Purification and characterization of the glutamine synthetase from Douglas-fir roots

International audienc

Purification and characterization of the glutamine synthetase from Douglas-fir roots

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Etude de quelques enzymes impliquées dans le métabolisme azoté de l'association ectomycorhizienne Douglas/Laccaria laccata

National audienc

Evaluation écotoxicologique de sédiments contaminés ou de matériaux de dragage. (II) Présentation des méthodes d'essai

This report presents an application of the proposed risk assessment methodology to sediments from the "Canal de l'Est" (South branch, Vosges, France). Three different sections of the canal have been studied. Metals, PAHs have been analysed on bulk sediments, and drained and pore water. Bioassays have been applied following the framework exposed in the report on methodology. In the first scenario (deposition in an open gravel quarry), three assessment endpoints are considered successively: risk to benthic invertebrates, risk to aquatic species, and risk to groundwater quality. In the case of the sediments from the "Canal de l'Est", only the third leads to a significant risk. In the second scenario (deposition on soil), three assumptions are examined either: risk to plants, risk to aquatic species following run-off on the deposit, and risk to groundwater quality. In the case of the sediments from the "Canal de l'Est", only the first one is characterised by a significant risk; however, the exposure assessment should be refined.A la suite des réflexions sur la démarche d'évaluation et de caractérisation des risques, et à la présentation des méthodes d'essai qui font l'objet des deux premiers rapports de cette étude, celui-ci s'emploie à leur application à un cas concret sur les sédiments du Canal de l'Est Branche Sud (Vosges), où trois biefs sont étudiés. Des analyses chimiques des différents sédiments, et eaux d'égouttage et interstitielles extraites sont réalisées. Les deux scénarios, mise en gravière et dépôt sur sol sont envisagés et les essais biologiques correspondants sont faits. Les résultats obtenus sont analysés en fonction de la caractérisation des risques. Pour le scénario gravière, les hypothèses de l'approche détaillée à savoir: ne pas perturber la structure et les peuplements d'invertébrés benthiques, ne pas entraîner d'effets à long terme sur les organismes de la colonne d'eau, protéger les usages nobles de la nappe alluviale sont examinées. Seule la troisième hypothèse conduit à un risque significatif. Pour le scénario sol, les hypothèses de non-effet sur les plantes, de l'absence d'effet sur les organismes aquatiques et la comparaison avec les limites de potabilité avec les concentrations déterminées dans les colonnes de percolation sont étudiées. Seul le risque pour les plantes apparaît significatif dans ce cas ; l'évaluation de l'exposition mériterait toutefois d'être affinée

Influence de dépôt particulaire de pluie sur les processus microbiens et biogéochimiques dans un milieu d'infiltration poreux

International audienceIn aquatic ecosystems, deposition of fine particles at the surface of bed sediments has a great influence on biogeochemical processes and organic matter mineralization. In urban area, the fine particle deposits collected in stormwater infiltration basins can strongly increase the concentrations of reduced solutes (as NH4+) in interstitial water infiltrating in the porous media. The purpose of this study was to test the relative influence of organic matter characteristics (quantity and quality) and the pollutant content of a stormwater particle deposit on mineralization processes, bacterial characteristics, and the release of nutrients in infiltration sediment systems. In microcosm experiments, two other natural particle deposits (one low and one rich particulate organic matter deposits) were studied to compare their effects with those of the stormwater deposit. The results showed that the biogeochemical processes (aerobic respiration, denitrification, fermentative processes) and the microbial metabolism (enzymatic activities) were stimulated in presence of the stormwater deposit and the natural particulate organic matter (POM)-rich deposit because of the quantity of the POM in these surface particle deposits. The high availability of the POM (indicated by its low C/N ratio) produced a higher stimulation of the microbial metabolism than the POM-rich deposit (with a high C/N ratio). In contrast, presence of pollutants (metals and hydrocarbons) in the stormwater deposit did not have significant influence on microbial processes in the porous media. Thus, stormwater sedimentary deposits strongly loaded in POM and pollutants have a great impact on functioning of water-sediment interfaces by stimulating biogeochemical and microbial processes: (1) interstitial water was deoxygenated, (2) several solutes (NH4+, PO43-, DOC) originating from POM were released to interstitial water and (3) these solutes, particularly DOC, that were transferred at depth can significantly affect the functional diversity of micro-organisms in the whole infiltration system

Approche méthodologique de l’évaluation des risques écotoxicologiques liés à la mise en dépôt sur sol de sédiments de dragage

National audienceThe implementation of an ecological risk assessment framework is presented for dredged material deposits on soil closed to a canal and a groundwater, and tested with sediment samples from a French North-Eastern canal. This framework includes two steps: a screening risk assessment, based on contaminant concentrations, and a detailed risk assessment based on toxicity bioassays and column leaching tests. The tested framework includes three assumptions, which are related (a) to effects to plants (Lolium perenne L.), (b) effects to aquatic organisms (Escherichia coli, Chlorella vulgaris, Ceriodaphnia dubia, and Xenopus laevis) and (c) to groundwater contamination. Several exposure conditions were tested, including standardised bioassays. According to the specific tested sediments, the three assumptions were more or less discriminatory, soil and groundwater pollution being the most sensitives. The assessment procedure has to be improved on several aspects, particularly assessment endpoint design for risk to ecosystems (e.g.: integration of pollutants bioaccumulation), bioassays protocols and column leaching test design.Une méthodologie d’évaluation des risques écotoxicologiques engendrés par un dépôt de sédiments de dragage sur un sol situé à proximité d’un canal et à la surface d’une nappe phréatique exploitée a été élaborée et testée avec des échantillons de sédiments d’un canal du Nord-Est de la France. La procédure générale comporte une étape d’évaluation simplifiée des risques, basée essentiellement sur la mesure des concentrations en polluants dans les sédiments, et une étape d’évaluation détaillée des risques où des essais d’écotoxicité et de percolation en colonnes sont mis en œuvre. Le scénario testé retient trois hypothèses, qui concernent (a) les effets sur les végétaux de la prairie périphérique du dépôt, représentés par Lolium perenne L., (b) les effets sur les organismes aquatiques du canal, représentés par Escherichia coli, Chlorella vulgaris, Ceriodaphnia dubia, et Xenopus laevis, et (c) la pollution de la nappe alluviale associée. Différentes modalités d’exposition (essais normalisés ou standardisés) ont été testées. Dans le cas particulier des trois sédiments étudiés, ces hypothèses se sont avérées plus ou moins discriminantes, la pollution de la prairie et de la nappe étant les plus sensibles. Des améliorations de la méthodologie sont envisagées concernant à la fois la sélection des variables biologiques (intégration des effets liés à la bioaccumulation des polluants, par exemple), et les protocoles des bioessais et de percolation en colonne

Approche méthodologique de l’évaluation des risques écotoxicologiques liés à la mise en dépôt sur sol de sédiments de dragage

National audienceThe implementation of an ecological risk assessment framework is presented for dredged material deposits on soil closed to a canal and a groundwater, and tested with sediment samples from a French North-Eastern canal. This framework includes two steps: a screening risk assessment, based on contaminant concentrations, and a detailed risk assessment based on toxicity bioassays and column leaching tests. The tested framework includes three assumptions, which are related (a) to effects to plants (Lolium perenne L.), (b) effects to aquatic organisms (Escherichia coli, Chlorella vulgaris, Ceriodaphnia dubia, and Xenopus laevis) and (c) to groundwater contamination. Several exposure conditions were tested, including standardised bioassays. According to the specific tested sediments, the three assumptions were more or less discriminatory, soil and groundwater pollution being the most sensitives. The assessment procedure has to be improved on several aspects, particularly assessment endpoint design for risk to ecosystems (e.g.: integration of pollutants bioaccumulation), bioassays protocols and column leaching test design.Une méthodologie d’évaluation des risques écotoxicologiques engendrés par un dépôt de sédiments de dragage sur un sol situé à proximité d’un canal et à la surface d’une nappe phréatique exploitée a été élaborée et testée avec des échantillons de sédiments d’un canal du Nord-Est de la France. La procédure générale comporte une étape d’évaluation simplifiée des risques, basée essentiellement sur la mesure des concentrations en polluants dans les sédiments, et une étape d’évaluation détaillée des risques où des essais d’écotoxicité et de percolation en colonnes sont mis en œuvre. Le scénario testé retient trois hypothèses, qui concernent (a) les effets sur les végétaux de la prairie périphérique du dépôt, représentés par Lolium perenne L., (b) les effets sur les organismes aquatiques du canal, représentés par Escherichia coli, Chlorella vulgaris, Ceriodaphnia dubia, et Xenopus laevis, et (c) la pollution de la nappe alluviale associée. Différentes modalités d’exposition (essais normalisés ou standardisés) ont été testées. Dans le cas particulier des trois sédiments étudiés, ces hypothèses se sont avérées plus ou moins discriminantes, la pollution de la prairie et de la nappe étant les plus sensibles. Des améliorations de la méthodologie sont envisagées concernant à la fois la sélection des variables biologiques (intégration des effets liés à la bioaccumulation des polluants, par exemple), et les protocoles des bioessais et de percolation en colonne

Evaluation écotoxicologique de sédiments contaminés ou de matériaux de dragage. Synthèse du rapport d'étude (avril 2001)

Ecotoxicological assessment of contaminated sediment or of dredge sediment. SynthesisLa contamination des sédiments de rivières ou de lacs, notamment dans le cadre d'opérations de dragage ou de curage, constitue une préoccupation majeure, en particulier pour les organismes chragés soit de réglementer ces opérations, soit de les réaliser. La mise en place en 1999 d'un Comité Technique National sur la Gestion des Sédiments, et de deux groupes de tarvail chargés d'élaborer ces matériaux, témoigne de l'effort entamé pour améliorer la gestion des produits de dragage. Parmi ces moyens figure le développement d'une méthode opérationnelle d'évaluation des risques, qui permette de prendre des décisions de gestion rationnelles et transparentes. La présente étude s'inscrit pdansle cadre de la réflexion globale évoquée ci-dessus et vise en particulier à tester l'adéquation de certains outils écotoxicologiques dans l'approche méthodologique générale. Une partie de cette étude est consacrée à des opérations de terrain pour validation des méthodologies mises au point. Le site pilote retenu (Canal des Vosges) a été sélectionné en lien avec le Service de la Navigation du Nord-Est. Les modalités de gestion des matériaux étudiées sont d'une part le dépôt sous eau en ballastière (gravière), d'autre part le dépôt sur sol