2 research outputs found
Machine Learning Prediction of Mycobacterial Cell Wall Permeability of Drugs and Drug-like Compounds
- Publication venue
- 'MDPI AG'
- Publication date
- 01/01/2023
- Field of study
The cell wall of Mycobacterium tuberculosis and related organisms has a very complex and unusual organization that makes it much less permeable to nutrients and antibiotics, leading to the low activity of many potential antimycobacterial drugs against whole-cell mycobacteria compared to their isolated molecular biotargets. The ability to predict and optimize the cell wall permeability could greatly enhance the development of novel antitubercular agents. Using an extensive structure–permeability dataset for organic compounds derived from published experimental big data (5371 compounds including 2671 penetrating and 2700 non-penetrating compounds), we have created a predictive classification model based on fragmental descriptors and an artificial neural network of a novel architecture that provides better accuracy (cross-validated balanced accuracy 0.768, sensitivity 0.768, specificity 0.769, area under ROC curve 0.911) and applicability domain compared with the previously published results
Report from the Multi-Messenger Working Group at UHECR-2014 Conference
- Author
- Aab A.
- Aartsen M. G.
- Abbasi R. U.
- Abe M.
- Abreu P.
- Abu-Zayyad T.
- Ackermann M.
- Adams J.
- Aglietta M.
- Aguilar J. A.
- Ahlers M.
- Ahn E. J.
- Ahrens M.
- Al Samarai I.
- Albuquerque I. F. M.
- Allekotte I.
- Allen M.
- Allison P.
- Almela A.
- Altmann D.
- Alvarez Castillo J.
- Alvarez-Muñiz J.
- Ambrosio M.
- Anastasi G. A.
- Anchordoqui L.
- Anderson T.
- Andrada B.
- Andringa S.
- Aramo C.
- Archinger M.
- Arguelles C.
- Arlen T. C.
- Arqueros F.
- Arsene N.
- Asorey H.
- Assis P.
- Aublin J.
- Auffenberg Jan
- Avila G.
- Azuma R.
- Badescu A. M.
- Bai X.
- Balaceanu A.
- Barcikowski E.
- Barwick S. W.
- Baum V.
- Baus C.
- Bay R.
- Beatty J. J.
- Beatty J. J.
- Becker Tjus J.
- Becker K. H.
- Becker K.-H.
- Bellido J. A.
- Belz J. W.
- BenZvi S.
- Berat C.
- Berghaus P.
- Bergman D. R.
- Berley D.
- Bernardini E.
- Bernhard A.
- Bertaina M. E.
- Bertou X.
- Besson D. Z.
- Biermann P. L.
- Billoir P.
- Binder G.
- Bindig D.
- Bissok M.
- Biteau J.
- Blaess S. G.
- Blake S. A.
- Blanco A.
- Blaufuss E.
- Blazek J.
- Bleve C.
- Blumenthal J.
- Boersma D. J.
- Bohm C.
- Boháčová M.
- Boncioli D.
- Bonifazi C.
- Borodai N.
- Bos F.
- Bose D.
- Botner O.
- Botti A. M.
- Brack J.
- Brancus I.
- Brayeur L.
- Bretz H.-P.
- Bretz Thomas
- Bridgeman A.
- Briechle Florian Lukas
- Brown A. M.
- Buchholz P.
- Bueno A.
- Buitink S.
- Buscemi M.
- Buzinsky N.
- Börner M.
- Böser S.
- Caballero-Mora K. S.
- Caccianiga B.
- Caccianiga L.
- Cady R.
- Cancio A.
- Canfora F.
- Caramete L.
- Caruso R.
- Casey J.
- Casier M.
- Castellina A.
- Cataldi G.
- Cazon L.
- Cester R.
- Chae M. J.
- Chavez A. G.
- Cheon B. G.
- Cheung E.
- Chiavassa A.
- Chiba J.
- Chikawa M.
- Chinellato J. A.
- Chirkin D.
- Cho W. R.
- Christov A.
- Christy B.
- Chudoba J.
- Clark K.
- Classen L.
- Clay R. W.
- Coenders S.
- Colalillo R.
- Coleman A.
- Collica L.
- Coluccia M. R.
- Conceição R.
- Contreras F.
- Cooper M. J.
- Coutu S.
- Covault C. E.
- Cowen D. F.
- Cronin J.
- D'Amico S.
- D'Olivo J. C.
- Dalliere R.
- Daniel B.
- Dasso S.
- Daughhetee J.
- Daumiller K.
- Davis J. C.
- Dawson B. R.
- Day M.
- de Almeida R. M.
- de André J. P. A. M.
- De Clercq C.
- de Jong S. J.
- De Mauro G.
- de Mello Neto J. R. T.
- De Mitri I.
- de Oliveira J.
- De Ridder S.
- de Souza V.
- de Vries K. D.
- de Wasseige G.
- de With M.
- Debatin J.
- Deligny O.
- Dembinski H.
- Desiati P.
- DeYoung T.
- Diogo F.
- Dobrigkeit C.
- Dorofeev A.
- dos Anjos R. C.
- Dova M. T.
- Dumm J. P.
- Dundovic A.
- Dunkman M.
- DĂaz Castro M. L.
- DĂaz-VĂ©lez J. C.
- Eagan R.
- Eberhardt B.
- Ebr J.
- Ehrhardt T.
- Eichmann B.
- Eisch J.
- Enge R.
- Erdmann Martin
- Erfani M.
- Escobar C. O.
- Espadanal J.
- Etchegoyen A.
- Euler S.
- Evenson P. A.
- Fadiran O.
- Falcke H.
- Fang K.
- Farrar G.
- Fauth A. C.
- Fazely A. R.
- Fazzini N.
- Fedynitch A.
- Feintzeig J.
- Felde J.
- Fick B.
- Figueira J. M.
- Filevich A.
- Filimonov K.
- FilipÄŤiÄŤ A.
- Finley C.
- Fischer-Wasels T.
- Flis S.
- Fratu O.
- Freire M. M.
- Fuchs T.
- Fujii T.
- Fujii T.
- Fukushima M.
- Fuster A.
- Gaior R.
- Gaisser T. K.
- Gallagher J.
- Garcia-Pinto D.
- GarcĂa B.
- Gaté F.
- Gemmeke H.
- Gerhardt L.
- Gherghel-Lascu A.
- Ghia P. L.
- Giaccari U.
- Giammarchi M.
- Gier D.
- Giller M.
- Giulio C. Di
- Gladstone L.
- Glagla M.
- Glaser Jens Christian
- Glass H.
- GlĂĽsenkamp T.
- Goldschmidt A.
- Golup G.
- Golup G.
- Gonzalez J. G.
- González N.
- Goodman J. A.
- Gookin B.
- Gordon J.
- Gorgi A.
- Gorham P.
- Goto T.
- Gouffon P.
- Grant D.
- Gretskov Pavel
- Grillo A. F.
- Groh J. C.
- GroĂź A.
- Grubb T. D.
- Guarino F.
- Guedes G. P.
- GĂłmez Berisso M.
- GĂłmez Vitale P. F.
- GĂłra D.
- GĹ‚as D.
- Ha C.
- Haack Christian
- Hallgren A.
- Halzen F.
- Hampel M. R.
- Hanlon W.
- Hansen P.
- Hansmann Tim Sebastian
- Hanson K.
- Harari D.
- Harrison T. A.
- Harton J. L.
- Hasankiadeh Q.
- Haungs A.
- Hayashi Y.
- Hayashida N.
- Hebbeker Thomas
- Hebecker D.
- Heck D.
- Heereman D.
- Heimann P.
- Helbing K.
- Hellauer R.
- Hellwig Denise
- Heros C. PĂ©rez de los
- Herve A. E.
- Hibino K.
- Hickford S.
- Hignight J.
- Hill G. C.
- Hill G. C.
- Hoffman K. D.
- Hoffmann R.
- Hojvat C.
- Holt E.
- Homeier A.
- Homola P.
- Honda K.
- Horvath P.
- Hoshina K.
- HrabovskĂ˝ M.
- Huang F.
- Huber M.
- Huege T.
- Huelsnitz W.
- Hulsman J.
- Hulth P. O.
- Hultqvist K.
- Hörandel J. R.
- IceCube Collaboration
- Ikeda D.
- In S.
- Inoue N.
- Insolia A.
- Isar P. G.
- Ishihara A.
- Ishii T.
- Ishimori R.
- Ismail A. Haj
- Ito H.
- Ivanov D.
- Jacobi E.
- Jacobsen J.
- Jandt I.
- Jansen S.
- Japaridze G. S.
- Jero K.
- Johnsen J. A.
- Josebachuili M.
- Jui C. C. H.
- Jurkovic M.
- Kadota K.
- Kakimoto F.
- Kalashev O.
- Kambeitz O.
- Kaminsky B.
- Kampert K. H.
- Kappes A.
- Karg T.
- Karg Timo
- Karle A.
- Kasahara K.
- Kasper P.
- Katkov I.
- Kauer M.
- Kawai H.
- Kawakami S.
- Kawana S.
- Kawata K.
- Keilhauer B.
- Keivani A.
- Kelley J. L.
- Kemp E.
- Kemp Julian
- Kheirandish A.
- Kido E.
- Kieckhafer R. M.
- Kim H. B.
- Kim J. H.
- Kim J. H.
- Kiryluk J.
- Kitamura S.
- Kitamura Y.
- Klages H. O.
- Kleifges M.
- Klein S. R.
- Kleinfeller J.
- Kläs J.
- Kohnen G.
- Kolanoski H.
- Konietz Richard
- Koob A.
- Kopper C.
- Kopper S.
- Koskinen D. J.
- Kowalski M.
- Krause Raphael
- Krings K.
- Krohm N.
- Kroll G.
- Kroll M.
- Kukec Mezek G.
- Kunka N.
- Kunnen J.
- Kuotb Awad A. M.
- Kurahashi N.
- Kuwabara T.
- Kuzmin V.
- Kwon Y. J.
- Kääpä A.
- Köpke L.
- KĂĽmpel Daniel
- Labare M.
- LaHurd D.
- Lan J.
- Lanfranchi J. L.
- Larsen D. T.
- Larson M. J.
- Latronico L.
- Lauscher Markus
- Lautridou P.
- Lebrun P.
- Legumina R.
- Leigui de Oliveira M. A.
- Lesiak-Bzdak M.
- Letessier-Selvon A.
- Leuermann Martin
- Leuner J.
- Lhenry-Yvon I.
- Lim S. I.
- Link K.
- Lopes L.
- Luce Q.
- Lucero A.
- Lundquist J. P.
- LĂłpez Casado Aida
- LĂłpez R.
- LĂĽnemann J.
- Machida K.
- Madsen J.
- Maggi G.
- Mahn K. B. M.
- Malacari M.
- Mallamaci M.
- Mandat D.
- Mantsch P.
- Mariazzi A. G.
- MariĹź I. C.
- Marsella G.
- Martello D.
- Martens K.
- Martinez H.
- MartĂnez Bravo O.
- Maruyama R.
- Mase K.
- MasĂas Meza J. J.
- Mathes H. J.
- Mathys S.
- Matis H. S.
- Matsuda T.
- Matsuyama T.
- Matteo A. Di
- Matthews J.
- Matthews J. A. J.
- Matthews J. N.
- Matthiae G.
- Maunu R.
- Mayotte E.
- Mazur P. O.
- McNally F.
- Meagher K.
- Medici M.
- Medina C.
- Medina-Tanco G.
- Meli A.
- Melo D.
- Menne T.
- Menshikov A.
- Merino G.
- Messina S.
- Meures T.
- Miarecki S.
- Micheletti M. I.
- Middell E.
- Middendorf Lukas
- Middlemas E.
- Miller J.
- Minamino M.
- Minaya I. A.
- Miramonti L.
- Mitrica B.
- Mockler D.
- Mohrmann L.
- Molina-Bueno L.
- Mollerach S.
- Montanet F.
- Montaruli T.
- Morello C.
- Morse R.
- Mostafá M.
- Mukai Y.
- Muller M. A.
- Myers I.
- MĂĽller Gero
- MĂĽller S.
- Nagasawa K.
- Nagataki S.
- Nahnhauer R.
- Nakamura T.
- Naranjo I.
- Naumann U.
- Navas S.
- Nellen L.
- Neuser J.
- Nguyen P. H.
- Niculescu-Oglinzanu M.
- Niechciol M.
- Niederhausen H.
- Niemietz L.
- Niggemann Tim
- Nitz D.
- Nonaka T.
- Nosek D.
- Novotny V.
- Nowicki S. C.
- Nozato A.
- NoĹľka H.
- Nygren D. R.
- Núñez L. A.
- O'Murchadha A.
- Obertacke A.
- Ochilo L.
- Ogio S.
- Ogura J.
- Ohnishi M.
- Ohoka H.
- Oikonomou F.
- Oki K.
- Okuda T.
- Olinto A.
- Olivas A.
- Omairat A.
- Ono M.
- Oshima A.
- Ozawa S.
- Pakk Selmi-Dei D.
- Palatka M.
- Palczewski T.
- Pallotta J.
- Papenbreer P.
- Parente G.
- Park I. H.
- Parra A.
- Paul Larissa
- Paul T.
- Pech M.
- Pedreira F.
- Pelayo R.
- Pepper J. A.
- Pera L. del
- Pereira L. A. S.
- Perrone L.
- Peters Christine
- Petrera S.
- Peña-Rodriguez J.
- Pfendner C.
- Phuntsok J.
- Piegaia R.
- Pieloth D.
- Pierog T.
- Pieroni P.
- Pierre Auger Collaboration
- Pimenta M.
- Pinat E.
- Pirronello V.
- Platino M.
- Plum Matthias
- Porowski C.
- Posselt J.
- Prado R. R.
- Price P. B.
- Privitera P.
- Prouza M.
- Przybylski G. T.
- Pshirkov M. S.
- PĂĽtz J.
- Pękala J.
- Quel E. J.
- Querchfeld S.
- Quinn S.
- Quinnan M.
- Rameez M.
- Ramos-Pollant R.
- Rautenberg J.
- Ravel O.
- Ravignani D.
- Rawlins K.
- Redl P.
- Rees I.
- Reimann René
- Reinert Darius
- Relich M.
- Resconi E.
- Revenu B.
- Rhode W.
- Richman M.
- Ridky J.
- Riedel B.
- Risse M.
- Ristori P.
- Rizi V.
- Robertson S.
- Rodrigues de Carvalho W.
- Rodrigues J. P.
- Rodriguez Fernandez G.
- Rodriguez Rojo J.
- Rodriguez D. C.
- RodrĂguez-FrĂas M. D.
- Rogozin D.
- Rongen Martin
- Rosado J.
- Roth M.
- Rott C.
- Roulet E.
- Rovero A. C.
- Rubtsov G.
- Rubtsov Grigory
- Ruhe T.
- Ruzybayev B.
- Ryckbosch D.
- Ryu D.
- Rädel Leif
- Saba S. M.
- Saffi S. J.
- Saftoiu A.
- Sagawa H.
- Sakurai N.
- Salazar H.
- Saleh A.
- Salesa Greus F.
- Salina G.
- Sanabria Gomez J. D.
- Sanchez-Lucas P.
- Sander H.-G.
- Sandrock A.
- Sandroos J.
- Santander M.
- Santos E.
- Santos E. M.
- Sarazin F.
- Sarkar B.
- Sarkar S.
- Sarmento R.
- Sarmiento-Cano C.
- Sato R.
- Scarso C.
- Schatto K.
- Schauer M.
- Scheriau F.
- Scherini V.
- Schieler H.
- Schimp M.
- Schmidt D.
- Schmidt T.
- Schmitz M.
- Schoenen Sebastian
- Scholten O.
- Schovánek P.
- Schröder F. G.
- Schukraft A.
- Schulte L.
- Schulz A.
- Schulz J.
- Schulz O.
- Schumacher Johannes
- Schöneberg S.
- Schönwald A.
- Sciutto S. J.
- Scott L. M.
- Seckel D.
- Segreto A.
- Sestayo Y.
- Settimo M.
- Seunarine S.
- Shadkam A.
- Shah P. D.
- Shanidze R.
- Shellard R. C.
- Shibata F.
- Shibata T.
- Shimodaira H.
- Shin B. K.
- Shin H. S.
- Sigl G.
- Silli G.
- Silva A. H. Cruz
- Sima O.
- Smith J. D.
- Smith M. W. E.
- Snow G. R.
- Sokolsky P.
- Soldin D.
- Sommers P.
- Sonntag S.
- Sorokin J.
- Spiczak G. M.
- Spiering C.
- Springer R. W.
- Squartini R.
- Stahlberg M.
- Stamatikos M.
- Stanca D.
- Stanev T.
- Stanisha N. A.
- StaniÄŤ S.
- Stasielak J.
- Stasik A.
- Stezelberger T.
- Stokes B. T.
- Stokstad R. G.
- Strafella F.
- Strahler E. A.
- Stratton S. R.
- Stroman T. A.
- Strotjohann N. L.
- Ström R.
- Stößl A.
- Suarez Durán M.
- Suarez F.
- Sudholz1 T.
- Sullivan G. W.
- Suomijärvi T.
- Supanitsky A. D.
- Sutherland M.
- Sutherland M. S.
- Suzawa T.
- Swain J.
- Szadkowski Z.
- Sánchez F.
- Taavola H.
- Taboada I.
- Taborda O. A.
- Takamura M.
- Takeda M.
- Takeishi R.
- Taketa A.
- Takita M.
- Tameda Y.
- Tanaka H.
- Tanaka K.
- Tanaka M.
- Tapia A.
- Telescope Array Collaboration
- Tepe A.
- Ter-Antonyan S.
- Terliuk A.
- Tešić G.
- Theodoro V. M.
- Thomas S. B.
- Thomson G. B.
- Tilav S.
- Timmermans C.
- Tinyakov P.
- Tkachev I.
- Toale P. A.
- Tobin M. N.
- Todero Peixoto C. J.
- Tokuno H.
- Tomankova L.
- Tomida T.
- Tomé B.
- Tonachini A.
- Torralba Elipe G.
- Torres Machado D.
- Torri M.
- Tosi D.
- Travnicek P.
- Trini M.
- Troitsky S.
- Troitsky Sergey
- Tselengidou M.
- Tsunesada Y.
- Tsutsumi K.
- Uchihori Y.
- Udo S.
- Ulrich R.
- Unger E.
- Unger M.
- Urban F.
- Urban Martin
- Usner M.
- Valbuena-Delgado A.
- Valdés Galicia J. F.
- Valiño I.
- Vallecorsa S.
- Valore L.
- van Aar G.
- van Bodegom P.
- van den Berg A. M.
- van Eijndhoven N.
- van Santen J.
- van Vliet A.
- Vandenbroucke J.
- Vanheule S.
- Varela E.
- Vargas Cárdenas B.
- Varner G.
- Vasiloff G.
- VeberiÄŤ D.
- Vehring M.
- Verzi V.
- Vicha J.
- Villaseñor L.
- Voge M.
- Vorobiov S.
- Vraeghe M.
- Vázquez J. R.
- Vázquez R. A.
- Wahlberg H.
- Wainberg O.
- Walck C.
- Wallraff Marius
- Walz David Simon
- Watsona A. A.
- Weaver Ch.
- Weber M.
- Weindl A.
- Wellons M.
- Wendt C.
- Westerhoff S.
- Whelan B. J.
- Whitehorn N.
- Wichary C.
- Wiebe K.
- Wiebusch Christopher
- Wiencke L.
- Wilczyński H.
- Williams D. R.
- Winchen T.
- Wissing H.
- Wittkowski D.
- Wolf M.
- Wong T.
- Wood T. R.
- Woschnagg K.
- Wundheiler B.
- Wykes S.
- Xu D. L.
- Xu X. W.
- Xu Y.
- Yamane R.
- Yamaoka H.
- Yamazaki K.
- Yanez J. P.
- Yang J.
- Yang L.
- Yashiro K.
- Yelos D.
- Yodh G.
- Yoneda Y.
- Yoshida S.
- Yoshida S.
- Yoshii H.
- Yushkov A.
- Zarzhitsky P.
- Zas E.
- Zavrtanik D.
- Zavrtanik M.
- Zepeda A.
- Zimmermann B.
- Ziolkowski M.
- Zoll M.
- Zollinger R.
- Zong Z.
- Zuccarello F.
- Zundel Z.
- Śmiałkowski A.
- Ĺ mĂda R.
- Publication venue
- 'Physical Society of Japan'
- Publication date
- 01/01/2016
- Field of study