Identificación de la presencia de ADN antiguo en restos óseos de la cultura capacha de Colima. 10-11 Tercera época Año 2 (2015) septiembre-diciembre. Diario de Campo. La antropología física ayer y hoy

Se analiza una colección osteológica recuperada del sitio arqueológico Las Fuentes en Colima, México, cuyos materiales corresponden a la fase cultural capacha del Formativo temprano (1500 a.C.). Las vasijas asa de estribo y las acinturadas, asociadas con los entierros, guardan una similitud con las elaboradas por las culturas de América del Sur, lo cual plantea probables contactos culturales y comerciales. Mediante la recuperación de los esqueletos y análisis del adnmitocondrial (adnmt) se pretende establecer hipótesis sobre estas relaciones. El artículo expone los avances y primeros resultados obtenidos.Alcántara Salinas, Andrés Saúl, “Un panteón preclásico en Colima”, tesis de licenciatura en arqueología, México, ENAH, 2005, pp. 25-58.Alcántara Salinas, Andrés Saúl, Laura Almendros y Ángeles Olay, “La tradición capacha. Evaluación y perspectivas desde el valle de Colima”, en El sistema fluvial Lerma-Santiago durante el Formativo y el Clásico temprano, México, INAH, 2010, pp. 19-41.Anderson, S. A. et al., “Sequence and Organization of the Human Mitochondrial Genome”, en Nature, vol. 290, núm. 5806, 1981, pp. 457-465.Andrews, R. M. et al., “Reanalysis and Revision of the Cambridge Reference Sequence for Human Mitochondrial DNA”, en Nature Genetics, vol. 23, núm. 2, 1999, p. 147.Boom, R. et al., “Rapid and Simple Method for Purification of Nucleic Acids”, en Journal of Clinical Microbiology, vol. 28, núm. 3, 1990, pp. 495-503.Bravo López, M. J., “Análisis del adnmitocondrial en mayas con-temporáneos y antiguos de Xcaret, Quintana Roo”, tesis de maestría en ciencias biológicas, México, UNAM, en proceso.Brown, M. D. et al., “mtDNA Haplogroup x: An Ancient Link Bet-ween Europe/Western Asia and North America?”, en Ame-rican Journal of Human Genetics, vol. 63, núm. 6, 1998, pp. 1852-1861.Cavalli-Sforza, L. L. y A. W. Edwards, “Phylogenetic Analysis. Models and Estimation Procedures”, en American Journal of Human Genetics, vol. 19, núm. 3, 1997, pp. 233-257.Cooper, A. y H. N. Poinar, “Ancient DNA: Do it Right or Not at All”, en Science, núm. 289, 2000, p. 1139.Cruz Laina, I. de la et al., “Sex Identification of Children Sacrificed to the Ancient Aztec Rain Gods in Tlatelolco”, en Current Anthropology, vol. 49, núm. 3, 2008, pp. 519-526._____, “Análisis de los linajes del adnmitocondrial en la población maya del periodo colonial (siglos XVI-XVII) de Xca-ret, Quintana Roo”, en III Simposio Internacional El Hombre Temprano en América, México, IIA-UNAM/INAH/Museo del Desierto, 2010, pp. 103-109.Eshleman, J. A., R. S. Malhi y D. G. Smith, “Mitochondrial dnaStudies of Native Americans: Conceptions and Misconceptions of the Population Prehistory of the Americas”, en Evolutionary Anthropology, núm. 12, 2003, pp. 7-18.Gilbert, M. T. P. et al., “Assessing Ancient dnaStudies”, en Trends in Ecology - Evolution, núm. 20, 2005a, pp. 541–544._____, “Biochemical and Physical Correlates of dnaContamina-tion in Archaeological Human Bones and Teeth Excavated at Matera, Italy”, en Journal of Archaeological Science, núm. 32, 2005b, pp. 785-793.González-Oliver, A. et al., “Founding Amerindian Mitochondrial DNA Lineages in Ancient Maya from Xcaret, Quintana Roo”, en American Journal of Physical Anthropology, vol. 116, núm. 3, 2001, pp. 230-235.Handt, O. et al., “Ancient DNA: Methodological Challenges”, en Experientia, núm. 50, 1994, pp. 524-529.Hernández Díaz, Verónica, “Muerte y vida en la cultura de tumbas de tiro”, en Miradas renovadas al Occidente indígena de México, México, UNAM/INAH/CEMCA, 2013, pp. 79-91.Höss, M. et al., “DNA Damage and DNA Sequence Retrieval from Ancient Tissues”, en Nucleic Acids Research, núm. 24, 1996, pp. 1304-1307.Kelly, Isabel, “Stirrup Pots from Colima, Some Implications”, en The Archaeology of West México, Ajijic, Sociedad de Estudios Avanzados del Occidente de México, 1974, pp. 2006-2011._____, “Archaeological Research in Colima, México”, en National Geographic Society Research Reports 1968. Projects, Washington, D.C., 1976, pp. 189-197._____, “Archaeological Research in Colima, México”, en National Geographic Society Research Reports 1968. Projects, Washington, D.C., 1978, pp. 307-311._____, Ceramic Sequence in Colima: Capacha, an Early Phase, Tucson, The University of Arizona Press (Anthropological Papers of the University of Arizona, 37), 1980, pp. 3-17.Krings, M. et al., “Neandertal DNA Sequences and the Origin of Modern Humans”, en Cell, núm. 90, 1997, pp. 19-30.Lell, J. T. et al., “Y Chromosome Polymorphisms in Native American and Siberian Populations: Identification of Native American Y Chromosome Haplotypes”, en Human Genetics, vol. 100, núms. 5-6, 1997, pp. 536-543.Lorenz, J. G. y D. G. Smith, “Distribution of Four Founding mtd-na Haplogroups among Native North Americans”, en American Journal of Physical Anthropology, vol. 101, núm. 3, 1996, pp. 307-323.Meighan, Clement, Archaeology of the Morett Site, Austin/Ber-keley/Los Ángeles, University of California Press, 1972.Olay Barrientos, María de los Ángeles, “El Occidente mesoamericano. Una historia en construcción”, en Introducción a la arqueología del Occidente de México, México, Universidad de Colima/INAH, 2004a, pp. 43-78._____, “Arqueología de Colima”, en Introducción a la arqueología del Occidente de México, México, Universidad de Colima/INAH, 2004b, pp. 271-300.Oliveros Morales, José Arturo, “El espacio de la muerte: Hacedores de tumbas en el mundo prehispánico”, tesis de doctorado en antropología, México, ENAH, 2000.Pääbo, S., J. Gilfford y A. C. Wilson, “Mitochondrial DNA Sequences from a 7000 Year Old Brain”, en Nucleic Acids Research, vol. 16, núm. 20, 1988, pp. 9775–9788.Pääbo, S., R. G. Higuchi y A. C. Wilson, “Ancient DNA and the Polymerase Chain Reaction”, en Journal Biology Chemistry, núm. 264, 1989, pp. 9709-9712.Pérez Martínez, M., “Relaciones genéticas determinadas con adnmitocondrial en poblaciones mesoamericanas con-temporáneas mazahua, otomí, lacandona, y maya antigua”, tesis de licenciatura, México, UNAM, 2013, p. 101.Pineda Vázquez, D., “Estudio del ADN mitocondrial en poblaciones indígenas contemporáneas: mixe, mixteca y maya del sureste de México”, tesis de maestría en ciencias biológicas, México, UNAM, en prensa.Sampietro, M. L. et al., “Tracking Down Human Contamination in Ancient Human Teeth”, en Molecular Biology Evolution, núm. 29, 2006, pp. 1801-1807.Stoneking, M., “The Human Genome Project and Molecular Anthropology”, en Genome Research, vol. 7, núm. 2, 1997, pp. 87-91._____, “Hypervariable Sites in the mtDNA Control Region are Mutational Hotspots”, en American Journal of Human Ge-netics, vol. 67, núm. 4, 2000, pp. 1029-1032.Stoneking, M. y H. Soodyall, “Human Evolution and the Mito-chondrial Genome”, en Current Opinion in Genetics - Development, vol. 6, núm. 6, 1996, pp. 731-736.Tamm, E. et al., “Beringian Standstill and Spread of Native American Founders”, en PLoS ONE, vol. 2, núm. 9, 2007, p. e829+.Torroni, A. et al., “Native American Mitochondrial dnaAnaly-sis Indicates that the Amerind and the Nadene Populations Were Founded by Two Independent Migrations”, en Gene-tics, vol. 130, núm. 1, 1992, pp. 153-162.Vigilant, L. et al., “Mitochondrial dnaSequences in Single Hairs from a Southern African Population”, en Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 86, núm. 23, 1989, pp. 9350-9354.Willerslev, E. y A. Cooper, “Review Paper. Ancient dna”, en Proceedings of the Royal Society of London. Biological Scien-ces, vol. 272, núm. 1558, 2005, pp. 3-16

Antropología molecular y análisis del ADN mitocondrial en poblaciones nahuas del Altiplano de México. 6 Cuarta época, año 2 (2018) septiembre-diciembre. Diario de Campo. Nombrar y contar. Visibilidad estadística de las poblaciones afromexicanas

Estudio que identifica las frecuencias de los haplogrupos del ADN mitocondrial en poblaciones nahuas de los estados de Hidalgo, Puebla y San Luis Potosí. Los resultados obtenidos se compararon con los obtenidos de otras poblaciones del mismo grupo. En las poblaciones nahuas el haplogrupo A presenta la mayor frecuencia en un rango de 46 a 74%; el menos frecuente es el haplogrupo D, que muestra frecuencias bajas de 2 a 17%. Las poblaciones nahuas actuales y antiguas no muestran un patrón claro de distribución de las frecuencias de los cuatro haplogrupos mitocondriales, contrariamente a lo observado para otras poblaciones de origen mesoamericano como las mayas (A, C, B y D, con base en su frecuencia decreciente). En términos generales, los resultados muestran diferencias genéticas significativas entre las poblaciones, especialmente al comparar a los nahuas de Veracruz entre sí y con otras poblaciones de ese mismo grupo, lo que podría deberse a la historia regional de los grupos y su origen. Además, las poblaciones nahuas modernas de la misma región geográfica no siempre muestran relaciones genéticas cercanas; por ejemplo, las dos poblaciones nahuas de la Ciudad de México o las dos poblaciones de Puebla y las de Hidalgo. Por otra parte, cuatro poblaciones nahuas modernas de distintas regiones geográficas muestran una cercanía genética que podría deberse a la presencia de un flujo génico continuo entre ellas. Otras tres poblaciones, dos antiguas, como los aztecas de Tlatelolco y nahuas de Tlaxcala, así como los nahuas modernos de la Sierra Norte de Puebla estudiados aquí, muestran similitudes genéticas que podrían deberse a un origen común.Álvarez-Sandoval, Brenda Arizai et al. (2015). “Genetic Evidence Supports the Multiethnic Character of Teopancazco, a Neighborhood Center of Teotihuacan, Mexico (AD 200-600)”. PLOS ONE, 10(7).Avilés Chávez, Víctor Hugo. Estudio del dna mitocondrial en indígenas nahuas que habitan los estados de Puebla e Hidalgo. Tesis de licenciatura en biología, Facultad de Ciencias-UNAM, México. En prensa.Brown, Michael D. et al. (1998). “mtDNA haplogroup X: an ancient link between Europe/Western Asia and North America?”. The American Journal of Human Genetics, 63(6), pp. 1852-1861. Recuperado de: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929707616292Cabrera, Antonio J. (2002). La Huasteca potosina: ligeros apuntes sobre este país. México: El Colegio de San Luis/CIESAS.Campbell, Lyle (1997). “Languages of North America”. En American Indian Languages (pp.107-138). Nueva York: Oxford.Cavalli-Sforza, Luca et al. (1994). “Introduction to Concepts, Data, and Methods”. The History and Geography of Human Genes (pp.7-11). Nueva Jersey: Princeton University Press.lavijero, Francisco Javier (2003). Historia antigua de México. México: Porrúa.Cruz, Isabel de la et al. (2008). “Sex identification of children sacrificed to the ancient Aztec rain gods in Tlatelolco”. Current Anthropology, 49 (3), pp. 519-526.Dopazo, Hernán (2009). “Genómica, bioinformática y evolución: una alianza estratégica para la biología del nuevo siglo”. Ciencia hoy, 19 (113), pp. 88-93. Recuperado de: https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=4316235Eshleman, Jason A. et al. (2003). “Mitochondrial dna studies of Native Americans: conceptions and misconceptions of the population prehistory of the Americas”. Evolutionary Anthropology: Issues, News, and Reviews, 12 (1), p. 18.Excoffier, Laurent et al. (2005). “Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis”. Evolutionary Bioinformatics Online, 1(4), 47-50. Recuperado de: http://www.cmpg.unibe.ch/software/arlequin3513/man/Arlequin35.pdfFagan, Brian Murray (1984). The Aztecs. Nueva York: W. H. Freeman.García Martínez, Bernardo (1987). Los pueblos de la sierra: el poder y el espacio entre los indios del norte de Puebla hasta 1700. México: El Colegio de México.Gibson, Charles (1964). Aztecs under Spanish rule: a history of the Indians of the Valley of Mexico, 1519-1810. Redwood City: Stanford University Press.Goodman, Morris (1964). Man’s place in the phylogeny of the primates as reflected in serum proteins. En Washburn, Sherwood L. (ed.) Classification and human evolution (pp. 204-234). Londres / Nueva York: Routledge Library Editions.González-Martín, Antonio (coord.) (2006). Historia biológica del hombre en América: aproximaciones desde la antropología física. Pachuca: Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo._____ et al. (2015). “Demographic History of Indigenous Populations in Mesoamerica Based on mtDNA Sequence Data”. PLOS ONE, 10(8).González-Oliver, Angélica et al. (2001). “Founding amerindian mitochondrial dna lineages in ancient Maya from Xcaret, Quintana Roo”. American Journal of Physical Anthropology, 11 6(3), pp. 230-235. Recuperado de: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.1118_____ (2013). “Análisis del dna mitocondrial antiguo y contemporáneo: un acercamiento a las relaciones genéticas en las poblaciones indígenas de Mesoamérica”. Cuicuilco, 20 (58), pp. 153-171. Recuperado de: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?pid=S018516592013000300009script=sci_arttexttlng=en_____ (2017). “Mitochondrial dna Analysis of Mazahua and Otomi Indigenous Populations from Estado de México Suggests a Distant Common Ancestry”. Human Biology, 89 (3), pp. 195-216.Gorostiza, Amaya et al. (2012). “Reconstructing the history of Mesoamerican populations through the study of the mitochondrial DNA control region”. PLoS One, 7(9).Instituto Nacional de Estadística, Geografía e Informática (INEGI) (2010). “Conteo de población y vivienda. Tabulados básicos. México”. Recuperado de: http://www.inegi.org.mx/default.aspxKemp, Brian Matthew et al. (2005). “An analysis of ancient Aztec mtdna from Tlatelolco: Pre Columbian relations and the spread of Uto-Aztecan”. En Reed, D. M. (ed.), Biomolecular Archaeology: Genetic Approaches to the Past (pp. 22-42). 19th Visiting Scholar Conference, Carbondale: Southern Illinois University._____ (2010). “Evaluating the farming/language dispersal hypothesis with genetic variation exhibited by populations in the Southwest and Mesoamerica”. pnas. Proceedings of the National Academy of Sciences, 107(15), pp. 6759-6764. Recuperado de: http://www.pnas.org/content/107/15/6759.fullLeón-Portilla, Miguel (1961). Los antiguos mexicanos. México: FCE.Liu, Lin et al. (2012). “Comparison of next-generation sequencing systems”. Journal of Biomedicine and Biotechnology, pp. 1-11.Malhi, Ripan Singh et al. (2003). “Native American mtdna prehistory in the American Southwest”. American Journal of Physical Anthropology, 120 (2), pp. 108-124. Recuperado de: https://doi.org/10.1002/ajpa.10138Mata-Míguez, Jaime et al. (2012). “The genetic impact of Aztec imperialism: ancient mitochondrial dna evidence from Xaltocan, Mexico”. American Journal of Physical Anthropology, 149 (4), pp. 504-516.Matos Moctezuma, Eduardo (1989). The Aztecs. Nueva York: Rizzoli.Mizuno, Fuzuki et al. (2017). “Characterization of complete mitochondrial genomes of indigenous Mayans in Mexico”. Annals of Human Biology, 44 (7), pp. 652-658. Recuperado de: https://doi.org/10.1080/03014460.2017.1358393Noguez, Xavier (2014). “La zona del Altiplano central en el Posclásico: la etapa tolteca”. En Historia antigua de México. vol. III: El horizonte Posclásico y algunos aspectos intelectuales de las culturas mesoamericanas (pp. 199-236). México: Porrúa / Instituto Nacional de Antropología e Historia / Universidad Nacional Autónoma de México.Ochoa-Lugo, Mirna Isabel et al. (2016). “Genetic Affiliation of Pre-Hispanic and Contemporary Mayas through Maternal Linage”. Human Biology, 88(2), pp. 136-167. Recuperado de: http://www.bioone.org/doi/abs/10.13110/humanbiology.88.2.0136Pääbo, Svante (1985). “Molecular cloning of ancient egiptian mummy dna”. Nature, 314, pp. 644-645._____ (1993). Molecular applications in Biological Anthropology. Cambridge: Cambridge University Press._____ et al. (1989). “Ancient dna and the polymerase chain reaction”. The Journal of Biological Chemistry, 264, pp. 9709-9712.Peñaloza-Espinosa, Rosenda et al. (2007). “Characterization of mtDNA haplogroups in 14 Mexican indigenous populations”. Human Biology, 79 (3), pp. 313-320. Recuperado de: http://www.bioone.org/doi/full/10.1353/hub.2007.0042Reguero Reza, María Teresa. (2014). “La secuenciación del ADN: consideraciones históricas y técnicas”. Revista Colombiana de Biotecnología, 16 (1), 5-8. Recuperado de: https://search.proquest.com/docview/1677190590?pq-origsite=gscholarRodríguez-Santiago, Benjamín y Armengol, Lluís (2012). “Tecnologías de secuenciación de nueva generación en diagnóstico genético pre- y postnatal”. Diagnóstico Prenatal, 23 (2), pp. 56-66.RStudio, Inc. 2018. RStudio. Version 1.1.456-2009-2018.Sandoval, Karla et al. (2009). “Linguistic and maternal genetic diversity are not correlated in Native Mexicans”. Human Genetics, 126(4), p. 521.Scheffler, Lilian (1992). “Nahuas”. En Los indígenas mexicanos (pp. 153-163). México: Panorama.Schwaller, John (2012). “The Expansion of Nahuatl as Lingua Franca among Priests in Sixteenth-Century Mexico”. Ethnohistory, 59(4), pp. 675-690.León-Portilla, Miguel (1961). Los antiguos mexicanos. México: FCE.StatSoft Incorporation (2011). “STATISTICA data analysis software system. Version 10”. Recuperado de: https://www.statsoft.comStoneking, Mark (1997). “The Human Genome Project and Molecular Anthropology”. Genome Research, 7 (2), pp. 87-91.Tajima, Fumio y Nei, Masatoshi. (1984). “Estimation of evolutionary distance between nucleotide sequences”. Molecular Biology and Evolution, 1(3), pp. 269-285. Recuperado de: https://academic.oup.com/mbe/article/1/3/269/1244029Torroni, Antonio et al. (1992). “Native American mitochondrial dna analysis indicates that the Amerind and the Nadene populations were founded by two independent migrations”. Genetics, 130(1), pp. 153-162. Recuperado de: http://www.genetics.org/content/130/1/153.short_____ (1993). “Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs”. American Journal of Human Genetics, 53(3), p. 563. Recuperado de: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1682412/Townsend, Richard Fraser (1992). Aztecs, Londres: Thames and Hudson.World Medical Association (2018). Declaration of Helsinki, Ethical principles for medical research involving human subjects. Recuperado de: https://www.wma.net/policies-post/wma-declarationof-helsinki-ethical-principles-for-medical-research-involving-human-subjects/Zuckerkandl, Emile (1964). “Perspectives in Molecular Anthropology”. En Washburn, S. L. (ed.), Classification and human evolution (pp. 243-272). Londres / Nueva York: Routledge Library Editions._____ et al. (1960). “A comparison of animal hemoglobins by tryptic peptide pattern analysis”. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences, 46, pp. 1349-1360

Génetica y genómica poblacional como herramientas de estudio antropológico en México. 6 (2018) septiembre-diciembre. Diario de Campo

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