Distribución histórica de haya (Fagus sylvatica L.) en el sur-oeste de Francia: evidencia a partir de análisis de carbón macrofósil del suelo

Estudia un método basado en el análisis de partículas de carbón presentes en el estrato mineral del suelo para reconstruir la historia paleoecológica del conjunto de poblaciones aisladas de haya presentes en el suroeste de Francia (Landes de Gascogne). Evalúa si el haya permaneció el último máximo glaciar en refugios crípticos en el suroeste de Francia, y explora si el origen de estas poblaciones es relicto o antrópico. No hay evidencia directa de la persistencia de haya durante el último máximo glaciar debido a la ausencia de datos C14 en ese periodo. La resolución espacial local del método usado permitió inferir que el microclima húmedo de las localidades evaluadas pudo haber amortiguado el clima glacial regional.Francia. BAPE Bolivia, Argentina y Perú: Erasmus Mundus External Cooperation Window Emecw Lot 18Trabajo de investigació

Untargeted metabolomics to evaluate antifungal mechanism: a study of Cophinforma mamane and Candida albicans interaction

Microbial interactions between filamentous fungi and yeast are still not fully understood. To evaluate a potential antifungal activity of a filamentous fungus while highlighting metabolomic changes, co-cultures between an endophytic strain of Cophinforma mamane (CM) and Candida albicans (CA) were performed. The liquid cultures were incubated under static conditions and metabolite alterations during the course were investigated by ultra-performance liquid chromatography–tandem mass spectrophotometry (UPLC–MS/MS). Results were analyzed using MS-DIAL, MS-FINDER, METLIN, Xcalibur, SciFinder, and MetaboAnalyst metabolomics platforms. The metabolites associated with catabolic processes, including the metabolism of branched-chain amino acids, carnitine, and phospholipids were upregulated both in the mono and co-cultures, indicating fungal adaptability to environmental stress. Several metabolites, including C20 sphinganine 1-phosphate, myo-inositol, farnesol, gamma-undecalactone, folinic acid, palmitoleic acid, and MG (12:/0:0/0:0) were not produced by CA during co-culture with CM, demonstrating the antifungal mechanism of CM. Our results highlight the crucial roles of metabolomics studies to provide essential information regarding the antifungal mechanism of C. mamane against C. albicans, especially when the lost/undetected metabolites are involved in fungal survival and pathogenicity

Guía para la elaboración de planes maestros de las Zonas de Agrobiodiversidad

El presente documento tiene por finalidad proporcionar de manera didáctica, información relevante que contribuya a la elaboración de los planes maestros de las ZABD reconocidas. Se incluyen aspectos sobre las comunidades e instituciones involucradas, pautas para la elaboración de una línea de base como punto de partida para la gestión del territorio reconocido, así como propuestas para la elaboración del plan maestro como tal, siempre bajo un enfoque participativo, teniendo como eje y protagonistas de esta gestión a las comunidades campesinas nativas que ven con buenas expectativas la posibilidad de que sus territorios sean reconocidos como una ZABD

Resolución Directoral N° 002-2022-INIA-DRGB

En ese sentido, el INIA-MIDAGRI, en concordancia con la Guía para el Reconocimiento de Zonas de Agrobiodiversidad en el Perú, documento mediante el cual se inició el proceso de promoción y difusión de información técnica sobre el mencionado reconocimiento, ha visto por conveniente y relevante elaborar guías complementarias que permitan comunicar a mayor detalle sobre los diferentes procesos que se enmarcan antes, durante y después del reconocimiento de una ZABD. De esta manera, el presente documento, GUÍA PARA ELABORAR EXPEDIENTES TÉCNICOS QUE POSTULEN AL RECONOCIMIENTO COMO ZONA DE AGROBIODIVERSIDAD, tiene por finalidad proporcionar de manera didáctica y precisa, información relevante que pueda ser utilizada por las comunidades campesinas y nativas y/o sus representantes, para la elaboración de los expedientes técnicos mediante el cual soliciten el reconocimiento de sus territorios como ZABD. Se incluye información que permite dilucidar sobre quiénes pueden elaborar estos expedientes, cómo deben ser elaborados los mismos, y sobre los sustentos técnicos que deben acompañar estos documentos

Guía para la evaluación de expedientes técnicos que postulan al reconocimiento como Zona de Agrobiodiversidad

El presente documento tiene por finalidad proporcionar de manera didáctica, información relevante que contribuya a desarrollar una evaluación objetiva y ágil de los expedientes técnicos que presentan las comunidades campesinas y nativas para solicitar el reconocimiento de sus territorios como ZABD. Se incluyen y describen los criterios a tomar en cuenta para desarrollar la evaluación del expediente. Asimismo, se describe el proceso de inspección ocular y su importancia, considerando que la información recabada en esta etapa complementa y sustenta lo presentado en el expediente técnico

Biodereplication of antiplasmodial extracts: application of the amazonian medicinal plant piper coruscans kunth

Improved methodological tools to hasten antimalarial drug discovery remain of interest, especially when considering natural products as a source of drug candidates. We propose a biodereplication method combining the classical dereplication approach with the early detection of potential antiplasmodial compounds in crude extracts. Heme binding is used as a surrogate of the antiplasmodial activity and is monitored by mass spectrometry in a biomimetic assay. Molecular networking and automated annotation of targeted mass through data mining were followed by mass-guided compound isolation by taking advantage of the versatility and finely tunable selectivity offered by centrifugal partition chromatography. This biodereplication workflow was applied to an ethanolic extract of the Amazonian medicinal plant Piper coruscans Kunth (Piperaceae) showing an IC50 of 1.36 ug/mL on the 3D7 Plasmodium falciparum strain. It resulted in the isolation of twelve compounds designated as potential antiplasmodial compounds by the biodereplication workflow. Two chalcones, aurentiacin (1) and cardamonin (3), with IC50 values of 2.25 and 5.5 uM, respectively, can be considered to bear the antiplasmodial activity of the extract, with the latter not relying on a heme-binding mechanism. This biodereplication method constitutes a rapid, efficient, and robust technique to identify potential antimalarial compounds in complex extracts such as plant extracts

Phylogenomic Analysis of the Plastid Genome of the Peruvian Purple Maize Zea mays subsp. mays cv. ‘INIA 601’

Peru is an important center of diversity for maize; its different cultivars have been adapted to distinct altitudes and water availability and possess an array of kernel colors (red, blue, and purple), which are highly appreciated by local populations. Specifically, Peruvian purple maize is a collection of native landraces selected and maintained by indigenous cultures due to its intense purple color in the seed, bract, and cob. This color is produced by anthocyanin pigments, which have gained interest due to their potential use in the food, agriculture, and pharmaceutical industry. It is generally accepted that the Peruvian purple maize originated from a single ancestral landrace ‘Kculli’, but it is not well understood. To study the origin of the Peruvian purple maize, we assembled the plastid genomes of the new cultivar ‘INIA 601’ with a high concentration of anthocyanins, comparing them with 27 cultivars/landraces of South America, 9 Z. mays subsp. parviglumis, and 5 partial genomes of Z. mays subsp. mexicana. Using these genomes, plus four other maize genomes and two outgroups from the NCBI database, we reconstructed the phylogenetic relationship of Z. mays. Our results suggest a polyphyletic origin of purple maize in South America and agree with a complex scenario of domestication with recurrent gene flow from wild relatives. Additionally, we identify 18 plastid positions that can be used as high-confidence genetic markers for further studies. Altogether, these plastid genomes constitute a valuable resource to study the evolution and domestication of Z. mays in South America

Catálogo de Rocoto del Banco de Germoplasma del INIA

El presente documento se ha elaborado en base a los resultados obtenidos durante la caracterización agromorfológica y fitoquímica (contenido de capsaicinoides), realizados a 200 accesiones de rocoto que conforman la colección nacional. En tal sentido, el “Catálogo de Rocoto del Banco de Germoplasma del INIA” proporciona información valiosa de este cultivo, que permitirá la identificación de accesiones promisorias, homologar las colecciones existentes a nivel nacional y documentar a todas las que se conservan en el Perú; además, promover su uso potencial en beneficio de los sectores agroalimentario y agroindustrial

Ecological and biochemical study of Himatanthus tarapotensis (Apocynaceae) : production patterns and role of plumericin in plant –insect interaction, at the Amazon

Himatanthus tarapotensis (Apocynaceae) connu au Pérou comme "bellaco caspi", est un arbre répandu dans plusieurs types d’habitat de l’Amazonie péruvienne où il est très utilisé en médicine traditionnelle pour le traitement de certaines maladies. Les propriétés médicinales des espèces de Himatanthus sont liées notamment à la présence du terpène bioactif pluméricine. Le potentiel pharmacologique de la pluméricine et le succès reproductif de H. tarapotensis ont mené à la réalisation de cette étude afin d’explorer les patrons de production de ce composé le long des variations des gradients environnementaux déterminés par les différents types d’habitat où la plante pousse naturellement. Cependant, il existe une confusion autour de la délimitation des espèces du genre Himatanthus qui pousseraient au Pérou et les noms scientifiques qui doivent être utilisés. En conséquent une partie de cette étude a consisté en l’évaluation taxonomique du genre Himatanthus. Dans la première partie de la thèse est présentée une révision synoptique des espèces de Himatanthus de l'Amazonie péruvienne, avec la finalité d'introduire une stabilité taxonomique de ces espèces au Pérou. Trois espèces de Himatanthus se trouvent au Pérou : H. tarapotensis, H. phagedaenicus et H. revolutus, distinguées entre eux notamment par des traits reproductifs. Dans la seconde partie, les feuilles d’individus juvéniles de H. tarapotensis qui se développent sur deux types d’habitat ont été prélevées pour évaluer la production de pluméricine en fonction des facteurs environnementaux : type de sol, période de précipitations, et pression des insectes en tenant compte de la croissance de la plante. La production de pluméricine chez H. tarapotensis ne montre pas différences significatives en fonction des types de sol. Mais, il a été observé une variation temporelle de la concentration du composé corrélée positivement avec la pression des insectes, notamment avec la larve herbivore Isognathus leachii (Lepidoptera : Sphingidae) et négativement avec la croissance. En même temps, ces deux facteurs ont été corrélés avec la précipitation, ce qui suggère que l’intensité de pluie influencerait la production de pluméricine de manière indirecte. Le composé bioactif pluméricine pourrait avoir un patron de production déterminé par son rôle médiateur des interactions de H. tarapotensis avec son environnement.Himatanthus tarapotensis (Apocynaceae) known in Peru as "bellaco caspi", is a common tree from several habitats in the Peruvian Amazon, where is widely used in traditional medicine for the treatment of various diseases. Medicinal properties from species of Himatanthus have been mainly related to the presence of a bioactive terpene plumericin. The pharmacological potential of plumericin and reproductive success of H. tarapotensis gave rise to the present study to explore the production patterns of this compound in function of environmental gradients determined by the different habitat types where this species grows in nature. However, the delimitation of Himatanthus species has long been problematic, and much confusion remains as to which names should be used and which species delimitations should be adopted. Consequently, a part of this study was dedicated to a taxonomic revision of Himatanthus species occurring in Peru. Therefore, in chapter 1 is presented a synoptic revision of Himatanthus species from the Peruvian Amazon, with the aim of introducing taxonomic stability of those species in Peru. Three species of Himatanthus are present in Peru: H. tarapotensis, H. phagedaenicus and H. revolutus, distinguished among themselves mainly by reproductive traits. In chapter 2, leaves collected from juvenile individuals of H. tarapotensis growing on two Amazonian habitats were used to evaluate the plumericin production in relation to environmental factors: soil type, period of precipitation, and insects pressure, keeping in mind their relation with the growth patterns of the plant. Plumericin production in H. tarapotensis was not affected by differences in soil types. However, it was observed a temporal variation in the concentration of this compound correlated positively to the insects pressure, mainly with the herbivorous larva of Isognathus leachii (Lepidoptera: Sphingidae) and negatively to the growth pattern of the plant. These two factors were correlated to the rainfall, thus suggesting that precipitation would be affecting indirectly on plumericin production. The bioactive compound plumericin would have a production pattern determined by its mediator role in interactions phenomena of H. tarapotensis and its environment