Trypanosoma cruzi subverts the sphingomyelinase-mediated plasma membrane repair pathway for cell invasion

Trypanosoma cruzi takes advantage of a sphingomyelinase-dependent plasma membrane repair pathway to gain access to host cells

The last 100 million years on the Scotian Margin, offshore eastern Canada: an event-stratigraphic scheme emphasizing biostratigraphic data

In order to provide a detailed stratigraphic framework for the Late Cretaceous and Cenozoic basin fill of the Scotian Margin (the continental shelf and continental slope off Nova Scotia, eastern Canada), we have developed an event-biostratigraphic scheme based mainly on new analyses of several exploration wells. These include the following shelf wells — Demascota G-32, Hesper I-52, Onondaga E-84 and Wenonah J-75 — as well as Shelburne G-29 and Shubenacadie H-100 on the slope. Several fossil groups are involved in this study, most notably dinoflagellate cysts (dinocysts) and nannofossils, with the former generally providing more diverse assemblages and the latter more precise calibration with global correlations. Because most of the material studied is from cuttings samples, we have relied largely on Last Appearance datums (LADs). The scheme incorporates information from about 250 microfossil species (or groups of species), delimiting about 180 events. Not all events occur in all wells and the scheme needs to be tested against future observations: nevertheless, it represents a considerable advance on previous schemes, which were based mostly on broad zones rather than detailed events. Moreover, it allows for a more refined assessment of ages of geological events, such as the early Eocene gamma spike and the incision of the Wenonah Canyon. And it provides an accurate age context for ongoing stratigraphic, sedimentological and paleoenvironmental studies, and ultimately for a fuller understanding of petroleum systems on the Scotian Margin. RÉSUMÉ Pour fournir un cadre stratigraphique détaillé du remplissage du Crétacé tardif et du Cénozoïque du bassin de la marge Néo-Écossaise (plateau continental et pente continentale au large de la Nouvelle-Écosse, est du Canada), nous avons mis au point une formule événementielle-biostratigraphique principalement basée sur de nouvelles analyses de plusieurs puits d’exploration. Ces derniers comprennent les puits Demascota G-32, Hesper I-52, Onondaga E-84 et Wenonah J-75 sur le plateau continental ainsi que Shelburne G-29 et Shubenacadie H-100 sur la pente continentale. L’étude touche plusieurs groupes de microfossiles, plus particulièrement les kystes de dinoflagellés (dinokystes) et les nannofossiles, les premiers procurant généralement des assemblages plus diversifiés et les derniers, un étalonnage plus précis avec des corrélations mondiales. Comme la majeure partie du matériel étudié provient d’échantillons de déblais, nous nous sommes largement appuyés sur les plans de référence des dernières manifestations. La formule incorpore des données provenant d’environ 250 espèces (ou groupes d’espèces) de microfossiles délimitant quelque 180 phénomènes, dont environ 50 % sont basés sur des nanofossiles, quelque 46 % sur des palynomorphes et 4 % sur des foraminifères. Les phénomènes en question ne se manifestent pas tous dans tous les puits et il faut encore soumettre la formule à des essais en vertu des observations futures: elle représente néanmoins un progrès considérable par rapport aux formules antérieures, qui étaient surtout basées sur des zones étendues plutôt que sur des phénomènes détaillés. Elle permet de plus une évaluation plus raffinée des âges des phénomènes géologiques, comme les pics gamma du Paléocène tardif et l’incision du canyon Wenonah. Elle procure par ailleurs un contexte de datation exact pour les études stratigraphiques, sédimentologiques et paléoenvironnementales courantes, et elle permettra en fin de compte une compréhension plus complète des systèmes pétroliers le long de la marge Néo-Écossaise. [Traduit par la redaction

Réévaluation de la biostratigraphie mésozoïque-cénozoïque du sous-bassin Laurentien du bassin Scotian, au large des côtes de l’est du Canada

We use new and existing nannofossil, palynological, and microfossil biostratigraphic data in conjunction with lithologic and geophysical logs from four wells to establish a series of sequence-stratigraphic events in the Mesozoic–Cenozoic of the Laurentian Subbasin of offshore Newfoundland, eastern Canada. Well biostratigraphic events are integrated with reflection seismic in the area to correlate regional seismic stratigraphic surfaces. The four wells are: Bandol-1, Emerillon C-56, East Wolverine G-37, and Heron H-73. We extend the event stratigraphic scheme previously developed for the Scotian Margin, offshore Nova Scotia, into new areas to the east along the southern Grand Banks, where we recognize four new well-log sequence stratigraphic events, and we modify the definition of a previously recognized regional surface. The new and modified regional surfaces are the Early Albian Unconformity, the Late Bathonian Maximum Flooding Surface (MFS), the Late Bajocian MFS (renamed from Bathonian/Bajocian MFS), the ?Bajocian/Toarcian Unconformity, and the Late Pliensbachian MFS. We recognize the "Avalon Unconformity" and "Base-Tertiary Unconformity" of previous studies as amalgamations of multiple smaller-scale unconformities and refine their age in the studied wells. A major improvement over our earlier Scotian Margin event schemes is the extension of the event stratigraphy into the Early Jurassic using a suite of marine biostratigraphic markers. We compare the Early Jurassic event scheme to Deep Sea Drilling Project Site 547B on the conjugate Moroccan Margin to better constrain potential source rock intervals and the early history of the central Atlantic Ocean.Nous utilisons des données biostratigraphiques sur les microfossiles, des données palynologiques et des données sur les nanofossiles, nouvelles et existantes, conjointement avec des diagraphies lithologiques et géophysiques de quatre puits pour définir une série de phénomènes stratigraphiques séquentiels de la tranche du Mésozoïque-Cénozoïque du sous-bassin Laurentien au large des côtes de Terre-Neuve, dans l’est du Canada. Les phénomènes biostratigraphiques des puits sont intégrés à la sismique réflexion dans le secteur aux fins d’une corrélation des surfaces stratigraphiques sismiques régionales. Les quatre puits en question sont les puits Bandol-1, Emerillon C-56, East Wolverine G-37 et Heron H-73. Nous élargissons le plan stratigraphique des phénomènes précédemment créé pour la marge de Scotian, au large des côtes de la Nouvelle-Écosse, aux nouveaux secteurs à l’est le long de la zone méridionale des Grands bancs, où nous reconnaissons quatre nouveaux phénomènes stratigraphiques séquentiels dans les diagraphies des puits et nous modifions la définition d’une surface régionale antérieurement reconnue. Les nouvelles surfaces régionales modifiées sont la discordance de l’Albien précoce, la surface d’inondation maximale (SIM) du Bathonien tardif, la SIM du Bajocien tardif (SIM du Bathonien/Bajocien rebaptisée), la discordance bajocienne?/toarcienne et la SIM du Pliensbachien tardif. Nous reconnaissons la « discordance d’Avalon » et la « discordance de base-tertiaire » d’études antérieures en tant que regroupements de plusieurs discordances d’échelle plus modeste et nous déterminons leur âge de façon plus précise dans les puits étudiés. Une amélioration notable par rapport à nos plans antérieurs des phénomènes survenus dans la marge de Scotian est l’élargissement de la stratigraphie des phénomènes au cours du Jurassique précoce au moyen de repères stratigraphiques marins. Nous comparons le plan des phénomènes du Jurassique précoce au site 547B du projet de forage en eau profonde sur la marge marocaine conjuguée pour mieux limiter les intervalles éventuels de roche mère et les débuts de l’océan Atlantique central

Re-evaluation of the Mesozoic–Cenozoic biostratigraphy of the Laurentian Subbasin of the Scotian Basin, offshore eastern Canada

We use new and existing nannofossil, palynological, and microfossil biostratigraphic data in conjunction with lithologic and geophysical logs from four wells to establish a series of sequence-stratigraphic events in the Mesozoic–Cenozoic of the Laurentian Subbasin of offshore Newfoundland, eastern Canada. Well biostratigraphic events are integrated with reflection seismic in the area to correlate regional seismic stratigraphic surfaces. The four wells are: Bandol-1, Emerillon C-56, East Wolverine G-37, and Heron H-73. We extend the event stratigraphic scheme previously developed for the Scotian Margin, offshore Nova Scotia, into new areas to the east along the southern Grand Banks, where we recognize four new well-log sequence stratigraphic events, and we modify the definition of a previously recognized regional surface. The new and modified regional surfaces are the Early Albian Unconformity, the Late Bathonian Maximum Flooding Surface (MFS), the Late Bajocian MFS (renamed from Bathonian/Bajocian MFS), the ?Bajocian/Toarcian Unconformity, and the Late Pliensbachian MFS. We recognize the "Avalon Unconformity" and "Base-Tertiary Unconformity" of previous studies as amalgamations of multiple smaller-scale unconformities and refine their age in the studied wells. A major improvement over our earlier Scotian Margin event schemes is the extension of the event stratigraphy into the Early Jurassic using a suite of marine biostratigraphic markers. We compare the Early Jurassic event scheme to Deep Sea Drilling Project Site 547B on the conjugate Moroccan Margin to better constrain potential source rock intervals and the early history of the central Atlantic Ocean.Nous utilisons des données biostratigraphiques sur les microfossiles, des données palynologiques et des données sur les nanofossiles, nouvelles et existantes, conjointement avec des diagraphies lithologiques et géophysiques de quatre puits pour définir une série de phénomènes stratigraphiques séquentiels de la tranche du Mésozoïque-Cénozoïque du sous-bassin Laurentien au large des côtes de Terre-Neuve, dans l’est du Canada. Les phénomènes biostratigraphiques des puits sont intégrés à la sismique réflexion dans le secteur aux fins d’une corrélation des surfaces stratigraphiques sismiques régionales. Les quatre puits en question sont les puits Bandol-1, Emerillon C-56, East Wolverine G-37 et Heron H-73. Nous élargissons le plan stratigraphique des phénomènes précédemment créé pour la marge de Scotian, au large des côtes de la Nouvelle-Écosse, aux nouveaux secteurs à l’est le long de la zone méridionale des Grands bancs, où nous reconnaissons quatre nouveaux phénomènes stratigraphiques séquentiels dans les diagraphies des puits et nous modifions la définition d’une surface régionale antérieurement reconnue. Les nouvelles surfaces régionales modifiées sont la discordance de l’Albien précoce, la surface d’inondation maximale (SIM) du Bathonien tardif, la SIM du Bajocien tardif (SIM du Bathonien/Bajocien rebaptisée), la discordance bajocienne?/toarcienne et la SIM du Pliensbachien tardif. Nous reconnaissons la « discordance d’Avalon » et la « discordance de base-tertiaire » d’études antérieures en tant que regroupements de plusieurs discordances d’échelle plus modeste et nous déterminons leur âge de façon plus précise dans les puits étudiés. Une amélioration notable par rapport à nos plans antérieurs des phénomènes survenus dans la marge de Scotian est l’élargissement de la stratigraphie des phénomènes au cours du Jurassique précoce au moyen de repères stratigraphiques marins. Nous comparons le plan des phénomènes du Jurassique précoce au site 547B du projet de forage en eau profonde sur la marge marocaine conjuguée pour mieux limiter les intervalles éventuels de roche mère et les débuts de l’océan Atlantique central

ATP-Mediated Kinome Selectivity: The Missing Link in Understanding the Contribution of Individual JAK Kinase Isoforms to Cellular Signaling

Kinases constitute an important class of therapeutic targets being explored both by academia and the pharmaceutical industry. The major focus of this effort was directed toward the identification of ATP competitive inhibitors. Although it has long been recognized that the intracellular concentration of ATP is very different from the concentrations utilized in biochemical enzyme assays, little thought has been devoted to incorporating this discrepancy into our understanding of translation from enzyme inhibition to cellular function. Significant work has been dedicated to the discovery of JAK kinase inhibitors; however, a disconnect between enzyme and cellular function is prominently displayed in the literature for this class of inhibitors. Herein, we demonstrate utilizing the four JAK family members that the difference in the ATP <i>K</i>_m of each individual kinase has a significant impact on the enzyme to cell inhibition translation. We evaluated a large number of JAK inhibitors in enzymatic assays utilizing either 1 mM ATP or <i>K</i>_m ATP for the four isoforms as well as in primary cell assays. This data set provided the opportunity to examine individual kinase contributions to the heterodimeric kinase complexes mediating cellular signaling. In contrast to a recent study, we demonstrate that for IL-15 cytokine signaling it is sufficient to inhibit either JAK1 or JAK3 to fully inhibit downstream STAT5 phosphorylation. This additional data thus provides a critical piece of information explaining why JAK1 has incorrectly been thought to have a dominant role over JAK3. Beyond enabling a deeper understanding of JAK signaling, conducting similar analyses for other kinases by taking into account potency at high ATP rather than <i>K</i>_m ATP may provide crucial insights into a compound’s activity and selectivity in cellular contexts