형질전환 쥐를 이용한 사람 HOXA7 유전자 조절부위의 구조와 기능 분석

Thesis (doctoral)--서울대학교 대학원 :수의학과 수의미생물학전공,1998.Docto

Production of single chain antibodies against mycotoxin aflatoxin B1 in recombinant Escherichia coli

Thesis (master`s)--서울대학교 대학원 :농생명공학부,2004.Aflatoxins B1 (AFB1) is a secondary metabolite produced mostly by Aspergillus flavus and A. parasiticus strains and the most toxic to human and several animal species as food contaminant. The single chain variable region (scFv) genes of a monoclonal antibody against AFB1 were cloned and expressed in recombinant Escherichia coli. A fusion of myeloma cells (Sp2/0-Ag14) and spleen cells from the immunized mice, and hybridoma cells were cultured to obtain anti-AFB1 monoclonal antibody. The antibody was found to be very specific to AFB1 with 1.3 ng/ml IC50 and 0.1 ng/ml detection limit. The complementary DNA (cDNA) for the anti-AFB1 antibody by reverse transcription-polymerase chin reaction (RT-PCR). Amino acid sequence analysis of the cDNA identified that the variable region was composed of heavy chain (VH) as a type of IgG1 and light chain (VL) as a type of λ. Overlap-extension PCR (OE-PCR) using flexible DNA linker encoding polypeptide (Gly4Ser)3 led to combination of VH and VL genes and their stable expression in recombinant E. coli. Co-expression of molecular chaperones or ubiquitin fusion system increased an expression level of anti AFB1 scFv. In vitro refolding of anti AFB1 scFv inclusion bodies was optimized by changing environmental condition of refolding and its biological activity was determined by competitive direct enzyme linked immunosorbent assay (cdELISA). The optimized condition was obtained when using 50 mM tris, 10 mM GSH, 1 mM GSSG and 0.02% tween 20.Maste

The variation of meiofaunal community by change of environment in the tidal flat on West coast of Korea

The community structure of major meiobenthos was studied in Chunsu bay on west coast of Korea in april, July and october, 2003. Chunsu bay, one of the famous spawning ground and nursery in west coast of Korea, was reduced to half of the total area and estuary of bay almost disappeared by construction of Seosan A, B dike. So, Chunsu bay is semi-closed and influenced by environmental stress like decreasing inflow of stream and increasing discharge of sewage by coastal development. The samples for analysing benthic micro-organism, benthic diatom and meiobenthic animal were collected using the van-Veen grab and acryl sub-corer at 11 stations in Chunsu bay. To examine feeding habit of major meiofaunal groups, nematodes and harpacticoid copepods at the Hwangdo tidal flats in inner part of Chunsu bay. Grazing rate was measured using a isotope-tracer (3H thymidine, 14C amino acid) method. Time-serial measurement of grazing rate was made to elucidate the effects of day/night and tidal cycle on diel feeding rhythm of the animals. The number of culturable bacteria fluctuated from 1.73±0.25×105 to 18.23±1.17×105 CFU/㎤ during the experimental period, and was highest in october. The numbers of culturable bacteria in the study sites were higher at the station near the entrance of bay than the station of inner part of bay, and fluctuated from 2.12±0.06×106 to 4.27±0.28×106 CFU/㎤ at the the Hwangdo tidal flats in October. Variation of the number of culturable bacteria by tidal rhythm showed higher in day than night time. The Concentration of Chl.a in the sediment at the study site was 18.0～168.2㎎/㎡ in April and 36.6～111.0㎎/㎡ in October. The most abundant meiobenthos was nematodes and followed by sarcomastigophorans, harpacticoid copepods. These Three taxa comprised more than 80% of the total abundance at all stations. For size distribution analyses showed that animals which fit into the sieve mesh size of 0.063mm were abundant. The maximum density of meiobenthos was1

서해안 호곡리 조간대 상부에 설치한 인공매립실험 지역의 중형저서동물 군집변화

1999년부터 2001년까지 서식지 복원을 위한 현장 설비 실험 및 저서생태계의 변화과정을 모니터링하기 위하여, 서해안 호곡리 조간대 갯벌 상부에 자연상태의 서식환경 중 식생이 없는 니질 연성 퇴적물만의 정점과 갈대군락 정점, 퇴적 촉진 구조물 (sediment trap) 정점, 그리고, 인위적인 육상토양 매립 정점 등으로 저서생물의 서식환경을 다르게 한 4정점을 선정하여, 각 정점에 서식하는 중형저서생물 군집 특성과 인위적 환경에서의 생물의 가입 진행과정 등을 분석하였다. 중형저서생물 시료의 채집은 각 정점에서 직경 3.6cm 크기의 아크릴로 된 튜브를 사용하여 퇴적물을 채취한 후, 표층으로부터 깊이 5cm까지를 각각 1cm씩 (0～1cm, 1～2cm, 2～3cm, 3～4cm, 4～5cm) 자른 다음 로즈벵갈 (rose bengal)을 혼합한 5% 중성 포르말린으로 고정했다. 현장에서 연구소로 운반되어진 생물 시료는 연구실에서 각 크기의 체 (1mm, 500㎛, 250㎛, 125㎛, 63㎛, 37㎛)로 크기별로 걸러내어 광학현미경 하에서 분류 및 계수를 하였다. 조사기간 동안 총 14개의 분류군이 출현하였는데, 출현 분류군에 있어서는 선충류가 전 정점에서 가장 우점하고 있었고, 그 다음으로 우점하는 분류군은 전체적으로 유공충류와 저서성 요각류, 갑각류의 유생 순으로 나타났다. 호곡리에서의 인위적인 갯벌조성 실험에서는 선충류가 가장 먼저 가입을 하여 성장과 번식을 하고, 그 다음으로 저서성 요각류의 가입이 이루어지는 결과를 보여주었다. 하지만 일정 시간이 흐르면 이들 두 분류군보다 유공충류가 급격히 증가를 하여 가장 높은 서식밀도를 보이는 분류군으로 나타났다. 또한 개체수 증가 뿐 아니라 퇴적물내의 수직 분포에 있어서도 시간의 경과에 따라 서서히 깊은 심도의 퇴적물 내로 서식 범위를 넓혀 가는 현상을 나타냈다. 출현 개체수에 있어서는 조간대 갈대군락 내의 퇴적물로부터는 2000년 5월 11,318 개체/10㎠, 2000년 4월 9,710 개체/10㎠ 등의 아주 높은 서식 밀도 값을 나타냈다. 이러한 결과는 조간대의 다른 어느 환경보다 갈대 군락 형성지의 경우가 중형저서생물이 서식하기에 아주 유리한 환경이라는 것을 시사하는 것으로 사료된다. 이를 뒷받침 해주는 결과로 가장 우점했던 선충류는 이 지역에서 가장 높은 서식밀도를 보여 10,571 개체/10㎠을 나타냈으며, 그 다음으로 우점하는 유공충류에 있어서도 이 지역에서 가장 높게2

울릉도·독도 해역 해양포유류 출현 특성 및 독도 바다사자 관련 연구 동향

독도 바다사자(가제, 가지, 강치, Zalophus japonicus)는 과거 동해와 일본 북해도에 주로 서식하였으며 우리나라에서는 울릉도, 독도가 최대 번식지였다. 그러나, 일제 강점기 시절 대량 포획된 이후 개체수가 급감하여 1990년대 중반에 국제자연보전연맹(IUCN)에 의해 절멸종으로 분류되었다. 그간 국내에서는 독도 바다사자에 대한 1950년대 사진자료와 일본인의 남획 기록 및 증언자료만 보유하고 있었으며, 독도 바다사자의 멸종으로 인해 유전 자원을 확보하지 못했다. 한국해양과학기술원(KIOST) 울릉도·독도해양연구기지에서는 2014년 4월 독도에서 바다사자 뼈로 추정되는 동물뼈 5점을 채취하여 부산대학교 해양연구소와 공동 연구를 통해 유전자를 분석해 왔다. 그 결과, 부산대학교 해양연구소에서는 채취한 뼈 중 1점에서 DNA를 검출하는 데 성공했고, 이 뼈가 독도 바다사자의 뼈인 것으로 확인한바 있다. 본 연구에서는 독도 바다사자 뼈 분석을 계기로 현재는 멸종된 것으로 보고된 독도 바다사자를 비롯한 울릉도와 독도 해역의 해양포유류 출현 특성과 함께 관련 연구 동향을 소개하고자 한다.2

해양의 서로다른 극한환경에서의 중형저서동물 군집특성 비교

전 해양의 약 93%를 차지하는 200m 이상의 심해를 대상으로 한 일반생물 및 심해의 특수한 생태계인 열수 분출공 지역과 냉용수 지역, 고래뼈 주변 생태계에 대한 연구는 전 세계적인 동향으로, 해양생태계 전반의 이해에 필수요소이고 해양학적 연구의 차원뿐 아니라 심해로의 접근 기술 개발 및 심해 유용생물의 개발 및 산업화를 위한 필수적인 연구분야라 할 수 있다. 또한 초심해역 중에도 급격한 사면에 의한 지형적으로 격리되어진 환경이라 할 수 있는 해구바닥은 독자의 생물상을 가지고 있다고 추측되어지고 있다. 이미 수 십년 전부터 심해 및 초심해저의 생물자원에 대한 연구가 전 세계적으로 이루어지고 있음에도 불구하고, 우리나라의 심해생물에 대한 연구는 동해에서의 제한된 생물을 대상으로 극히 단편적인 연구만 수행되어왔다. 이러한 심해 연구의 집중연구를 위하여 2002년 10월에는 필리핀 플레이트를 둘러싼 마리아나 해구에 있는 세계에서 가장 깊은 해역인 수심 10,900m의 챌린저 해연에서 일본의 ROV \\\\'Kaiko\\\\'를 이용한 탐사와, 2003년과 2004년에 남서태평양의 피지분지와 라우분지에서의 열수지역 탐사 등을 수행하였다. 또한, 북동 태평양의 심해저 자원 탐사의 일환으로 1995년부터 매년 수행되고 있는 온누리호를 이용한 환경탐사연구를 통하여 심해저의 생물상에 대한 연구가 있는데, 주로 Multiple corer와 Box corer를 이용하여 중형저서동물과 대형저서동물의 군집에 대한 연구를 수행하였다. 탐사 결과, 최심해 해역인 마리아나 해구에서는 모두 5정점에서, 8 분류군이 출현하였으며, 정점별로 136～419 inds./10㎠의 서식밀도를 나타냈고, 가장 우점하는 분류군은 저서유공충류였으며, 선충류와 저서성 요각류가 대부분을 차지하고 있었다. 2003년, 2004년에 남서태평양 피지분지와 라우분지의 열수 부근해역에서는 전체 11 중형저서동물 분류군이 출현하였는데, 이중 가장 우점한 분류군은 선충류와 저서성 요각류로 나타났으며, 25～150 inds./10㎠의 비교적 낮은 서식밀도를 나타냈다. 1995년부터 수행되어온 북동태평양 심해지역에서는 전체 12개의 중형저서동물의 분류군이 출현하였으며, 6～306 inds./10㎠의 서식밀도를 나타냈으며, 이중 선충류가 가장 우점한 그룹이었으며, 저서유공충류와 저서성 요각류가 그 다음으로 우점하게 나타났다. 다양한 극한 심해환경에서의 중형저서동물의 군2