8 research outputs found
QM/MM Molecular Dynamics Study of Purine-Specific Nucleoside Hydrolase
- Author
- Barlow J. N.
- Beeman D.
- Berendsen H. J. C.
- Berg M.
- Berti P. J.
- Berti P. J.
- Cen Y.
- Chen Z. Q.
- Cornell W. D.
- Cui L. W.
- Degano M.
- Dolinsky T. J.
- Dudev T.
- Ebrahimi A.
- Estupinan B.
- Fahie K.
- Giabbai B.
- Goeminne A.
- Goeminne A.
- Hornak V.
- Hu P.
- Hu P.
- Jorgensen W. L.
- Ke Z.
- Ke Z.
- Ke Z.
- Ke Z.
- Kumar S.
- Kurtz J. E.
- Liang Z. J.
- Lovane E.
- Loverix S.
- Mazumder D.
- Mazumder D.
- Mazumder-Shivakumar D.
- Merino P.
- Millen A. L.
- Millen A. L.
- Miller R. L.
- Mitterbauer R.
- Muzzolini L.
- Parkin D. W.
- Parkin D. W.
- Petersen C.
- Porcelli M.
- Przybylski J. L.
- Ribeiro J. M. C.
- Rios-Font R.
- Ruibo Wu
- Ryckaert J. P.
- Shi W. X.
- Shim E. J.
- Souaille M.
- Sponer J. E.
- Ting Liu
- Tiwari S.
- Vandemeulebroucke A.
- Vandemeulebroucke A.
- Vandemeulebroucke A.
- Vandemeulebroucke A.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Wang J. M.
- Wang J. M.
- Wang S. L.
- Wengjin Gong
- Wu R.
- Wu R. B.
- Wu R. B.
- Yingkai Zhang
- Zexing Cao
- Zhang Y. K.
- Zhang Y. K.
- Zhang Y. K.
- Zhang Y. K.
- Zhou Y.
- Zhou Y.
- Zulfiqar F.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textEffects of Nucleophile, Oxidative Damage, and Nucleobase Orientation on the Glycosidic Bond Cleavage in Deoxyguanosine
- Author
- Baik M.-H.
- Becke A. D.
- Becke A. D.
- Berti P. J.
- Birck M. R.
- Birck M. R.
- Cadet J.
- Calvaresi M.
- Chen X.-Y.
- Chen Z.
- Cheng X.
- Cysewski P.
- Di Laudo M.
- Dinner A. R.
- Dwyer J. J.
- Erion M. D.
- Frisch M. J. T. G. W.
- Fromme J. C.
- Fromme J. C.
- Gannett P. M.
- GarcÃa-Moreno E. B.
- Halliwell B.
- Hamid S.
- Harvey S. C.
- Hatano A.
- Hitomi K.
- Hitomi K.
- Horenstein B. A.
- Hunter K. C.
- Hunter K. C.
- Hwang G. T.
- Kincaid K.
- King G.
- Knutson C. G.
- Kouchakdjian M.
- Lee C. T.
- Lee S.
- Lindahl T.
- Lindahl T.
- Loft S.
- Loverix S.
- Loverix S.
- Loverix S.
- Luo N.
- Ma A.
- Mazumder D.
- Mazumder D.
- Mazumder-Shivakumar D.
- McAuleyhecht K. E.
- McCann J. A. B.
- McCann J. A. B.
- McConnell T. L.
- Millen A. L.
- Millen A. L.
- Murray P. E.
- Osakabe T.
- Osman R.
- Osman R.
- Parkin D. W.
- Prior J. J.
- Przybylski J. L.
- Rabow L. E.
- Ratsep P. C.
- Rick S. W.
- Rios-Font R.
- Rios-Font R.
- Ryjacek F.
- Saparbaev M.
- Schlitt K. M.
- Schroeder G. K.
- Schyman P.
- Scott A. P.
- Seela F.
- Stivers J. T.
- Swarts S. G.
- Tehrani Z. A.
- Tomasi J.
- Tomasi J.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Vertessy B. G.
- Von Sonntag C.
- Wang Y.
- Ward J. F.
- Watson J. D.
- Whittleton S. R.
- Wielgus-Kutrowska B.
- Wilson D. M.
- Wuenschell G. E.
- Zharkov D. O.
- Zharkov D. O.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textDesigning an Appropriate Computational Model for DNA Nucleoside Hydrolysis: A Case Study of 2′-Deoxyuridine
- Author
- Ahn D. S.
- Ahn D. S.
- Almatarneh M. H.
- Almerindo G. I.
- Anderson V. E.
- Austin M. B.
- Baik M. H.
- Bao X. G.
- Barbe S.
- Barone V.
- Berti P. J.
- Berti P. J.
- Bianchet M. A.
- Birck M. R.
- Boys S. F.
- Brown T. N.
- Brown T. N.
- Burney S.
- Calvaresi M.
- Cao Z.
- Chatterjee A.
- Chen S. L.
- Chen X. Y.
- Chen X. Y.
- Chocholousova J.
- Chuchev K.
- Cramer C. J.
- da Silva C. O.
- De Vivo M.
- Deng H.
- Di Laudo M.
- Dinner A. R.
- Evans M. D.
- Fu A. P.
- Gao J. Y.
- Garrett E. R.
- Gates K. S.
- Hadler K. S.
- Halliwell B.
- Hitomi K.
- Hopmann K. H.
- Hunter K. C.
- Hunter K. C.
- Jiang Y. L.
- Kallies B.
- Kavli B.
- Kim S.
- Kim Y.
- Klungland A.
- Kobko N.
- Kohanoff J.
- Kongsted J.
- Krokan H. E.
- Krwawicz J.
- Lendvay G.
- Li P.
- Li Q. G.
- Liang W. C.
- Lindahl T.
- Lindahl T.
- Liu P. F.
- Loverix S.
- Loverix S.
- Lundin A.
- Luo N.
- Ma A.
- Manojkumar T. K.
- Mazumder D.
- Mazumder D.
- Mazumder-Shivakumar D.
- McCann J. A. B.
- McCann J. A. B.
- Meng S.
- Millen A. L.
- Mosbaugh D. W.
- Nakabeppu Y.
- Nilsen H.
- Olufsen M.
- Osakabe T.
- Osman R.
- Pettersen H. S.
- Prior J. J.
- Ramos M. J.
- Rejnek J.
- Rejnek J.
- Rick S. W.
- Rios-Font R.
- Robertson K. D.
- Rosta E.
- Schramm V. L.
- Schroeder G. K.
- Schyman P.
- Shapiro R.
- Shchavlev A. E.
- Shomura Y.
- Sicinska D.
- Simon S.
- Simon S.
- Singh V.
- Sousa M. M. L.
- Sousa S. F.
- Stivers J. T.
- Studebaker A. W.
- Swarts S. G.
- Tautermann C. S.
- Ward J. F.
- Werner R. M.
- Whittleton S. R.
- Wilson D. M.
- Wiseman H.
- Wu Y.
- Wu Y.
- Xu D.
- Zeng Y.
- Zha M.
- Zhan C. G.
- Zhang L. D.
- Zharkov D. O.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textComputational Approaches: Reaction Trajectories, Structures, and Atomic Motions. Enzyme Reactions and Proficiency
- Author
- Almarsson O.
- Antosiewicz J.
- Aqvist J.
- Bahnson B. J.
- Bahnson B. J.
- Bash P. A.
- Bashford D.
- Bearne S. L.
- Benkovic S. J.
- Berendsen H. J. C.
- Brink J.
- Brooks B.
- Brooks B. R.
- Brooks B. R.
- Bruice T. C.
- Bruice T. C.
- Bruice T. C.
- Bruice T. C.
- Bruice T. C.
- Bruice T. C.
- Cerjan C. J.
- Chandrasekhar J.
- Chen L.
- Cornell W. D.
- Cui Q.
- Cui Q.
- Dahm S. C.
- Dahm S. C.
- Darden T.
- Davis M. E.
- Dominy B. N.
- Elstner M.
- Estabrook R. A.
- Fedor M. J.
- Feig M.
- Friesner R. A.
- Gabbara S.
- Ganem B.
- Gao J. L.
- Garcia-Viloca M.
- Garcia-Viloca M.
- Gilson M. K.
- Go N.
- Gordon M. S.
- Haynes M. R.
- Hennig M.
- Horenstein B. A.
- Horenstein B. A.
- Houk K. N.
- Hur S.
- Hur S.
- Hur S.
- Hur S.
- Hur S.
- Hur S.
- Jencks W. P.
- Jez J. M.
- Jez J. M.
- Jez J. M.
- Jorgensen W. L.
- Klamt A.
- Klimasauskas S.
- Klimasauskas S.
- Koizumi M.
- Konecny R.
- Kuczera K.
- Kuimelis R. G.
- Kumar S.
- Laitinen T.
- Lan E. Y.
- Lau E. Y.
- Lazaridis T.
- Lee M. S.
- Levitt M.
- Li G. H.
- Li H.
- Lightstone F. C.
- Lightstone F. C.
- Lockless S. W.
- Luo J.
- Luo J.
- Luo J.
- Luo J.
- Luo J.
- MacKerell A. D.
- Marti S.
- Mazumder D.
- Mazumder-Shivakumar D.
- Mazumder-Shivakumar D.
- Meroueh S. O.
- Monard G.
- Nina M.
- O'Gara M.
- Page M. I.
- Pauling L.
- Pauling L.
- Pearlman D. A.
- Radkiewicz J. L.
- Radzicka A.
- Radzicka A.
- Rajamani R.
- Ranaghan K. E.
- Reddy S. Y.
- Reddy S. Y.
- Rocchia W.
- Roux B.
- Rubach J. K.
- Scheiner S.
- Schiott B.
- Scott W. G.
- Sekhar V. C.
- Shea J. E.
- Sievers A.
- Simonson T.
- Slim G.
- Still W. C.
- Tama F.
- Tama F.
- Thomas A.
- Thorpe I. F.
- Tirion M. M.
- Tobi D.
- Torres R. A.
- Torres R. A.
- Torres R. A.
- Tsui V.
- Valina A. L. B.
- Vamvaca K.
- Vieille C.
- Villa J.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Watney J. B.
- Wolfenden R.
- Wolfenden R.
- Wu J. C.
- Zhang X.
- Zhang X. D.
- Zhang X. Y.
- Zhang Y. K.
- Zhang Y. K.
- Zheng Y. J.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textTheoretical Studies on the Thermodynamics and Kinetics of the N-Glycosidic Bond Cleavage in Deoxythymidine Glycol
- Author
- Adelman R.
- Adelman R.
- Ames B. N.
- Barone V.
- Basu A. K.
- Bates C.
- Beck A. D.
- Birck M. R.
- Brown K. L.
- Canduri F.
- Cathcart R.
- Cathcart R.
- Cossi M.
- Csontos J.
- Dizdaroglu M.
- Durant J. L.
- Flippen J. L.
- Frisch M. J.
- Gelbin A.
- Gilchrest B. A.
- Gonzalez C.
- Hazra T. K.
- Hilbert T. P.
- Hilbert T. P.
- Hruska F. E.
- Hunt C.
- Ide H.
- Iwai S.
- Jiang D.
- Jiang Y. L.
- Kao J. Y.
- Katafuchi A.
- Kropachev K. Y.
- Lin J. J.
- Loverix S.
- Loverix S.
- Lustig M. J.
- Manuel R. C.
- Mazumder D.
- McNulty J. M.
- McNulty J. M.
- McTigue M. M.
- Mendieta J.
- Miaskiewicz K.
- Miaskiewicz K.
- Millen A. L.
- Miller H.
- Moyano A.
- Osakabe T.
- Parikh S. S.
- Parr R. G.
- Pfeifer G. P.
- Reardon J. T.
- Reed A. E.
- Reed A. E.
- Roday S.
- Roldan-Arjona T.
- Schramm V. L.
- Schyman P.
- Shivakumar D. M.
- Slupphaug G.
- Takao M.
- Vaishnav Y.
- Vandemeulebroucke A.
- Versees W.
- Weiss B.
- Wiseman H.
- Yamamoto R.
- Yu W. B.
- Zhang Q.
- Zuo S.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textA Kinetic and Thermodynamic Study of the Glycosidic Bond Cleavage in Deoxyuridine
- Author
- Bates C.
- Becke A. D.
- Becke A. D.
- Becke A. D.
- Berti P. J.
- Bianchet M. A.
- Birck M. R.
- Boiteux S.
- Boys S. F.
- Bruner M.
- Bruner S. D.
- Canduri F.
- Canduri F.
- Chen X.-Y.
- Chen X.-Y.
- Coste F.
- David S. S.
- Deng H.
- Deng H.
- Di Laudo M.
- Dinner A. R.
- Dodson M. L.
- Durant J. L.
- Frisch M. J.
- Fromme J. C.
- Fromme J. C.
- Fromme J. C.
- Fromme J. C.
- Gao X.-F.
- Gelbin A.
- Hatahet Z.
- Horenstein B. A.
- Horenstein B. A.
- Huang X.
- Huffman J. L.
- Hunt C.
- Hunter K. C.
- Jiang Y. L.
- Jiang Y. L.
- Jiang Y. L.
- Kimura E.
- Kline P. C.
- Kline P. C.
- Kuznetsov N. A.
- Lee C. T.
- Lee J. K.
- Lewandowicz A.
- Lingaraju G. M.
- Lingaraju G. M.
- Loverix S.
- Loverix S.
- Luo N.
- Lynch B. J.
- Manuel R. C.
- Mauro D. J.
- Mazumder D.
- McConnell T. L.
- McCullough A. K.
- Mendieta J.
- Mentch F.
- Muzzolini L.
- Norman D. P. G.
- Norman D. P. G.
- Norman D. P. G.
- Norman R. A.
- Nunez S.
- Osakabe T.
- Parikh S. L.
- Parikh S. S.
- Parkin D. W.
- Parkin D. W.
- Porello S. L.
- Rabow L. E.
- Rising K. A.
- Roday S.
- Savva R.
- Scheuring J.
- Scheuring J.
- Schramm V. L.
- Schramm V. L.
- Schyman P.
- Shivakumar D. M.
- Smar M.
- Stivers J. T.
- Stivers J. T.
- Stivers J. T.
- Truong T. N.
- Vandemeulebroucke A.
- Vasilenko N. L.
- Versees W.
- Versees W.
- Versees W.
- Voet D.
- Werner R. M.
- Werner R. M.
- Whittleton S. R.
- Wielgus-Kutrowska B.
- Williams S. D.
- Yang J.
- Zaika E. I.
- Zastawny T. H.
- Zhang R. B.
- Zhao Y.
- Zhao Y.
- Zhao Y.
- Zhao Y.
- Zharkov D. O.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full text
