Intracellular pH Homeostasis Plays a Role in the Tolerance of Debaryomyces hansenii and Candida zeylanoides to Acidified Nitrite▿

The effects of acidified-nitrite stress on the growth initiation and intracellular pH (pHi) of individual cells of Debaryomyces hansenii and Candida zeylanoides were investigated. Our results show that 200 μg/ml of nitrite caused pronounced growth inhibition and intracellular acidification of D. hansenii at an external pH (pHex) value of 4.5 but did not at pHex 5.5. These results indicate that nitrous acid as such plays an important role in the antifungal effect of acidified nitrite. Furthermore, both yeast species experienced severe growth inhibition and a pHi decrease at pHex 4.5, suggesting that at least some of the antifungal effects of acidified nitrite may be due to intracellular acidification. For C. zeylanoides, this phenomenon could be explained in part by the uncoupling effect of energy generation from growth. Debaryomyces hansenii was more tolerant to acidified nitrite at pHex 5.5 than C. zeylanoides, as determined by the rate of growth initiation. In combination with the fact that D. hansenii was able to maintain pHi homeostasis at pHex 5.5 but C. zeylanoides was not, our results suggest that the ability to maintain pHi homeostasis plays a role in the acidified-nitrite tolerance of D. hansenii and C. zeylanoides. Possible mechanisms underlying the different abilities of the two yeast species to maintain their pHi homeostasis during acidified-nitrite stress, comprising the intracellular buffer capacity and the plasma membrane ATPase activity, were investigated, but none of these mechanisms could explain the difference

Visuaalisia kyselyjä opiskelijarekisteriin

Tietokannat ovat tietotekniikan arkipäivää. Vuosien saatossa on rakennettu suuri joukko ohjelmia käsittelemään tietokantoihin tallennettua tietoa. Tyypillinen ohjelma rakennetaan tiettyä kyselyjoukkoa ja tietokantaa varten, mutta yleisempi kyselyjärjestelmä sallii kyselyjen tekemisen mihin tahansa tietokantaan. Erityisesti visuaalinen kyselyjärjestelmä mahdollistaa tietokantamallin, kyselyjen ja tulosten visuaalisen esittämisen. Visuaalinen kyselyjärjestelmä on myös usein helppokäyttöinen. Tässä työssä tarkastellaan kyselyjä Teknillisen korkeakoulun opiskelijarekisteriin (OREK) visuaalisen kyselyjärjestelmän kannalta. Merkittävimmät ongelmat nykyisessä käytössä ovat tietokannan mallin monimutkaisuus ja kyselyjen muodostamiseen kuluva aika. Helposti käytettävä kyselyjärjestelmä mahdollistaisi sen, että useat uudet käyttäjät voisivat tehdä kyselyjä. Ratkaisua etsitään katsauksella aiemmin toteutettuihin järjestelmiin. Ratkaisuna esitetään uusi diagrammipohjainen visuaalinen kyselyjärjestelmä SEEQ (System for Enhanced Exploration and Querying) sekä yleisesti tietokantojen että erityisesti opiskelijarekisterien käsittelyyn. Sen tärkeimmät ominaisuudet, käyttöliittymä ja implementaatio kuvataan. SEEQiä verrataan olemassa oleviin kyselyjärjestelmiin ja sillä on monia yhteisiä, hyödyllisiä ominaisuuksia. Sen käyttökelpoisuutta arvioidaan esimerkkikyselyjen avulla, jotka on muodostettu nykyisten järjestelmien käytön ja arveltujen tutkimustarpeiden perusteella. SEEQ havaitaan erityisen hyväksi visuaalisuudessa sillä, toisin kuin monet muut järjestelmät, se sisältää myös tulosten visualisoinnin tietokantamallin ja kyselyn visualisoinnin lisäksi. Lopuksi eritellään parannusehdotuksia ja jatkotutkimusmahdollisuuksia