Identificación y caracterización molecular del Norovirus circulante en la ganadería porcina española

Norovirus es un agente patógeno que causa la mayoría de gastroenteritis de origen no bacteriano en humanos a nivel mundial. Es capaz de infectar a un gran rango de hospedadores aparte del ser humano. Entre los Norovirus animales, el de porcino (genogrupo II) es el que más se asemeja genéticamente al Norovirus que afecta al ser humano. Así mismo, España representa uno de los principales países productores de porcino en Europa y a nivel mundial. A pesar de la relevancia del sector porcino y el posible potencial zoonótico del Norovirus que afecta a esta especie, existe poca información sobre la circulación de Norovirus porcino en nuestro país. El objetivo de este trabajo es identificar y evaluar la incidencia de este virus en la cabaña porcina española mediante el análisis de 480 muestras clínicas recibidas por Exopol S.L. durante un período de tres años (2020-2022) y analizar las relaciones filogenéticas entre estas cepas y otras previamente descritas en porcinos y humanos.Para la identificación de Norovirus porcino en diferentes tipos de muestras biológicas, se diseñó un ensayo de RT-PCR en tiempo real que presentó una mayor sensibilidad que otro ensayo previamente descrito. Mediante esta metodología, Norovirus fue identificado en un 10,8 % (52/480) de las muestras clínicas del estudio. La frecuencia de detección fue mayor en las muestras de cerdo ibérico y parece asociarse al sistema de producción característico de esta raza autóctona. La circulación de Norovirus en cerdo blanco resultó particularmente alta en el caso de cerdos de cebo (11,5 %), al igual que en estudios similares.Este trabajo describe la primera caracterización molecular de Norovirus porcino en España, identificando dos genotipos de cepas diferentes (GII.18 y GII.11) y que corroboran los resultados de estudios previos de genotipado realizados para este agente en otros países europeos. Por otro lado, el análisis filogenético demostró una gran variabilidad entre los dos genotipos identificados, y plantea la necesidad de hacer posteriores estudios con el fin de evaluar mejor el origen de estas cepas, así como un seguimiento para rastrear la aparición de virus potencialmente zoonóticos derivados de eventos de recombinación. Por tanto, este trabajo resulta un esfuerzo por poner en práctica el concepto “One Health”.<br /

Identificación molecular del subtipo del virus de Influenza A circulante en la cabaña de porcinos en España mediante PCR en tiempo real y secuenciación

El virus de la Influenza A es el patógeno responsable de la gripe porcina (SIV), una enfermedad respiratoria con alta prevalencia en las explotaciones en nuestro país y en donde ocasiona importantes pérdidas económicas. Durante las últimas décadas, se han descritoprincipalmente cuatro subtipos virales de SIV (H1avN1, H1huN2, H3N2 y H1N1pdm), circulando entre la población porcina europea. Sin embargo, la rápida evolución de estos agentes ha dado lugar a la aparición de nuevos subtipos por procesos de recombinación genética característicos de estos virus.La realización del presente estudio ha permitido identificar mediante RT-qPCR, el subtipo del 94% (124/132) de casos clínicos positivos a SIV procedentes de granjas españolas y recibidos en el laboratorio Exopol durante el año 2020. Entre los subtipos identificados, el H1avN2 (43%) fue el más frecuente, un resultado similar a lo descrito por Sosa Portugal y col.en años previos en porcinos de la península ibérica. En otros países europeos, sin embargo, el subtipo H1avN1 sigue siendo el subtipo más extendido. El resto de subtipos identificados en nuestro trabajo fueron los siguientes: H1huN2 (16%), H1avN1 (10%), H3N1 (11%), H3N2 (10%), y H1pdmN1pdm (2%). La diversidad genética de los SIV identificados en el presente estudio fue evaluada mediante secuenciación Sanger de los genes HA y NA. Un total de 29 secuencias para el gen HA y 36 secuencias para el gen NA fueron obtenidas de casos clínicos procedentes de distintas provincias españolas. El análisis filogenético de las secuencias demostró una mayor similitud con secuencias de cepas españolas descritas en años previos que con cepas de SIV originarias de otros países europeos. Además, el gen NA se encuentra generalmente más conservado que el gen HA, aunque en este caso, las secuencias de tipo H3 presentaron la mayor similitudnucleotídica. La vigilancia continua de los SIV es de gran importancia para la industria porcina, tanto para monitorear la evolución del virus que cambia rápidamente, como para conocer la situación epidemiológica de una región o un país. Es por estos motivos que los datos obtenidos en este trabajo no sólo nos han permitido confirmar la circulación de las tres cepas clásicas porcinas, sino que también han constituido la primera descripción de una nueva cepa H1pdmN1 en la cabaña porcina española.<br /