HabRef v7.0, référentiel des typologies d'habitats et de végétation pour la France. Guide méthodologique

HabRef a vocation à couvrir l'ensemble des territoires français, de métropole et d'outre‐mer et prend en compte les typologies d’habitats (dont les typologies d’habitats d’espèces) ou de végétations couvrant les milieux marins et/ou continentaux, ainsi que les listes d’habitats issues de directives communautaires ou de conventions internationales.Il est composé de deux ensembles :‐ le référentiel sensu stricto, tronc commun de champs d’informations donnant toutes les informations utiles sur chaque typologie (métadonnées) et indiquant pour chaque unité d’une typologie son identifiant unique national (CD_HAB), son nom et sa validité (nom de référence ou synonyme), son code dans la typologie, son niveau hiérarchique, sa présence en France, son descriptif principal ;‐ une base de connaissances associée au référentiel qui comporte les champs additionnels spécifiques à chaque typologie (descriptifs complémentaires, remarques, etc.) et renseigne, pour chaque unité d’une typologie, sur les relations synonymiques, la présence dans les territoiresfrançais, les liens avec les espèces, les correspondances avec d’autres unités, les sources d’information.Cette 7e version d’HabRef comporte 37 typologies et 45 tables de correspondances entre typologies, pour un total de 35 521 unités typologiques valides et de 45 782 correspondances. 99 626 relations entre unités typologiques et taxons sont également renseignées

La Planète Revisitée en Corse 2019-2021 : un grand inventaire de la biodiversité négligée dans une île méditerranéenne

International audienceFrom 2019 to 2021, scientific field campaigns have been organised in Corsica by the Muséum national d’Histoire naturelle, the Office français de la biodiversité and the Collectivité de Corse as part of the “Our Planet Reviewed” naturalist exploration programme. This paper presents the context, the state of biogeographical and taxonomic knowledge prior to our expeditions, and the objectives, the methods and the first results obtained. The aim was to establish a modern survey of the species present in a selection of sites representative of different Corsican ecosystems, and to further develop the natural history collections through depositing new specimens and species with associated standard DNA barcodes, useful for their identification. Over a period of three years, nineteen sites were surveyed with a semi-standardised protocol and a large-scale trapping scheme was organised in three of these. Sampling efforts focused on forest habitats at higher altitudes and on coastal dune and lowland marshland habitats. A vast array of methods was used to collect invertebrates, with a specific effort on flightinterception traps and pan traps. A total of 34 experts participated to the field surveys and more than 80 further contributed to the study of the specimens. Occurrence data are available in the Inventaire national du patrimoine naturel (http://www.inpn.fr) and, for specimens processed through DNA barcoding, specimen and DNA sequencing data will be accessible in the Barcode of Life datasystems (BOLD : http://www.boldsystems.org). In early 2023, the assembled datasets included 31,100 occurrence data for 3,900 taxa of terrestrial arthropods, representing a 53% increase in publicly available data for the island. More than 6,800 DNA barcode sequences have been produced for arthropods, representing a 14-fold increase in available sequences of Corsican insects compared to those available before the start of the programme. So far, these efforts resulted in producing the first Corsican records for 148 species and in the description of 12 species new to science.De 2019 à 2021, des missions scientifiques de terrain ont été organisées en Corse par le Muséum national d’Histoire naturelle, l’Office français de la biodiversité et la Collectivité de Corse dans le cadre du programme d’exploration naturaliste “La Planète Revisitée”. Cet article présente le contexte, l’état des connaissances biogéographiques et taxinomiques avant le début du programme, les objectifs, les méthodes ainsi que les premiers résultats obtenus. L’objectif était d’établir un inventaire moderne des espèces présentes dans une série de sites représentatifs de différents écosystèmes et d’enrichir les collections d’histoire naturelle de nouveaux spécimens et nouvelles espèces, et en y associant des codes-barres ADN standards, utiles à leur identification. Pendant les trois ans, 19 sites ont été inventoriés de façon semi-standardisée dont trois ont bénéficié d’un dispositif de piégeage d’ampleur. L’accent a été mis sur l’échantillonnage des espèces forestières, ainsi que sur les pièges à interception et les assiettes colorées pour les diptères et les hyménoptères. Au total, 34 experts ont participé aux inventaires de terrain et plus de 80 ont contribué à l’étude du matériel. Les données d’observation sont mises à disposition dans l’Inventaire national du patrimoine naturel (http://www.inpn.fr), et pour les individus associés à des codes-barres ADN, les données des spécimens et les séquences ADN seront accessibles dans le Barcode of Life datasystems (BOLD : http://www.boldsystems.org). Début 2023, les jeux de données produits comprennent 31 100 données d’occurrence pour 3900 taxons d’arthropodes terrestres, ce qui représente une augmentation de 53 % des données publiques disponibles pour l’île. Les codes-barres ADN de plus de 6800 spécimens d’arthropodes ont été produits, ce qui représente 14 fois plus de séquences existantes pour les insectes de Corse que ce qui était disponible avant le début du programme. Jusqu’à présent, 148 signalements nouveaux et 12 espèces nouvelles pour la Science ont été publiés