Comparative study of meningitis dynamics across nine African countries: a global perspective

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Meningococcal meningitis (MM) represents an important public health problem especially in the "meningitis belt" in Africa. Although seasonality of epidemics is well known with outbreaks usually starting in the dry season, pluri-annual cycles are still less understood and even studied. In this context, we aimed at study MM cases time series across 9 sahelo-sudanian countries to detect pluri-annual periodicity and determine or not synchrony between dynamics. This global and comparative approach allows a better understanding of MM evolution in time and space in the long-term.</p> <p>Results</p> <p>We used the most adapted mathematical tool to time series analyses, the wavelet method. We showed that, despite a strong consensus on the existence of a global pluri-annual cycle of MM epidemics, it is not the case. Indeed, even if a clear cycle is detected in all countries, these cycles are not as permanent and regular as generally admitted since many years. Moreover, no global synchrony was detected although many countries seemed correlated.</p> <p>Conclusion</p> <p>These results of the first large-scale study of MM dynamics highlight the strong interest and the necessity of a global survey of MM in order to be able to predict and prevent large epidemics by adapted vaccination strategy. International cooperation in Public Health and cross-disciplines studies are highly recommended to hope controlling this infectious disease.</p

Modeling the spread of cholera using human mobility estimates derived from mobile phone records

Modeling the spread of cholera using human mobility estimates derived from mobile phone record

Regional-scale climate-variability synchrony of cholera epidemics in West Africa

BACKGROUND: The relationship between cholera and climate was explored in Africa, the continent with the most reported cases, by analyzing monthly 20-year cholera time series for five coastal adjoining West African countries: Côte d'Ivoire, Ghana, Togo, Benin and Nigeria. METHODS: We used wavelet analyses and derived methods because these are useful mathematical tools to provide information on the evolution of the periodic component over time and allow quantification of non-stationary associations between time series. RESULTS: The temporal variability of cholera incidence exhibits an interannual component, and a significant synchrony in cholera epidemics is highlighted at the end of the 1980's. This observed synchrony across countries, even if transient through time, is also coherent with both the local variability of rainfall and the global climate variability quantified by the Indian Oscillation Index. CONCLUSION: Results of this study suggest that large and regional scale climate variability influence both the temporal dynamics and the spatial synchrony of cholera epidemics in human populations in the Gulf of Guinea, as has been described for two other tropical regions of the world, western South America and Bangladesh

Evolution climatique et santé (éco-épidémiologie du choléra en Afrique)

Le choléra, dû aux souches pathogènes de la bactérie Vibrio cholerae, est une maladie très contagieuse, avec en 2004 au moins 100000 cas déclarés, principalement sur le continent africain. La nature autochtone de V. cholerae dans le milieu aquatique rappelle que cette bactérie, avant d'être pathogène pour l'homme, joue un rôle écologique dans son écosystème. Cette dernière propriété implique une influence directe des conditions environnementales et climatiques sur la présence, la persistance et l'abondance de la bactérie dans l'écosystème aquatique et donc indirectement sur l'émergence du choléra chez l'homme. Cette relation choléra/environnement a déjà étudiée en Asie et en Amérique du Sud mais aucune étude ne s'est intéressée à ce jour, à la situation sur le continent le plus affecté, l'Afrique. Dans ce contexte, nous avons d'abord étudié les dynamiques de choléra dans différents pays d'Afrique de l'Ouest et du Nord par les analyses d ondelettes. Ensuite, nous avons testé l'existence d'un lien entre ces dynamiques et différents paramètres caractérisant la variabilité climatique (i.e. Indice de l'Oscillation Indienne, IOI) et environnementale (i.e. précipitations et anomalies de température de surface terrestre et océanique, données issues de la télédétection). Enfin, nous avons réalisé un modèle épidémiologique de type SIR intégrant des paramètres environnementaux pour expliquer la dynamique du choléra dans deux pays africains. L'application directe a été la mise en place d'un premier outil de prédiction des épidémies de choléra grâce à la surveillance de l'environnement par satellite. Les résultats ont montré en dehors du cycle annuel déjà bien connu, pour les dynamiques de choléra un cycle compris entre 3 et 6 ans, ainsi qu'un synchronisme des épidémies pour un ensemble de cinq pays adjacents du Golfe de Guinée. De plus, des corrélations ont été détectées entre ces dynamiques et les variations climatiques et environnementales. Enfin, le développement d'un modèle mathématique a servi à l'élaboration d'un système d'alerte basé sur le suivi des conditions environnementales par télédétection spatiale et ce afin de répondre à un meilleur contrôle de la maladie.Cholera, due to pathogenic strain of Vibrio cholerae, is a highly contagious disease with more than 100000 cases declared in 2004, mainly in Africa. V. cholerae is autochthonous to the aquatic environment they form an important component of the ecosystem before becoming pathogenic for humans. This implies that exist a direct impact of environmental and climatic conditions on the presence, the persistence and the abundance of the bacteria within the aquatic ecosystem and thus an indirect influence on the emergence of the disease in human populations. This relationship between V. cholerae and the environment has already been studied for Asia and South America whereas, at least to our knowledge, no study was performed for Africa, the most affected continent. In this context, we first studied cholera population dynamics focusing on different countries of West and North Africa, using wavelets analyses. Secondly, we tested the existence of a link between these disease dynamics and several parameters which could characterise the climatic variability (i.e. IOI, Indian Oscillation Index) and the environmental variability (i.e. rainfall and Land and Sea Surface Temperature Anomalies, LSSTA; data issued from remove sensing). Finally, we built an SEIR epidemiological model integrating environmental parameters in order to describe cholera population dynamics in two African countries. The direct application is the elaboration of a first cholera epidemics prediction tool based on environment monitoring. Results showed a 3 to 6 years cycle of cholera population dynamics, and the synchronism between cholera epidemics across 5 countries in the Gulf of Guinea. Moreover, correlations were detected between these dynamics and climatic and environment variability at both local and global scales. Finally, the elaboration of a mathematical model allowed the realisation of a first early warning system, based on environmental survey by remote sensing, in order to better control the disease.MONTPELLIER-BU Sciences (341722106) / SudocSudocFranceF

De la statistique élémentaire à l’analyse de co-inertie

Thunnus obesus (Lowe, 1939)© P. Opic Les analyses ont concerné quatre des neuf espèces présentes dans la base de données des captures du Programme palangre réunionnais (PPR). Il s’agit des quatre espèces les plus abondantes : l’espadon (symbole utilisé : SWO), le germon (ALB), l’albacore (YFT) et le thon obèse (BET). La distribution spatiale des pêches est divisée en trois zones (fig. 63, cf. cahier hors-texte) : la zone s’étendant de la côte est de Madagascar jusqu’autour de l’île de la Réun..