Computer-Aided Imaging Analysis of Probe-Based Confocal Laser Endomicroscopy With Molecular Labeling and Gene Expression Identifies Markers of Response to Biological Therapy in IBD Patients: The Endo-Omics Study

Abstract Background We aimed to predict response to biologics in inflammatory bowel disease (IBD) using computerized image analysis of probe confocal laser endomicroscopy (pCLE) in vivo and assess the binding of fluorescent-labeled biologics ex vivo. Additionally, we investigated genes predictive of anti-tumor necrosis factor (TNF) response. Methods Twenty-nine patients (15 with Crohn’s disease [CD], 14 with ulcerative colitis [UC]) underwent colonoscopy with pCLE before and 12 to 14 weeks after starting anti-TNF or anti-integrin α4β7 therapy. Biopsies were taken for fluorescein isothiocyanate–labeled infliximab and vedolizumab staining and gene expression analysis. Computer-aided quantitative image analysis of pCLE was performed. Differentially expressed genes predictive of response were determined and validated in a public cohort. Results In vivo, vessel tortuosity, crypt morphology, and fluorescein leakage predicted response in UC (area under the receiver-operating characteristic curve [AUROC], 0.93; accuracy 85%, positive predictive value [PPV] 89%; negative predictive value [NPV] 75%) and CD (AUROC, 0.79; accuracy 80%; PPV 75%; NPV 83%) patients. Ex vivo, increased binding of labeled biologic at baseline predicted response in UC (UC) (AUROC, 83%; accuracy 77%; PPV 89%; NPV 50%) but not in Crohn’s disease (AUROC 58%). A total of 325 differentially expressed genes distinguished responders from nonresponders, 86 of which fell within the most enriched pathways. A panel including ACTN1, CXCL6, LAMA4, EMILIN1, CRIP2, CXCL13, and MAPKAPK2 showed good prediction of anti-TNF response (AUROC >0.7). Conclusions Higher mucosal binding of the drug target is associated with response to therapy in UC. In vivo, mucosal and microvascular changes detected by pCLE are associated with response to biologics in inflammatory bowel disease. Anti-TNF–responsive UC patients have a less inflamed and fibrotic state pretreatment. Chemotactic pathways involving CXCL6 or CXCL13 may be novel targets for therapy in nonresponders

Visualizing ontologies with AberOWL

INTRODUCCIÓN: Milena Arias y Marlen Villegas, en el 2011, realizaron una revisión sistemática, en centros de salud con alta tasa de infecciones, por lo que implementaron medidas preventivas, para contrarrestarlas, reduciendo las bacteriemias asociadas a catéter en un 100%. Resar R y col., en el 2012, realizaron un estudio en la que describieron un cumplimiento del Bundle por parte del personal sanitario de 10 a 20%. OBJETIVO: Cuantificar el cumplimiento del “Care Bundle” para prevención de infección del torrente sanguíneo asociado a catéter intravascular en el HNAAA. MÉTODOS: Estudio no experimental, Descriptivo-Longitudinal. Se trabajó con el programa Epidat 3.1, con una población de 1726 observaciones-día, una proporción esperada de 20%(4), y un nivel de confianza de 95%, obteniéndose 216 observaciones-día. Para la recolección de datos, se utilizará una lista de indicadores (checking list); cuyos resultados serán analizados utilizando frecuencia absoluta y relativa. RESULTADOS: Se tuvo un total de 29 pacientes. Al tomar en cuenta los criterios de Bundle; el cumplimiento del lavado de manos fue de 0%. El uso adecuado de clorhexidina, fue de 33,3% y la limpieza del puerto de inyección de 76.8%. Un 81,5%, utilizó de manera correcta las barreras máximas. Respecto al adecuado sitio de inserción del catéter y la revisión del mantenimiento necesario de la vía, el cumplimiento fue de 100%. Del total de pacientes estudiados, 17 de ellos sufrieron de IIH. CONCLUSIONES: El cumplimiento de los cinco (05) ítems del care Bundle de prevención de infección del torrente sanguíneo por catéter central fue de 0%