Etude de faisabilité d'un projet de développement de la culture du café Arabica

L'objectif de ce projet est de définir et de mettre en place, principalement dans le nord du pays, pendant une phase initiale de 5 ans, un programme de développement de l'arabicaculture dont le produit procurera aux planteurs et à l'état des revenus rémunérateurs. L'étude s'est déroulée au Viet Nam du 9/8 au 7/9/96. Elle a permis de situer l'importance du secteur agricole dans le contexte national, d'établir un bilan - diagnostic de la caféiculture robusta et Arabica, de définir les opérateurs et services d'appui à la production ainsi que les perspectives d'évolution du secteur caféier. Dans ce rapport sont détaillés les actions envisagées et les modalités d'exécution, les coûts et plan de financement ainsi que la justification économique et financière au niveau des planteurs, des unités de transformation et de l'économie national

Multimodal analysis of methylomics and fragmentomics in plasma cell-free DNA for multi-cancer early detection and localization

Despite their promise, circulating tumor DNA (ctDNA)-based assays for multi-cancer early detection face challenges in test performance, due mostly to the limited abundance of ctDNA and its inherent variability. To address these challenges, published assays to date demanded a very high-depth sequencing, resulting in an elevated price of test. Herein, we developed a multimodal assay called SPOT-MAS (screening for the presence of tumor by methylation and size) to simultaneously profile methylomics, fragmentomics, copy number, and end motifs in a single workflow using targeted and shallow genome-wide sequencing (~0.55×) of cell-free DNA. We applied SPOT-MAS to 738 non-metastatic patients with breast, colorectal, gastric, lung, and liver cancer, and 1550 healthy controls. We then employed machine learning to extract multiple cancer and tissue-specific signatures for detecting and locating cancer. SPOT-MAS successfully detected the five cancer types with a sensitivity of 72.4% at 97.0% specificity. The sensitivities for detecting early-stage cancers were 73.9% and 62.3% for stages I and II, respectively, increasing to 88.3% for non-metastatic stage IIIA. For tumor-of-origin, our assay achieved an accuracy of 0.7. Our study demonstrates comparable performance to other ctDNA-based assays while requiring significantly lower sequencing depth, making it economically feasible for population-wide screening