Pathfinder: sistema para el análisis y visualización de datos sobre catálogos y exposiciones artísticas

El objetivo de esta comunicación breve es presentar el sistema Pathfinder (http://pathfinder-art.es) adoptado el formato de presentación «demo». Pathfinder (PF) es una aplicación utilitaria concebida como herramienta para el análisis gráfico y textual de la información registrada en ExpoFinder (www.expofinder.es), un repositorio de datos estructurados y semánticamente relacionados sobre exposiciones artísticas (Rodríguez-Ortega & Cruces Rodríguez, 2018). Se trata de un desarrollo software realizado por el grupo de investigación iArtHis_Lab, del Departamento de Historia del Arte de la Universidad de Málaga (España), en el marco de los proyectos de investigación Catálogos artísticos: gnoseología, epistemologías y redes de conocimiento. Análisis crítico y computacional (HAR2014-51915-P), financiado por el Ministerio de de Economía y Competitividad, y Metodologías de datos aplicadas al análisis de las exposiciones artísticas para el desarrollo de la economía creativa (PRY128-17), financiado por and el Centro de Estudios Andaluces de la Junta de Andalucía.Catálogos artísticos: gnoseología, epistemologías y redes de conocimiento. Análisis crítico y computacional (HAR2014-51915-P), financiado por el Ministerio de de Economía y Competitividad Metodologías de datos aplicadas al análisis de las exposiciones artísticas para el desarrollo de la economía creativa (PRY128-17), financiado por and el Centro de Estudios Andaluces de la Junta de Andalucía. Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Repensando los estudios metadisciplinares en la sociedad datacéntrica: análisis dinámico de las redes de conocimiento de la Historia del Arte a través de la base de datos ISOC-Arte (CSIC)

Nuestra propuesta de comunicación tiene por objetivo presentar la metodología de trabajo, las técnicas de análisis y los resultados más relevantes alcanzados en el proyecto de investigación «Análisis estratégico y dinámico de la investigación en Historia del Arte en España», que se está desarrollando en el marco de un convenio de colaboración establecido desde junio de 2014 entre el grupo iArtHis_Lab de la Universidad de Málaga y el Centro de Ciencias Humanas y Sociales del CSIC para el análisis de las redes de producción y distribución de conocimiento en el ámbito disciplinar de la Historia del Arte .Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tec

Discordant identification of pediatric severe sepsis by research and clinical definitions in the SPROUT international point prevalence study

Introduction: Consensus criteria for pediatric severe sepsis have standardized enrollment for research studies. However, the extent to which critically ill children identified by consensus criteria reflect physician diagnosis of severe sepsis, which underlies external validity for pediatric sepsis research, is not known. We sought to determine the agreement between physician diagnosis and consensus criteria to identify pediatric patients with severe sepsis across a network of international pediatric intensive care units (PICUs). Methods: We conducted a point prevalence study involving 128 PICUs in 26 countries across 6 continents. Over the course of 5 study days, 6925 PICU patients <18 years of age were screened, and 706 with severe sepsis defined either by physician diagnosis or on the basis of 2005 International Pediatric Sepsis Consensus Conference consensus criteria were enrolled. The primary endpoint was agreement of pediatric severe sepsis between physician diagnosis and consensus criteria as measured using Cohen's ?. Secondary endpoints included characteristics and clinical outcomes for patients identified using physician diagnosis versus consensus criteria. Results: Of the 706 patients, 301 (42.6 %) met both definitions. The inter-rater agreement (? ± SE) between physician diagnosis and consensus criteria was 0.57 ± 0.02. Of the 438 patients with a physician's diagnosis of severe sepsis, only 69 % (301 of 438) would have been eligible to participate in a clinical trial of pediatric severe sepsis that enrolled patients based on consensus criteria. Patients with physician-diagnosed severe sepsis who did not meet consensus criteria were younger and had lower severity of illness and lower PICU mortality than those meeting consensus criteria or both definitions. After controlling for age, severity of illness, number of comorbid conditions, and treatment in developed versus resource-limited regions, patients identified with severe sepsis by physician diagnosis alone or by consensus criteria alone did not have PICU mortality significantly different from that of patients identified by both physician diagnosis and consensus criteria. Conclusions: Physician diagnosis of pediatric severe sepsis achieved only moderate agreement with consensus criteria, with physicians diagnosing severe sepsis more broadly. Consequently, the results of a research study based on consensus criteria may have limited generalizability to nearly one-third of PICU patients diagnosed with severe sepsis

White matter abnormalities across different epilepsy syndromes in adults: an ENIGMA-Epilepsy study

The epilepsies are commonly accompanied by widespread abnormalities in cerebral white matter. ENIGMA-Epilepsy is a large quantitative brain imaging consortium, aggregating data to investigate patterns of neuroimaging abnormalities in common epilepsy syndromes, including temporal lobe epilepsy, extratemporal epilepsy, and genetic generalized epilepsy. Our goal was to rank the most robust white matter microstructural differences across and within syndromes in a multicentre sample of adult epilepsy patients. Diffusion-weighted MRI data were analysed from 1069 healthy controls and 1249 patients: temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis (n = 599), temporal lobe epilepsy with normal MRI (n = 275), genetic generalized epilepsy (n = 182) and non-lesional extratemporal epilepsy (n = 193). A harmonized protocol using tract-based spatial statistics was used to derive skeletonized maps of fractional anisotropy and mean diffusivity for each participant, and fibre tracts were segmented using a diffusion MRI atlas. Data were harmonized to correct for scanner-specific variations in diffusion measures using a batch-effect correction tool (ComBat). Analyses of covariance, adjusting for age and sex, examined differences between each epilepsy syndrome and controls for each white matter tract (Bonferroni corrected at P < 0.001). Across ‘all epilepsies’ lower fractional anisotropy was observed in most fibre tracts with small to medium effect sizes, especially in the corpus callosum, cingulum and external capsule. There were also less robust increases in mean diffusivity. Syndrome-specific fractional anisotropy and mean diffusivity differences were most pronounced in patients with hippocampal sclerosis in the ipsilateral parahippocampal cingulum and external capsule, with smaller effects across most other tracts. Individuals with temporal lobe epilepsy and normal MRI showed a similar pattern of greater ipsilateral than contralateral abnormalities, but less marked than those in patients with hippocampal sclerosis. Patients with generalized and extratemporal epilepsies had pronounced reductions in fractional anisotropy in the corpus callosum, corona radiata and external capsule, and increased mean diffusivity of the anterior corona radiata. Earlier age of seizure onset and longer disease duration were associated with a greater extent of diffusion abnormalities in patients with hippocampal sclerosis. We demonstrate microstructural abnormalities across major association, commissural, and projection fibres in a large multicentre study of epilepsy. Overall, patients with epilepsy showed white matter abnormalities in the corpus callosum, cingulum and external capsule, with differing severity across epilepsy syndromes. These data further define the spectrum of white matter abnormalities in common epilepsy syndromes, yielding more detailed insights into pathological substrates that may explain cognitive and psychiatric co-morbidities and be used to guide biomarker studies of treatment outcomes and/or genetic research

A systems-level analysis highlights microglial activation as a modifying factor in common forms of human epilepsy

The common human epilepsies are associated with distinct patterns of reduced cortical thickness, detectable on neuroimaging, with important clinical consequences. To explore underlying mechanisms, we layered MRI-based cortical structural maps from a large-scale epilepsy neuroimaging study onto highly spatially-resolved human brain gene expression data, identifying >2,500 genes overexpressed in regions of reduced cortical thickness, compared to relatively-protected regions. The resulting set of differentially-expressed genes shows enrichment for microglial markers, and in particular, activated microglial states. Parallel analyses of cell-specific eQTLs show enrichment in human genetic signatures of epilepsy severity, but not epilepsy causation. Post mortem brain tissue from humans with epilepsy shows excess activated microglia. In an experimental model, depletion of activated microglia prevents cortical thinning, but not the development of chronic seizures. These convergent data strongly implicate activated microglia in cortical thinning, representing a new dimension for concern and disease modification in the epilepsies, potentially distinct from seizure control

Topographic divergence of atypical cortical asymmetry and atrophy patterns in temporal lobe epilepsy

Temporal lobe epilepsy, a common drug-resistant epilepsy in adults, is primarily a limbic network disorder associated with predominant unilateral hippocampal pathology. Structural MRI has provided an in vivo window into whole-brain grey matter structural alterations in temporal lobe epilepsy relative to controls, by either mapping (i) atypical inter-hemispheric asymmetry; or (ii) regional atrophy. However, similarities and differences of both atypical asymmetry and regional atrophy measures have not been systematically investigated. Here, we addressed this gap using the multisite ENIGMA-Epilepsy dataset comprising MRI brain morphological measures in 732 temporal lobe epilepsy patients and 1418 healthy controls. We compared spatial distributions of grey matter asymmetry and atrophy in temporal lobe epilepsy, contextualized their topographies relative to spatial gradients in cortical microstructure and functional connectivity calculated using 207 healthy controls obtained from Human Connectome Project and an independent dataset containing 23 temporal lobe epilepsy patients and 53 healthy controls and examined clinical associations using machine learning. We identified a marked divergence in the spatial distribution of atypical inter-hemispheric asymmetry and regional atrophy mapping. The former revealed a temporo-limbic disease signature while the latter showed diffuse and bilateral patterns. Our findings were robust across individual sites and patients. Cortical atrophy was significantly correlated with disease duration and age at seizure onset, while degrees of asymmetry did not show a significant relationship to these clinical variables. Our findings highlight that the mapping of atypical inter-hemispheric asymmetry and regional atrophy tap into two complementary aspects of temporal lobe epilepsy-related pathology, with the former revealing primary substrates in ipsilateral limbic circuits and the latter capturing bilateral disease effects. These findings refine our notion of the neuropathology of temporal lobe epilepsy and may inform future discovery and validation of complementary MRI biomarkers in temporal lobe epilepsy.11Nsciescopu

Expofinder y Pathfinder. Infraestructura tecnológica para la generación de conocimiento en el ámbito de la Historia del Arte

Para ello se desarrollaron tres aplicaciones. La primera, Beagle, escrita en PHP, capturaba de manera cíclica la información disponible en Internet sobre exposiciones temporales artísticas, a partir de una lista de direcciones o URLs, filtrando, mediante un proceso que incluía mecanismos de inteligencia artificial, los elementos relevantes, que se almacenaban en Expofinder, la segunda aplicación, basada en el aprovechamiento del software de código abierto WordPress como framework sobre el que construir un programa que permitiera el almacenamiento de los datos de las exposiciones, a modo de repositorio, ofreciendo un sistema para que usuarios, debidamente formados y supervisados por otros actores “humanos”, validaran o descartaran los hallazgos de Beagle y almacenaran lo obtenido siguiendo un protocolo que garantizara la coherencia ontológica de los datos custodiados de acuerdo a una estructura basada en criterios histórico-artísticos coherentes. La tercera aplicación, Pathfinder, construida íntegramente utilizando tecnología JavaScript y pensada para ejecutarse en el navegador del equipo cliente, permite realizar un análisis cuantitativo de los datos cualitativos conservados en Expofinder, empleando aproximaciones estadísticas, relacionales, gráficas y geográficas. Estas aplicaciones, una vez finalizado el proyecto Exhibitium, han seguido funcionando (durante más de siete años) y arrojando resultados, habiendo servido como base a dos proyectos adicionales, Andalex, del Centro de Estudios Andaluces de la Junta de Andalucía, y ArtCatalog, financiado por el Ministerio de Economía y Competitividad (HAR2014-51915-P). Además, se han usado como herramienta de trabajo en otras dos tesis doctorales que han arrojado resultados esclarecedores sobre sus respectivos objetos de estudio.La tesis doctoral describe el proceso para diseñar una plataforma tecnológica, con base epistemológica y ontológica fuertemente anclada en el paradigma digital del estudio de la Historia del Arte, con capacidad de crecimiento, reorientación y ampliación en su alcance y ámbito de actuación, nacida como respuesta al desafío planteado por el proyecto Exhibitium, del grupo de investigación iArtHis_LAB, del Departamento de Historia del Arte de la Universidad de Málaga, que tiene como objetivo específico la promoción, desarrollo y consolidación en España de los estudios sobre Historia del Arte Digital (Digital Art History). La propuesta fue presentada en 2014 al concurso convocado por la Fundación BBVA para proyectos en el ámbito de Humanidades Digitales, resultando seleccionada entre más de 250 solicitudes. En el proyecto participaron grupos de investigación especializados en el análisis de grandes conjuntos de datos, como "Khaos" de la Universidad de Málaga y el laboratorio CulturePlex, de la Universidad de Western Ontario (Canadá). Exhibitium proponía el desarrollo de un dispositivo tecnológico para la explotación y análisis de los datos sobre exposiciones, conjugando tecnologías computacionales y metodologías de análisis derivadas de la vigilancia tecnológica, el análisis de redes y las estrategias de KDD (Knowledge Discovery in Databases)

WordPress como framework para la captura, filtro y estructuración de datos

The Exhibitium Project , awarded by the BBVA Foundation, is a data-driven project developed by an international consortium of research groups . One of its main objectives is to build a prototype that will serve as a base to produce a platform for the recording and exploitation of data about art-exhibitions available on the Internet . Therefore, our proposal aims to expose the methods, procedures and decision-making processes that have governed the technological implementation of this prototype, especially with regard to the reuse of WordPress (WP) as development framework.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Andalucía Tech. Fundación BBVA

Analyse dinamique d’un terme et son résau de connaissances associées: le cas du descripteur historia del arte

Aplicando estrategias de ingeniería de conocimiento, se analizan la conformación de redes técnico-científicas y sociocognitivas tomando como base el corpus científico identificado con el descriptor "historia del arte".Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Adalucía Tech

Análisis de ISOC-ARTE desde la ingeniería del conocimiento: método y metrías

On a étudié par des techniques et des outils d'ingénierie des connaissances la base de données ISOC-ARTE afin d'étudier leurs réseaux de connaissances, les sujets de recherche les plus pertinents, les auteurs et les revues qui leur sont associés, et leur évolution dans le temps. On présente la méthodologie utilisée dans l'analyse et les premiers résultats. ISOC-ART réunit plus de 45 000 références, principalement des articles de recherche en histoire de l'art, produites entre 1975 et 2014. L'étude est le résultat de l'accord de coopération signé entre le Centre de Sciences Humaines et Sociales du Conseil Supérieur de la Recherche Scientifique (CCHS-CSIC), propriétaire des bases ISOC, et l'Université de Málaga, et est la responsabilité du groupe de recherche iArtHis_Lab, en collaboration avec le groupe de recherche "Techne, ingénierie de la connaissance et le produit" de l'Université de Grenade.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech