Genetic characterization of Zeyheria tuberculosa progenies and evaluation for formation of a seed orchard

Zeyheria tuberculosa, a native species of Brazil known for its significant potential in silviculture and genetic improvement, holds prominence among various species. In this study, our objective was to assess the diversity, genetic structure, and feasibility of establishing a seedling seed orchard (SSO) for this species. A total of 71 progenies were collected from different locations and were used in our experiment in Ijaci - MG. We genotyped 92 individuals (nine families with eight individuals, two families with seven individuals, and one family with six individuals), specifically selecting those with the highest predicted genetic values, using ten ISSR primers. The molecular markers employed effectively detected polymorphism (PIC = 0.44). The population exhibited moderate to high genetic diversity, as evidenced by observed (AO = 2.00) and effective alleles (AE = 1.61), Nei's diversity index (H* = 0.35), and Shannon's diversity index (I* = 0.52). Molecular variance analysis indicated significant genetic differentiation between the progenies (Φst = 0.19), yet the majority of the variation was observed within them (80.1%). Employing a Bayesian approach, we identified the formation of two distinct genetic groups, further confirming the non-genetic structure of the population. These findings affirm the potential of the Z. tuberculosa progenies to contribute to the establishment of a seedling seed orchard, supporting genetic improvement strategies and the conservation of the species' genetic diversity

SELEÇÃO DE ÁRVORES MATRIZES DE Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex. Ducke) Barneby NO ESPÍRITO SANTO

O objetivo desse trabalho foi selecionar indivíduos da espécie Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex. Ducke) Barneby, localizados em uma área de floresta plantada no Espírito Santo, para serem utilizados como matrizes constituindo um futuro pomar de sementes, que possam subsidiar plantios comerciais na obtenção de madeira. Para isto, foi realizado o inventário da área, onde foram coletados valores de diâmetro à altura do peito (DAP) em todos os indivíduos e para a altura total (Ht) foi realizado cálculos de estimativa. O delineamento foi em blocos casualizados, onde foi realizada a análise de variância (ANOVA) e aplicado o Teste de Tukey para determinação dos tratamentos a serem utilizados na seleção. Foram selecionadas 171 árvores baseadas nos valores médios de 15,59 cm de DAP e 12,03 m de Ht dos tratamentos escolhidos, além da avaliação quanto a forma do fuste, condição fitossanitária, vigor, disposição na paisagem e condição de luminosidade. As variáveis DAP e Ht se mostraram favoráveis para realização da seleção das árvores e as outras características avaliadas servirão para criação do pomar de sementes

SELEÇÃO DE PRIMERS ISSR PARA ANÁLISES DE DIVERSIDADE GENÉTICA EM Plathymenia reticulata Benth

O objetivo deste trabalho foi selecionar primers ISSR para serem utilizados em futuras análises de diversidade genética em populações naturais de P. reticulata. Amostras foliares de cinco indivíduos da espécie foram coletadas para extração e purificação de DNA. O DNA obtido das amostras foi submetido a ensaios de PCR utilizando 28 primers, seguida de eletroforese em gel de agarose para análise dos fragmentos amplificados. Foram selecionados 10 primers por possuírem número considerado de locos e boa definição dos fragmentos. Os primers selecionados geraram ao todo 121 fragmentos amplificados, sendo 54 polimórficos. Os marcadores moleculares ISSR utilizados nesse estudo permitiram revelar o polimorfismo em Vinhático, indicando que a utilização de 10 primers (44,62% de polimorfismo) são suficientes para quantificar em estudos futuros a diversidade genética existente em indivíduos de P. reticulata

SELEÇÃO DE MARCADORES ISSR PARA Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex. Ducke) Barneby

O objetivo deste trabalho foi selecionar primers ISSR para serem utilizados em futuras análises de diversidade genética em população de S. amazonicum, conhecido popularmente como Paricá. Para isto, foram utilizadas folhas coletadas em 5 indivíduos da espécie em estudo, para a realização da extração e purificação do DNA genômico. Posteriormente, as amostras de DNA foram submetidas a ensaios de PCR utilizando 43 primers, seguida por eletroforese em gel de agarose, de modo a permitir a avaliação e seleção dos primers com maior qualidade de amplificação. Foram selecionados 11 primers por possuírem número considerável de locos polimórficos, além de serem nítidos e bem definidos. Os primers selecionados geraram 129 fragmentos, demonstrando que a quantidade de marcadores moleculares ISSR utilizados neste estudo são suficientes para quantificar a diversidade genética em futuros trabalhos com populações da espécie

GENETIC CHARACTERIZATION OF Dalbergia nigra (Vell.) Allemão ex Benth IN ATLANTIC FOREST FRAGMENTS: IMPLICATIONS TO THE CONSERVATION AND MANAGEMENT

Dalbergia nigra (Vell.) Allemão ex Benth is an arboreal species, popularly known as jacarandá-da-Bahia. Endemic to the Atlantic Forest, the species has economic and ecological importance, as it has quality wood and potential for use in the recovery of degraded areas. However, it is classified as vulnerable to extinction due to the fragmentation of the Atlantic Forest and its intense exploitation in the past, in which, little is known about the genetic consequences generated in its populations. The objective of this study was to characterize the diversity and genetic structure of the species Dalbergia nigra in the Atlantic Forest biome, within the limits of the state of Espírito Santo. The sampling was carried out in 12 populations distributed in the South, Central, Northwest and North-Coast mesoregions, being sampled 15 individuals per population, totaling 180 individuals. For the analyzes, 12 Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) primers and 7 pairs of Simple Sequence Repeats (SSR) primers were used. Regarding the performance of the molecular markers, the PIC values for the ISSR ranged from 0.26 to 0.36, indicating moderate informativeness, whereas for the SSR the values ranged from 0.33 to 0.61, indicating moderate to high informativeness for the populations evaluated individually, and high for the joint data. The values of H* and I* calculated for the ISSR data and, mainly the HO, HE and F values obtained for the SSR data, also differentiated the populations with higher (PFP, FNP, APSE, RBS, RNV and MNPC) and minor (PEAMA, RPPNC, RBAR, FNRP, RBCV and APPE) genetic diversity, in addition to revealing moderate to high levels for genetic diversity in the joint data. The genetic distance between the pairs of individuals did not conform between the markers, however, a kinship relationship was observed by geographic proximity. Regarding genetic structuring, Amova indicated moderate genetic differentiation (ΦST = 0.1616) for ISSR data and low differentiation (ΦST = 0.1483) for SSR data, however, for both markers, the greatest genetic variation is within populations. The moderate to low genetic differentiation corroborates with the Nm data obtained from the ISSR (Nm = 1.98 to 8.78) and SSR (Nm = 1.09 to 9.21), indicating the occurrence of gene flow between populations. The Bayesian analysis carried out from the ISSR data resulted in only two groups, while the SSR data revealed that there are three genetic groups dividing into populations located in the North-Coastal region, close to or located in the Northwest region, and close or located in the South region. The Mantel test revealed a low correlation between the markers, however, according to the entanglement analysis, there was a moderate association between the matrices of genetic distances (Entanglement = 0.47), with consistency between some individuals. The satisfactory results found for the species confirm the potential of possible matrices for the collection of seeds and production of seedlings, however, the low levels of genetic diversity found for some populations, are possibly associated with the intense exploitation of D. nigra in the past and the fragmentation of the Atlantic Forest.Dalbergia nigra (Vell.) Allemão ex Benth é uma espécie arbórea, conhecida popularmente como jacarandá-da-Bahia. Endêmica da Floresta Atlântica, a espécie possui importância econômica e ecológica, pois, tem madeira de qualidade e potencial para uso em recuperação de áreas degradadas. No entanto, encontra-se classificada como vulnerável à extinção devido a fragmentação da Floresta Atlântica e a sua intensa exploração no passado, no qual, pouco se sabe sobre as consequências genéticas geradas em suas populações. O objetivo deste estudo foi caracterizar a diversidade e estrutura genética da espécie Dalbergia nigra no bioma Floresta Atlântica, dentro dos limites do estado do Espírito Santo. A amostragem foi realizada em 12 populações distribuídas nas mesorregiões Sul, Central, Noroeste e Litoral-Norte, sendo amostrados 15 indivíduos por população, totalizando 180 indivíduos. Para as análises, foram utilizados 12 primers Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) e 7 pares de primers Simple Sequence Repeats (SSR). Com relação ao desempenho dos marcadores moleculares, os valores de PIC para os ISSR variaram de 0,26 a 0,36, indicando moderada informatividade, já para os SSR os valores variaram entre 0,33 a 0,61 indicando moderada a alta informatividade para as populações avaliadas individualmente e, alta para os dados conjuntos. Os valores de H* e I* calculados para os dados ISSR e, principalmente os valores de HO, HE e F obtidos para os dados SSR, diferenciaram igualmente as populações com maior (PFP, FNP, APSE, RBS, RNV e MNPC) e menor (PEAMA, RPPNC, RBAR, FNRP, RBCV e APPE) diversidade genética, além de, revelarem níveis moderados a altos para a diversidade genética nos dados conjuntos. A distância genética entre os pares de indivíduos não teve conformidade entre os marcadores, contudo, foi observado relação de parentesco por proximidade geográfica. Sobre a estruturação genética, a Amova indicou moderada diferenciação genética (ΦST = 0,1616) para os dados ISSR e, baixa diferenciação (ΦST = 0,1483) para os dados SSR, porém, para ambos os marcadores, a maior variação genética está dentro das populações. A moderada a baixa diferenciação genética corrobora com os dados de Nm obtidos a partir dos ISSR (Nm = 1,98 a 8,78) e SSR (Nm = 1,09 a 9,21), indicando ocorrência de fluxo gênico entre as populações. A análise bayesiana realizada a partir dos dados ISSR resultou apenas em dois grupos, enquanto, os dados SSR revelaram haver três grupos genéticos se dividindo em populações localizadas na região Litoral-Norte, próximas ou localizadas na região Noroeste e, próximas ou localizadas na região Sul. O teste de Mantel revelou baixa correlação entre os marcadores, porém, de acordo com a análise de emaranhamento, houve moderada associação entre as matrizes de distâncias genéticas (Entanglement = 0,47), com consistência entre alguns indivíduos. Os resultados satisfatórios encontrados para a espécie confirmam o potencial de possíveis matrizes para a coleta de sementes e produção de mudas, porém, os baixos níveis de diversidade genética encontrados para algumas populações, possivelmente estão associados a intensa exploração de D. nigra no passado e a fragmentação da Floresta Atlântica.Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES

AVALIAÇÃO DE MÉTODOS PARA ARMAZENAMENTO DE TECIDOS FOLIARES E OBTENÇÃO DE DNA EM CINCO ESPÉCIES DE BROMELIACEAE

Realizaram-se testes comparativos utilizando diferentes metodologias de conservação de material foliar coletado de cinco espécies de Bromeliaceae, visando a obtenção de DNA de alta qualidade que possibilitasse estudos com marcadores moleculares. A qualidade do DNA extraído foi avaliada através de dois métodos: análise da pureza e quantificação em NanoDrop® por e ensaios utilizando três marcadores ISSR. Os resultados revelaram que, todos os métodos disponibilizaram material de qualidade. Entretanto, a obtenção de macerado a partir de folhas de Bromeliaceae liofilizadas demandam de tempo e esforço por parte do manipulador, sendo indicada a aplicação de metodologias de congelamento com nitrogênio líquido, uma vez que produz material de boa qualidade possibilitando a obtenção de resultados nítidos na técnica de eletroforese