Direct Coupling Analysis of Epistasis in Allosteric Materials

In allosteric proteins, the binding of a ligand modifies function at a distant active site. Such allosteric pathways can be used as target for drug design, generating considerable interest in inferring them from sequence alignment data. Currently, different methods lead to conflicting results, in particular on the existence of long-range evolutionary couplings between distant amino-acids mediating allostery. Here we propose a resolution of this conundrum, by studying epistasis and its inference in models where an allosteric material is evolved in silico to perform a mechanical task. We find in our model the four types of epistasis (Synergistic, Sign, Antagonistic, Saturation), which can be both short or long-range and have a simple mechanical interpretation. We perform a Direct Coupling Analysis (DCA) and find that DCA predicts well the cost of point mutations but is a rather poor generative model. Strikingly, it can predict short-range epistasis but fails to capture long-range epistasis, in consistence with empirical findings. We propose that such failure is generic when function requires subparts to work in concert. We illustrate this idea with a simple model, which suggests that other methods may be better suited to capture long-range effects.Comment: 22 pages, 9 figure

Training curriculum in minimally invasive emergency digestive surgery : 2022 WSES position paper

Background Minimally invasive surgery (MIS), including laparoscopic and robotic approaches, is widely adopted in elective digestive surgery, but selectively used for surgical emergencies. The present position paper summarizes the available evidence concerning the learning curve to achieve proficiency in emergency MIS and provides five expert opinion statements, which may form the basis for developing standardized curricula and training programs in emergency MIS. Methods This position paper was conducted according to the World Society of Emergency Surgery methodology. A steering committee and an international expert panel were involved in the critical appraisal of the literature and the development of the consensus statements. Results Thirteen studies regarding the learning curve in emergency MIS were selected. All but one study considered laparoscopic appendectomy. Only one study reported on emergency robotic surgery. In most of the studies, proficiency was achieved after an average of 30 procedures (range: 20-107) depending on the initial surgeon's experience. High heterogeneity was noted in the way the learning curve was assessed. The experts claim that further studies investigating learning curve processes in emergency MIS are needed. The emergency surgeon curriculum should include a progressive and adequate training based on simulation, supervised clinical practice (proctoring), and surgical fellowships. The results should be evaluated by adopting a credentialing system to ensure quality standards. Surgical proficiency should be maintained with a minimum caseload and constantly evaluated. Moreover, the training process should involve the entire surgical team to facilitate the surgeon's proficiency. Conclusions Limited evidence exists concerning the learning process in laparoscopic and robotic emergency surgery. The proposed statements should be seen as a preliminary guide for the surgical community while stressing the need for further research.Peer reviewe

Deutsche Bundesbank e Banca d’Italia. La conoscenza enciclopedica condivisa in una comunità socioprofessionale di parlanti

Questo elaborato si concentra sull’estrazione di tecnicismi specifici (TS) della lingua speciale economico-finanziaria dal corpus manuale bilingue comparabile CorBank, che contiene quattro discorsi in italiano (sub-corpus CorBankIT) e quattro in tedesco (sub-corpus CorBankDE) raccolti nelle conferenze stampa annuali dei presidenti della Banca d’Italia e della Deutsche Bundesbank. Dopo un’analisi basata sui corpora e l’estrazione di termini dalle liste di frequenza, poi riuniti nel glossario GlosBank, si è proceduto ad applicare il metodo termontografico elaborato da Rita Temmerman e Koen Kerremans del Centrum voor Vaktaal en Communicatie (CVC) presso la Erasmushogeschool di Bruxelles per la ricerca di tracce di conoscenza enciclopedica condivise tra i due sub-corpora. Il metodo termontografico ha portato alla costruzione delle due mappe termontografiche, denominate BankMapIT e BankMapDE, che si prestano a una comparazione, per osservare i concetti in comune nella comunità socioprofessionale analizzata, obiettivo primario della ricerca. La particolarità di questo metodo è che, superando la presentazione bidimensionale del termine (termine e suo equivalente), fornisce anche la sua terza dimensione, cioè lo pone in relazione con gli altri termini. L’intera analisi è stata svolta anche nella prospettiva dell’interpretazione di conferenza. L’interprete si inserisce sempre come terza persona in un’interazione tra individui appartenenti a comunità socioprofessionali diverse dalla sua. Da ciò si conferma una tendenziale asimmetria enciclopedica tra interprete e relatore che è colmabile solo con la preparazione preliminare all’evento

Stima degli effetti individuali sulla disponibilità a pagare da responsi dicotomici con reiterazione: escursionisti e villeggianti in visita al Parco Nazionale del Gran Paradiso

Numerosi studiosi italiani che si interessano di valori ricreativi stanno prestando una crescente attenzione ai metodi di valutazione basati sulle cosiddette preferenze affermate, e, in special modo, alla valutazione contingente (CV) (esempi recenti sono Tempesta, 1996; Marangon e Tempesta 1998). Questi studi hanno ancora, almeno in parte, obiettivi di tipo sperimentale e mirano ad identificare la performance nel contesto italiano di questa metodologia sviluppata prevalentemente in ambito anglosassone. In tale contesto risultano, ad esempio, di un certo interesse gli studi che tentano una validazione delle stime CV tramite il confronto con altre tecniche, in special modo il metodo costo di viaggio (TC) (cfr. Romano e Carbone 1993; Romano e Rossi 1994). I1 panorama di applicazioni italiane di queste metodologie è esteso ben oltre i semplici valori ricreativi, come è facilmente dimostrabile sfogliando la rassegna di saggi e applicazioni contenuta in Bishop e Romano (1998