Identification of priority geosites for public use management: application to the geological heritage inventory of São Paulo state

The characterization of the elements of geodiversity, through different inventory and quantitative evaluation methods, in the past decades, has allowed the identification of the most representative sites of the regional geological evolution of the state of São Paulo. Between 2013 and 2016, the first phase of the inventory of the geological heritage of São Paulo state was carried out. At the end of this stage, 142 geosites integrated into 11 geological categories were defined, which were characterized and quantitatively evaluated according to their scientific value and degradation risk, to establish future management priorities. Between 2017 and 2019, in the second phase of the research, the data obtained in the inventory were submitted to an analysis aiming at the diagnosis of use and protection and the proposal of strategies for management and public use of these geosites. Currently, the inventory of the geological heritage of the state is composed of 143 geosites, of which, based on their scientific value, 57 were evaluated as potential candidates to be integrated into the inventory of the national geological heritage. Despite this, there are still few works that systematically apply the stages of conservation and monitoring of geological sites. In this context, this study presented the initial phase of the definition of a methodology for the assessment of the evolution of the state of conservation of the geological heritage and its application in the state of São Paulo, to subsidize future actions of management and preservation of this heritage. In this stage, 129 state geosites were evaluated based on three defined criteria. This evaluation preliminarily resulted in the identification of 10 priority geosites, which will A caracterização dos elementos da geodiversidade, por meio de diferentes métodos de inventário e avaliação quantitativa, nas últimas décadas, tem permitido identificar os sítios mais representativos da evolução geológica regional do estado de São Paulo. Entre os anos de 2013 e 2016, realizou-se a primeira fase do inventário do patrimônio geológico do estado São Paulo. Ao fim dessa etapa, foram definidos 142 geossítios integrados em 11 categorias geológicas, os quais foram caracterizados e avaliados de forma quantitativa de acordo com seu valor científico e risco de degradação, com o intuito de estabelecer prioridades de gestão futura. Entre os anos de 2017 e 2019, na segunda fase da pesquisa, os dados obtidos no inventário foram submetidos a uma análise visando ao diagnóstico de uso e proteção e à proposição de estratégias para a gestão e uso público desses geossítios. Atualmente, o inventário do patrimônio geológico do estado é composto de 143 geossítios, dos quais, com base no valor científico, 57 foram avaliados por como potenciais candidatos a integrar o inventário do patrimônio geológico nacional. Apesar disso, ainda são poucos os trabalhos que aplicam de forma sistemática as etapas de conservação e monitoramento de sítios geológicos. Nesse contexto, este trabalho apresenta a fase inicial de definição de uma metodologia para a avaliação da evolução do estado de conservação do patrimônio geológico e sua aplicação no estado de São Paulo, a fim de subsidiar futuras ações de gestão e preservação desse patrimônio. Nesta etapa foram avaliados 129 geossítios estaduais com base em três critérios definidos. Esta avaliação resultou, preliminarmente, na identificação de dez geossítios prioritários, os quais serão abrangidos nas etapas subsequentes

Identification of priority geosites for public use management: application to the geological heritage inventory of São Paulo state

The characterization of the elements of geodiversity, through different inventory and quantitative evaluation methods, in the past decades, has allowed the identification of the most representative sites of the regional geological evolution of the state of São Paulo. Between 2013 and 2016, the first phase of the inventory of the geological heritage of São Paulo state was carried out. At the end of this stage, 142 geosites integrated into 11 geological categories were defined, which were characterized and quantitatively evaluated according to their scientific value and degradation risk, to establish future management priorities. Between 2017 and 2019, in the second phase of the research, the data obtained in the inventory were submitted to an analysis aiming at the diagnosis of use and protection and the proposal of strategies for management and public use of these geosites. Currently, the inventory of the geological heritage of the state is composed of 143 geosites, of which, based on their scientific value, 57 were evaluated as potential candidates to be integrated into the inventory of the national geological heritage. Despite this, there are still few works that systematically apply the stages of conservation and monitoring of geological sites. In this context, this study presented the initial phase of the definition of a methodology for the assessment of the evolution of the state of conservation of the geological heritage and its application in the state of São Paulo, to subsidize future actions of management and preservation of this heritage. In this stage, 129 state geosites were evaluated based on three defined criteria. This evaluation preliminarily resulted in the identification of 10 priority geosites, which will

Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains

Ruiz JC, D'Afonseca V, Silva A, et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. PLoS ONE. 2011;6(4): e18551.Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in genomic architecture, gene content and genetic order. When C. pseudotuberculosis was compared with other Corynebacterium species, it became evident that this pathogenic species has lost numerous genes, resulting in one of the smallest genomes in the genus. Other differences that could be part of the adaptation to pathogenicity include a lower GC content, of about 52%, and a reduced gene repertoire. The C. pseudotuberculosis genome also includes seven putative pathogenicity islands, which contain several classical virulence factors, including genes for fimbrial subunits, adhesion factors, iron uptake and secreted toxins. Additionally, all of the virulence factors in the islands have characteristics that indicate horizontal transfer. Conclusions: These particular genome characteristics of C. pseudotuberculosis, as well as its acquired virulence factors in pathogenicity islands, provide evidence of its lifestyle and of the pathogenicity pathways used by this pathogen in the infection process. All genomes cited in this study are available in the NCBI Genbank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) under accession numbers CP001809 and CP001829

O DIÁLOGO ENTRE A EDUCAÇÃO PATRIMONIAL E O ENSINO DE HISTÓRIA

The text is an experience report of activities developed with the class of the ninth semester of History (University of Bahia State/Campus X) in 2018, during the classes of the curricular component “Documental and Patrimonial Culture I”. We started with researches about material and immaterial heritage in the city of Teixeira de Freitas, Bahia, discussing the concepts while recognizing the local heritage and questioning their resonance, belonging to communities and social memory according to the interpretation of José Reginaldo Gonçalves (2005), Peter Burke (2006), and Olgário Vogt (2009). The students researched on the pertinent literature, including the use of the collection of monographs from the course of History, as well as going to the field to interview residents who occupy and modify the city in its daily life. Thus, the methodology of oral history was essential to reconstruct narratives that show the importance of the heritage mapped by the students. The results of this research were presented in a field class called “City and heritage: traversing Teixeira de Freitas”, where we visited the following heritage sites: A Biquinha; Praça do Belo; Rodoviária Nova Memorial and the Feira de Domingo in the neighborhood named São Lourenço. During the field class, we used the heritage education strategies described by Evelina Grumberg (2007) which included: observation, registration, exploration and appropriation of the mentioned heritage. The textual narrative intersperses the importance of the dialogue between heritage education and history teaching with an emphasis on local history from the perspective of Raphael Samuel (1990) and Selva Guimarães Fonseca (2006). It also debates the resonance of heritage with the communities that experience it, and in an inverse way, the social memory framed by public power and private agents.O texto é um relato de experiência de atividades desenvolvidas junto à turma do nono semestre de História (UNEB/campus X) no ano de 2018, durante as aulas do componente curricular “Cultura Documental e Patrimonial I”. Iniciamos com pesquisas sobre patrimônios materiais e imateriais da cidade de Teixeira de Freitas, BA, debatendo os conceitos, ao mesmo passo que reconhecíamos os patrimônios locais, questionando a ressonância dos mesmos, o pertencimento as comunidades e a memória social, segundo a interpretação de José Reginaldo Gonçalves (2005), Peter Burke (2006), e Olgário Vogt (2009). Os estudantes pesquisaram na bibliografia pertinente, inclusive utilizando o acervo de monografias do curso de História, como também foram a campo para entrevistar moradores que ocupam e modificam a cidade no seu cotidiano. Assim, a metodologia da história oral foi imprescindível para reconstituição de narrativas que evidenciam a importância dos patrimônios mapeados pelos estudantes. O resultado das pesquisas elaboradas foi apresentado em uma aula de campo denominada “Cidade e patrimônio: percorrendo Teixeira de Freitas”, onde visitamos os seguintes patrimônios: A Biquinha; A Praça do Belo; O Memorial da Rodoviária Nova; e a Feira de Domingo do bairro São Lourenço. Durante a aula de campo utilizamos as estratégias da educação patrimonial descritas por Evelina Grumberg (2007), que compreenderam: observação, registro, exploração e apropriação dos patrimônios citados. A narrativa textual intercala a importância do diálogo entre a educação patrimonial e o ensino de história com ênfase na história local sob a perspectiva de Raphael Samuel (1990) e Selva Guimarães Fonseca (2006). Como também debate a ressonância dos patrimônios junto às comunidades que os vivenciam, e de forma inversa, a memória social enquadrada pelo poder público e os agentes privados

AS NEGRAS DE GANHO EM SALVADOR E NO RIO DE JANEIRO NO SÉCULO XIX

Na presente comunicação abordaremos a temática das mulheres quitandeirasno século XIX, voltado principalmente para as capitais de Salvador e Rio de Janeiro,compreendendo um pouco melhor sobre esse contexto, observando como funcionavaos comércios, principalmente como esse processo foi importante para que essasmulheres negras conquistassem espaço e lutassem para sua subsistência, algumaspara sustentar seus filhos, outras para conquistar sua carta de alforria ou de seusfilhos pois, além de lutar contra os abusos da fiscalização também precisavam de seuespaço dentro do comércio e, com isso mostrando suas artimanhas comerciastrazidas da África. Mostrando também como a sociedade do século XIX era patriarcale desigual, quando no quesito de gênero, uma vez que muitas delas assumiam seusfilhos e filhas sozinhas, sem nenhuma assistência paterna e, que ainda assim ficarammarcadas e estigmatizadas pela sociedade atual

Equações preditivas da força muscular ventilatória na população brasileira: revisão sistemática

As pressões respiratórias máximas (PImáx ePEmáx) avaliam o índice de força dos músculos respiratórios.Essas medidas são relevantes para a avaliação da força muscularrespiratória e para o monitoramento clínico. O objetivo desteestudo foi avaliar os artigos que sugerem equações preditivasde PImáx e PEmáx para a população brasileira. Foram incluídosestudos que estabeleceram equações de predição para PImáxe PEmáx da população brasileira saudável, com idades entre4 e 90 anos e de ambos os sexos, que mediam as pressõesrespiratórias máximas na posição sentada. Uma pesquisafoi realizada, em março de 2020, nas bases de dadosMEDLINE, LILACS, Cochrane, SciELO, CINAHL, Web of Sciencee SCOPUS, sem filtros de tempo ou idioma. Os descritoresutilizados foram “força muscular”, “equações” e “músculosrespiratórios preditivos”, com seus respectivos sinônimos.Dos 3.920 estudos encontrados nas bases de dados,963 eram duplicados e 2.779 foram excluídos, 178 tiveramseus textos analisados integralmente e apenas 9 atendiamaos critérios de inclusão. As variáveis utilizadas nas equaçõespreditivas de força muscular ventilatória analisadas nestarevisão foram: idade, peso e estatura. No entanto, os estudosmostraram fragilidades metodológicas, como falta de validaçãocruzada da equação,Las presiones inspiratoria y espiratoria máximas(PImáx y PEmáx) evalúan el índice de fuerza muscular respiratoria.Estas medidas son importantes en la evaluación de la fuerzamuscular respiratoria y el seguimiento clínico. El objetivo de esteestudio fue evaluar los artículos proponen ecuaciones predictivaspara PImáx y PEmáx a la población brasileña. Se incluyeronestudios que establecieron ecuaciones predictivas para PImáxy PEmáx a la población brasileña sana de ambos sexos, de entre4 y 90 años de edad, y que miden las presiones respiratoriasmáximas en posición sentada. Se realizó, en marzo de 2020,una búsqueda en las bases de datos MEDLINE, LILACS, Cochrane,SciELO, CINAHL, Web of Science y SCOPUS, sin año de publicaciónespecífico ni idioma. Los descriptores utilizados fueron “fuerzamuscular”, “ecuaciones” y “músculos respiratorios predictivos”y sus respectivos sinónimos. De los 3.920 estudios encontrados,963 eran duplicados y se excluyeron 2.779, así se analizaron178 textos en su totalidad y solo 9 cumplieron con los criterios deinclusión. Las variables edad, peso y talla fueron las que habíansido utilizadas en las ecuaciones predictivas de fuerza muscular respiratoria analizadas por esta revisión. Sin embargo, los estudios apuntaron limitaciones metodológicas, como falta de validacióncruzada de la ecuación, exclusión de outliers y familiaridadde la PImáx y PEmáx.As pressões respiratórias máximas (PImáx ePEmáx) avaliam o índice de força dos músculos respiratórios.Essas medidas são relevantes para a avaliação da força muscularrespiratória e para o monitoramento clínico. O objetivo desteestudo foi avaliar os artigos que sugerem equações preditivasde PImáx e PEmáx para a população brasileira. Foram incluídosestudos que estabeleceram equações de predição para PImáxe PEmáx da população brasileira saudável, com idades entre4 e 90 anos e de ambos os sexos, que mediam as pressõesrespiratórias máximas na posição sentada. Uma pesquisafoi realizada, em março de 2020, nas bases de dadosMEDLINE, LILACS, Cochrane, SciELO, CINAHL, Web of Sciencee SCOPUS, sem filtros de tempo ou idioma. Os descritoresutilizados foram “força muscular”, “equações” e “músculosrespiratórios preditivos”, com seus respectivos sinônimos.Dos 3.920 estudos encontrados nas bases de dados,963 eram duplicados e 2.779 foram excluídos, 178 tiveramseus textos analisados integralmente e apenas 9 atendiamaos critérios de inclusão. As variáveis utilizadas nas equaçõespreditivas de força muscular ventilatória analisadas nesta revisão foram: idade, peso e estatura. No entanto, os estudos mostraram fragilidades metodológicas, como falta de validação cruzada da equação, exclusão de outliers e familiarização do PImáx e PEmáx

Performance in the Deep Squat Test and musculoskeletal injuries: a systematic review

<div><p>Abstract Introduction: The Deep Squat Test has been applied in pre-season evaluations of sports teams and in military courses to predict the risk of musculoskeletal injuries. Objective: To evaluate the association of DS performance and the risk of musculoskeletal injuries. Methods: In this systematic review, a search without language or time filters was carried out in MEDLINE, SciELO, SCOPUS, SPORTDiscuss, CINAHL and BVS databases with the following title words: injury prediction, injury risk and deep squat in December 2016. Participants' profile, sample size, classification of musculoskeletal injuries, follow-up time, study design and results were extracted from the studies. Bias risk analysis was performed with the Newcastle-Ottawa Scale. Results: Five studies were included, using different analyzes, whose results varied. Odds ratio ranged from 1.21 to 2.59 (95% CI = 1.01 - 3.28); relative risk was 1.68 (95% CI = 1.50 - 1.87), sensitivity from 3 to 24%, specificity from 90 to 99%, PPV from 42 to 63%, NPV from 72 to 75% and AUC from 51 to 58%. Conclusion: The DS can be a test whose presence of movement dysfunctions is a predictor of the risk of musculoskeletal injuries in individuals who practice physical exercises. However, due to the methodological limitations presented, caution is suggested when interpreting such results. PROSPERO registration: CRD4201706922.</p></div

Proteomic Analysis of <i>Trypanosoma cruzi</i> Response to Ionizing Radiation Stress

<div><p><i>Trypanosoma cruzi</i>, the causative agent of Chagas disease, is extremely resistant to ionizing radiation, enduring up to 1.5 kGy of gamma rays. Ionizing radiation can damage the DNA molecule both directly, resulting in double-strand breaks, and indirectly, as a consequence of reactive oxygen species production. After a dose of 500 Gy of gamma rays, the parasite genome is fragmented, but the chromosomal bands are restored within 48 hours. Under such conditions, cell growth arrests for up to 120 hours and the parasites resume normal growth after this period. To better understand the parasite response to ionizing radiation, we analyzed the proteome of irradiated (4, 24, and 96 hours after irradiation) and non-irradiated <i>T. cruzi</i> using two-dimensional differential gel electrophoresis followed by mass spectrometry for protein identification. A total of 543 spots were found to be differentially expressed, from which 215 were identified. These identified protein spots represent different isoforms of only 53 proteins. We observed a tendency for overexpression of proteins with molecular weights below predicted, indicating that these may be processed, yielding shorter polypeptides. The presence of shorter protein isoforms after irradiation suggests the occurrence of post-translational modifications and/or processing in response to gamma radiation stress. Our results also indicate that active translation is essential for the recovery of parasites from ionizing radiation damage. This study therefore reveals the peculiar response of <i>T. cruzi</i> to ionizing radiation, raising questions about how this organism can change its protein expression to survive such a harmful stress.</p></div

Distribution of upregulated and downregulated protein spots versus molecular weight, pI, and fold change.

<p>In the scatter plots, upregulated protein spots are shown in red and downregulated protein spots are shown in green. The correlation between molecular weight and pI or fold-change ratio is shown in (A) and (B), respectively. Spots with no significant difference in expression are colored gray. The blue line indicates the negative correlation between molecular weight and fold change.</p

Experimental design.

<p>Each two-dimensional gel was loaded with 50 µg of total protein extract per sample, labeled either with Cy3 or Cy5. The internal control (a pool containing 50 µg of all time point proteins: NI, 4, 24, and 96 hours after irradiation) was labeled with Cy2.</p