Evaluación de tecnologías diagnósticas y tipos de muestreos

For the researcher evaluating sampling diagnostic technology, the present revision and up-dating of diagnostic and sampling techniques has as its objective the demonstration of how they can be used to reduce costs and risks and how to carry out test characteristics' calculations, to establish sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value, in an unbiased way in a representative sample of the population in which the test will be used and to give recommendations to prevent errors which frequently occur in test evaluation, such as in pseudo-retrospective sampling.La presente revisión y actualización tiene como objetivo mostrar al investigador de evaluación de tecnologías diagnósticas los diferentes tipos de muestreo que se pueden utilizar para disminuir costos y riesgos, y la manera de realizar los cálculos de las características de las pruebas, a saber: sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo y valor predictivo negativo de una manera sin sesgo en una muestra representativa de la población en que la prueba sería utilizada y se dan algunas recomendaciones para evitar errores demasiado frecuentes en la evaluación de pruebas diagnósticas como el muestreo seudorretrospectivo

Reproducibilidad del tiempo en posición sedente evaluado con el International Physical Activity Questionnaire (IPAQ) y el Global Physical Activity Questionnaire (GPAQ)

ResumenObjetivo:Evaluar la reproducibilidad y el nivel de acuerdo del tiempo en posición sedente evaluado con el IPAQ y el GPAQ. Métodos: Se realizó un estudio de evaluación de tecnologías diagnósticas. Los cuestionarios IPAQ y GPAQ fueron administrados por dos encuestadores a 92 adultos (42.2 ±13.9 años), en dos oportunidades con un intervalo de tiempo entre 3 y 6 días, en el mismo orden de aplicación establecido aleatoriamente en la primera prueba. En el análisis, se evaluó la reproducibilidad prueba-reprueba de los ítems que miden el tiempo en posición sedente del IPAQ y del GPAQ y la reproducibilidad entre ítems, aplicando el Coeficiente de Correlación Intraclase (CCI (2.1)) y sus intervalos de confianza del 95% (IC95%). El nivel de acuerdo se estableció mediante el método Bland y Altman.[Angarita A, Camargo DM, Oróstegui I. Reproducibilidad del tiempo en posición sedente evaluado con el International Physical Activity Questionnaire (IPAQ) y el Global Physical Activity Questionnaire (GPAQ). MedUNAB 2010; 13:5-12].Palabras clave: Cuestionario, reproducibilidad, sedentarismo, IPAQ, GPAQ

Mycobacterium chelonae y Mycobacterium abscessus: patógenos emergentes

A mycobacterium isolated in 1903 from the lungs of a sick marine turtle was the first report of Mycobacterium chelonae. It is a different species from Mycobacterium fortutuitum, isolated from frogs in 1905, and from Mycobacterium abscessus which was initially considered a subspecies of M. chelonae. Within the group of rapidly growing mycobacteria, which are characterized by their growth in culture in less than 7 days, these three species are the only human pathogens of the species. They are causative agents of localized or disseminated subcutaneous nodules and abscesses, of postoperative lesions, osteomielitis, queratitis and several other lesions. Skin and soft tissue lesions are most frequently observed, produced by the traumatic inoculation of these mycobacteria. Histopathology of nodules and abscesses reveals a mixed inflammatory, supurative and granulomatous process. In one quatier of these cases, clumps of acid fast bacilli can be demonstrated, usually localized within a vacuole at the centre of an abscess. Several outbreaks of subcutaneous abscesses produced by atypical mycobacteria, secondary to the application of contaminated injections, have been reponed in Colombia. In 1981, 50 people -mostly, children- were affected after vaccination against yellow fever in Bucaramanga; in 1989, 13 people were affected after subcutaneous allergen injections in Medellin. A third one involved 297 people, in 1993, along the Atlantic coast after the application of xilocayne subcutaneously for bioenergetic therapy. Other postraumatic cases have also been reported. The disseminated disease caused by mycobacteria of rapid growth occurs in immunosuppressed patients. Polymorphonuclears predominate in skin biopsies, no epithelioid granuloma is obsetved and abundant bacilli can be demonstrated in histological sections. The causative mycobacteria can be isolated from biopsies of lesions, since the precise diagnosis requires the accurate identification of the microrganism by culture. The practice of antibiograms is recommended dueto the varying differences in antimicrobial sensitivities among these mycobacteria. M. abscessus is sensitive to clarithromycin, amikacyn and cefoxitim; M. fortuitum to amikacyn, cefoxitim and ciprofloxacyn, and M. chelonae to cefoxitim and amikacyn. Monotherapy is not recommended under any circumstances. Differential diagnosis of cutaneous disease due to atypical mycobacteria must be made with all those clinical entities manifested by nodules, abscesses, ulcers or draining sinuses, such as tuberculosis, sporotrichosis, nocardiosis and botriomicosis. Atypical mycobacteria are among the agents which can produce skin nodules and abscesses of lymphangitic spread. In pulmonary disease, the main differential diagnosis is tuberculosis. When there are abscesses at the centre of granulomas, aiypical mycobacteria etiology must be suspected. These microorganisms are widely distributed in nature. The main source of transmission of these atypical mycobacteria to humans is via water. Strict supervision for their application to man, use of disposable syringes and needles, adequate disinfection of reusable material and equipment with proven mycobactericidals, ¡.e., 2% alkaline glutaraldehyde, and minimal biosecurity standards prevent diseases caused by atypical mycobacteria.Mycobacterium chelonae es el nombre correcto para la micobacteria aislada en 1903 de los pulmones enfermos de una tortuga marina. En una especie distinta de Mycobacterium fo/tuitum, aislado de ranas en 1905, y de Mycobacterium abscessus, considerado actualmente como una subespecie de M chelonae. Estas tres especies son las únicas patógenas para el hombre dentro del grupo de micobacterias ambientales o atipicas, de crecimiento rápido, las cuales se caracterizan por formar colonias en cultivo en menos de siete días. Son agentes etiológicos de nódulos y abscesos cutáneos, localizados y diseminados, de lesiones postoperatorias, usualmente en la cicatriz quirúrgica, de lesiones pulmonares y de linfadenitis granulomatosa, de osteomielitis y de queratitis, entre otras. Las lesiones cutáneas y de los tejidos blandos son las más frecuentes y resultan generalmente de la inoculación traumática de esta micobacteria. Histopatológicamente, los nódulos y abscesos muestran un proceso inflamatorio, supurativo y granulomatoso, mixto, en el que en la cuarta parte de los casos pueden demostrarse conglomerados de bacilos ácido alcohol resistentes, que tienden a estar situados en una vacuola en el centro del absceso. En Colombia, se han descrito tres brotes de abscesos subcutáneos producidos por bacterias ambientales, secundarios a la aplicación de inyecciones contaminadas con el germen causal: en 1981, en Bucaramanga, luego de la aplicación de la vacuna contra la fiebre amarilla, en 50 personas, la mayoría niños; en 1989, en Medellin, por la inyección subcutánea de alergenos, en 13 personas; y, en 1993, en varias ciudades de la costa atlántica, luego de aplicaciones subcutáneas de xilocaína, como tratamiento bionergético, en 297 pacientes. Existen otros informes aislados de casos posttraumáticos.La enfermedad diseminada por micobacterias de rápido crecimiento, se presenta en pacientes inmunosuprimidos. En la biopsia, predominan los polimorfonucleares, no hay granuloma epitelioide y el número de bacilos es abundante. La micobacteria implicada puede aislarse a partir de un frotis o biopsia de la lesión, pero, el diagnóstico preciso sólo puede establecerse por cultivo. Es recomendable practicar un antibiograma por las diferencias en la sensibilidad de estas micobacterias. M. abscessus es sensible a claritromicina, amikacina y cefoxitina. M. fortuitum lo es a amikacina, cefoxitina y ciprofloxacina y M. chelonae es sensible a cefoxitina y amikacina. El uso de monoterapia no es aconsejable. El diagnóstico diferencial de enfermedad cutánea por micobacterias atípicas debe hacerse con todas aquellas entidades que se manifiestan por nódulos, abscesos, úlceras o trayectos fistulosos, tales como la tuberculosis, la leishmaniasis, las úlceras piógenas, los nódulos reumatoideos, los granulomas a cuerpo extraño, la esporotricosis, la nocardiosis y la botriomicosis, entre otras. Las micobacterias atipicas están entre los microorganismos que pueden producir nódulos y abscesos de propagación linfangitica. En el pulmón, el principal diagnóstico diferencial es la tuberculosis, cuando hay granulomas centrados por micrabscesos, debe pensarse en etiología por micobacterias atipicas. Estos géneros están ampliamente distribuidos en el medio ambiente. El agua y diferentes soluciones acuosas son el mayor vector para su trasmisión al hombre. Su estricta supervisión para aplicación al ser humano, el uso de agujas y jeringas desechables, la adecuada desinfección de equipos y material reutilizable con micobactericidas de comprobada eficacia, el más útil de los cuales es el glutaraldehido alcalino al 2% y el cumplimiento de unas mínimas normas de bioseguridad, son las principales medidas de control para la prevención de enfermedades producidas por rnicobacterias ambientales

Efecto de tres modalidades de crioterapia sobre la temperatura de la piel durante las fases de enfriamiento y recalentamiento

Introducción: La crioterapia es útil en el manejo de las lesiones músculo esqueléticas, debido a los efectos derivados del enfriamiento tisular, sin embargo, pocos estudios han evaluado la efectividad de distintas modalidades de crioterapia para mantener el enfriamiento después de la aplicación y los efectosde la actividad post-enfriamiento sobre la recuperación de la temperatura.Objetivos: Comparar los efectos de tres modalidades de crioterapia y de la actividad post-enfriamiento, sobre la recuperación de la temperatura de la piel.Métodos: Estudio experimental con 36 sujetos sanos aleatorizados en tres grupos:paquete de hielo, inmersión en agua helada o criomasaje. Las modalidades se aplicaron por 15min en la pantorrilla. Posteriormente, cada grupo se subdividió aleatoriamente en reposo o marcha seguida dereposo. Para el análisis se aplicaron t de student apareda y ANOVA de mediciones repetidas (a=0,05).Resultados: Las tres modalidades disminuyeron la temperatura de la piel, con un efecto mayor causadopor el criomasaje (-27,6°C). Durante el recalentamiento los tres grupos aumentaron la temperatura,independientemente de la actividad post-enfriamiento (p<0,0001). La recuperación de la temperaturafue menor en el grupo de inmersión en agua helada. Solo el grupo que recibió el paquete de hielo yrealizó marcha seguida de reposo alcanzó la temperatura inicial.Conclusiones: Las tres modalidades disminuyeron la temperatura de la piel, con un mayor efecto producido por el criomasaje; sin embargo, lainmersión mantuvo por más tiempo su efecto sin importar el tipo de actividad post-enfriamiento.SaludUIS 2011; 43 (2): 119-129Palabras clave: Crioterapia, temperatura, recalentamiento, termorregulación, fisioterapiaABSTRACTIntroduction: Cryotherapy is useful in the management of muscle-skeletal injuries, due to the effects of tissuecooling; however, few studies have evaluated the effectiveness of diferents forms of cryotherapy to maintain coolingafter application and the effects of post-cooling activity on the recovery on the skin temperature.Objectives: Tocompare the effects of three modalities of cryotherapy on the skin temperature (ST) and its variation during therewarming, under two different activities.Methods: An experimental study with 36 subjects randomly allocatedto either three groups: crushed ice pack (CI), massage with ice (MI) or ice-water immersion (WI), these modalitieswere applied for 15min in the calf. Subsequently each group was subdivided randomly in: rest or gait followedby rest. For the analysis a paired Student’s t test and ANOVA for repeated measurements were applied witha=0.05.Results: The three modalities decreased skin temperature, with a greater effect caused by MI (-27.6).During rewarming the three groups increased temperature, regardless the activity post-cooling (P <0.0001). TheST recovery was minor in the WI group. Only the group that received CI and the rewarming was walking followedby rest, reached the initial ST.Conclusions: The three modalities decreased skin temperature but the MI showedthe greatest cooling on ST, however the WI maintained by major time this decreasing during the rewarming withoutinfluence of activity. Salud UIS 2011; 43 (2): 119-129Keywords: Cryotherapy, skin temperature, rewarming, thermoregulatio

Efecto de tres modalidades de crioterapia sobre la temperatura de la piel durante las fases de enfriamiento y recalentamiento

Introducción: La crioterapia es útil en el manejo de las lesiones músculo esqueléticas, debido a los efectos derivados del enfriamiento tisular, sin embargo, pocos estudios han evaluado la efectividad de distintas modalidades de crioterapia para mantener el enfriamiento después de la aplicación y los efectosde la actividad post-enfriamiento sobre la recuperación de la temperatura.Objetivos: Comparar los efectos de tres modalidades de crioterapia y de la actividad post-enfriamiento, sobre la recuperación de la temperatura de la piel.Métodos: Estudio experimental con 36 sujetos sanos aleatorizados en tres grupos:paquete de hielo, inmersión en agua helada o criomasaje. Las modalidades se aplicaron por 15min en la pantorrilla. Posteriormente, cada grupo se subdividió aleatoriamente en reposo o marcha seguida dereposo. Para el análisis se aplicaron t de student apareda y ANOVA de mediciones repetidas (a=0,05).Resultados: Las tres modalidades disminuyeron la temperatura de la piel, con un efecto mayor causadopor el criomasaje (-27,6°C). Durante el recalentamiento los tres grupos aumentaron la temperatura,independientemente de la actividad post-enfriamiento (p<0,0001). La recuperación de la temperaturafue menor en el grupo de inmersión en agua helada. Solo el grupo que recibió el paquete de hielo yrealizó marcha seguida de reposo alcanzó la temperatura inicial.Conclusiones: Las tres modalidades disminuyeron la temperatura de la piel, con un mayor efecto producido por el criomasaje; sin embargo, lainmersión mantuvo por más tiempo su efecto sin importar el tipo de actividad post-enfriamiento.SaludUIS 2011; 43 (2): 119-129Palabras clave: Crioterapia, temperatura, recalentamiento, termorregulación, fisioterapiaABSTRACTIntroduction: Cryotherapy is useful in the management of muscle-skeletal injuries, due to the effects of tissuecooling; however, few studies have evaluated the effectiveness of diferents forms of cryotherapy to maintain coolingafter application and the effects of post-cooling activity on the recovery on the skin temperature.Objectives: Tocompare the effects of three modalities of cryotherapy on the skin temperature (ST) and its variation during therewarming, under two different activities.Methods: An experimental study with 36 subjects randomly allocatedto either three groups: crushed ice pack (CI), massage with ice (MI) or ice-water immersion (WI), these modalitieswere applied for 15min in the calf. Subsequently each group was subdivided randomly in: rest or gait followedby rest. For the analysis a paired Student’s t test and ANOVA for repeated measurements were applied witha=0.05.Results: The three modalities decreased skin temperature, with a greater effect caused by MI (-27.6).During rewarming the three groups increased temperature, regardless the activity post-cooling (P <0.0001). TheST recovery was minor in the WI group. Only the group that received CI and the rewarming was walking followedby rest, reached the initial ST.Conclusions: The three modalities decreased skin temperature but the MI showedthe greatest cooling on ST, however the WI maintained by major time this decreasing during the rewarming withoutinfluence of activity. Salud UIS 2011; 43 (2): 119-129Keywords: Cryotherapy, skin temperature, rewarming, thermoregulatio

Osmolality predictive models of different polymers as tools in parenteral and ophthalmic formulation development.

During the development of parenteral dosage forms, different physicochemical studies are required to ensure stable, effective and safe formulations. The osmolality of this kind of dosage forms should bear a close similarity to the body fluids to prevent local irritation, pain or even more significant side effects like endothelial damage. The osmotic studies performed in Polyethylene glycol 400 (PEG 400), Polyethylene glycol 4000 (PEG 4000), Poloxamer 407 (P407), Sodium Hyaluronate (SH), Chondroitin Sulphate Sodium (CS), Cremophor RH 40 (CRE40) and Polyvinyl alcohol (PVA) aqueous solutions, showed that the theoretical determination of the osmolality based on their molecular weight as the only determinant factor did not agree with the values obtained by the measurement of colligative properties such as the freezing point depression. The data obtained from this study and its analysis, provided predictive equations that can be used as tools in the primary development to estimate formulation's osmolality at different concentrations; and its evolution over a period at the hypothetical worst-case scenario of storage temperature

Ethical guidelines for the allocation of scarce health resources in the framework of the COVID-19 pandemic in Colombia

La pandemia por COVID-19 ha traído una inmensa presión sobre recursos sanitarios limitados, que incluyen personal de salud, elementos de protección personal y, de manera especialmente preocupante, camas de cuidado intensivo, ventiladores y demás equipos requeridos para el cuidado crítico

Tissue-Associated Bacterial Alterations in Rectal Carcinoma Patients Revealed by 16S rRNA Community Profiling

Sporadic and inflammatory forms of colorectal cancer (CRC) account for more than 80% of cases. Recent publications have shown mechanistic evidence for the involvement of gut bacteria in the development of both CRC-forms. Whereas, colon and rectal cancer have been routinely studied together as CRC, increasing evidence show these to be distinct diseases. Also, the common use of fecal samples to study microbial communities may reflect disease state but possibly not the tumor microenvironment. We performed this study to evaluate differences in bacterial communities found in tissue samples of 18 rectal-cancer subjects when compared to 18 non-cancer controls. Samples were collected during exploratory colonoscopy (non-cancer group) or during surgery for tumor excision (rectal-cancer group). High throughput 16S rRNA amplicon sequencing of the V4V5 region was conducted on the Ion PGM platform, reads were filtered using Qiime and clustered using UPARSE. We observed significant increases in species richness and diversity in rectal cancer samples, evidenced by the total number of OTUs and the Shannon and Simpson indexes. Enterotyping analysis divided our cohort into two groups, with the majority of rectal cancer samples clustering into one enterotype, characterized by a greater abundance of Bacteroides and Dorea. At the phylum level, rectal-cancer samples had increased abundance of candidate phylum OD1 (also known as Parcubacteria) whilst non-cancer samples had increased abundance of Planctomycetes. At the genera level, rectal-cancer samples had higher abundances of Bacteroides, Phascolarctobacterium, Parabacteroides, Desulfovibrio, and Odoribacter whereas non-cancer samples had higher abundances of Pseudomonas, Escherichia, Acinetobacter, Lactobacillus, and Bacillus. Two Bacteroides fragilis OTUs were more abundant among rectal-cancer patients seen through 16S rRNA amplicon sequencing, whose presence was confirmed by immunohistochemistry and enrichment verified by digital droplet PCR. Our findings point to increased bacterial richness and diversity in rectal cancer, along with several differences in microbial community composition. Our work is the first to present evidence for a possible role of bacteria such as B. fragilis and the phylum Parcubacteria in rectal cancer, emphasizing the need to study tissue-associated bacteria and specific regions of the gastrointestinal tract in order to better understand the possible links between the microbiota and rectal cancer.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Programa Nacional de Apoio à Atenção Oncológica (Pronon)Associacao Beneficiente Alzira Denise Hertzog Silva (ABADHS)CIPE AC Camargo Canc Ctr, Med Genom Lab, Sao Paulo, BrazilUniv Sao Paulo, Inst Quim, Dept Bioquim, Sao Paulo, BrazilUniv Sao Paulo, Cursode Posgrad Bioinformat, Sao Paulo, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Dept Pelv Surg, Sao Paulo, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Dept Pathol, Sao Paulo, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Coll Med, Dept Gynecol, Lab Mol Gynecol, Sao Paulo, BrazilHosp Sirio Libane, Ctr Oncol Mol, Sao Paulo, BrazilUniv Sao Paulo, Food Res Ctr FoRC, Fac Ciencias Farmaceut, Dept Alimentos & Nutr Expt, Sao Paulo, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Dept Clin Oncol, Sao Paulo, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Lab Computat Biol & Boinformat, Sao Paulo, BrazilVirginia Tech, Biocomplex Inst, Blacksburg, VA USAUniv Sao Paulo, Fac Med, Inst Psychiat, Lab Neurosci LIM Alzira Denise Hertzog Silva 27, Sao Paulo, BrazilLaboratory of Molecular Gynecology, Department of Gynecology, Medicine College, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, BrazilFAPESP: 2015/01507-7FAPESP: 2013/07914-8CAPES: 88887.062078/2014-00CAPES: 3385/2013PRONON: 25000.055.167/2015-23Web of Scienc