13 research outputs found
Population Genetic Structure of the Grasshopper Eyprepocnemis plorans in the South and East of the Iberian Peninsula
- Author
- AJ Muñoz-Pajares
- AK Hundsdoerfer
- AR Pradeep
- CB Phillips
- CD Soulsbury
- D Falush
- DJ Spiegelhalter
- DJ Tester
- E Bonnet
- E Muñoz
- E Zietkiewicz
- F Hernandez
- F Perfectti
- Francisco Perfectti
- G Evanno
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cano
- J Felsenstein
- JA Herrera
- JH De Leon
- JPM Camacho
- Juan Pedro Martínez Camacho
- K Vijayan
- KE Holsinger
- L Excoffier
- LR Dice
- María Dolores López-León
- María Inmaculada Manrique-Poyato
- MB Ratnaparkhe
- MC Pardo
- MD López-León
- ME Fernandez
- N Saitou
- Nicolas Salamin
- O Roux
- P Taberlet
- PK Kar
- PM Schlüter
- Ricardo Gómez
- RN Jones
- RV Kantety
- S Sesarini
- S Wright
- SL Datwyler
- T Kojima
- T Nagaoka
- V Pinedo-Cancino
- VM Dirsh
- W Wu
- X Vekemans
- XP Zhang
- Y Tsumura
- Z Lu
- Z Ren
- Publication venue
- 'Public Library of Science (PLoS)'
- Publication date
- 01/01/2013
- Field of study
The grasshopper Eyprepocnemis plorans subsp. plorans harbors a very widespread polymorphism for supernumerary (B) chromosomes which appear to have arisen recently. These chromosomes behave as genomic parasites because they are harmful for the individuals carrying them and show meiotic drive in the initial stages of population invasion. The rapid increase in B chromosome frequency at intrapopulation level is thus granted by meiotic drive, but its spread among populations most likely depends on interpopulation gene flow. We analyze here the population genetic structure in 10 natural populations from two regions (in the south and east) of the Iberian Peninsula. The southern populations were coastal whereas the eastern ones were inland populations located at 260–655 m altitude. The analysis of 97 ISSR markers revealed significant genetic differentiation among populations (average GST = 0.129), and the Structure software and AMOVA indicated a significant genetic differentiation between southern and eastern populations. There was also significant isolation by distance (IBD) between populations. Remarkably, these results were roughly similar to those found when only the markers showing low or no dropout were included, suggesting that allelic dropout had negligible effects on population genetic analysis. We conclude that high gene flow helped this parasitic B chromosome to spread through most of the geographical range of the subspecies E. plorans plorans.This study was supported by a grant from the Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación (CGL2009-11917), and was partially performed by FEDER funds. MIMP was supported by a fellowship (FPU) from the Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación
Protein-coding genes in B chromosomes of the grasshopper Eyprepocnemis plorans
- Author
- A Conesa
- A Seki
- A Takemoto
- A Untergasser
- AJ Muñoz-Pajares
- AM Banaei-Moghaddam
- AM Banaei-Moghaddam
- AS Graphodatsky
- B Ishak
- B Navarro-Domínguez
- BJ Haas
- CM Case
- CR Leach
- DP Fox
- F Perfectti
- FJ Ruiz-Ruano
- GSC Slater
- GT Valente
- J Baxter
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Herrera
- JH Werren
- JJFA Van Vugt
- JM Cesario
- JP Camacho
- K Yoshida
- KU Hong
- L Fu
- M Ashburner
- M Carchilan
- M Ruiz-Estévez
- M Ruiz-Estévez
- M Ruiz-Estévez
- M Teruel
- MD López-León
- MD López-León
- MM Martis
- N Henriques-Gil
- PA Coelho
- PA Nguyen
- PJ Seo
- Q Zhou
- R Pallai
- RL Tatusov
- S Hirotsune
- S Sivakumar
- S Wu
- S Zurita
- SF Altschul
- T Ono
- VA Trifonov
- VP Miao
- W Bao
- X Wang
- Z Ning
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Inter-annual maintenance of the fine-scale genetic structure in a biennial plant
- Author
- A Shimono
- AJ Muñoz-Pajares
- BA Loiselle
- BK Epperson
- C Born
- C Lara-Romero
- CM Beale
- CM Herrera
- D Kelly
- DG Berens
- E Paradis
- E Pérez-Collazos
- EM Kierepka
- F Austerlitz
- FA Jones
- GA Wilson
- HP Zhou
- IJ Wang
- J Isselstein
- J Königer
- J Silvertown
- J Valverde
- JG Segarra-Moragues
- JL Hamrick
- JM Gómez
- JM Gómez
- JM Gómez
- JM Gómez
- JM Gómez
- JM Gómez
- JR Freeland
- K Keenan
- L Excoffier
- M Abdelaziz
- M Kearse
- MF DiLeo
- MK Rhodes
- MS Rosenberg
- NC Ellstrand
- OJ Hardy
- OJ Hardy
- OJ Hardy
- OJ Hardy
- PG Meirmans
- PGL Klinkhamer
- PGL Klinkhamer
- R Hart
- R Holderegger
- R Rouger
- RJ Dyer
- S Kalisz
- S Volis
- S Wright
- SJ Robinson
- T Jombart
- T Jombart
- TJ de Jong
- TJ de Jong
- WD Kissling
- X Vekemans
- Z-F Wang
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Chromosomal Mapping of Repetitive DNAs in the Grasshopper Abracris flavolineata Reveal Possible Ancestry of the B Chromosome and H3 Histone Spreading
- Author
- A Gallagher
- A Pedrosa-Harand
- AG Bugrov
- AG Bugrov
- AJ Muñoz-Pajares
- AM Pendás
- Anton Wutz
- AT Sumner
- B Charlesworth
- B John
- C Biémont
- CA Mestriner
- CJ Bidau
- D Pinkel
- D Schweizer
- Danilo Bueno
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- Diogo Cavalcanti Cabral-de-Mello
- DJ Colgan
- DM Cella
- EB Wilson
- EO Long
- ER Castillo
- F Pelliccia
- F Roa
- F Yang
- FJ Ruiz-Ruano
- I Schubert
- IA Ferreira
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cabrero
- JC Vilardi
- JPM Camacho
- L Zhang
- M Ruiz-Estévez
- M Teruel
- M Teruel
- M Teruel
- M Teruel
- M Teruel
- M Úbeda-Manzanaro
- MA Merlo
- MD López-León
- MD López-León
- MK Dhar
- ML Grieco
- MM Martis
- MR Vicari
- MS Zwick
- NB Rubtsov
- NL Oliveira
- O Raskina
- O Raskina
- Octavio Manuel Palacios-Gimenez
- P Nguyen
- R Barzotti
- RE Hanson
- RF Artoni
- RN Jones
- RN Jones
- RN Jones
- RT Nakajima
- S Cohen
- S Cohen
- S Cohen
- TA Voltolin
- V Loreto
- VA Confalonieri
- Y Panzera
- Publication venue
- 'Public Library of Science (PLoS)'
- Publication date
- Field of study
U1 snDNA clusters in grasshoppers: chromosomal dynamics and genomic organization
- Author
- A Anjos
- A Mesa
- AJ Muñoz-Pajares
- B Charlesworth
- BA Hanley
- D Bueno
- D C Cabral-de-Mello
- D Contreras
- D O’Reilly
- D Pinhal
- D Pinkel
- DB Carvalho
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DC Cabral-de-Mello
- DJ Forbes
- E Lund
- E Lund
- ER Castillo
- ERD Castillo
- F J Ruiz-Ruano
- F Pelliccia
- G Drouin
- GM Hewitt
- H Busch
- IE Jetybayev
- IL Hofacker
- J Cabrero
- J Cabrero
- J Cabrero
- J P M Camacho
- J Vierna
- J Vierna
- JA Coyne
- JC Yu
- JM Sierra-Montes
- JPM Camacho
- JR Leavitt
- K Katoh
- K Tamura
- KP Gogolevsky
- L Excoffier
- M J de Souza
- M Manchado
- M Marz
- M Nei
- M Westerman
- MA Merlo
- MJD White
- MSR Neto
- O Kohany
- O Raskina
- OM Palacios-Gimenez
- P Bringmann
- P Librado
- P Nguyen
- P Novák
- P Novák
- PC Lo
- PK Flook
- R Barzotti
- R Freire
- R Zeller
- RC Edgar
- S Bretagne
- S Valadkhan
- S West
- SF Altschul
- SM Mount
- TW Nilsen
- V Loreto
- VV Kapitonov
- W Gilbert
- X Wang
- Y Panzera
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Multiplicity dependence of pion, kaon, proton and lambda production in p–Pb collisions at √sNN = 5.02 TeV
- Author
- 1
- 2
- 3
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- 5
- a
- A. A. E. Bergognon da
- A. A. P. Suaide dg
- A. Agostinelli y
- A. Ahmad Masoodi p
- A. Akindinov ba
- A. Alici k
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- A. Andronic cl
- A. Augustinus ag
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- A. Badalà cv
- A. Baldisseri m
- A. Bercuci bt
- A. Bhasin cf
- A. Bilandzic bv
- A. Bogdanov br
- A. Borissov dt
- A. C. Oliveira Da Silva dg
- A. Caliva az
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- A. Deloff bs
- A. Deppman dg
- A. Di Mauro ag
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- A. Fantoni bn
- A. Feliciello cz
- A. Fernández Téllez b
- A. Ferretti w
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- A. Harton l
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- A. Jachołkowski z
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- A. Kazantsev co
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- Publication date
- 17/07/2013
- Field of study
Inthis Letter, comprehensive results on π±,K±,K0S, p(pbar) and Λ(Λbar) production at mid-rapidity (0< yCMS < 0.5) in p–Pb collisions at √sNN = 5.02 TeV, measured by the ALICE detector at the LHC, are reported. The transverse momentum distributions exhibit a hardening as a function of event multiplicity, which is stronger for heavier particles. This behavior is similar to what has been observed in pp and Pb–Pb collisions at the LHC. The measured pT distributions are compared to d–Au, Au–Au and Pb–Pb results at lower energy and with predictions based on QCD-inspired and hydrodynamic models
Production of charged pions, kaons and protons at large transverse momenta in pp and Pb–Pb collisions at s
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- Publication venue
- 'Elsevier BV'
- Publication date
- 01/01/2014
- Field of study
Transverse momentum spectra of pi(+/-), K-+/- and p((p) over bar) up to p(T) = 20 GeV/c at mid-rapidity in pp, peripheral (60-80%) and central (0-5%) Pb-Pb collisions at v root s(NN) = 2.76 TeV have been measured using the ALICE detector at the Large Hadron Collider. The proton-to-pion and the kaon-to-pionratios both show a distinct peak at p(T) approximate to 3 GeV/c in central Pb-Pb collisions. Below the peak, p(T) 10 GeV/c particle ratios in pp and Pb-Pb collisions are in agreement and the nuclear modification factors for pi(+/-), K-+/- and p((p) over bar) indicate that, within the systematic and statistical uncertainties, the suppression is the same. This suggests that the chemical composition of leading particles from jets in the medium is similar to that of vacuum jets
Production of charged pions, kaons and protons at large transverse momenta in pp and Pb–Pb collisions at sNN=2.76 TeV
- Author
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- Publication venue
- 'Elsevier BV'
- Publication date
- 01/01/2014
- Field of study
Transverse momentum spectra of pi(+/-), K-+/- and p((p) over bar) up to p(T) = 20 GeV/c at mid-rapidity in pp, peripheral (60-80%) and central (0-5%) Pb-Pb collisions at v root s(NN) = 2.76 TeV have been measured using the ALICE detector at the Large Hadron Collider. The proton-to-pion and the kaon-to-pionratios both show a distinct peak at p(T) approximate to 3 GeV/c in central Pb-Pb collisions. Below the peak, p(T) 10 GeV/c particle ratios in pp and Pb-Pb collisions are in agreement and the nuclear modification factors for pi(+/-), K-+/- and p((p) over bar) indicate that, within the systematic and statistical uncertainties, the suppression is the same. This suggests that the chemical composition of leading particles from jets in the medium is similar to that of vacuum jets
Freeze-out radii extracted from three-pion cumulants in pp, p-Pb and Pb-Pb collisions at the LHC
- Author
- Abelev B
- Adam J
- Adamová D
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- Agnello M
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- Publication venue
- 'Elsevier BV'
- Publication date
- 01/01/2013
- Field of study