Analyse du champ électromagnétique, dans les bobines des sondes de HR-MAS utilisées pour RMN à haut-champ

STRASBOURG-Sc. et Techniques (674822102) / SudocSudocFranceF

Application de la RMN HRMAS en cancérologie ("Modèles métaboliques de classification des tumeurs cérébrales".)

STRASBOURG-Medecine (674822101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

La métabolomique par spectroscopie RMN HRMAS appliquée en cancerologie

Le Cancer, l une des pathologies les plus fréquentes au sein de la population, possède encore actuellement un taux de morbi-mortalité important tous sexes confondus, et ce malgré les importants progrès diagnostiques et thérapeutiques réalisés. D un point de vue diagnostique, dans une approche dite de Biologie de systèmes , en complément de l étude anatomo- pathologique qui reste la référence, de nouvelles techniques ont été développées pour la caractérisation de profils métaboliques (Métabolomique) d échantillons tissulaires pathologiques ou non, parmi lesquelles la Spectroscopie RMN HRMAS. Après un bref rappel théorique et avoir dressé le bilan des applications de cette technique en Cancérologie, nous avons exposé les différentes étapes du protocole à mettre en place afin d envisager son implémentation dans un cadre hospitalier. L ensemble des résultats présentés permettent d envisager l utilisation de cette technique en pratique clinique courante. Il faut néanmoins valider la robustesse des modèles statistiques élaborés et confirmer ces résultats sur de plus grandes cohortes d échantillons. Des développements technologiques, analytiques et statistiques sont également nécessaires.Cancer, one of the most frequent pathologies among the population, has still an important morbidity-mortality rate all sex confounded, despite the important diagnostical and therapeutical progresses achieved. From a diagnostical point of view, in a so called Systems Biology approach , as a complement of the gold standard histopathological study, some new techniques have been developed for the characterization of metabolic profiles (Metabolomics) of tissular samples pathological or not, among which HRMAS NMR Spectroscopy. After some brief theoretical considerations and after reporting the applications of this technique in Cancerology, we exposed the different steps of the protocol to design in order to consider its implementation in a hospital set up. All the results presented allow considering the use of this technique in a clinical routine. Nevertheless, it is necessary to validate the robustness of the statistical models built and to confirm these results on much larger cohorts of samples. Some technical, analytical and statistical developments are also needed.STRASBOURG-Bib.electronique 063 (674829902) / SudocSudocFranceF

Régression Bêta PLS

International audienceMany responses, for instance experimental results, yields or economic indices, can be naturally expressed asrates or proportions whose values must lie between zero and one or between any two given values. The Beta regressionoften allows to model these data accurately since the shapes of the densities of Beta laws are very versatile. Yet, asany of the usual regression model, it cannot be applied safely in case of multicollinearity and not at all when themodel matrix is rectangular. These situations are frequently found from chemistry to medicine through economicsor marketing. To circumvent this difficulty, we derived an extension of PLS regression to Beta regression models. It,as well as several other tools, such as cross validation or bootstrap techniques, is available for the R language in theplsRbeta package.De nombreuses variables d'intérêt, comme par exemple des résultats expérimentaux, des rendements ou des indicateurs économiques, s'expriment naturellement sous la forme de taux, de proportions ou d'indices dont les valeurs sont nécessairement comprises entre zéro et un ou plus généralement deux valeurs fixes connues à l'avance. La régression Bêta permet de modéliser ces données avec beaucoup de souplesse puisque les fonctions de densité des lois Bêta peuvent prendre des formes très variées. Toutefois, comme tous les modèles de régression usuels, elle ne peut s'appliquer directement lorsque les prédicteurs présentent des problèmes de multicolinéarité ou pire lorsqu'ils sont plus nombreux que les observations. Ces situations se rencontrent fréquemment de la chimie à la médecine en passant par l'économie ou le marketing. Pour circonvenir cette difficulté, nous formulons une extension de la régression PLS pour les modèles de régression Bêta. Celle-ci, ainsi que plusieurs outils comme la validation croisée et des techniques bootstrap, est disponible pour le langage R dans la bibliothèque plsRbeta

Metabolic characterization of caviar specimens by 1H NMR spectroscopy : Towards caviar authenticity and integrity

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In situ mapping of the reactivity of chemical sensitizers in reconstructed human epidermis using high-resolution magic angle spinning (HRMAS) NMR technique. SOT 58th Annual Meeting (Society of Toxicology), Baltimore, États-Unis

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Metabolic characterization of caviar specimens by 1H NMR spectroscopy : Towards caviar authenticity and integrity

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