Identificación y caracterización de actinobacterias con presencia de los sistemas PKS y NRPS

Tesis de Doctorado en Ciencias de la SaludUno de los pasos más importantes en el proceso de obtención de nuevos metabolitos secundarios, a partir de productos naturales de origen microbiano es la selección de bacterias adecuadas, como las actinobacterias. Este phylum se caracteriza por su capacidad para producir diferentes compuetsos bioactivos, los cuales se sabe que son producidos por los sistemas modulares policétido sintasa (PKS) y el sintetasa de péptido no ribosomal (NRPS). Con el objetivo de explorar la presencia y distribución de estos sistemas biosintéticos en actinobacterias, se han diseñado iniciadores específicos para las regiones del sistema PKS y NRPS, permitiedo una rápida detección de dichos sistemas en actinibacterias. En este estudio se identificaron actinobacterias halófilas y haloalcalófilas con la presencia de los sistemas PKS y NRPS para predecir la síntesis de móleculas bioactivas. Se aislaron e identificaron 51 cepas de actinobacterias halófilas y haloalcalófilas, provenientes de ambientes salinos y salino-sódicos de México. El análisis filogenético basado en la secuenciación del gen 16S rRNA mostró que las cepas aisladas pertenecen a los géneros Saccharomonospora, Actinopolyspora y Nocardiopsis. El sistema PKS fue detectado en 5 cepas del genero Saccharomonospora. El sistema NRPS fue detectado en 6 cepas pertenecientes a los géneros Nocardiopsis y Saccharomonospora. La presencia de ambos sistemas PKS y NRPS fue detectada en 37 cepas correspondientes a los tres géneros identificados. Tres cepas no demostraron la presencia de los sistemas PKS y NRPS. La determinación de la presencia de regiones génicas especificas permitirá identificar si una cepa de actinobacteria es potencialmente productora de compuestos con posible aplicación en biomedicina.Conacy

Draft Genome Sequence of Saccharomonospora sp. Strain LRS4.154, a Moderately Halophilic Actinobacterium with the Biotechnologically Relevant Polyketide Synthase and Nonribosomal Peptide Synthetase Systems

The draft genome sequence of Saccharomonospora sp. strain LRS4.154, a moderately halophilic actinobacterium, has been determined. The genome has 4,860,108 bp, a G C content of 71.0%, and 4,525 open reading frames (ORFs). The clusters of PKS and NRPS genes, responsible for the biosynthesis of a large number of biomolecules, were identified in the genome

Draft Genome Sequence of Saccharomonospora piscinae KCTC 19743T, an Actinobacterium Containing Secondary Metabolite Biosynthetic Gene Clusters

Artículo científico producto de proyecto de investigación.The draft genome sequence of Saccharomonospora piscinae KCTC 19743T, with a size of 4,897,614 bp, was assembled into 11 scaffolds containing 4,561 open reading frames and a G C content of 71.0 mol%. Polyketide synthase and nonribosomal peptide synthetase gene clusters, which are responsible for the biosynthesis of several biomolecules, were identified and located in different regions in the genome.CONACY

Identificación y caracterización de actinobacterias con presencia de los sistemas PKS y NRPS

Tesis de Doctorado en Ciencias de la SaludUno de los pasos más importantes en el proceso de obtención de nuevos metabolitos secundarios, a partir de productos naturales de origen microbiano es la selección de bacterias adecuadas, como las actinobacterias. Este phylum se caracteriza por su capacidad para producir diferentes compuetsos bioactivos, los cuales se sabe que son producidos por los sistemas modulares policétido sintasa (PKS) y el sintetasa de péptido no ribosomal (NRPS). Con el objetivo de explorar la presencia y distribución de estos sistemas biosintéticos en actinobacterias, se han diseñado iniciadores específicos para las regiones del sistema PKS y NRPS, permitiedo una rápida detección de dichos sistemas en actinibacterias. En este estudio se identificaron actinobacterias halófilas y haloalcalófilas con la presencia de los sistemas PKS y NRPS para predecir la síntesis de móleculas bioactivas. Se aislaron e identificaron 51 cepas de actinobacterias halófilas y haloalcalófilas, provenientes de ambientes salinos y salino-sódicos de México. El análisis filogenético basado en la secuenciación del gen 16S rRNA mostró que las cepas aisladas pertenecen a los géneros Saccharomonospora, Actinopolyspora y Nocardiopsis. El sistema PKS fue detectado en 5 cepas del genero Saccharomonospora. El sistema NRPS fue detectado en 6 cepas pertenecientes a los géneros Nocardiopsis y Saccharomonospora. La presencia de ambos sistemas PKS y NRPS fue detectada en 37 cepas correspondientes a los tres géneros identificados. Tres cepas no demostraron la presencia de los sistemas PKS y NRPS. La determinación de la presencia de regiones génicas especificas permitirá identificar si una cepa de actinobacteria es potencialmente productora de compuestos con posible aplicación en biomedicina.Conacy