Caracterización de la variabilidad genética de cepas de Pseudomonas spp. patógenas en arroz

The objective of this work was to characterize the genetic variability of strains of Pseudomonas spp. that cause Sheath Brown Rot of rice in Cuba, through the analysis of genomic regions. A first grouping was performed based on the genetic fingerprint analysis by PCR, and then the analysis was developed through rep-PCR (ERIC, BOX and REP-PCR). In the two types of tests, the strains showed molecular variability, which was evidenced by the formation of three groups of Pseudomonas that circulate in the country. One of them grouped the strains A74 and A75, the second group included the strains A90 and A91, and the last group related most of the strains (A9, A36, A63, PR1 and PR3), the latter identified as Pseudomonas sp. or Pseudomonas fluorescens.El objetivo de este trabajo fue caracterizar la variabilidad genética de cepas de Pseudomonas spp. causantes de la Pudrición parda de la vaina en arroz, en Cuba, mediante el análisis de regiones genómicas. Se realizó un primer agrupamiento basado en el análisis de la huella genética mediante PCR. Posteriormente, se desarrolló el análisis a través de rep-PCR (ERIC, BOX y REP-PCR). En los dos tipos de ensayos las cepas mostraron variabilidad molecular, lo que se evidenció por la formación de tres grupos de Pseudomonas que circulan en el país. El primer grupo estuvo conformado por las cepas A74 y A75, el segundo incluyó las cepas A90 y A91, y el último relacionó la mayoría de las cepas (A9, A36, A63, PR1 y PR3); estas últimas se identificaron como Pseudomonas sp. o Pseudomonas fluorescens

Metodología para la detección temprana de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli en cultivo de frijol común (Phaseolus vulgaris L.) en la provincia Mayabeque, Cuba

El frijol común (Phaseolus vulgaris L.) es la leguminosa comestible de mayor importancia en el mundo, proporciona una fuente significativa de proteínas, vitaminas y minerales a la dieta humana. La baja productividad de este cultivo se debe a numerosos factores, entre ellos están los problemas fitosanitarios, como son las enfermedades causadas por bacterias. En Cuba encontramos el denominado Tizón común o Bacteriosis común, provocado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli que ocasiona grandes pérdidas en el rendimiento y en la calidad de la semilla. Con el objetivo de elaborar una estrategia que permita la detección temprana de dicho patógeno en semillas y en la fase temprana de la enfermedad en campo se emplearon hojas y frutos procedentes de plantas con síntomas típicos de la enfermedad. Para ello, se procedió al aislamiento en medios de cultivo semiselectivos (YDC y XCP1), la prueba de patogenicidad en cultivos susceptibles, así como la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) con los cebadores específicos p7X4c yp7X4e. Los aislados manifestaron diferentes sintomatologías de la enfermedad en las plantas inoculadas artificialmente y con el empleo de la PCR se obtuvo, como producto amplificado, un fragmento de ADN cuya talla corresponde con la informada en laliteratura para los aislados pertenecientes a este patógeno. Esta metodología permitió detectar la presencia de este agente en las regiones productoras de frijol en la provincia Mayabeque. Se mostró que la estrategia trazada puede emplearse como método de diagnóstico para la detección temprana de dicho patógeno en semillas o en las fases tempranas de la enfermedad; de esta forma se contribuye a controlar, disminuir o evitar las pérdidas causadas por este agente en el cultivo del frijol

Detección e identificación de nuevos aislados de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli en cultivares de frijol común (Phaseolus vulgaris L.) en la provincia Mayabeque, Cuba

Este estudio se realizó con el objetivo de detectar e identificar el agente causal de la enfermedad denominada Bacteriosis común o Tizón común en frijol, Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli. Se colectaron un total de 30 muestras de hojas y vainas de plantas infectadas de forma natural en diferentes localidades de la provincia Mayabeque. Las muestras se procesaron para el aislamiento del agente causal y se identificaron por las siguientes técnicas: aislamiento en medios de cultivo semiselectivos (YDCA y XCP1), prueba de patogenicidad en un cultivar susceptible (Bat 304), así como la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) con los cebadores específicos (p7X4c yp7X4e). De 30 aislados obtenidos, 29 provocaron síntomas en el cultivar utilizado en la prueba de patogenicidad. Los aislados manifestaron diferentes sintomatologías de la enfermedad en las plantas inoculadas artificialmente. La PCR rindió, como producto amplificado, un fragmento de ADN cuya talla corresponde con la informada en la literatura para los aislados pertenecientes a este patógeno. Estos resultados mostraron que la presencia de X. axonopodis pv. phaseoli afecta las regiones productoras de frijol en esta provincia, lo que representa un problema frecuente en dichas áreas.Palabras clave: bacteriosis común, tizón común, Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, patogenicidad.Detection and identification of new isolates of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli on common bean (Phaseolus vulgaris L.) cultivars in Mayabeque province, CubaABSTRACT: With the aim of detecting and identifying Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, the causal agent of the disease known as common bacterial blight (CBB) on common bean, 30 leaf and pod samples were taken from naturally infected plants in different localities of Mayabeque province. The samples were examined and the causal agent isolated and identified by using the following techniques: isolation on semiselective media (YDCA y XCP1), pathogenicity test in a susceptible cultivar (BAT 304), and the PCR technique with specific primers (p7X4c yp7X4e). Of the 30 isolates obtained, 29 caused symptoms on the cultivar used in the pathogenicity test. Different symptomatologies of the disease were shown by the artificially inoculated plants. The amplification product of the PCR was a DNA fragment with 800 bp, the size reported for the isolates of this pathogen. These results showed the presence of X. axonopodis pv. phaseoli affecting the bean growing areas of the province, a frequent problem in these areas.Key word: common bacterial blight, Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, pathogenicity

Contiguous Deletion of the X-Linked Adrenoleukodystrophy Gene (ABCD1) and DXS1357E: A Novel Neonatal Phenotype Similar to Peroxisomal Biogenesis Disorders

X-linked adrenoleukodystrophy (X-ALD) results from mutations in ABCD1. ABCD1 resides on Xq28 and encodes an integral peroxisomal membrane protein (ALD protein [ALDP]) that is of unknown function and that belongs to the ATP-binding cassette–transporter superfamily. Individuals with ABCD1 mutations accumulate very-long-chain fatty acids (VLCFA) (carbon length >22). Childhood cerebral X-ALD is the most devastating form of the disease. These children have the earliest onset (age 7.2 ± 1.7 years) among the clinical phenotypes for ABCD1 mutations, but onset does not occur at <3 years of age. Individuals with either peroxisomal biogenesis disorders (PBD) or single-enzyme deficiencies (SED) in the peroxisomal β-oxidation pathway—disorders such as acyl CoA oxidase deficiency and bifunctional protein deficiency—also accumulate VLCFA, but they present during the neonatal period. Until now, it has been possible to distinguish unequivocally between individuals with these autosomal recessively inherited syndromes and individuals with ABCD1 mutations, on the basis of the clinical presentation and measurement of other biochemical markers. We have identified three newborn boys who had clinical symptoms and initial biochemical results consistent with PBD or SED. In further study, however, we showed that they lacked ALDP, and we identified deletions that extended into the promoter region of ABCD1 and the neighboring gene, DXS1357E. Mutations in DXS1357E and the ABCD1 promoter region have not been described previously. We propose that the term “contiguous ABCD1 DXS1357E deletion syndrome” (CADDS) be used to identify this new contiguous-gene syndrome. The three patients with CADDS who are described here have important implications for genetic counseling, because individuals with CADDS may previously have been misdiagnosed as having an autosomal recessive PBD or SE