Beacon v2 and Beacon networks: A "lingua franca" for federated data discovery in biomedical genomics, and beyond

Beacon is a basic data discovery protocol issued by the Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH). The main goal addressed by version 1 of the Beacon protocol was to test the feasibility of broadly sharing human genomic data, through providing simple "yes" or "no" responses to queries about the presence of a given variant in datasets hosted by Beacon providers. The popularity of this concept has fostered the design of a version 2, that better serves real-world requirements and addresses the needs of clinical genomics research and healthcare, as assessed by several contributing projects and organizations. Particularly, rare disease genetics and cancer research will benefit from new case level and genomic variant level requests and the enabling of richer phenotype and clinical queries as well as support for fuzzy searches. Beacon is designed as a "lingua franca" to bridge data collections hosted in software solutions with different and rich interfaces. Beacon version 2 works alongside popular standards like Phenopackets, OMOP, or FHIR, allowing implementing consortia to return matches in beacon responses and provide a handover to their preferred data exchange format. The protocol is being explored by other research domains and is being tested in several international projects

N2P : Netlogo to Pandora, noves funcionalitats i mòdul de visualització en entorns ABM

Cada vez los modelos de simulaciones de procesos basados en agentes crecen en complejidad y escala. Los recursos computacionales nunca han estado más al alcance de los investigadores. Sin embargo, las herramientas que facilitan el aprovechamiento de estos recursos para modelos complejos no son el estándar. Debido a la árdua curva de aprendizaje, es preferible limitarse a herramientas ya conocidas para mantener la productividad. En este proyecto se desarrolla una herramienta capaz de traducir modelos de NetLogo, un lenguaje altamente popular entre modeladores, a Pandora, un framework capaz de aprovechar todos los recursos de un centro de computación de alto rendimiento

Modelos de yacimientos minerales: tipologías y aplicaciones

En los últimos treinta años se han publicado numerosos trabajos relacionados con los modelos de yacimientos minerales, la mayoría de los cuales han sido elaborados por especialistas norteamericanos y canadienses. La elaboración de un tipo de modelo (geológico, estadístico, económico, ley-tonelaje) para un yacimiento mineral dado es de gran importancia par los geólogos preospectores, ya que sirve de guía para descubrir, estudiar y evaluar el mismo. El presente artículo de revisión recoge y generaliza los aspectos esenciales que hay que tener en consideración para definir los modelos de yacimientos minerales. Se brindan los aspectos esenciales de la conceptualización de los modelos, partiendo de un análisis profundo de las diferentes clasificaciones de los yacimientos minerales. Por último, en el trabajo se expone una clasificación tipológica de los modelos válida para ser utilizada en los trabajos de prospección y exploración de yacimientos, tanto en Cuba como en el resto del mundo

Modelo geológico descriptivo para los yacimientos lateríticos de Fe-Ni-Co en la faja ofiolítica Mayarí-Baracoa de Cuba Oriental

Los modelos descriptivos de yacimientos minerales constituyen sistematizaciones de información geológica de gran valor para la exploración y la evaluación de territorios que presenten aquellos atributos definidos en el modelo y que los hagan perspectivos para el descubrimiento de nuevos recursos minerales. En este trabajo se presenta una visión generalizada de los procesos de intemperismo y se hace una propuesta de modelos para los yacimientos de lateritas de Fe-Ni-Co en Cuba, a partir de los que se localizan en la faja ofiolítica Mayarí-Baracoa en Cuba Oriental