Apropriações, conflitos e negociações de gênero, classe e sorologia: etnografando situações e performances no mundo social do HIV/AIDS (Rio de Janeiro)

Considerando o caráter multifacetado e socialmente heterogêneo da epidemia do HIV/AIDS, gostaria de refletir sobre as formas pragmáticas de apropriação, negociação e conflito de gênero em termos das disposições possíveis de masculinidade e feminilidade ou, ainda, suas amplas combinações entre homens e mulheres de diferentes identidades sexuais e diversos status sorológicos. Os contextos a serem explorados e descritos são aqueles particulares ao mundo social da AIDS, incluindo tanto o cotidiano de uma ONG AIDS específica, bem como os que se apresentam em situações tanto públicas como privadas na cidade do Rio de Janeiro. Pretendo discutir como novas subjetividades podem se constituir a partir dos usos de categorias sexuais e sorológicas, valores morais e de expressões performativas de gênero

Automated Feature Engineering for Classification Problems

O estudo sobre geração de features tem aumentado conforme os anos, é um dos maiores desafios para Machine Learning. Totalmente dependente de conhecimento de domínio é uma área que se feita de forma manual consome muito tempo e não é escalável. Por sua vez, meta-learning auxilia o aprendizado através diferentes domínios. Nos apresentamos uma abordagem de automação de geração de features que utiliza o meta-learning como auxílio na seleção de features. Considerando que geramos uma grande quantidade de features, usamos o conhecimento de 100 data sets de diferentes domínios para responder à pergunta se devemos ou não gerar features para um data set e também quais features. Nosso experimento mostrou que é possível utilizar o meta-learning no processo de seleção, podendo nos informar se devemos ou não gerar o conjunto de features automáticas para um determinado data set, obtendo 66.96% de taxa de acerto, enquanto a nossa baseline é de 50%, nos provamos estatisticamente que a nossa taxa de acerto é melhor do que a baseline em 88% dos casos.Infelizmente, não obtivemos um excelente resultado a nível base ao utilizar apenas as features que foram selecionadas individualmente, porém ao nível meta obtemos um resultado de 65.52% de taxa de acerto ao prever quais features individuais supostamente trariam melhora na performance do modelo. Considerando que a nossa baseline é de 39%, nos estatisticamente provamos que nossa taxa de acerto é melhor que a baseline em 93% dos casos.Os resultados nos mostram que meta-learning pode ser utilizado no auxílio de geração e seleção de features, entretanto a nossa abordagem ainda pode ser aprimorada sendo mais assertiva nas previsões a nível meta e melhores resultados a nível base. Nosso código esta disponível em https://github.com/guifeliper/automated-feature-engineering.The study on feature generation has grown over the last years, is one of the biggest challenges for Machine Learning. Entirely dependent on domain knowledge, it is an area that if done manually, is time-consuming and not scalable. In turn, meta-learning helps to learn through different domains and can bring benefits to this area.We present an automated feature engineering approach that uses meta-learning as an assistant in the selection of features. Considering that we generate a large number of features, we use the knowledge of 100 data sets from different domains to answer the question of whether or not to create features for a data set and also what features to use.Our experiment showed that it is possible to use meta-learning in the selection process, and can inform us whether or not we should generate the set of automatic features for a given data set, obtaining 66.96% of accuracy, while the overall baseline is 50% and statistically, our accuracy is proved to be better than the baseline at 88% of the cases.Unfortunately, we did not get an excellent result in the base level by using only the features that were selected individually, but at the meta level, we get a 65.52% of accuracy, when predicting which individual features would supposedly bring improve for the performance. Considering that our overall baseline is 39%, we statistically proved that our accuracy is better than the baseline at 93% of the cases.The results show that meta-learning can be used to aid the generation and selection of features. However, our approach can still be improved, being more precise in the predictions at the meta-level and better results at the base level. Our code is available at https://github.com/guifeliper/automated-feature-engineering

Doença, ativismo biossocial e cidadania terapêutica: a emergência da mobilização de pessoas com HTLV no Brasil

O artigo aborda a emergência da mobilização social e política de pessoas infectadas pelo HTLV, na década de 2000. Com fortes vínculos com o ativismo de HIV/Aids, pessoas com HTLV e seus grupos e organizações engendraram práticas sociais, discursos e identidades que contribuem para se pensar em termos teóricos e históricos sobre a questão das biossocialidades e da cidadania terapêutic

5-aza-2cdr promove desmetilação do MGMT e modifica expressão de diferentes genes nas células SCC-9

Orientador: Ana Paula de SouzaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de PiracicabaResumo: O câncer de cabeça e pescoço é a sexta neoplasia mais frequente no mundo sendo que mais de 90% são do tipo carcinoma escamoso. O carcinoma escamoso oral surge de uma desdiferenciação maligna das células do estrato espinhoso do epitélio da mucosa oral e é geralmente associada ao consumo de cigarro e/ou bebidas alcoólicas. O surgimento dessa neoplasia pode estar associado com a presença de mutações genéticas, bem como, com a presença de eventos epigenéticos, como a metilação do DNA. Na tentativa de reverter a metilação do DNA, a droga desmetilante 5-aza-2¿-deoxycitidina (5-aza-2CdR), formulada em 1968, foi inicialmente utilizada no tratamento de leucemias e de síndromes mielodisplásicas. No entanto, o uso dessa substância em tumores sólidos passou a ser liberado em meados de 2015 e, assim, pouco ainda se sabe sobre sua ação no carcinoma oral. A fim de abordar essa questão, investigamos o efeito do agente desmetilante 5-aza-2CdR em células da linhagem SCC-9 como também seu efeito sobre a expressão dos genes supressores tumorais MGMT, APC e BRCA1 e dos oncogenes cMYC e hTERT. Para isso, células SCC-9 foram tratadas com 5-aza-2CdR na concentração de 0,3µM ou 2µM, durante 24 horas ou 48 horas. Foi realizado o teste MTT para análise da citotoxicidade das doses empregadas e observamos que, em ambos tempos, a concentração de 2?M foi citotóxica. Usando a técnica de análise de melting (MS-HRM), nossos resultados mostraram que 5-aza-2CdR provocou uma desmetilação parcial no promotor do gene MGMT após 48 horas de tratamento o que não foi observado para o gene hTERT que se manteve hipermetilado. Os demais genes analisados BRCA1, APC e cMYC foram observados originalmente desmetilados na região analisada em células SCC-9. Quanto à transcrição que foi analisada por PCR tempo real, os genes supressores de tumores MGMT, APC e BRCA1 foi positivamente regulada enquanto a expressão do gene cMYC foi negativamente regulada nas células expostas à droga por 48h. Em contrapartida, o gene hTERT mostrou uma diminuição da expressão que foi seguida por uma recuperação na expressão no tempo de 48horas. Os resultados também mostraram que a expressão gênica dos genes supressores tumorais sofreu aumento ainda mais significante quando as células foram expostas à dose menor da droga (0,3µM). Dessa forma, concluímos que a aplicação do agente desmetilante 5-aza-2cdr em baixa concentração aumentou a expressão dos genes supressores tumorais (MGMT, APC e BRCA1 ) e diminuiu a expressão do proto-oncogene cMYC em células de carcinoma espinocelular de oralAbstract: Head and neck cancer is the sixth most frequent neoplasm in the world, with more than 90% representing squamous cell carcinoma. Oral squamous cell carcinoma arises from a malignant dedifferentiation of epithelium cells generally associated with the consumption of cigarettes and alcoholic beverages. This tumor is characterized by an accumulation of mutations and epigenetic alterations, including DNA methylation. To reverse DNA methylation, 5-aza-2'-deoxycytidine was formulated in 1968, and initially it was used in leukemias and myelodysplastic syndrome treatment. The use in solid tumors was released in 2015 and, therefore, little is known about its action in oral cancer. In order to address this issue, we investigated the effect of demethylating agent 5-aza-2'-deoxycytidine in SCC9 cells as well as the effects on transcription the tumor suppressor genes MGMT, APC and BRCA1 and oncogenes cMYC and hTERT. SCC-9 cells were exposed to 5-aza-2'-deoxycytidine at concentrations of 0.3 µM or 2 µM during 24 hours or 48 hours. After, high resolution melting analysis (MS-HRM) was performed in order to determinate genes methylation pattern. Results showed partial demethylation of the MGMT gene after 48 hours of 5-aza-CdR treatment. No difference was observed in hTERT gene that remained hypermethylated. The other genes BRCA1, APC and cMYC were found orinally demethylated in the analyzed region. Tumor suppressor genes MGMT, APC and BRCA1 were up regulated and oncogene cMYC was down regulated after 48h of 5-aza-2CdR treatment. Our results also showed that transcription of tumor suppressors genes was significantly increased in cells exposed to lower dose of drug (0.3µM). Thus, we concluded that the low concentration of 5-aza-2cdr demethylating agent increased the expression of tumor suppressor genes (MGMT, APC and BRCA1) and decreased cMYC proto-oncogene expression in oral squamous cell carcinoma cellsMestradoHistologia e EmbriologiaMestre em Biologia Buco-Dental2015/24749-6FAPES

Biosynthesis scale-up of human soluble catechol-O-methyltransferase

Catechol-O-methyltransferase (COMT, EC 2.1.1.6) was first described in 1958. It is a Sadenosyl-L-methionine (SAM) dependent methyltransferase which catalyses the methylation of catechol substrates (catecholamines, catecholestrogens). This enzyme has several important functions in the body, acting as a barrier between the blood and various organs, through the elimination of toxic or biologically active catechols. COMT plays a particularly important role in the brain, where it participates in the metabolism of the neurotransmitter dopamine, and so its role in neurodegenerative diseases is extremely relevant, especially in Parkinson's disease. In recent years, several COMT inhibitors have been developed for Parkinson's disease treatment, and there is considerable interest in developing new and more effective inhibitors. To do so, large amounts of COMT in an active form are necessary, and the best way to achieve this is by up-scaling its production through biotechnological processes. In this work, we propose a fed-batch process for biosynthesis scale-up of the soluble isoform of COMT, using an Escherichia coli expression system for the production of the soluble isoform of this protein, testing various fermentation conditions and controlling various parameters during the process. After several different batch and fed-batch experiments, the selected fermentation conditions were 20% dissolved oxygen, an initial batch concentration of 20 g/L of glycerol and tryptone, and a constant feed of 1 g glycerol/L/h, achieving a final specific COMT activity of 442.34 nmol/h/mg. Cell viability was monitored by flow cytometry and glycerol concentration by an HPLC system.A proteína catecol-O-metiltransferase (COMT, CE 2.1.1.6) foi descrita pela primeira vez em 1958. É uma enzima metiltransferase dependente da S-adenosil-L-metionina (SAM) que catalisa a metilação de substratos catecólicos (catecolaminas, catecolestrogénios). Esta enzima desempenha várias funções importantes no organismo, funcionando como uma barreira entre o sangue e diversos orgãos, através da eliminação de catecóis biológicamente activos ou tóxicos. A enzima COMT desempenha ainda uma função particularmente importante no cérebro, onde participa no metabolismo do neurotransmissor dopamina, pelo que o seu papel nas doenças neurodegenerativas é extremamente relevante, nomeadamente na doença de Parkinson. Esta deonça é caracterizada pela perda progressive de neurónios libertadores de dopamina, levando a uma diminuição acentuada dos níveis deste neurotransmissor no cérebro. Nesta patologia, um dos principais alvos terapêuticos é a enzima COMT, já que a sua ação é indesejável nos pacientes portadores desta doença. Nos últimos anos têm vindo a ser desenvolvidos vários inibidores desta enzima para o tratamento da doença de Parkinson, e há um grande interesse em desenvolver novos inibidores mais eficazes. Para tal, são necessárias grandes quantidades de COMT numa forma activa, e a melhor maneira de o conseguir é a sua produção em larga escala através de processos biotecnológicos. Neste trabalho é proposto um processo de produção em larga escala da isoforma solúvel da COMT, utilizando o sistema de expressão Escherichia coli para a biosíntese da isoforma solúvel desta proteína e testando várias condições de fermentação, com o objectivo de estabelecer um processo de fermentação descontínuo com posterior fornecimento de substrato, controlando vários parâmetros durante esta fase. As condições de fermentação escolhidas, após terem sido testadas em processos de fermentação contínuos, foram uma percentagem de oxigénio dissolvido de 20%, uma concentração de 20 g/L das fontes de carbono e azoto (glicerol e triptona, respectivamente), e por fim, um perfil de adição de substrato no processo de alimentação de 1 g glicerol/L/h. Os resultados finais foram uma densidade óptica máxima de aproximadamente 50 e uma actividade enzimática especifica de 442.34 nmol/h/mg

Em busca da construção de uma escola reflexiva:relatando uma parceria entre universidade e escola

Neste artigo narramos o processo de construção do projeto «Escola Singular: Ações Plurais», desenvolvido em uma escola pública de Campinas(SP – Brasil), que surge a partir de uma parceria entre a Faculdade de Educação da Universidade Estadual de Campinas com a Escola Municipal de Ensino Fundamental Padre Francisco Silva. A partir de discussões, dilemas, leituras, acontecidas nos espaços de reflexão coletiva da escola referida, encontros dos quais participam a equipe de gestão, os professores da escola e a universidade, decidiu-se por uma mudança na estrutura, organização e currículo da escola. A pareceria entre a escola e a universidade, a partir do ano 2003, teve como objetivo a melhoria da educação pública. O Projeto é financiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa no estado de São Paulo (Fapesp).In this article we refer to the construction process of the «Escola Singular: Ações Plurais» (Singular School: Plural Actions) project, which is developed by a public school located in Campinas (SP – Brasil). This is the result of a partnership between Faculty of Education of Universidade Estadual de Campinas and theMunicipal School of Primary Teaching of Padre Francisco Silva. Through topic discussions, dilemmas and readings which happened at the provided reflection spaces of the school and university, it was decided to change the structure, organization and curriculum of the school. Since 2003 the partnership between the school and university has had as its main goal the improvement of public education. This project is financed by Fundação de Amparo à Pesquisa no estado de São Paulo (Fapesp)

Comunidade virtual de práticas de formador de formadores: um convite à escrita de narrativas de experiências vividas

A criação de uma comunidade virtual de práticas de formador de formadores faz parte de uma investigação narrativa de doutorado, em processo, que tem como um dos objetivos (re)colher narrativas de formador de formadores a fim de organizar uma coleção de registros que possa ser fonte de conhecimento para esses (e desses) profissionais. Os formadores, assim como professores e profissionais da educação, sempre têm boas histórias para contar, mas nem sempre as registram ou partilham. Há narrativas inspiradoras e felizes; outras inspiradoras e tristes; algumas nada inspiradoras, mas muito potentes para se refletir sobre a atuação e as condições de trabalho oferecidas a esse profissional dentro de programas de formação continuada, entre outros aspectos. Consideramos que há muito a se descobrir pela voz de formador de formadores, e que é possível ampliar o corpus de conhecimento sobre esse profissional e seu campo de atuação, uma vez que há pouca literatura sobre esse tema. Para acessar essas histórias se fez necessário criar um dispositivo que viabilizasse e mobilizasse a escrita de produções de saberes experienciais numa dimensão narrativa e formativa. Neste texto pretendemos compartilhar o processo de criação e administração de um grupo privado em rede social – no recorte de seus dois primeiros meses de funcionamento – e o que temos aprendido e refletido como investigadores narrativos a partir do movimento de elaboração e acompanhamento de postagens e reações no grupo