarray studies to automatically identify subnetworks that are distinctive to specific experimental conditions rather than common to them all. To better understand key regulatory mechanisms and how they change under different conditions, we derive unique networks from multiple independent networks built using glasso which goes beyond standard correlations. This involves calculating cluster prediction accuracies to detect the most predictive genes for a specific set of conditions. We differentiate between accuracies calculated using cross-validation within a selected cluster of studies (the intra prediction accuracy) and those calculated on a set of independent studies belonging to different study clusters (inter prediction accuracy). Finally, we compare our method's results to related state-of-the art techniques. We explore how the proposed pipeline performs on both synthetic data and real data (wheat and Fusarium). Our results show that subnetworks can be identified reliably that are specific to subsets of studies and that these networks reflect key mechanisms that are fundamental to the experimental conditions in each of those subsets