137 research outputs found
Homozygous single base deletion in TUSC3 causes intellectual disability with developmental delay in an Omani family
Intellectual disability (ID) is the term used to describe a diverse group of neurological conditions with congenital or juvenile onset, characterized by an IQ score of less than 70 and difficulties associated with limitations in cognitive function and adaptive behavior. The condition can be inherited or caused by environmental factors. The genetic forms are heterogeneous, with mutations in over 500 known genes shown to cause the disorder. We report a consanguineous Omani family in which multiple individuals have ID and developmental delay together with some variably present features including short stature, microcephaly, moderate facial dysmorphism, and congenital malformations of the toes or hands. Homozygosity mapping combined with whole exome next generation sequencing identified a novel homozygous single base pair deletion in TUSC3, c.222delA, p.R74 fs. The mutation segregates with the disease phenotype in a recessive manner and is absent in 60,706 unrelated individuals from various disease-specific and population genetic studies. TUSC3 mutations have been previously identified as causing either syndromic or non-syndromic ID in patients from France, Italy, Iran and Pakistan. This paper supports the previous clinical descriptions of the condition caused by TUSC3 mutations and describes the seventh family with mutations in this gene, thus contributing to the genetic spectrum of mutations. This is the first report of a family from the Arabian peninsula with this form of ID
Concordant copy number and transcriptional activity of genes mapping to derivative chromosomes 8 during cellular immortalization in vitro
Deletion, rearrangement, or amplification of sequences mapping to chromosome 8 are frequently observed in human prostate and other tumors. However, it is not clear whether these events alter the transcriptional activity of the affected genes. To examine this question, we have utilized oligonucleotide microarray technology and compared the transcriptional patterns of normal human prostate tissues and five immortalized cell lines carrying either two normal chromosomes 8 or one normal and one derivative chromosome 8. Comparison of the transcriptional profiles of the tissues and cell lines identified 125 differentially expressed transcripts specific to chromosome 8, with 46 transcripts mapping to 8p and 79 transcripts mapping to 8q. The majority of genes mapping to 8p (44/46, 96%) were transcriptionally down-regulated in cells hemizygous for 8p, whereas the majority of genes mapping to 8q (58/79, 73%) were up-regulated in cells carrying three copies of 8q. Moreover, hemizygous alleles on 8p exhibited sub-haploinsufficient transcript levels for several genes that could be induced to haploinsufficient levels under hypomethylating conditions, suggesting that epigenetic regulation is a common mechanism for gene silencing in cells deleted for one copy of 8p. The results of these studies clearly demonstrate that alterations of gene copy number and transcriptional activity are directly correlated in cell lines harboring derivative chromosomes 8, and that these events are commonly observed during cellular immortalization in vitro. © 2005 Wiley-Liss, Inc.Peer Reviewedhttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/49531/1/20274_ftp.pd
Three independently deleted regions at chromosome arm 16q in human prostate cancer: allelic loss at 16q24.1âq24.2 is associated with aggressive behaviour of the disease, recurrent growth, poor differentiation of the tumour and poor prognosis for the patient
Loss of heterozygosity at chromosome arm 16q is a frequent event in human prostate cancer. In this study, loss of heterozygosity at 16q was studied in 44 prostate cancer patients exhibiting various clinical features. Fifteen polymorphic polymerase chain reaction (PCR) markers were used to identify the separately deleted areas and the findings were compared with clinicopathological variables and 5-year survival of the patients. The results indicated that there are at least three independently deleted regions at 16q. Allelic losses at the central and distal areas were associated significantly with aggressive behaviour of the disease (16q24.1âq24.2, P< 0.01, and 16q24.3âqter, P< 0.05), and the central area of deletion was further significantly associated with poorly differentiated tumour cells (P< 0.05) and with recurrent (P< 0.01) growth of the tumour. During the follow-up period, 28% of the patients initially with M0 disease developed distant metastases. Of the patients showing allelic loss at 16q24.1âq24.2, distant metastasis were found in 45% during the 5-year follow-up period, and 31% of the patients showing loss at 16q21.1 also developed distant metastases. After the 5-year follow-up period, 14 (32%) of the patients remained alive, whereas 19 (43%) had died because of their prostate cancer. The overall survival rate of the patients showing allelic loss at 16q21.1 or 16q24.1âq24.2 was significantly lower than that of the patients with retained heterozygosity. © 1999 Cancer Research Campaig
Abnormal expression and function of the E-cadherinâcatenin complex in gastric carcinoma cell lines
Designing and analysing chemistry teaching based on a didactic model : An action study based on the didactic model Map of practical work for di-dactic analysis and design of teaching about mixtures and solutions in pri-mary school.
Syftet med denna studie Àr att bidra till en ökad kunskap kring hur den didaktiska modellen Map of practical work framtagen av Millar m.fl. (1999) kan anvÀndas som stöd för didaktisk design samt didaktisk analys av naturvetenskapsundervisningen pÄ lÄg- och mellanstadiet. Vi har exemplifierat hur modellen Map of practical work kan anvÀndas som stöd i planering, genomförande och analys av undervisning. För att göra detta har vi anvÀnt oss av forskningsansatsen aktionsforskning. Vi har med stöd i modellen tagit fram en laborativ undervisningssekvens om blandningar och lösningar som vi anvÀnt oss av i tre cykler. Efter varje individuell cykel gjordes en analys av den tidigare cykeln med hjÀlp av modellen. Analysen i sin tur lade grunden för de didaktiska val vi gjorde för att göra justeringar till nÀsta cykel som skulle genomföras. För att kunna göra observationer och analysera efterarbetet valde vi att spela in deltagarnas röster med ljudinspelning. I resultatet framkommer det hur den didaktiska modellen fungerat som stöd i planeringen, genomförandet och analysen av undervisningssekvenserna. Resultatet visar Àven vilka didaktiska val vi gjort med stöd av modellen. Det framkommer ocksÄ inom vilken nivÄ av effektivitet som vi uppfattar att varje undervisningssekvens uppfyllde. Slutsatsen Àr att Map of practical work kan vara ett stöd för pedagoger i planerandet, genomförandet och analysen av undervisningen i de naturvetenskapliga Àmnena. Men kan med fördel kombineras med andra didaktiska modeller.  Nyckelord: Aktionsforskning, Didaktisk modellering, Kemi, Praktiskt arbetssÀtt, Systematiska undersökningar
Designing and analysing chemistry teaching based on a didactic model : An action study based on the didactic model Map of practical work for di-dactic analysis and design of teaching about mixtures and solutions in pri-mary school.
Syftet med denna studie Àr att bidra till en ökad kunskap kring hur den didaktiska modellen Map of practical work framtagen av Millar m.fl. (1999) kan anvÀndas som stöd för didaktisk design samt didaktisk analys av naturvetenskapsundervisningen pÄ lÄg- och mellanstadiet. Vi har exemplifierat hur modellen Map of practical work kan anvÀndas som stöd i planering, genomförande och analys av undervisning. För att göra detta har vi anvÀnt oss av forskningsansatsen aktionsforskning. Vi har med stöd i modellen tagit fram en laborativ undervisningssekvens om blandningar och lösningar som vi anvÀnt oss av i tre cykler. Efter varje individuell cykel gjordes en analys av den tidigare cykeln med hjÀlp av modellen. Analysen i sin tur lade grunden för de didaktiska val vi gjorde för att göra justeringar till nÀsta cykel som skulle genomföras. För att kunna göra observationer och analysera efterarbetet valde vi att spela in deltagarnas röster med ljudinspelning. I resultatet framkommer det hur den didaktiska modellen fungerat som stöd i planeringen, genomförandet och analysen av undervisningssekvenserna. Resultatet visar Àven vilka didaktiska val vi gjort med stöd av modellen. Det framkommer ocksÄ inom vilken nivÄ av effektivitet som vi uppfattar att varje undervisningssekvens uppfyllde. Slutsatsen Àr att Map of practical work kan vara ett stöd för pedagoger i planerandet, genomförandet och analysen av undervisningen i de naturvetenskapliga Àmnena. Men kan med fördel kombineras med andra didaktiska modeller.  Nyckelord: Aktionsforskning, Didaktisk modellering, Kemi, Praktiskt arbetssÀtt, Systematiska undersökningar
INTRESSENTERNAS BETYDELSE I ARBETET MED Hà LLBARHETSREDOVISNING - En fallstudie pÄ plats i Bosnien & Hercegovina
FyraÄringars kostvanor och fysiska aktivitet
Ăvervikt och fetma bland barn Ă€r ett snabbt vĂ€xande hĂ€lsoproblem i vĂ€stvĂ€rlden, problemet Ă€r bland annat minskad fysisk aktivitet och kost med ett stort fett- och sockerinnehĂ„ll Den som varit överviktig som barn kan i större utstrĂ€ckning fĂ„ hĂ€lsoproblem i vuxen Ă„lder Eftersom detta grundlĂ€ggs redan i barndomen har distriktssköterskan pĂ„ barnavĂ„rdscentralen en viktig roll att fylla. För att distriktssköterskan skall kunna hjĂ€lpa och stötta familjen bör de veta hur fyrĂ„ringar Ă€ter och hur de rör sig. De Svenska nĂ€ringsrekommendationerna kan vara stöd i samtal med förĂ€ldrar. Syftet var att kartlĂ€gga fyraĂ„ringars kostvanor och fysiska aktivitet och undersöka samband i en regional population i Mellansverige. Kostvanorna hos den regionala populationen av fyraĂ„ringar jĂ€mfördes med kostvanor hos en nationell population fyraĂ„ringar. En postenkĂ€t skickades ut till 96 förĂ€ldrar angĂ„ende deras fyraĂ„ringars kostvanor och fysiska aktivitet. FrĂ„gorna hĂ€mtades ur SLV:s tidigare undersökningar om kost och fysisk aktivitet. Svarsfrekvensen var 59 %. Databearbetning gjordes med SPSS (Statistical package for social science). Resultaten visar att majoriteten av barnen Ă„t en allsidig kost och rörde sig mer Ă€n 60 minuter per dag som rekommenderas. I jĂ€mförelser med den nationella populationen sĂ„gs signifikant skillnad i konsumtion av fĂ€rdiglagad mat och snabbmat. PĂ„ grund av att övervikt och fetma Ă€r ett vanligt förekommande problem sĂ„ hade i aktuellt examensarbete förvĂ€ntats att se nĂ„got samband mellan kostvanor, fysisk aktivitet och tid vid TV/dator, men inga samband sĂ„gs
Vilken medvetenhet och erfarenhet har gemene man om sitt deltagande vid insamling av big data?
- âŠ