Phylogenetic analysis of rabies surveillance samples from north and northeast Brazil

Viruses of the Lyssavirus genus are classified into several genotypes (GT1 to GT7), of which only GT1 (classic rabies virus—RABV) has a cosmopolitan distribution and circulates in Brazil. GT1 is subdivided into several antigenic variants (AgV) maintained in independent cycles with a narrow host range and distinct geographic distributions, namely, AgV1 and AgV2 found in dogs, AgV3 in the vampire bats Desmodus rotundus, and AgV4 and AgV6 in bats non-hematophagous Tadarida brasiliensis and Lasiurus cinereus, a common variant of marmoset (Callithrix jacchus), and crab-eating fox (Cerdocyon thous). In this study, we performed phylogenetic analysis to identify at the antigenic variant level; six RABV genomes derived from the Rabies Surveillance in the north and northeast regions of Brazil. The analysis resulted in the formation of 11 monophyletic clusters, each corresponding to a particular variant, with high bootstrap support values. The samples were positioned inside the AgV3, AgV6, and Callithrix variant clades. This is the first report of the AgV6 variant found in northern Brazil, which provides valuable information for rabies surveillance in the country. The possibility of viral spillover has been much debated, as it deals with the risk of shifting transmission from a primary to a secondary host. However, more genomic surveillance studies should be performed, with a greater number and diversity of samples to better understand the transmission dynamics of each variant to detect changes in its geographic distribution and spillover events

O IMPACTO DA FORMAÇÃO DE BIOFILME NA RECORRÊNCIA DA INFECÇÃO POR CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE: UM ESTUDO COMPARATIVO DE CEPAS TOXIGÊNICAS MLST CLADO 2

Introdução/objetivo: Clostridioides difficile é a principal causa de diarreia associada ao uso de antibióticos relacionada a assistência à saúde. Um desafio no tratamento da infecção por C. difficile é a capacidade dessa bactéria em formar biofilmes, um mecanismo de virulência crítico por promover resistência a antibióticos e, consequentemente, maior recorrência da doença. Nesse estudo in vitro, o objetivo foi comparar a capacidade de formação de biofilme de cepas MLST Clado 2: ICC-45 (ribotipo SLO231/UK[CE]821) isolada no Brasil, e duas cepas epidêmicas: NAP1/027/ST01 (LIBA5756), isolada em um surto na Costa Rica e a cepa epidêmica de referência NAP1/027/ST01 (R20291). Além disso, a cepa não toxigênica ATCC700057 foi incluída como controle. Métodos: A capacidade das cepas de formar biofilme foi avaliada por coloração com cristal violeta. Além disso, as amostras foram coradas com Film Tracer biofilm matrix (Invitrogen®) e a espessura da matriz do biofilme foi medida usando microscopia confocal. A arquitetura da matriz foi analisada por Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV). A expressão dos genes de virulência (tcdA, tcdB, tcdC, cdtB, spo0A, slpA, cwp66 e cwp84) foi examinada por RT-qPCR. Investigou-se ainda o efeito dos antibióticos Metronidazol (MTZ) e Vancomicina (VAN) no crescimento do biofilme. Resultados: Todas as cepas testadas mostraram capacidade de formar biofilmes moderados (1,13,5). Após 72h, a biomassa do biofilme das cepas epidêmicas NAP1/027/ST01 (LIBA5756 e R20291) foi significativamente maior do que os biofilmes ICC-45 e ATCC 700057, o que foi confirmado por MEV e confocal. As cepas R20291 e LIBA 5756 apresentaram uma expressão mais elevada dos genes tcdA, tcdB, tcdC, cdtA, slpA e spo0A em comparação com a cepa ICC-45. Não foram observadas diferenças significativas na expressão de cdtB, cwp66 e cwp84. Quanto ao efeito dos antibióticos, tanto a VAN quanto o MTZ inibiram a formação de biofilme nas cepas epidêmicas. No entanto, na linhagem ICC-45, as concentrações MIC de VAN e MIC e 4MIC de MTZ não inibiram a formação de biofilme. Conclusão: Os três isolados MLST Clado 2, de diferentes ribotipos, são bactérias formadoras de biofilmes competentes, indicando suas capacidades de induzir a recorrência da infecção por C. difficile, tornando o tratamento desafiador. Esses dados evidenciam a importância da vigilância epidemiológica voltada para a emergência de cepas resistentes e causadoras de recidivas diante de um mundo globalizado