A Comprehensive In Silico Analysis of the Functional and Structural Impact of SNPs in the IGF1R Gene

Insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R) acts as a critical mediator of cell proliferation and survival. Many single nucleotide polymorphisms (SNPs) found in the IGF1R gene have been associated with various diseases, including both breast and prostate cancer. The genetics of these diseases could be better understood by knowing the functions of these SNPs. In this study, we performed a comprehensive analysis of the functional and structural impact of all known SNPs in this gene using publicly available computational prediction tools. Out of a total of 2412 SNPs in IGF1R retrieved from dbSNP, we found 32 nsSNPs, 58 sSNPs, 83 mRNA 3′ UTR SNPs, and 2225 intronic SNPs. Among the nsSNPs, a total of six missense nsSNPs were found to be damaging by both a sequence homology-based tool (SIFT) and a structural homology-based method (PolyPhen), and one nonsense nsSNP was found. Further, we modeled mutant proteins and compared the total energy values with the native IGF1R protein, and showed that a mutation from arginine to cysteine at position 1216 (rs61740868) on the surface of the protein caused the greatest impact on stability. Also, the FASTSNP tool suggested that 31 sSNPs and 3 intronic SNPs might affect splicing regulation. Based on our investigation, we report potential candidate SNPs for future studies on IGF1R mutations

Efeito da suplemantacao alimentar sobre o comportamento reprodutivo de tourinhos Canchim. I. caracteristicas puberais.

Avaliacao do efeito da suplentacao alimentar durante o periodo seco sobre a puberdade de tourinhos Canchim

Pesos e ganhos de pesos de bovinos cruzados Canchim x Nelore.

Este trabalho teve o objetivo de estudar efeitos de fatores geneticos e de meio sobre os pesos ao nascimento (PN), a desmama (PD) e aos 12 (12), 18 (P18) e 24 (P24) meses de idade e os ganhos de peso do nascimento a desmama (GND), da desmama aos 12 meses (GD12), dos 12 aos 18 meses (G1218) e dos 18 aos 24 meses (G1824) de idade de animais cruzados Canchim X Nelore, filhos de touros Canchim e vaca Nelores. Foi observada significancia dos efeitos incluidos no modelo matematico (ano e mes de nascimento, sexo do bezerro, origem da vaca, idade da vaca ao parto e pai do bezerro, dentro de ano de nascimento) sobre quase todas as caracteristicas estudadas, com excecao da idade da vaca ao parto que nao influenciou nenhuma delas. As estimativas de herdabilidade, obtidas pelo metodo dos quadrados minimos, foram iguais a 0,41 +- 0,14 (PN), 0,42 +- 0,15 (PD), 0,53 +- 0,16 (P12), 0,46 +- 0,19 (P18), 0,63 +- 0,20 (P24), 0,37 +- 0,14 (GND), 0,33, +- 0,14 (GD12), 0,34 +- 0,17 (G1218 w 0,15 +- (G1824).Resumo expandido

Estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos para ganhos de peso na raça Canchim.

O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e de correlações genéticas, fenotípicas e de ambiente para os ganhos diários de peso do nascimento a desmama, da desmama aos 12 meses, dos 12 aos 18 meses e dos 18 a 24 meses de idade, na raça Canchim. Os dados de animais de cinco fazendas foram analisados pelo método de quadrados minimos

Características do pelame de bovinos Nelore, Angus x Nelore e Senepol x Nelore.

As características do pelame influenciam diretamente a capacidade de termorregulação dos bovinos manejados em clima tropical. O objetivo neste trabalho foi avaliar as características do pelame de novilhas Nelore, Angus x Nelore e Senepol x Nelore criadas na região Sudeste do Brasil, na Embrapa Pecuária Sudeste. Foram analisados dados de espessura de pelame, densidade numérica de pêlos, comprimento e ângulo de inclinação dos pêlos e densidade da massa do pelame. Os dados foram analisados por meio de análises de variância e as médias comparadas pelo teste t. Foi encontrado efeito significativo (P<0,05 ou P<0,01) de grupo genético para todas as características estudadas. Os animais Angus x Nelore apresentaram maior comprimento dos pêlos do que os animais dos outros grupos genéticos e maior espessura de pelame do que os animais Senepol x Nelore, sendo que estes últimos apresentaram o menor número de pêlos/cm2. Os animais Nelore apresentaram maior ângulo de inclinação dos pêlos do que os animais dos outros grupos e menor densidade de massa dos pêlos do que os animais Angus x Nelore