Homozygous single base deletion in TUSC3 causes intellectual disability with developmental delay in an Omani family

Intellectual disability (ID) is the term used to describe a diverse group of neurological conditions with congenital or juvenile onset, characterized by an IQ score of less than 70 and difficulties associated with limitations in cognitive function and adaptive behavior. The condition can be inherited or caused by environmental factors. The genetic forms are heterogeneous, with mutations in over 500 known genes shown to cause the disorder. We report a consanguineous Omani family in which multiple individuals have ID and developmental delay together with some variably present features including short stature, microcephaly, moderate facial dysmorphism, and congenital malformations of the toes or hands. Homozygosity mapping combined with whole exome next generation sequencing identified a novel homozygous single base pair deletion in TUSC3, c.222delA, p.R74 fs. The mutation segregates with the disease phenotype in a recessive manner and is absent in 60,706 unrelated individuals from various disease-specific and population genetic studies. TUSC3 mutations have been previously identified as causing either syndromic or non-syndromic ID in patients from France, Italy, Iran and Pakistan. This paper supports the previous clinical descriptions of the condition caused by TUSC3 mutations and describes the seventh family with mutations in this gene, thus contributing to the genetic spectrum of mutations. This is the first report of a family from the Arabian peninsula with this form of ID

Concordant copy number and transcriptional activity of genes mapping to derivative chromosomes 8 during cellular immortalization in vitro

Deletion, rearrangement, or amplification of sequences mapping to chromosome 8 are frequently observed in human prostate and other tumors. However, it is not clear whether these events alter the transcriptional activity of the affected genes. To examine this question, we have utilized oligonucleotide microarray technology and compared the transcriptional patterns of normal human prostate tissues and five immortalized cell lines carrying either two normal chromosomes 8 or one normal and one derivative chromosome 8. Comparison of the transcriptional profiles of the tissues and cell lines identified 125 differentially expressed transcripts specific to chromosome 8, with 46 transcripts mapping to 8p and 79 transcripts mapping to 8q. The majority of genes mapping to 8p (44/46, 96%) were transcriptionally down-regulated in cells hemizygous for 8p, whereas the majority of genes mapping to 8q (58/79, 73%) were up-regulated in cells carrying three copies of 8q. Moreover, hemizygous alleles on 8p exhibited sub-haploinsufficient transcript levels for several genes that could be induced to haploinsufficient levels under hypomethylating conditions, suggesting that epigenetic regulation is a common mechanism for gene silencing in cells deleted for one copy of 8p. The results of these studies clearly demonstrate that alterations of gene copy number and transcriptional activity are directly correlated in cell lines harboring derivative chromosomes 8, and that these events are commonly observed during cellular immortalization in vitro. © 2005 Wiley-Liss, Inc.Peer Reviewedhttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/49531/1/20274_ftp.pd

Three independently deleted regions at chromosome arm 16q in human prostate cancer: allelic loss at 16q24.1–q24.2 is associated with aggressive behaviour of the disease, recurrent growth, poor differentiation of the tumour and poor prognosis for the patient

Loss of heterozygosity at chromosome arm 16q is a frequent event in human prostate cancer. In this study, loss of heterozygosity at 16q was studied in 44 prostate cancer patients exhibiting various clinical features. Fifteen polymorphic polymerase chain reaction (PCR) markers were used to identify the separately deleted areas and the findings were compared with clinicopathological variables and 5-year survival of the patients. The results indicated that there are at least three independently deleted regions at 16q. Allelic losses at the central and distal areas were associated significantly with aggressive behaviour of the disease (16q24.1–q24.2, P< 0.01, and 16q24.3–qter, P< 0.05), and the central area of deletion was further significantly associated with poorly differentiated tumour cells (P< 0.05) and with recurrent (P< 0.01) growth of the tumour. During the follow-up period, 28% of the patients initially with M0 disease developed distant metastases. Of the patients showing allelic loss at 16q24.1–q24.2, distant metastasis were found in 45% during the 5-year follow-up period, and 31% of the patients showing loss at 16q21.1 also developed distant metastases. After the 5-year follow-up period, 14 (32%) of the patients remained alive, whereas 19 (43%) had died because of their prostate cancer. The overall survival rate of the patients showing allelic loss at 16q21.1 or 16q24.1–q24.2 was significantly lower than that of the patients with retained heterozygosity. © 1999 Cancer Research Campaig

Designing and analysing chemistry teaching based on a didactic model : An action study based on the didactic model Map of practical work for di-dactic analysis and design of teaching about mixtures and solutions in pri-mary school.

Syftet med denna studie är att bidra till en ökad kunskap kring hur den didaktiska modellen Map of practical work framtagen av Millar m.fl. (1999) kan användas som stöd för didaktisk design samt didaktisk analys av naturvetenskapsundervisningen på låg- och mellanstadiet. Vi har exemplifierat hur modellen Map of practical work kan användas som stöd i planering, genomförande och analys av undervisning. För att göra detta har vi använt oss av forskningsansatsen aktionsforskning. Vi har med stöd i modellen tagit fram en laborativ undervisningssekvens om blandningar och lösningar som vi använt oss av i tre cykler. Efter varje individuell cykel gjordes en analys av den tidigare cykeln med hjälp av modellen. Analysen i sin tur lade grunden för de didaktiska val vi gjorde för att göra justeringar till nästa cykel som skulle genomföras. För att kunna göra observationer och analysera efterarbetet valde vi att spela in deltagarnas röster med ljudinspelning. I resultatet framkommer det hur den didaktiska modellen fungerat som stöd i planeringen, genomförandet och analysen av undervisningssekvenserna. Resultatet visar även vilka didaktiska val vi gjort med stöd av modellen. Det framkommer också inom vilken nivå av effektivitet som vi uppfattar att varje undervisningssekvens uppfyllde. Slutsatsen är att Map of practical work kan vara ett stöd för pedagoger i planerandet, genomförandet och analysen av undervisningen i de naturvetenskapliga ämnena. Men kan med fördel kombineras med andra didaktiska modeller.   Nyckelord: Aktionsforskning, Didaktisk modellering, Kemi, Praktiskt arbetssätt, Systematiska undersökningar

Designing and analysing chemistry teaching based on a didactic model : An action study based on the didactic model Map of practical work for di-dactic analysis and design of teaching about mixtures and solutions in pri-mary school.

Syftet med denna studie är att bidra till en ökad kunskap kring hur den didaktiska modellen Map of practical work framtagen av Millar m.fl. (1999) kan användas som stöd för didaktisk design samt didaktisk analys av naturvetenskapsundervisningen på låg- och mellanstadiet. Vi har exemplifierat hur modellen Map of practical work kan användas som stöd i planering, genomförande och analys av undervisning. För att göra detta har vi använt oss av forskningsansatsen aktionsforskning. Vi har med stöd i modellen tagit fram en laborativ undervisningssekvens om blandningar och lösningar som vi använt oss av i tre cykler. Efter varje individuell cykel gjordes en analys av den tidigare cykeln med hjälp av modellen. Analysen i sin tur lade grunden för de didaktiska val vi gjorde för att göra justeringar till nästa cykel som skulle genomföras. För att kunna göra observationer och analysera efterarbetet valde vi att spela in deltagarnas röster med ljudinspelning. I resultatet framkommer det hur den didaktiska modellen fungerat som stöd i planeringen, genomförandet och analysen av undervisningssekvenserna. Resultatet visar även vilka didaktiska val vi gjort med stöd av modellen. Det framkommer också inom vilken nivå av effektivitet som vi uppfattar att varje undervisningssekvens uppfyllde. Slutsatsen är att Map of practical work kan vara ett stöd för pedagoger i planerandet, genomförandet och analysen av undervisningen i de naturvetenskapliga ämnena. Men kan med fördel kombineras med andra didaktiska modeller.   Nyckelord: Aktionsforskning, Didaktisk modellering, Kemi, Praktiskt arbetssätt, Systematiska undersökningar

Fyraåringars kostvanor och fysiska aktivitet

Övervikt och fetma bland barn är ett snabbt växande hälsoproblem i västvärlden, problemet är bland annat minskad fysisk aktivitet och kost med ett stort fett- och sockerinnehåll Den som varit överviktig som barn kan i större utsträckning få hälsoproblem i vuxen ålder Eftersom detta grundläggs redan i barndomen har distriktssköterskan på barnavårdscentralen en viktig roll att fylla. För att distriktssköterskan skall kunna hjälpa och stötta familjen bör de veta hur fyråringar äter och hur de rör sig. De Svenska näringsrekommendationerna kan vara stöd i samtal med föräldrar. Syftet var att kartlägga fyraåringars kostvanor och fysiska aktivitet och undersöka samband i en regional population i Mellansverige. Kostvanorna hos den regionala populationen av fyraåringar jämfördes med kostvanor hos en nationell population fyraåringar. En postenkät skickades ut till 96 föräldrar angående deras fyraåringars kostvanor och fysiska aktivitet. Frågorna hämtades ur SLV:s tidigare undersökningar om kost och fysisk aktivitet. Svarsfrekvensen var 59 %. Databearbetning gjordes med SPSS (Statistical package for social science). Resultaten visar att majoriteten av barnen åt en allsidig kost och rörde sig mer än 60 minuter per dag som rekommenderas. I jämförelser med den nationella populationen sågs signifikant skillnad i konsumtion av färdiglagad mat och snabbmat. På grund av att övervikt och fetma är ett vanligt förekommande problem så hade i aktuellt examensarbete förväntats att se något samband mellan kostvanor, fysisk aktivitet och tid vid TV/dator, men inga samband sågs