384 research outputs found

    Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle.

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    The aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of representative bulls were recorded, totaling 476 Gyr animals. For CNV identification was used the PennCNV software and the CNVRs were determined by the CNVRuler software. A total of 26,672 CNVs were found, beingon average 62 CNV per animal. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes with 96% of these between 1.1 Kb to 100 Kb. The Ensembl's VEP tool, using the CNVRs information as input, found 913 coding regions, suggesting that exon regions were duplicated. In summary, the results help to better understand the Gyr genome and suggest that CNVRs might have some relationship with production traits.WCGALP 2014

    Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle.

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    The aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of representative bulls were recorded, totaling 476 Gyr animals. For CNV identification was used the PennCNV software and the CNVRs were determined by the CNVRuler software. A total of 26,672 CNVs were found, beingon average 62 CNV per animal. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes with 96% of these between 1.1 Kb to 100 Kb. The Ensembl's VEP tool, using the CNVRs information as input, found 913 coding regions, suggesting that exon regions were duplicated. In summary, the results help to better understand the Gyr genome and suggest that CNVRs might have some relationship with production traits

    Desenvolvimento de experimento com compostagem de resíduos orgânicos sólidos urbanos

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    Em consonância com os problemas ambientais que o Município de Volta Redonda vem enfrentando com a relação à gestão dos seus resíduos sólidos orgânicos urbanos e as diretrizes da nova Política Nacional de Resíduos Sólidos, o presente trabalho estuda, em escala piloto, soluções técnicas alternativas para o tratamento e destinação final destes resíduos orgânicos através de novas técnicas de compostagem. No estudo foram testadas diferentes técnicas de compostagem de maneira direcionada para os resíduos sólidos orgânicos urbanos quer sejam restos de alimentos, podas ou aparas de vegetais. Adequando-se também as particularidades relativas à disponibilidade de área, logística de transporte, plano diretor e demais aspectos que envolvem a escolha de melhores metodologias de tratamento e disposição final dos resíduos orgânicos por processos aeróbios. No projeto, em conjunto com a COPPE/UFRJ e com apoio da FAPERJ, foram montadas e monitoradas composteiras e leiras na área do campus Três Poços - UniFOA. O pequeno volume de chorume gerado no processo é recirculado nas leiras, sendo benéfico para manutenção da umidade destas de forma a manter uma boa atividade bacteriana. Foram realizadas várias análises de campo para controle do processo de compostagem, tais como umidade, gases emanados (CH4, CO2 e O2) e temperatura nos diversos perfis das leiras. As análises laboratoriais relativas ao monitoramento dos processos de compostagem (pH, SV, ST, CN, TOM, TOC, NKt, N, P, K, Na, Mg) estão em confecção por laboratório especializado na UFRRJ e estudos complementares também estão em realização durante este ano de 2012 na Universidade de Dresden/Alemanha para complementação das alternativas de processo para tratamento dos resíduos orgânicos estudados

    Influência da adição de potássio e cálcio sobre atributos do solo de área de videira destinada à elaboração de vinhos finos no Vale do Submédio São Francisco.

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    Este trabalho avaliou o efeito da aplicação de potássio e cálcio sobre os atributos do solo de área com videiras Vitis vinifera L. destinadas à elaboração de vinhos finos
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