Verfahren und Vorrichtung zum Erstellen einer Mikroskopiepanoramadarstellung

Ausführungsbeispiele der vorliegenden Erfindung beziehen sich auf ein Verfahren zur Erstellung einer Mikroskopiedarstellung einer dreidimensionalen Probe mit flacher Ausdehnung in x und y Richtung. Das Verfahren umfasst folgende Schritte: a) Anordnen der flachen, dreidimensionalen Probe auf einen Positionierer; b) Aufnehmen der Probe mittels einer Bilderfassungsvorrichtung, um eine erste Mikroskopieaufnahme der Probe mit einem ersten Ausschnitt zu erhalten; c) Ändern (106) der Perspektive auf die zweidimensionale Probe in z-Richtung; d) Aufnehmen der Probe mittels der Bilderfassungsvorrichtung, um eine zweite Mikroskopieaufnahme der Probe mit einem zweiten Ausschnitt zu erhalten; e) Ermitteln einer Veränderungsinformation, die einen Rückschluss auf die Veränderung der Perspektive in z-Richtung zulässt, anhand eines Unterschieds zwischen der ersten und der zweiten Mikroskopieaufnahme; und f) Zusammenfügen der ersten und der zweiten Mikroskopieaufnahme unter Berücksichtigung der Veränderungsinformation, um die Mikroskopiepanoramadarstellung zu erhalten

Automated plasmodia recognition in microscopic images for diagnosis of malaria using convolutional neural networks

Malaria is one of the world's most common and serious tropical diseases, caused by parasites of the genus plasmodia that are transmitted by Anopheles mosquitoes. Various parts of Asia and Latin America are affected but highest malaria incidence is found in Sub-Saharan Africa. Standard diagnosis of malaria comprises microscopic detection of parasites in stained thick and thin blood films. As the process of slide reading under the microscope is an error-prone and tedious issue we are developing computer-assisted microscopy systems to support detection and diagnosis of malaria. In this paper we focus on a deep learning (DL) approach for the detection of plasmodia and the evaluation of the proposed approach in comparison with two reference approaches. The proposed classification schemes have been evaluated with more than 180,000 automatically detected and manually classified plasmodia candidate objects from so-called thick smears. Automated solutions for the morphological analysis of malaria blood films could apply such a classifier to detect plasmodia in the highly complex image data of thick smears and thereby shortening the examination time. With such a system diagnosis of malaria infections should become a less tedious, more reliable and reproducible and thus a more objective process. Better quality assurance, improved documentation and global data availability are additional benefits