Qualification des sites à potentiel énergétique hydrolien en Charente Maritime : apports de l’Ifremer

La demande faite à l’Ifremer par le département de la Charente Maritime concerne la qualification et caractérisation de sites à potentiel hydrolien, déjà sélectionnés lors de précédentes études, à l’aide des données de type bathymétriques, et hydrodynamiques disponibles au LERPC de La Tremblade. Cela consiste à 1) Fournir les données de bathymétrie à la plus haute résolution disponible sur les sites choisis sous mise en forme de couche SIG, 2) fournir et expliciter les données de Courants ADCP réalisées par le laboratoire (J.Y. Stanisière, 2007-2013), 3) utiliser des données de courant du modèle Mars3D- PC existantes (P. Polsenaere & O. Le Moine, 2014-2017) pour en extraire après post traitement un certain nombre de variables chronologiques et/ou spatialisées nécessaires à l’étude ( profils moyens de courants, permanence des courants en fonction des profondeurs, données de vitesse de courants en fonction du temps à différentes profondeurs, etc…). Ce document est une revue des données et traitement réalisés dans le cadre de ce contrat

Projet Grand Barachois : Rapport de mission Ifremer Miquelon 2016

La dynamique des masses d'eau et les flux transitant paraissent favoriser un comblement et/ou des limitations de renouvellement d'eau mettant en péril la durabilité de l’environnement de cette lagune Miquelonnaise. La Préfecture de Saint Pierre et la DTAM, en soutien à la gestion durable de cet environnement ont sollicité l’Ifremer pour l’évaluation des flux d’alimentation de cette lagune. Une mission sur place a été faite, pour coordonner les actions, et réaliser un certain nombre de mesures préliminaires (jaugeages et bathymétrie du chenal, Courantométrie horizontale)

Profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole de Charente-Maritime (17). Atlas cartographique de zones hydrographiques cohérentes en terme de risque microbiologique

. Profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole Ce projet s'inscrit au titre de la préservation du littoral dans la démarche d'amélioration de la qualité des eaux de baignade et de la qualité sanitaire des zones et eaux conchylicoles, notamment inscrite dans les orientations fondamentales du Schéma Directeur d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SDAGE) des Agences de l'Eau Loire-Bretagne (AELB) et Adour-Garonne (AEAG). L'élaboration des profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole a pour objectif global de recenser, de quantifier et hiérarchiser les différentes sources de pollution susceptibles d'impacter les zones de production conchylicole. Ils permettent d'identifier l'origine de la contamination des zones de production conchylicole, d'évaluer et hiérarchiser l'impact des flux de pollution susceptibles de dégrader la qualité des eaux et enfin aboutir à un programme d'actions visant à supprimer ou réduire ces sources de pollution. . Maîtrise d'ouvrage : Conseil Départemental de la Charente-Maritime La réduction des risques sanitaires de contamination bactériologique dans les zones de production conchylicole est un enjeu économique majeur et prioritaire pour le département de la Charente-Maritime. Les profils de vulnérabilité pour l'ensemble des zones de production conchylicole de la Charente-Maritime est placé en 2016 sous maitrise d'ouvrage du département de la Charente-Maritime. La cellule qualité des eaux littorales et portuaires du Conseil Départemental de la Charente-Maritime est chargée de conduire ces études. . Définition des zones hydrographiques (expertise Ifremer) Suite aux sollicitations des acteurs du territoire en matière de gestion durable du littoral et de reconquête de la qualité des eaux en Charente-Maritime, le LER-PC s'est engagé dans le cadre des profils de vulnérabilité à apporter son expertise sur le domaine de l'environnement et de ces interactions sur les zones de production conchylicole dans les Pertuis Charentais. Le premier volet portant sur la recherche de bibliographie sur les sujets, études et historiques de données microbiologiques dans les Pertuis Charentais, et le second concernant la définition d'un zonage hydrographique cohérent de l'influence microbiologique pour les zones de production conchylicole. Si le premier concernait un relevé bibliographique issu d'étude d'Archimer, le second l'était moins et nécessitait une étude expertise d'Ifremer particulière. L'objectif prioritaire de ce volet décrit dans le rapport a donc été de définir pour le Conseil Départemental de la Charente-Maritime des zones hydrographiques cohérentes en terme de risque microbiologique. Secondairement, ce travail permet de donner aux acteurs du territoire en matière de gestion durable du littoral et de reconquête de la qualité des eaux en Charente-Maritime des éléments complémentaires permettant d'objectiver la priorisation des études de recherche de sources de contamination à venir.

Évaluation du bilan énergétique de l'huître creuse,

Cette étude d'écophysiologie a été réalisée sur l'huître japonaise (Crassostrea gigas) cultivée en baie de Marennes-Oléron (France) en mai 1992. Les mesures sont effectuées dans des conditions alimentaires naturelles au cours de trois cycles de mesure (a, b, c) à des coefficients de marée de 49,57 et 88. La matière particulaire totale est mesurée en continu durant les cycles de marée. La fonction de consommation est calculée selon une nouvelle formulation prenant en compte un "échappement particulaire" précédant le tri pré-ingestif et représentant une perte passive de particules de petites tailles entraînées par la masse d'eau à travers le filtre branchial. La comparaison des fonctions de consommation et d'absorption de la matière organique totale et de la chlorophylle a, montre des différences significativement supérieures pour la charge particulaire de 55 mg.l−1 (c) comparée aux autres conditions (a, b) de charges particulaires inférieures à 30 mg.l−1. La comparaison des coefficients de sélectivité et des taux d'absorption de la chlorophylle a, (43,3 et 81,6 %), respectivement, supérieurs à ceux de la matière organique totale (33,4 et 68,7 %), respectivement, montre le tri de la matière organique effectué par l'huître. Le bilan énergétique calculé prend en compte le matériel d'origine phytoplanctonique et le matériel organique total. Les potentiels de croissance ainsi obtenus de 0,88-11,60 et 47,60 J.h−1.g−1 respectivement pour les conditions à 13,5–28,9 et 54,6 mg.l−1 de charge particulaire totale, traduisent une forte variabilité journalière d'énergie disponible pour la production organique dans le milieu naturel. Ces résultats sont cohérents avec les résultats de croissance d'huîtres en élevage dans la baie de Marennes-Oléron

Écophysiologie de la maturation sexuelle et de la ponte de l'huître creuse

L'étude de la maturation et de la ponte de l'huître creuse Crassostrea gigas, s'intègre dans une large problématique visant à comprendre les causes de mortalité qui surviennent épisodiquement dans le bassin de Marennes-Oléron au printemps et en été. Un conditionnement thermique et alimentaire des élevages permet d'obtenir simultanément des huîtres à tous les stades de maturité sexuelle. Le calcul des taux de filtration, consommation, absorption et respiration permet d'estimer le potentiel de croissance, et donne le bilan énergétique des huîtres aux différents stades sexuels. Les réponses physiologiques sont semblables pour des huîtres mâles ou femelles. La filtration de 2,4 à 2,6 1.h−1, passe à 1,8 1.h−1 à un stade de maturation avancée. La prise de poids liée au développement des gonades ne semble pas avoir d'effet sur le taux de filtration. Les huîtres de 2,5 ans présentent un bilan énergétique déficitaire (–15 J.h−1) à un stade de maturation avancée. Ce déficit est confirmé (–90 J.h−1) sur des huîtres de 1,5 ans au même stade de maturation. En revanche, les huîtres immatures, en début de maturation ou en post-ponte, ont un potentiel de croissance compris entre 110 et 170 J.h−1 . Le déficit énergétique observé au stade de maturation avancée relève essentiellement de la fonction d'absorption qui chute de façon importante en période de forte gamétogenèse. L'étude de la respiration permet de définir une allométrie particulière à la croissance gonadique avec un coefficient d'allométrie de 0,574. La faiblesse physiologique des huîtres, observée à un stade de maturation avancée, doit être prise en compte dans la recherche des facteurs responsables des mortalités printanières et estivales affectant les cheptels en élevage dans le bassin de Marennes-Oléron

Comparative analysis of oxygen consumption rates between cupped oyster spat of

Respiration rates of various geographical strains of Crassostrea gigas were compared to assess the respiratory expenditure as a physiological indicator of catabolism (cost of maintenance). Parental oysters, sampled in France (Marennes-Oléron), Japan (Hiroshima), Taiwan (Tunkang) and Spain (Cadix), were differentiated by both their geographic origin and by mitochondrial DNA markers, allowing the distinction between the two closely related taxa Crassostrea gigas and Crassostrea angulata. After reproduction of these parental oysters, respiration rates of spat of each strain, reared under common controlled conditions, were individually estimated at 20 °C by using a volumetric microrespirometer. Our results demonstrated that physiological variability existed among the Crassostrea gigas strains and is likely to be related to physiological differences between geographical regions and/or genetic adaptations. The French strain showed the highest rates (0.71 μL·h−1), while the Japanese, Taiwanese and the hybrid between Spanish and French strains consumed less, 0.53, 0.43 and 0.40 μL·h−1, respectively. Our results confirmed the discrepancies previously suggested between Crassostrea gigas and Crassostrea angulata. Comprehensive physiological assessments should be carried out over a wide temperature range to confirm our results and to further evaluate growth potential. Appropriate decision making based on these studies will help future shellfish management in shellfish rearing areas such as the overstocked Marennes-Oléron Bay

Méthodes d’analyses de la matière organique ; méthodes biochimiques, méthodes d’analyse des pigments chlorophylliens et analyse thermique élémentaire

The study aims to update and specify the analytical methods commonly used at URAPC/IFREMER laboratory in La Tremblade. The first part of this study focused on the various types of variability by using biochemical methods to assess oyster meat proteins, lipids and carbohydrates concentrations. Moreover, proximate biochemical composition of oyster meat was compared among individuals and within groups (homogeneized pooled meat). Results showed that conclusions were affected by the way samples were prepared (individuals or pooled samples). The carbohydrates concentration among oysters showed the highest variability. The second part of the study focused on chlorophyll a and pheophytin analysis. Several chlorophyll a origins were compared using Turner and Jenway fluorimeters. Several extinction filters commonly used affected significantly the estimates, therefore prompting to revalue fluorimeters calibrating procedures. Comparison between three origins of organic matter (i.e., oyster meat, suspended particulate organic matter, sediment particulate matter) were carried out by using two types of analytical methods: chemical analysis and combustion analysis using a CHN/SO analyser. Although results showed correlated estimates between the two methods for oyster meat, no relationship was established between both lipids estimates from the suspended organic matter or from sediment. The uncorrelated estimates resulted from the lipids’extraction method which should be reviewed for this sample types.Ce travail trouve son origine dans la volonté de mettre à jour et de préciser les méthodes analytiques mises en oeuvre au laboratoire URAPC de la Tremblade. Une première partie est une réflexion sur les différents types de variabilité des résultats d’analyses biochimiques des protéines, lipides et glucides de la chair d’huître (Crassostrea gigas), et sur la signification des résultats dans le cas d’analyses globales de plusieurs individus (mélange des chairs), ou dans le cas de mesures individuelles, huître par huître. Selon le cas, l’interprétation zootechnique des résultats d’affinage en claire est différente!... La teneur en glucides inter-huîtres présente la plus grande variabilité. La deuxième partie de ce rapport est consacrée à l’analyse de la chlorophylle a et des phéopigments. Les résultats comparatifs d’analyses effectuées sur plusieurs sources de chlorophylle à partir de deux types de fluorimètres (Turner et Jenway), conduit à remettre en cause l’utilisation de certains filtres à fort pouvoir absorbant, et à préciser les conditions d’étalonnage des appareils. Dans la troisième partie de l’étude, les analyses biochimiques effectuées sur 3 sources différentes de matière organique (chair, matière organique en suspension et vase) sont comparées aux résultats obtenus par un analyseur thermique des éléments constituants de la matière (CHN). Si les résultats sont cohérents entre les deux méthodes d’analyse pour les mesures de chair, un problème apparaît au niveau de l’analyse des lipides sur la matière organique en suspension dans l’eau, ainsi que sur celle contenue dans la vase. La méthode d’extraction des lipides dans ces deux derniers cas, est suspectée et doit être remise en cause

Hydrologie du Grand Etang de Miquelon : estimation des flux. Rapport annuel 2014

This study aims to assess the hydrological fluxes between the ‘Grand Etang’ of Miquelon and the oceanic part. Bathymetric surveys and Doppler currentmeter data acquisitions were carried out from August 14th, 2014 to November 5th, 2014 to allow the following estimates : Total area (227 Ha) and characteristics volumes (total : 7,1x106 m3; oscillating 42,8x106 m3 (40 %); half-tide 5,2 106 m3) Velocity Index of channel to evaluate the average current speed at cross-section channel Fluxes, on flood and ebb tide respectively : - Instantaneous flow : maxima at 85,3 and 65,3 m3/s ; mean 34,2 and 26,4 m3/s. - Circulating fluxes by tide : maxima 0,96 and 1 x106 m3, mean : 0,28 and 0,41 m3 - Mean renewal : 10,7% each tide. Tidal asymetry duration was reported: flood time was lower than the ebb one (4,9 h. vs 7,4 h.), which results in outflow fluxes significantly greater than inflow through the channel. Hypothesis of secondary inflow by percolation from ocean is formulated.Le programme vise à évaluer les flux hydrologiques entre le Grand Etang de Miquelon et l'océan. Les levés bathymétriques et les acquisitions courantométriques réalisés du 14/08/2014 au 05/11/2014 ont permis : L'évaluation des surfaces (227 Ha) et volumes caractéristiques (total : 7,1x106 m3, oscillant 42,8x106 m3 (40 %) mimarée 5,2 106 m3) L'estimation d'un indice de vélocité du chenal pour l'évaluation de la vitesse moyenne des courants L'évaluation des flux, en flot et jusant respectivement, soit : - débits instantanés : maxima à 85,3 et 65,3 m3/s moyens 34,2 et 26,4 m3/s. - flux circulants par marée : maxima à 0,96 et 1 x106 m3, moyens : 0,28 à 0,41 m3 - renouvellements moyens : 10,7% par marée. Le constat d'asymétrie du temps de marée: le temps de flot étant inférieur à celui de jusant (4,9 h. vs 7,4 h), qui implique des flux sortants bien supérieurs à ceux entrants par le chenal. L'hypothèse d'une alimentation secondaire par percolation est émise