Analyse de la diversité génétique des plasmides d'Escherichia coli antibiorésistants causant la colibacillose aviaire

Les souches d’Escherichia coli aviaires antibiorésistantes sont porteuses de plasmides à une fréquence très élevée. Dans une étude antérieure, l’hétérogénéité de ces plasmides a été montrée. Une sonde d’ADN plasmidique (2 kb) extraite de l’une de ces souches a été utilisée dans la technique du Southern blot pour analyser les relations existantes entre les plasmides. À partir de poulets atteints de colibacillose et provenant de différentes fermes d’élevage, les plasmides de 22 souches d’E. coli ont été isolées. La sonde s’est hybridée avec tous les profils plasmidiques de ces souches, ce qui est en faveur de la présence d’une grande homologie de séquence entre ces plasmides ainsi que leur appartenance au même groupe d’hybridation. Le profil d’hybridation confirme l’hétérogénéité des plasmides contenus dans ces souches

Phylogenetic diversity of Moroccan cork oak woodlands fungi

Interspecific variation among 87 sporocarps of fungi belonging to 15 genera and 39 species were evaluated by analyzing the internal transcribed spacer (ITS) of the rDNA region using restriction fragment length polymorphism (RFLP). The ITS region was first amplified by polymerase chain reaction (PCR) with specific primers and then cleaved with different restriction enzymes. Amplification products, which ranged between 500 and 950 base pairs (bp), were obtained for all the isolates analyzed. The degree of polymorphism observed did not allow proper identification of most of the species. Cleavage of amplified fragments with the restriction enzymes Alu I, EcoR I and Hinf I revealed extensive polymorphism. The fifteen genera and most species presented specific restriction patterns. The only species not identifiable by a specific pattern belonged to the genera Russula (R. decipiens and R. straminea). These species might be considered as closely related species. The Pisolithus sporocarps had two ITS-RFLP types with one dominating. ITS sequencing confirms that the two RFLP types correspond to two distinct species of Pisolithus. Our data show the potential of ITS region PCR-RFLP for the molecular characterization of ectomycorrhizal fungi and their identification and monitoring in artificial inoculation programs