Ego-graph based exploration of semantic knowledge graphs

Wissensgraphen erfreuen sich in der Forschung großer Beliebtheit, da sie Weltwissen repräsentieren. Um diese riesigen Strukturen für den Menschen verständlich aufzubereiten ist ein weit verbreiteter Ansatz, der des Knoten-Kanten Diagramms. Diese Diagramme werden häufig durch kräfte-basierte Layoutalgorithmen generiert. Ein Nachteil dabei, ist die zunehmende Unübersichtlichkeit des Diagramms, bei immer größer werdenden Graphen. Dabei gibt es durchaus Szenarien, in denen man nicht am gesamten Graphen interessiert ist, sondern nur an einzelnen Knoten und deren Nachbarn. In dieser Arbeit wird ein inkrementelles Verfahren vorgestellt, in welchem nicht der gesamte Graph visualisiert wird, sondern erst mal nur ein ausgewählter Startknoten. Ausgehend von diesem Startknoten ist es möglich, Nachbarknoten manuell zu expandieren und der Visualisierung hinzuzufügen. Die Auswahl der Knoten wird dabei den Nutzer*innen überlassen und findet mit Hilfe eines Knoten-basierten Menüs statt, in dem Nachbarknoten nach Kategorien ausgewählt werden können. Für die Umsetzung dieser Ego-Graph-basierten Exploration wurden mehrere verwandte Arbeiten untersucht, die eine ähnliche Herangehensweise vorgestellt haben. Daraus wurde dann experimentell ein eigener webbasierter Prototyp entworfen

Understanding metabolism of arginine in biological systems via MALDI imaging

Arginine is an important amino acid but has been barely studied in plants. The little research that has been done indicates that the pathways of synthesis are similar to those found in animals and procaryotes. However little is known about the cellular and tissue localization of the amino acid in plants. The research reported in this paper was designed to examine whether MALDI-MSI was sufficiently sensitive to examine the distribution of this amino acid in plant material, and whether the synthetic pathways were co-located. In wheat and orchid roots, the amount of arginine in tissues varies greatly and the pathways for its synthesis were not always detected with the amino acid

Linamarase Expression in Cassava Cultivars with Roots of Low- and High-Cyanide Content

This paper reports the expression and localization of linamarase in roots of two cassava (Manihot esculenta Crantz) cultivars of low and high cyanide. Two different patterns of linamarase activity were observed. In the low-cyanide type, young leaves displayed very high enzyme activity during the early plant growing stage (3 months), whereas in root peel, the activity increased progressively to reach a peak in 11-month-old plants. Conversely, in the high-cyanide cultivar (HCV), root peel linamarase activity decreased during the growth cycle, whereas in expanded leaves linamarase activity peaked in 11-month-old plants. The accumulation of linamarin showed a similar pattern in both cultivars, although a higher concentration was always found in the HCV. Linamarase was found mainly in laticifer cells of petioles and roots of both cultivars with no significant differences between them. At the subcellular level, there were sharp differences because linamarase was found mainly in the cell walls of the HCV, whereas in the low-cyanide cultivar, the enzyme was present in vacuoles and cell wall of laticifer cells. Reverse transcriptase-PCR on cassava tissues showed no expression of linamarase in cassava roots, thus, the transport of linamarase from shoots to roots through laticifers is proposed