Molecular phenotype of zebrafish ovarian follicle by serial analysis of gene expression and proteomic profiling, and comparison with the transcriptomes of other animals

BACKGROUND: The ability of an oocyte to develop into a viable embryo depends on the accumulation of specific maternal information and molecules, such as RNAs and proteins. A serial analysis of gene expression (SAGE) was carried out in parallel with proteomic analysis on fully-grown ovarian follicles from zebrafish (Danio rerio). The data obtained were compared with ovary/follicle/egg molecular phenotypes of other animals, published or available in public sequence databases. RESULTS: Sequencing of 27,486 SAGE tags identified 11,399 different ones, including 3,329 tags with an occurrence superior to one. Fifty-eight genes were expressed at over 0.15% of the total population and represented 17.34% of the mRNA population identified. The three most expressed transcripts were a rhamnose-binding lectin, beta-actin 2, and a transcribed locus similar to the H2B histone family. Comparison with the large-scale expressed sequence tags sequencing approach revealed highly expressed transcripts that were not previously known to be expressed at high levels in fish ovaries, like the short-sized polarized metallothionein 2 transcript. A higher sensitivity for the detection of transcripts with a characterized maternal genetic contribution was also demonstrated compared to large-scale sequencing of cDNA libraries. Ferritin heavy polypeptide 1, heat shock protein 90-beta, lactate dehydrogenase B4, beta-actin isoforms, tubulin beta 2, ATP synthase subunit 9, together with 40 S ribosomal protein S27a, were common highly-expressed transcripts of vertebrate ovary/unfertilized egg. Comparison of transcriptome and proteome data revealed that transcript levels provide little predictive value with respect to the extent of protein abundance. All the proteins identified by proteomic analysis of fully-grown zebrafish follicles had at least one transcript counterpart, with two exceptions: eosinophil chemotactic cytokine and nothepsin. CONCLUSION: This study provides a complete sequence data set of maternal mRNA stored in zebrafish germ cells at the end of oogenesis. This catalogue contains highly-expressed transcripts that are part of a vertebrate ovarian expressed gene signature. Comparison of transcriptome and proteome data identified downregulated transcripts or proteins potentially incorporated in the oocyte by endocytosis. The molecular phenotype described provides groundwork for future experimental approaches aimed at identifying functionally important stored maternal transcripts and proteins involved in oogenesis and early stages of embryo development

Analyse, du niveau systemique au niveau cellulaire, des mecanismes d'approvisionnement en oxygene chez les animaux aquatiques

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Avant-propos

Forgue Guy Jean. Avant-propos. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°18, novembre 1983. L'anglais américain. Aspects de la traduction littéraire. p. 395

Shira Wolosky. — Emily Dickinson: A Voice of War

Forgue Guy Jean. Shira Wolosky. — Emily Dickinson: A Voice of War. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°24-25, mai 1985. L'impérialisme culturel américain ? p. 320

Les capacités d'adaptation du silure glane en hypoxie : un cas exemplaire d'homéostasie du milieu intérieur

Nous étudions les principes généraux qui expliquent comment les animaux aquatiques assurent leurs échanges gazeux (O2 et CO2) en fonction d'une part, de leurs besoins physiologiques et d'autre part, des changements des caractéristiques physico-chimiques du milieu. Cette synthèse, basée sur le cas exemplaire du silure glane, résume nos observations sur les mécanismes qui permettent à des animaux aquatiques physiologiquement très différents de s'adapter aux variations d'oxygénation du milieu ambiant. Le but de la stratégie d'adaptation est de maintenir constant l'état d'oxygénation du sang, à une faible valeur de pression partielle d'O2 (Po2) dans le sang artériel, indépendamment des variations de Po2 dans l'eau. Chez le silure, la valeur la plus couramment mesurée de Po2 dans le sang artériel est 2 kPa (15 mm Hg) pour des variations de Po2 dans l'eau comprises entre 3 et 40 kPa (1,5 à 20 mg.1−1 à 13 °C). Ce qui est aussi particulier chez cet animal est que toute l'adaptation est réalisée par la ventilation : il n'y a aucun changement de débit cardiaque, ni de modification de l'affinité de l'hémoglobine pour l'oxygène via le pH sanguin. La valeur de Po2 inspirée jusqu'à laquelle la consomation d'O2 peut être assurée pendant au moins 24 h à 13 °C est 2 à 3 kPa. Nous pensons que chez le silure cette valeur de Po2 est largement indépendante de la température car chez des animaux aussi divers que la carpe, la truite ou l'écrevisse (adaptés au laboratoire à différentes températures comprises entre 10 et 23 °C) la valeur de Po2 critique est aussi égale à 2-3 kPa indépendamment de la température. Toutes les mesures que nous citons ont été faites chez des animaux à jeun au laboratoire mais le principe du « fonctionnement » de très nombreux animaux aquatiques avec de faibles valeurs de Po2 artériel, indépendamment de la température, a été vérifié dans le milieu naturel. Nous n'avons actuellement aucune idée sur les capacités du silure dans un élevage intensif, en particulier lorsque des pathologies s'y développent. Néanmoins, il est clair que les capacités maximales d'adaptation du silure face à l'hypoxie sont très grandes

The Norm in American English

Poetry : Theory and Practice of Irrational Translation. Speaking of form that convention calls poetry, the author opposes all linguistically oriented theories that exclude or attack the ineffable in literary translation. Translation is treated as an aspect of other activities, the movement of metaphor, the making of a poem, the origin of language itself. All show how both the mythic, irrational and the conscious, linguistic coexist in the elaboration of the ineffable emotional impulse, which the author asserts to be irreducible and unreplacable. An analysis of Blake's short poem « The Sick Rose » and five French translations illustrate the thesis.La norme en anglais américain. Qu'est-ce que l'anglais américain « correct » ? Qui détermine la norme linguistique aux Etats-Unis et sur quels critères ? L'auteur retrace la longue bataille des normativistes depuis la guerre des dictionnaires au siècle dernier jusqu'aux querelles et aux incertitudes actuelles.Forgue Guy Jean. The Norm in American English. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°18, novembre 1983. L'anglais américain. Aspects de la traduction littéraire. pp. 451-461

A. S. Hornby. — The Oxford Paperback American Dictionary

Forgue Guy Jean. A. S. Hornby. — The Oxford Paperback American Dictionary. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°32, avril 1987. American Potpourri. pp. 329-330

Shira Wolosky. — Emily Dickinson: A Voice of War

Forgue Guy Jean. Shira Wolosky. — Emily Dickinson: A Voice of War. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°24-25, mai 1985. L'impérialisme culturel américain ? p. 320

Thomas P. Riggio (éd.). — Dreiser-Mencken Letters; the Correspondence of Theodore Dreiser and H.L. Mencken 1907-1945

Forgue Guy Jean. Thomas P. Riggio (éd.). — Dreiser-Mencken Letters; the Correspondence of Theodore Dreiser and H.L. Mencken 1907-1945. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°35, février 1988. Droit et affaires aux Etats-Unis. pp. 170-171

Thomas P. Riggio (éd.). — Dreiser-Mencken Letters; the Correspondence of Theodore Dreiser and H.L. Mencken 1907-1945

Forgue Guy Jean. Thomas P. Riggio (éd.). — Dreiser-Mencken Letters; the Correspondence of Theodore Dreiser and H.L. Mencken 1907-1945. In: Revue Française d'Etudes Américaines, N°35, février 1988. Droit et affaires aux Etats-Unis. pp. 170-171