Population genetics of abnormal haemoglobins in Burkina Faso, West Africa

Les fréquences géniques des hémoglobines A (HbA), HbS et HbC, ont été étudiées au Burkina-Faso (BF) ainsi que dans une région avoisinante du Niger : Ayorou. La fréquence d'HbS est plus élevée dans le Sahel (Nord du BF et Ayorou) que dans la zone de savane. L'inverse est trouvé pour HbC. Les résultats essentiels de ce travail sont : (a) la confirmation d'un pic de la fréquence génique de HbC dans le centre du BF (plateau Mossi); (b) une corrélation négative entre les fréquences de HbS et HbC. Cavalli-Sforza et Bodmer ont observé que cette corrélation atteint une intensité significativement différente de celle qui est attendue, par suite de la relation allélique entre HbS et HbC; (c) la comparaison de ces résultats avec les données rassemblées par Livingstone montre une modification de la valeur sélective des différents génotypes au cours des dernières années. Les individus AS ont une valeur sélective plus basse et les AA et SS en ont une plus haute. Nos données sont favorables à l'hypothèse du relâchement partiel de la sélection dans cette région. (Résumé d'auteur

Binding affinity data of DNA aptamers for therapeutic anthracyclines from microscale thermophoresis and surface plasmon resonance spectroscopy

Anthracyclines like daunorubicin (DRN) and doxorubicin (DOX) play an undisputed key role in cancer treatment, but their chronic administration can cause severe side effects. For precise anthracycline analytical systems, aptamers are preferable recognition elements. Here, we describe the detailed characterisation of a single-stranded DNA aptamer DRN-10 and its truncated versions for DOX and DRN detection. Binding affinities were determined from surface plasmon resonance (SPR) and microscale thermophoresis (MST) and combined with conformational data from circular dichroism (CD). Both aptamers displayed similar nanomolar binding affinities to DRN and DOX, even though their rate constants differed as shown by SPR recordings. SPR kinetic data unravelled a two-state reaction model including a 1 : 1 binding and a subsequent conformational change of the binding complex. This model was supported by CD spectra. In addition, the dissociation constants determined with MST were always lower than that from SPR, and especially for the truncated aptamer they differed by two orders of magnitude. This most probably reflects the methodological difference, namely labelling for MST vs. immobilisation for SPR. From CD recordings, we suggested a specific G-quadruplex as structural basis for anthracycline binding. We concluded that the aptamer DRN-10 is a promising recognition element for anthracycline detection systems and further selected aptamers can be also characterised with the combined methodological approach presented here