XLF and APLF bind Ku80 at two remote sites to ensure DNA repair by non-homologous end joining

International audienceThe Ku70-Ku80 (Ku) heterodimer binds rapidly and tightly to the ends of DNA double-strand breaks and recruits factors of the non-homologous end-joining (NHEJ) repair pathway through molecular interactions that remain unclear. We have determined crystal structures of the Ku-binding motifs (KBM) of the NHEJ proteins APLF (A-KBM) and XLF (X-KBM) bound to a Ku-DNA complex. The two KBM motifs bind remote sites of the Ku80 alpha/beta domain. The X-KBM occupies an internal pocket formed by an unprecedented large outward rotation of the Ku80 alpha/beta domain. We observe independent recruitment of the APLF-interacting protein XRCC4 and of XLF to laser-irradiated sites via binding of A- and X-KBMs, respectively, to Ku80. Finally, we show that mutation of the X-KBM and A-KBM binding sites in Ku80 compromises both the efficiency and accuracy of end joining and cellular radiosensitivity. A- and X-KBMs may represent two initial anchor points to build the intricate interaction network required for NHEJ

Effets de la castration et de l’immunocastration sur l’axe corticotrope et le système immunitaire des porcs

National audienceLa castration chirurgicale des porcs est controversée pour des raisons de bien‐être animal. Il est donc nécessaire d’étudier les alternatives potentielles comme la production de mâles entiers ou immunocastrés, et de vérifier que ces alternatives ne soulèvent pas de nouveaux problèmes de santé ou de bien‐être animal. Cette étude a été réalisée afin de comprendre les effets des hormones testiculaires sur l’immunité et la réactivité au stress des porcs. Elle se déroule sur 65 animaux répartis en 4 groupes expérimentaux : entiers, castrés chirurgicalement (à 5/6 jours d’âge), vaccinés contre la GnRH (immunocastrés), et castrés puis immunocastrés. Des prises de sang à 3, 4 et 5 mois permettent de valider l’effet des traitements sur les niveaux circulants de stéroïdes sexuels et d’étudier les populations lymphocytaires. Le cortisol est dosé dans la salive pour mesurer l’activité de l’axe corticotrope et la réactivité au stress. Les animaux sont abattus à 5 mois pour déterminer le développement des testicules, des surrénales et du thymus. Les résultats montrent que l’immunocastration induit une augmentation des concentrations salivaires de cortisol 24 jours après la première injection. La castration chirurgicale semble aussi accroître l’activité surrénalienne. La castration chirurgicale inhiberait partiellement le fonctionnement thymique des porcs (poids du thymus réduit à 5 mois,diminution du nombre de lymphocytes totaux et altération des pourcentages des différentes sous‐populations lymphocytaires sanguines à 4 mois et thymiques au stade d’abattage) alors que les effets de l’immunocastration sont moins clairs. Les conséquences potentielles de ces modifications sur la santé globale des animaux restent à déterminer

Effets de la castration et de l’immunocastration sur l’axe corticotrope et le système immunitaire des porcs

La castration chirurgicale des porcs est controversée pour des raisons de bien‐être animal. Il est donc nécessaire d’étudier les alternatives potentielles comme la production de mâles entiers ou immunocastrés, et de vérifier que ces alternatives ne soulèvent pas de nouveaux problèmes de santé ou de bien‐être animal. Cette étude a été réalisée afin de comprendre les effets des hormones testiculaires sur l’immunité et la réactivité au stress des porcs. Elle se déroule sur 65 animaux répartis en 4 groupes expérimentaux : entiers, castrés chirurgicalement (à 5/6 jours d’âge), vaccinés contre la GnRH (immunocastrés), et castrés puis immunocastrés. Des prises de sang à 3, 4 et 5 mois permettent de valider l’effet des traitements sur les niveaux circulants de stéroïdes sexuels et d’étudier les populations lymphocytaires. Le cortisol est dosé dans la salive pour mesurer l’activité de l’axe corticotrope et la réactivité au stress. Les animaux sont abattus à 5 mois pour déterminer le développement des testicules, des surrénales et du thymus. Les résultats montrent que l’immunocastration induit une augmentation des concentrations salivaires de cortisol 24 jours après la première injection. La castration chirurgicale semble aussi accroître l’activité surrénalienne. La castration chirurgicale inhiberait partiellement le fonctionnement thymique des porcs (poids du thymus réduit à 5 mois,diminution du nombre de lymphocytes totaux et altération des pourcentages des différentes sous‐populations lymphocytaires sanguines à 4 mois et thymiques au stade d’abattage) alors que les effets de l’immunocastration sont moins clairs. Les conséquences potentielles de ces modifications sur la santé globale des animaux restent à déterminer

Odeurs de verrat : effets génétiques et non génétiques

The European pig industry is engaged in a voluntary abandonment of surgical castration of male piglets by 2018. A condition of this abandonment is to solve different problems related to breeding boars, especially meat quality. One of the best ways is that of genetics, including genomic selection. A resource population has been implemented using French Pietrain pigs raised in a control animal testing station. About 1000 Pietrain type or cross‐type Pietrain x Large White boars were raised and slaughtered to determine the characteristics of sexual development, body composition and above all meat quality traits. Plasma testosterone concentration differed from one genetic type to another, but the differences were generally small. This concentration was not affected by the batch or by the weight of the animals or by their age at measurement. Androstenone content in backfat was not affected by the batch but the average almost doubled from one genetic type to another, the highest levels being observed both in one Pietrain type and in one crossbred type. Androstenone content increased with slaughter weight and plasma testosterone concentration. The effect of slaughter age depended on the genetic type. Skatole content in backfat was little affected by the concentration of testosterone, but varied from one batch to another, from one genetic type to another and decreased with age at slaughter.Les filières porcines européennes se sont engagées dans une démarche volontaire d’abandon de la castration chirurgicale des porcelets mâles à l’horizon 2018. L’une des conditions de cet abandon est de résoudre les différents problèmes liés à l’élevage de mâles entiers, et plus particulièrement ceux de qualité de viande. L’une des voies privilégiées est celle de la génétique, notamment la sélection génomique. Une population ressource a donc été mise en oeuvre dans des populations françaises de type Piétrain, avec un contrôle des animaux en station de testage. Environ 1000 verrats de type Piétrain ou de type croisé Piétrain x Large White ont été élevés et abattus pour déterminer les caractères de production, de développement sexuel, de composition corporelle et surtout de défaut d’odeur de viande. La concentration en testostérone plasmatique diffère d’un type génétique à l’autre, mais les différences restent globalement faibles. Cette concentration n’est pas affectée par la bande d’élevage, par le poids des animaux ou par leur âge à la mesure. La teneur en androsténone de la bardière n’est pas affectée par l’effet de la bande d’élevage mais varie quasiment du simple au double en moyenne d’un type génétique à l’autre, les teneurs les plus élevées étant observées à la fois dans un des types Piétrain pur et dans un des types croisés. Cette teneur augmente avec le poids d’abattage et la concentration plasmatique en testostérone. L’effet de l’âge à l’abattage dépend du type génétique. La teneur en scatol de la bardière est peu affectée par la concentration en testostérone mais varie d’une bande à l’autre, d’un type génétique à l’autre et diminue avec l’âge à l’abattage

Odeurs de verrat : effets génétiques et non génétiques

Les filières porcines européennes se sont engagées dans une démarche volontaire d’abandon de la castration chirurgicale des porcelets mâles à l’horizon 2018. L’une des conditions de cet abandon est de résoudre les différents problèmes liés à l’élevage de mâles entiers, et plus particulièrement ceux de qualité de viande. L’une des voies privilégiées est celle de la génétique, notamment la sélection génomique. Une population ressource a donc été mise en oeuvre dans des populations françaises de type Piétrain, avec un contrôle des animaux en station de testage. Environ 1000 verrats de type Piétrain ou de type croisé Piétrain x Large White ont été élevés et abattus pour déterminer les caractères de production, de développement sexuel, de composition corporelle et surtout de défaut d’odeur de viande. La concentration en testostérone plasmatique diffère d’un type génétique à l’autre, mais les différences restent globalement faibles. Cette concentration n’est pas affectée par la bande d’élevage, par le poids des animaux ou par leur âge à la mesure. La teneur en androsténone de la bardière n’est pas affectée par l’effet de la bande d’élevage mais varie quasiment du simple au double en moyenne d’un type génétique à l’autre, les teneurs les plus élevées étant observées à la fois dans un des types Piétrain pur et dans un des types croisés. Cette teneur augmente avec le poids d’abattage et la concentration plasmatique en testostérone. L’effet de l’âge à l’abattage dépend du type génétique. La teneur en scatol de la bardière est peu affectée par la concentration en testostérone mais varie d’une bande à l’autre, d’un type génétique à l’autre et diminue avec l’âge à l’abattage.The European pig industry is engaged in a voluntary abandonment of surgical castration of male piglets by 2018. A condition of this abandonment is to solve different problems related to breeding boars, especially meat quality. One of the best ways is that of genetics, including genomic selection. A resource population has been implemented using French Pietrain pigs raised in a control animal testing station. About 1000 Pietrain type or cross‐type Pietrain x Large White boars were raised and slaughtered to determine the characteristics of sexual development, body composition and above all meat quality traits. Plasma testosterone concentration differed from one genetic type to another, but the differences were generally small. This concentration was not affected by the batch or by the weight of the animals or by their age at measurement. Androstenone content in backfat was not affected by the batch but the average almost doubled from one genetic type to another, the highest levels being observed both in one Pietrain type and in one crossbred type. Androstenone content increased with slaughter weight and plasma testosterone concentration. The effect of slaughter age depended on the genetic type. Skatole content in backfat was little affected by the concentration of testosterone, but varied from one batch to another, from one genetic type to another and decreased with age at slaughter

Évaluation de la puberté de cochettes Landrace français et indentification de facteurs de variation

International audienceWhile insemination at first estrus is not recommended, most studies agree on the benefits of early puberty, both for reproductive performance and sow longevity. In the swine population in France, sexual maturity is expected at ca. 200 days of age. Although age at puberty is crucial information, it is not recorded on farms. Since selection for low boar taint influences male puberty, it raises questions about its potential side effects on female reproductive ability. This study was carried out as part of a project that assessed impacts of selection against boar taint on the reproduction of Landrace females. The sexual maturity of 1878 gilts at ca. 200 days of age was evaluated on five farms using quantitative plasma progesterone analysis in two blood samples taken 10 days apart. Cutoff values of 2.5 or 5.0 ng/mL gave similar estimates of 19% immature gilts, with a large variation among farms (8-49%). Insemination was not performed for 4% of gilts, 9% were re-inseminated during the first cycle and 15% did not farrow. The rate of earlyreproduction difficulties varied greatly among farms. The influence of immaturity at 200 days was generally low, with a large farm effect. Further investigation is required to analyze long-term effects of late puberty

Déterminisme génétique du risque d'odeur de verrat dans la population Landrace français

International audienceFollowing the cessation of piglet castration, genetic improvement of pig lines can help minimize the occurrence of the defect in meat quality called boar taint, which is developed by non-castrated males. Since pig breeds differ in their risk of developing boar taint, it is important to consider line-by-line selection by estimating genetic parameters of odorant compounds in relation to sexual development and production traits. The present study focused on French Landrace, one of the main French maternal lines. Approximately 1000 non-castrated males were raised and then slaughtered to measure growth performance, body composition and meat quality, including concentrations of the fat-odorant compounds androstenone and skatole. A blood sample was taken just before slaughtering to measure plasma levels of four steroid hormones. Genetic parameters were estimated from the standardized and then centered reduced variables. As expected, heritability values were high for androstenone (h 2 =0.69) and estradiol (h 2 =0.79). Genetic correlations of boar taint compounds were moderate to high with testosterone and estradiol but close to 0 with progesterone and cortisol. Genetic correlations of the compounds were relatively low with growth rate, ultimate pH or color, but moderate and favorable with carcass leanness. It is therefore possible to include reduction in fat-odorant molecules in selection objectives, either directly or via sex hormones, while controlling their impacts on production performance.Déterminisme génétique du risque d'odeur de verrat dans la population Landrace français L'amélioration génétique des lignées porcines peut favoriser l'arrêt de la castration des porcelets tout en minimisant les défauts de qualité de viande développés par les mâles entiers. Tous les types génétiques ne présentent pas le même niveau de risque vis-à-vis de l'odeur de verrat. Aussi, il est important de considérer une sélection lignée par lignée en estimant les paramètres génétiques des composés odorants en lien avec le développement sexuel et les caractères de production. L'étude s'est intéressée au Landrace français, une des principales lignées maternelles françaises. Environ 1000 mâles non castrés ont été élevés, ont eu une prise de sang puis ont été abattus afin de mesurer les performances de croissance et de composition corporelle, de qualité de viande, les niveaux sanguins d'hormones sexuelles et les concentrations des composés odorants du gras. Les paramètres génétiques ont été estimés sur les variables normalisées puis centrées réduites. Les héritabilités sont conformes aux attendus, très élevées pour l'androsténone (h 2 =0,69) et l'oestradiol (h 2 =0,79). Les corrélations génétiques des composés odorants sont modérées à élevées avec la testostérone et l'oestradiol mais proches de 0 avec la progestérone et le cortisol. Les corrélations génétiques avec la vitesse de croissance, le pH ultime ou la couleur sont plutôt faibles, alors qu'elles sont modérées et favorables avec l'adiposité de la carcasse. Il est donc possible d'intégrer la diminution de la teneur en molécules odorantes du gras dans les objectifs de sélection, soit directement, soit via les hormones sexuelles, tout en maitrisant l'incidence sur les performances de production

Placenta and adrenal adaptation according to piglet genetic potential for maturity at birth

Placenta and adrenal adaptation according to piglet genetic potential for maturity at birth. 10. International Conference on Pig Reproduction (ICPR

Dataset describing the effects of housing environment, dominance status and parity on the PBMC transcriptome of sows during gestation and lactation

International audienceBlood immune cells transcriptome can be used as a tool to investigate molecular mechanisms or identify biomarkers of several physiological processes. Factors such as reproductive status, age, or physical and mental states resulting from social and non-social environmental aspects can influence the activation and phenotype of immune cells. This data paper describes the gene expression levels in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of multiparous sows, using RNA sequencing. Sows of various parity ranks were housed during gestation in a stable social group either in a conventional environment on a slatted concrete floor (C) or in an enriched environment with deep straw litter and a bigger space allowance (E). Videos were recorded between days 99 and 104 of gestation (G99 and G104) to determine the sows’ dominance status. Blood samples were collected at 98 days of gestation (G98) and 12 days of lactation (L12) and the PBMC fraction was isolated. Then, total RNA was extracted from PBMC and submitted to next-generation sequencing using the Illumina NextSeq 2000 system. Quality control, mapping, and annotation were performed using the Dragen RNA v3.8.4 software. The differential analysis was performed using the R package DESeq2. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using a criterion of Padj cut-off < 0.1 and FC > 1.2 or < 0.83 to identify up-regulated and down-regulated genes. For each time point (G98 and L11), the following contrasts were used for the differential analysis: sows housed in the enriched environment compared to the conventional environment [E vs C], dominant sows compared to subordinate sows [Dom vs Sub], and high parity sows (HP: 4th gestation or higher) compared to low parity sows (LP: 2nd and 3rd gestation) [HP vs LP]. The identified DEGs were used for functional analysis using the Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID) software. To our knowledge, this is the first dataset allowing the investigation of the simultaneous effects of housing environment, dominance status, and parity on the PBMC transcriptome of adult sows. These data could also be used to compare the transcriptome of pregnant and lactating females

Impact of Antiplatelet Therapy During Endovascular Therapy for Tandem Occlusions

International audienceBackground and Purpose- Antiplatelet agents could be used in the setting of endovascular therapy for tandem occlusions to reduce the risk of de novo intracranial embolic migration, reocclusion of the extracranial internal carotid artery lesion, or in-stent thrombosis in case of carotid stent placement but have to be balanced with the intracerebral hemorrhagic transformation risk. In this study, we aim to investigate the impact of acute antiplatelet therapy administration on outcomes during endovascular therapy for anterior circulation tandem occlusions. Methods- This is a retrospective analysis of a collaborative pooled analysis of 11 prospective databases from the multicenter observational TITAN registry (Thrombectomy in Tandem Lesions). Patients were divided into groups based on the number of antiplatelet administered during endovascular therapy. The primary outcome was favorable outcome, defined as a modified Rankin Scale score of 0 to 2 at 90 days. Results- This study included a total of 369 patients; 145 (39.3%) did not receive any antiplatelet agent and 224 (60.7%) received at least 1 antiplatelet agent during the procedure. Rate of favorable outcome was nonsignificantly higher in patients treated with antiplatelet therapy (58.3%) compared with those treated without antiplatelet (46.0%; adjusted odds ratio, 1.38 [95% CI, 0.78-2.43]; P=0.26). Rate of 90-day mortality was significantly lower in patients treated with antiplatelet therapy (11.2% versus 18.7%; adjusted odds ratio, 0.47 [95% CI, 0.22-0.98]; P=0.042), without increasing the risk of any intracerebral hemorrhage. Successful reperfusion (modified Thrombolysis in Cerebral Ischemia score 2b-3) rate was significantly better in the antiplatelet therapy group (83.9% versus 71.0%; adjusted odds ratio, 1.89 [95% CI, 1.01-3.64]; P=0.045). Conclusions- Administration of antiplatelet therapy during endovascular therapy for anterior circulation tandem occlusions was safe and was associated with a lower 90-day mortality. Optimal antiplatelet therapy remains to be assessed, especially when emergent carotid artery stenting is performed. Further randomized controlled trials are needed