4 research outputs found
Is a non-synonymous SNP in the HvAACT1 coding region associated with acidic soil tolerance in barley?
Construção do Receptor CYSLTR1 por Modelagem Comparativa
A asma é caracterizada como um distúrbio inflamatório
crônico das vias aéreas, provocada pela contração
da musculatura lisa dos bronquíolos, ocasionando
obstrução parcial dos mesmos e dificultando a
respiração. A Organização Mundial de Saúde (OMS)
estima que 300 milhões de pessoas atualmente sofram
de asma, sendo que as crianças estão entre as mais
acometidas. Somente em 2005, 255.000 pessoas
morreram de asma. Dentre os mediadores envolvidos
no processo asmático, os leucotrienos cisteínicos,
derivados do ácido araquidônico, são considerados os
mais potentes entre aqueles envolvidos no processo
asmático, indicados como principais mediadores da
inflamação reversível das vias aéreas. Nos últimos
20 anos, grandes esforços têm sido realizados para
identificar e desenvolver antagonistas dos receptores
de leucotrienos na busca de melhorar o tratamento
da asma, limitar a sua morbidade, e reduzir os efeitos
dos medicamentos atuais. Portanto, o presente estudo
propôs a construção de um modelo teórico do receptor
do leucotrienos cisteínicos denominado CysLT1 por
Modelagem Comparativa. Conclui-se que o modelo
obtido através das metodologias computacionais e
apresentado no presente estudo pode auxiliar em
futuros testes, principalmente em metodologias que
empregam ancoragem molecular e de novo design
testando, in silico, ligantes de diversas fontes contra o
receptor CysLT1
Metal binding selectivity of oxa-aza macrocyclic ligand: a DFT study of first- and second-row transition metal for four coordination systems
A detailed theoretical study of the 1,7,1l,17-tetraoxa-2,6,12,16-tetraaza-cycloeicosane ligand ([20]AneN(4)O(4)) coordinated to Fe2+, Co2+, Ni2+, Ru2+, Rh2+, and Pd2+ transition metal ions was carried out with the B3LYP method. Two different cases were performed: when nitrogen is the donor atom (1a (q) ) and also with the oxygen as the donor atom (1b (q) ). For all the cases performed in this study 1a (q) structures were always more stable than the 1b (q) ones. Considering each row is possible to see that the energy increases with the increase of the atomic number. The M2+ cation binding energies for the 1a (q) complexes increase with the following order: Fe2+ < Ru2+ < Co2+ < Ni2+ < Rh2+ < Pd2+.FAPERJFAPERJCAPESCAPESCNPqCNP
First- and second-row transition metal oxa-aza macrocyclic complexes: a DFT study of an octahedral conformation
A theoretical study of structures of the 1,7,1 l,17-tetraoxa-2,6,12,16-tetraaza-cycloeicosane ligand ([20]AneN(4)O(4)) coordinated to Fe2+, Co2+, Ni2+, Ru2+, Rh2+, and Pd2+ transition metals ions was carried out with the DFT/B3LYP method. Complexes were fully optimized in C-s symmetry with the metal ions coordinated either to nitrogen (1a) or oxygen atoms (1b). For all the cases performed in this work, 1a was always more stable than 1b. Considering each row it is possible to see that the binding energy increases with the atomic number. The M2+ cation binding energies increase in the following order: Fe2+ < Ru2+ < Co2+ < Ni2+ < Rh2+ < Pd2+. In addition, it was observed the preference of Pd2+ and Rh2+ complexes for a tetrahedral arrangement, while Fe2+, Ru2+, Co2+, Ni2+ complexes had a preference for the octahedral arrangement. From the orbital representation results, it was seen that 1b unsymmetrical orbitals may influence the susceptibility over metal ions orientation toward heteroatoms orbitals.FAPERJ (Fundacao de Amparo a Pesquisa do Rio de Janeiro)Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES)CAPES (Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior)CNPq (Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico