An integrated cell atlas of the lung in health and disease

Single-cell technologies have transformed our understanding of human tissues. Yet, studies typically capture only a limited number of donors and disagree on cell type definitions. Integrating many single-cell datasets can address these limitations of individual studies and capture the variability present in the population. Here we present the integrated Human Lung Cell Atlas (HLCA), combining 49 datasets of the human respiratory system into a single atlas spanning over 2.4 million cells from 486 individuals. The HLCA presents a consensus cell type re-annotation with matching marker genes, including annotations of rare and previously undescribed cell types. Leveraging the number and diversity of individuals in the HLCA, we identify gene modules that are associated with demographic covariates such as age, sex and body mass index, as well as gene modules changing expression along the proximal-to-distal axis of the bronchial tree. Mapping new data to the HLCA enables rapid data annotation and interpretation. Using the HLCA as a reference for the study of disease, we identify shared cell states across multiple lung diseases, including SPP1 + profibrotic monocyte-derived macrophages in COVID-19, pulmonary fibrosis and lung carcinoma. Overall, the HLCA serves as an example for the development and use of large-scale, cross-dataset organ atlases within the Human Cell Atlas. </p

An integrated cell atlas of the lung in health and disease

Single-cell technologies have transformed our understanding of human tissues. Yet, studies typically capture only a limited number of donors and disagree on cell type definitions. Integrating many single-cell datasets can address these limitations of individual studies and capture the variability present in the population. Here we present the integrated Human Lung Cell Atlas (HLCA), combining 49 datasets of the human respiratory system into a single atlas spanning over 2.4 million cells from 486 individuals. The HLCA presents a consensus cell type re-annotation with matching marker genes, including annotations of rare and previously undescribed cell types. Leveraging the number and diversity of individuals in the HLCA, we identify gene modules that are associated with demographic covariates such as age, sex and body mass index, as well as gene modules changing expression along the proximal-to-distal axis of the bronchial tree. Mapping new data to the HLCA enables rapid data annotation and interpretation. Using the HLCA as a reference for the study of disease, we identify shared cell states across multiple lung diseases, including SPP1+ profibrotic monocyte-derived macrophages in COVID-19, pulmonary fibrosis and lung carcinoma. Overall, the HLCA serves as an example for the development and use of large-scale, cross-dataset organ atlases within the Human Cell Atlas

Dessiner son parcours professionnel, pour en tirer des enseignements

Dans le cadre de la formation continue pour des enseignants du supérieur, une activité d’expression visuelle a soutenu une posture réflexive à propos du développement professionnel de chacun. Il a été demandé aux enseignants de dessiner leur parcours professionnel en le comparant à un parcours routier. Ce dessin a ensuite servi de support aux enseignants pour dégager les leviers et les freins de leur développement professionnel, puis pour clarifier leur(s) perspective(s) d’évolution professionnelle. Cadrage théorique et échanges en binômes ont enrichi ce regard distancié. L’ensemble de ces activités constitue une préparation efficace et motivante à la rédaction d’un portfolio dans lequel l’enseignant analyse ses pratiques et son développement professionnels. Cet article décrit le cadre théorique et les modalités de cet ensemble d’activités ; il analyse ensuite les résultats obtenus, essentiellement à partir de l’étude du corpus de dessins réalisés par les enseignants, et d’une enquête d’évaluation réalisée auprès de ceux-ci

Les stratégies volitionnelles dans l'enseignement supérieur: se mettre au travail et s'y maintenir

La métacognition ?L’apprentissage autorégulé ?Quelles différences ?Quelles similitudes ?Comment les définir ?Comment les utiliser en contexte scolaire, académique, professionnel ?Voici les questions auxquelles cet ouvrage tente de répondre.Dans l’introduction, les coordinatrices dressent un historique des concepts et des travaux de recherche construits autour de cette problématique, depuis Flavell à nos jours. Les contributions de ce livre couvrent les différents niveaux de l’enseignement, de l’élémentaire au supérieur, en passant par le secondaire et l’éducation continue. Elles sont rédigées par des chercheurs enseignants francophones issus de Belgique, de France, de Suisse et du Canada.Certains chapitres, plus théoriques, intéresseront surtout les chercheurs et spécialistes du domaine, d’autres, plus proches des pratiques de classe sur le terrain, interpelleront davantage les praticiens-didacticiens qui souhaiteraient intégrer ces approches constructives et dynamiques dans leurs pratiques pédagogiques.info:eu-repo/semantics/publishe

La volition, entre motivation et cognition : quelle place dans la pratique des étudiants, quels liens avec la motivation et la cognition?

Cet article présente les conclusions d’une étude menée par le groupe AdAPTE dans le cadre de ses recherches sur la volition des étudiants de l’enseignement supérieur. Basé sur les résultats d’une enquête menée auprès de 2200 étudiants de première année répartis dans 16 établissements d’enseignement supérieur, il se focalise sur la manière dont les étudiants gèrent les conditions dans lesquelles ils se placent pour réaliser les activités d’apprentissage en autonomie et plus particulièrement la réalisation de synthèses. Le questionnaire est divisé en trois parties. La première permet de définir le profil des répondants. La deuxième interroge la perception qu’ont les étudiants de leur motivation, de leur profil volitionnel et de leurs comportements cognitifs. Enfin, la troisième permet de déterminer comment les étudiants utilisent les stratégies volitionnelles, réparties en six catégories. Les résultats de cette enquête ont mis en lumière différents liens. Au niveau de la motivation, un lien apparaît entre les étudiants qui se mettent facilement au travail et y restent jusqu’au bout et ceux qui expriment plus souvent un sentiment de compétence élevé et qui y prennent plus de plaisir que les autres. Au niveau de la cognition, un lien entre l’engagement cognitif et le profil volitionnel a été identifié. L’analyse de la concordance entre les stratégies génériques et leur mise en œuvre via des stratégies spécifiques a permis d’identifier lesquelles devraient être particulièrement travaillées soit avec tous les étudiants, soit avec un sous-ensemble de ceux-ci dans le cadre de l’aide à la réussite. Grâce à ces résultats, des pistes pour rendre les étudiants plus actifs, plus attentifs et plus persévérants sont proposées aux enseignants et aux accompagnateurs méthodologiques, c’est-à-dire aux personnes qui visent le développement des méthodes de travail efficaces, personnelles et adaptées des étudiants en début d’enseignement supérieur.This paper reports the findings of a study by the AdAPTE group as part of its research on the volition of students in higher education. Based on the results of a survey among nearly 2,200 first-year students in 16 institutions of higher education, it focuses on how students manage learning activities, more specifically syntheses, in autonomy. The questionnaire is divided into three parts. Part one defines the profile of participants. Part two addresses students’ perceptions of their motivation, volition profile and cognitive behaviour. Finally, part three examines how students use volitional strategies classified into six categories. The results of this survey revealed various links. As regards motivation, it appears that students who get to work and stay at work feel more competent and enjoy it more than others. At the cognitive level, a link between cognitive engagement and volition profile was identified. The concordance analysis between generic strategies and their implementation through specific strategies made it possible to identify which one should be particularly exercised either with all the students or with a subset of them in the context of academic achievement support. Thanks to these results, teachers and methodological assistants are offered useful hints to make students more active, attentive and persevering at the beginning of higher education