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    비판막성 심방세동에 의한 뇌경색의 이차 예방을 위한 와파린과 비 비타민 K 경구용 항응고제의 비교

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    학위논문(박사) -- 서울대학교 대학원 : 의과대학 의학과, 2024. 8. 권형민.심방 세동은 뇌졸중의 주요 위험 인자로, 심방 세동에 의한 뇌졸중은 다른 기전으로 인해 발생한 뇌경색에 비해 더 심각하고 그 예후가 좋지 않다. 따라서, 심방 세동을 가진 환자들에게 있어서 뇌졸중의 발생 (일차 예방) 과 재발을 예방 (이차 예방)하는 것은 중요한 문제이다. 오랜 세월동안 이 환자들의 일차 및 이차 예방을 위해 와파린이 표준 치료제로 사용되어 왔지만, 와파린은 장기간 사용에 있어 여러 문제점이 있었다. 최근 들어 비 비타민 K 경구용 항응고제 (NOAC)들이 개발되었고, 다양한 임상 시험 (randomized controlled study)들과 대규모 관찰 연구들을 통해 와파린보다 심방 세동 환자의 뇌졸중 일차 예방에 있어서 더 안전하고 열등하지 않은 효과를 보이는 것을 입증하였다. 하지만, 이미 심방 세동으로 인한 뇌졸중이 발생한 환자들에게 있어서 재발을 방지하는 이차 예방과 관련되어서는 많은 연구가 이루어지지 못했다. 이 연구에서는 국내 국민건강보험 공단 빅데이터 자료를 이용하여, 심방 세동으로 인한 뇌졸중 환자의 이차 예방에 있어서 와파린과 NOAC 의 효과 및 안전성에 대해 비교하고자 한다. 아울러, 각 NOAC 들 간의 비교를 통해서 현재 국내에 NOAC 처방 현황 및 한국인에게 더 안전하고 효과적인 NOAC 은 어떤 것인지에 대해서도 알아보고자 한다. 2015 년에서 2019 년 사이 국민건강보험 공단의 레지스트리에 등록되어 있는 환자들 중 뇌경색 및 비판막성 심방 세동의 ICD-10-CM code 를 모두 가진 환자들을 분석 대상으로 삼았다. 뇌경색 진단의 실효성을 얻기 위해 뇌 자기공명영상을 입원 직전 혹은 직후 수행한 환자만을 대상으로 하였으며 처음으로 와파린 혹은 NOAC 을 사용한 환자를 대상으로 했다. 주요 효과 변수는 뇌경색 + 전신 색전증으로 정의하였으며, 주요 안전 변수는 뇌출혈 + 위장관 출혈으로 정의했다. 그 외에 각각의 뇌경색, 전신 색전증, 주요 출혈, 사망을 이차 결과 변수로 분석했다. 관찰 기간은 2019 년 12 월까지로 정의하였으며, cox regression analysis model 을 기반으로 와파린 사용자와 NOAC 사용자 간의 주요 결과 변수들의 차이를 분석하였다. 총 21,064 명의 경구 항응고제 사용자가 분석 대상이 되었으며, 그 중 와파린 사용자가 2,925 (13.9%) 명, NOAC 사용자가 18,139 (86.1%) 명이었다. 양 군 간의 유의미한 표본 크기 차이로 인한 교란 변수들의 차이를 줄이기 위해 1:4 propensity score matching 을 수행하였다. 관찰 기간의 중간 값은 15.5 달이었다. 시간 및 교란 변수들을 보정한 다변량 분석에서 NOAC 사용자는 와파린 사용자에 비해 유의미하게 적은 뇌경색 + 전신 색전증 위험도를 보였다 [adjusted hazard ratio (aHR), 0.86; 95% confidence interval (CI), 0.78-0.95]. NOAC 은 출혈 부작용에 있어서도 와파린보다 안전한 결과를 보였다 (aHR, 0.78; 95% CI, 0.68-0.89). NOAC 용량에 따른 와파린과의 비교 분석에서, 표준 용량의 NOAC 은 와파린보다 더 효과적이고 안전한 결과를 보였다. 하지만, 저용량 NOAC 의 경우 뇌경색 + 전신 색전증의 예방 효과에 있어서도, 출혈성 부작용에 있어서도 와파린과 통계적으로 유의미한 차이를 보이지 못했다. 종류에 따른 분석에서는 dabigatran, rivaroxaban, apixaban, edoxaban 의 네 종류 NOAC 모두 와파린보다 더 뛰어난 이차 예방 효과를 보였다. 출혈 부작용에 있어서는 rivaroxaban 을 제외한 세 종류의 NOAC 은 모두 와파린보다 안전한 결과를 보여주었으며, rivaroxaban 은 와파린과 비슷한 정도의 출 부작용 위험도를 보였다. 한국 건강보험공단 빅데이터를 이용한 전국 리얼 월드 데이터 분석에서, NOAC 은 비판막성 심방 세동으로 인한 뇌졸중 환자의 이차 예방 효과 및 안전성에 있어서 모두 와파린보다 우수한 모습을 보였다. 모든 종류의 NOAC 은 와파린보다 이차 예방 효과가 우수하였으며, rivaroxaban 을 제외한 모든 NOAC 들은 와파린보다 더 안전하였 . 한국에서 NOAC 의 처방이 급증하고 있는 만큼, 환자의 특성에 맞는 적절한 NOAC 을 가이드라인에 맞는 용량으로 사용하는 것이 중요해 보인다.Atrial fibrillation (AF) is a major risk factor for stroke, and stroke caused by AF is more serious and has a poorer prognosis than cerebral infarction caused by other mechanisms. Therefore, preventing stroke occurrence (primary prevention) and recurrence (secondary prevention) is an important issue in patients with AF. Warfarin has been used as a standard treatment for primary and secondary prevention of these patients for a long time, but warfarin has several problems with long-term use. Recently, non-vitamin oral anticoagulants (NOACs) have been suggested, and through various clinical trials and large-scale observational studies, they have been proven to be safer and non-inferior to warfarin in the primary prevention of stroke in patients with AF. However, not much research has been done on preventing recurrence in patients who have already had a stroke due to AF. In this study, we aim to compare the effectiveness and safety of warfarin and NOAC in secondary prevention of stroke patients due to AF using big data from the National Health Insurance Service (NIHS) in Korea. In addition, through comparison between each NOAC, we would like to find out the current status of NOAC prescriptions in Korea and which NOAC is safer and more effective for Koreans. Among patients registered in the NHIS registry between 2015 and 2019, patients with both ICD-10-CM codes for ischemic stroke and non-valvular atrial fibrillation were analyzed. To ensure reliability of cerebral infarction diagnosis, only patients who had brain magnetic resonance imaging performed immediately or immediately after hospitalization were included, and patients who used warfarin or NOAC for the first time were included. The primary effectiveness outcome was defined as ischemic stroke + systemic embolism, and the primary safety outcome was defined as intracranial hemorrhage + gastrointestinal hemorrhage. Furthermore, ischemic stroke, systemic embolism, major bleeding, and all-cause of death were analyzed as secondary outcome variables. The observation period was defined as until December 2019, and the differences in outcome variables between warfarin users and NOAC users were analyzed based on the cox regression analysis model. A total of 21,064 oral anticoagulant users were analyzed, of which 2,925 (13.9%) were warfarin users and 18,139 (86.1%) were NOAC users. To reduce the difference in variables due to the significant difference in sample size between the two groups, 1:4 propensity score matching was performed. The median observation period was 15.5 months. In multivariate analysis adjusting for time and confounding variables, NOAC users showed a significantly lower risk of ischemic stroke + systemic embolism than warfarin users [adjusted hazard ratio (aHR), 0.86; 95% confidence interval (CI), 0.78-0.95]. NOACs showed safer results than warfarin also in bleeding complications (aHR, 0.78; 95% CI, 0.68-0.89). In a comparative analysis with warfarin according to NOAC dose, standard-dose NOAC showed more effective and safer results than warfarin. However, in the case of low-dose NOAC, there was no statistically significant difference from warfarin in the preventive effectiveness of "ischemic stroke + systemic embolism" or in hemorrhagic complications. In an analysis by type, all four types of NOACs - dabigatran, rivaroxaban, apixaban, and edoxaban - showed better secondary prevention effectiveness than warfarin. In terms of bleeding complications, dabigatran, apixaban, and edoxaban showed safer results than warfarin, and rivaroxaban showed a risk of bleeding complications similar to warfarin. In this nationwide real-world data analysis using the Korean NHIS big data, NOAC was shown to be superior to warfarin in both secondary prevention effectiveness and safety in stroke patients due to nonvalvular AF. All types of NOACs had better secondary prevention effectiveness than warfarin, and dabigatran, apixaban, and edoxaban were safer than warfarin. As the prescription of NOACs is rapidly increasing in Korea, it seems important to use appropriate NOACs suited to the patient's characteristics at a dose that meets the guidelines.Abstract 1 Contents 4 List of tables 5 List of figures 6 Introduction 7 Methods 9 Results 14 Discussion 17 Reference 23 Abstract in Korean 48박

    초기 병변이 없는 일과성 허혈 발작 환자에서 FLAIR 영상의 혈관 고강도 신호가 추적 영상 병변에 미치는 영향

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    학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 의과대학 의학과, 2018. 8. 윤병우.Though lesion negative transient ischemic attack (TIA) patients accounted for considerable amounts in clinical fields, their diagnoses are interrupted with many mimic diseases (e.g., seizure, migraine, hypoglycemia, psychotic disease). To assess more objective diagnosis of true ischemic origin TIA patients, we evaluated the relationship between FLAIR vascular hyperintensity (FVH) and early ischemic lesion recurrence [FU-DWI (+)] in lesion negative transient ischemic attack (TIA) patients. We recruited consecutive lesion negative TIA patients within 24 hours of symptom onset, who underwent follow-up MRI during the acute period. FVH was defined as a focal or serpentine high signal intensity on FLAIR images. Furthermore, to compare clinical outcomes between the FU-DWI (+) and FU-DWI (-) groups, we assessed 1-year recurrent ischemic stroke or TIA. Among 392 lesion negative TIA patients, 82 patients had FU-DWI (+) on the follow-up MRI. In the multivariate analysis, FVH remained an independent predictor of FU-DWI (+) [adjusted OR (aOR) = 4.77, 95% confidence interval (CI) 2.45-9.29, P < 0.001]. The time to initial MRI (aOR = 0.49, 95% CI = 0.33-0.70, P < 0.001) and intracranial atherosclerosis (aOR = 2.07, 95% CI = 1.10-3.92, P = 0.025) were also associated with FU-DWI (+), independent of FVH. In clinical outcomes, the FU-DWI (+) group showed more frequent 1-year recurrent ischemic stroke events than the FU-DWI (-) group (10.7% versus 3.1%, respectively, P = 0.007). FVH is associated with FU-DWI (+) in lesion negative TIA patients. As FU-DWI (+) commonly occurs during the acute period and has a subsequent worse outcome after discharge, additional radiological or clinical markers for it are necessary.Abstract …………………………………………………………1 Contents …………………………………………………………4 List of tables ……………………………………………………5 List of figures ……………………………………………………6 Introduction ……………………………………………………7 Methods ………………………………………………………8 Results …………………………………………………………13 Discussion ……………………………………………………15 Reference ………………………………………………………29 Abstract in Korean ……………………………………………35Maste

    Korean Design Magazine Journalism and the Condition of Design Criticism

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    학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 미술대학 디자인학부(디자인역사문화전공), 2018. 8. 김민수.이 연구는 1976년부터 2005년까지 발간된 디자인 잡지 비평문헌의 전개과 정과 그 특징을 고찰하여 한국 디자인 잡지 저널리즘의 성격을 밝히고, 실천 적 디자인 비평의 조건을 모색하는 데 목적이 있다. 한국의 디자인은 규모와 영향력의 면에서 많은 발전을 이루었지만, 이론과 철학의 면에서는 많은 논 의가 이루어지지 못했다는 평가를 받고 있다. 이러한 철학 빈곤의 현실에 대 한 대안으로 디자인 비평이 언급된 지도 시간이 흘렀지만, 여전히 비평이 부 재한 현실이 존재하는 것이 사실이다. 이러한 상황 인식을 바탕으로 이 연구 는디자인비평형태의하나로디자인잡지에실린비평의내용과형식을살 펴보고 이를 통해 디자인 비평의 실천적 조건을 모색했다. 이를 위해 먼저, II. 장에서는 디자인 저널리즘의 의미를 밝혔고, 이 와 디자인 비평의 관계를 밝혔다. 그리고 이러한 맥락에서 다루어지는 디자 인 잡지의 종류와 그것을 다루는 방법론적 틀을 제안했다. 즉, 디자인 저널리 즘은 각각의 영역에서 개별적으로 수행되는 디자인 활동과 그 생산물에 관 한소식을전하고해석하는행위를통해사회적수용과배제를끌어내는활 동의 총칭이라고 정의했다. 이때, 디자인 활동과 생산물에 대한 해석의 역할 을 디자인 비평이 담당하며, 이는 디자인 저널리즘의 한 축을 이루는 핵심적 역할이라는 점을 확인했다. 디자인 저널리즘과 디자인 비평의 관계를 바탕으로 III. 장에서는 종 합 디자인지인 월간《디자인》의 비평문헌을 분석했다. 창간이후 2005년까 지85편의비평문헌에관한서술을통해그내용과특징을살펴보았다.그결 과 월간《디자인》의 비평문헌은 발간되는 동안의 사회적 사건과 접점을 형 성하며, 여러 층위의 비평문헌을 소통시켰다는 점을 확인했다. 하지만 종합 디자인지라는 매체의 특성으로 인해 관념적인 내용을 주로 다루었으며, 비 평적 판단이 내려지지 않는 경우가 다수 존재했고, 매체 내의 지속성이 부족 했다는 한계를 가지고 있음을 확인했다. IV. 장에서는 종합 디자인지의 비평문헌을 통해 파악한 비평문헌의 한계와 이에 대한 대안적 형태의 하나로 디자인 비평 전문지인 《디자인문화 비평》의 내용과 형식을 살펴보았다. 비평 전문지 비평문헌은 통일된 주제의 식아래서다양한필진의글로구성되어당대디자인현상에대한비평적고 찰이 이루어질 수 있었다는 점을 확인했다. 서로 다른 디자인 잡지의 비평문 헌이가진내용과형식을살펴보는것을통해현장성,비평적실천,그리고지 속성이라는 디자인 비평의 세 가지 실천적 조건을 제안했다. 즉 디자인 비평 은 한 사회의 변화하는 디자인 인식과 함께 디자인이 생산되고 소비되는 다양 한현장을특정한관점에서조명해야하며,여기서발견된가치에대한판단 이 필요하다는 것을 밝혔다. 그리고 이러한 디자인 비평은 급변하는 매체 환 경에 대응하는 지속할 수 있는 형태를 모색해야 한다는 점을 확인했다. 이를 통해 이 연구는 디자인 저널리즘의 의미를 확인하고, 디자인 잡 지에서 역사적으로 소통된 디자인 비평의 구체적 내용과 형태를 확인하는 것을 통해 그 한계와 새로운 가능성을 발견하고자 했다. 수많은 인공물과 함 께살아가는현시대를반추하며동시에견인할수있는비평의제구실을위 해이연구가작은실마리를제공할수있기를기대한다.I.서론 1 I.1.연구의목적과배경 1 I.2.선행연구검토 5 I.2.1.디자인잡지에관한연구 5 I.2.2.디자인비평에관한연구 8 I.3.용어정의 12 I.3.1.디자인잡지 12 I.3.1.비평문헌 13 II.고찰을위한선결과제 15 II.1.이론검토:디자인저널리즘과문화저널리즘 15 II.2.연구대상과비평문헌분석방법 22 II.2.1.연구대상 22 II.2.2.비평문헌분석방법 30 III.종합디자인지비평문헌의전개와특징 38 III.1.월간디자인비평문헌의전개 38 III.1.1.1976년-1985년 38 III.1.2.1986년-1995년 46 III.1.3.1996년-2005년 59 III.2.월간디자인비평문헌의특징 72 III.2.1.형태정보:편수변화와매체내위치 72 III.2.2.필자정보:성별과직업의특성 74 III.2.3.내용정보:대상,가치,해석과평가 76 III.3.소결 85 IV.디자인비평지의의미와디자인비평의조건모색 90 IV.1.비평문헌의한계와디자인비평전문지의출현 90 IV.2.디자인문화비평의내용과의미 94 IV.2.1.디자인문화비평비평문헌의내용 95 IV.2.2.비평전문지비평문헌의의미 111 IV.3.디자인비평의조건 113 IV.3.1.디자인비평의현장성 114 IV.3.2.비평적판단 116 IV.3.3.비평의지속성 118 V.결론 122 참고문헌 127 부록:월간디자인의비평문헌목록 132 Abstract 135Maste

    Chosun Exhibition(1929) and ‘colonial modernity’

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    Quantification of nitric oxide concentration in the hemocytes of Manila clam Crenomytilus grayanus by using 4,5-diaminofluorescein diacetate (DAF-2DA) detection method

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    혈구는 해산연체동물의 면역 반응을 일으키는 중요한 세포로 자극시 oxygen radical과 nitrogen radical 을 분비하여 생체방어에 이용한다. 척추동물의 nitrogen radical의 일종인 일산화질소 (nitric oxide, NO) 는 주로 대식세포의 효소인 nitric oxide synthase (NOS) 에 의해 L-arginine를 이용하여 합성되어 생체내에서 cytokine, bacterial lipopolysaccharide (LPS) 또는 기생충 등과 반응하여 항균작용, 면역조절, 염증유도 등의 역할을 한다. NOS는 isoform인 endothelial NOS (eNOS), inducible NOS (iNOS) 및 neuronal NOS (nNOS) 로 구성되며, eNOS와 nNOS는 세포내에서 극소량으로 존재하나, iNOS에 의해 발생하는 NO는 염증유발 물질에 의해 대량으로 발생 한다. 담치에서의 NO 측정에 관한 연구는 LPS, β-glucans 또는 phorbol-myristate acetate (PMA)에 노출되거나 중금속인 Cd에 노출되었을 때, 기생충 감염시 혈림프에서 NO 농도의 증가가 나타남으로써 병원성 물질의 침입이나 중금속과 같은 외부 침입성 비자기 물질에 대한 반응에 따라 NO 생성의 변화가 측정되고 있다. 이러한 사실은 NO 생성이 생물의 생리학적·병리학적 특성에 따라 민감하게 반응하며, 따라서 NO 량의 변화는 생물의 생리적 특성을 진단하는데 중요한 인자로 판단된다. NO는 반감기가 수초에 불과한 기체로 주로 세포내에 존재하나 일부는 세포외로 유리되어 이산화질소로 산화되거나 아질산염과 질산염으로 분해된다. 아직까지 무척추동물의 NO정량은 세포외로 유리된 NO의 누적량을 측정하는 Griess assay가 주로 이용되어 왔다. 최근 DAF assay는 4,5-Diamino-fluorescein diacetate (DAF-2DA) 가 esterase에 의해 DAsynthase (NOS) 에 의해 L-arginine를 이용하여 합성되어 생체내에서 cytokine, bacterial lipopolysaccharide (LPS) 또는 기생충 등과 반응하여 항균작용, 면역조절, 염증유도 등의 역할을 한다. NOS는 isoform인 endothelial NOS (eNOS), inducible NOS (iNOS) 및 neuronal NOS (nNOS) 로 구성되며, eNOS와 nNOS는 세포내에서 극소량으로 존재하나, iNOS에 의해 발생하는 NO는 염증유발 물질에 의해 대량으로 발생 한다. 담치에서의 NO 측정에 관한 연구는 LPS, β-glucans 또는 phorbol-myristate acetate (PMA)에 노출되거나 중금속인 Cd에 노출되었을 때, 기생충 감염시 혈림프에서 NO 농도의 증가가 나타남으로써 병원성 물질의 침입이나 중금속과 같은 외부 침입성 비자기 물질에 대한 반응에 따라 NO 생성의 변화가 측정되고 있다. 이러한 사실은 NO 생성이 생물의 생리학적·병리학적 특성에 따라 민감하게 반응하며, 따라서 NO 량의 변화는 생물의 생리적 특성을 진단하는데 중요한 인자로 판단된다. NO는 반감기가 수초에 불과한 기체로 주로 세포내에 존재하나 일부는 세포외로 유리되어 이산화질소로 산화되거나 아질산염과 질산염으로 분해된다. 아직까지 무척추동물의 NO정량은 세포외로 유리된 NO의 누적량을 측정하는 Griess assay가 주로 이용되어 왔다. 최근 DAF assay는 4,5-Diamino-fluorescein diacetate (DAF-2DA) 가 esterase에 의해 DAF-2로 변형된 후 세포가 생성하는 NO와 선택적으로 반응하여 Triazolo-fluorescein (DAF-2T) 라는 형광물질이 되는 원리를 이용하여 실시간으로 세포내에 NO에 의해 생성되는 형광량을 화상분석 (image analysis) 이나 형광분광기 (fluorescent spectrophotometer), 또는 유세포 분석기(flow cytometer) 를 정량할 수 있는 기술이 알려지고 있다. 따라서 본 연구에서는 DAF-2DA를 이용하여 담치혈구 세포의 NO생성을 1mM L-arginine과 그 유사체인 1mM Nω-Nitro-L -arginine methyl ester hydrochloride (L-NAME)를 각각 노출시켜 up regulation과 down regulation 되도록 조절한 뒤, 이를 DAF-2DA와 반응 후 현광분석기를 이용하여 측정하였다.L-arginine에 노출 된 혈구세포는 대조구에 비해 높은 NO생성을 나타내었으며, L-NAME에 노출 된 혈구 세포는 대조구에 비해 낮은 NO생성이 나타나는 것으로 측정되었다. 이를 결과를 통해 DAF-2DA와 반응 후 현광분석기를 이용하여 담치의 NO생성량 측정이 가능함을 확인하였다. 이 연구를 통해 얻은 기술은 담치의 NO생성 측정기술은 화상분석이나 형광분광기, 또는 유세포 분석기를 이용하여 실시간으로 NO생성을 측정하는데 유용하게 사용될 수 있을 것이며, 이러한 정보는 담치의 생리학적·병리학적 특성에 관한 연구에 유용한 지표가 될 것으로 사료 된다.2

    Quantification of nitric oxide concentration in the hemocytes of Manila clam Ruditapes philippinarum by using 4,5-diaminofluorescein diacetate (DAF-2) detection method

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    Nitric oxide (NO) is an important intra-intercellular signaling molecule that regulates many physiological processes and participates in the development some pathological conditions in animals. In this study, we compared different methods for determining NO concentration in the hemocytes of Manila clam Ruditapes philippinarum. For measuring the intracellular NO levels, we used the specific fluorescent probe 4,5-diaminofluorescein diacetate (DAF-2 DA), and the quantification methods that were compared were based on image analysis, spectrophotometry, and flow cytometry. NO concentration could be determined using all the 3 methods, and the concentration varied significantly depending upon the presence of NO regulators in the hemocytes; NO concentration increased in the presence of L-arginine, while it decreased in the presence of N-nitro-L-arginine methyl ester. In particular, it is found that estimation of NO using a flowcytometry is more economical, reliable and accurate compared to image analysis and spectrophotometry. Accordingly we believe that determining NO concentration by using flowcytometry will be useful in evaluating physiological and pathological conditions in marine bivalves. 일산화질소 (NO) 는 면역계에서 세포내 외의 신호전달에 관여하는 물질로 생물의 생리적, 병리학적 기작을 조절한다. 본 연구는 바지락 혈구의 NO 농도 측정을 위해 4,5-diaminofluorescein diacetate (DAF-2 DA) 를 이용한 DAF assay의 적용이 가능한지 확인하고자 화상분석법, 형광흡광도 측정법 및 유세포분석 기법 등을 이용하였다. 연구결과 인위적인 바지락 혈구의 NO 생성을 위해 L-arginine을 첨가한 경우 대조구에 비하여 NO 생성이 유의적으로 증가하였고, 반대로 NO 저해제인 L-NAME를 첨가한 경우 NO 생성은 급격히 감소하였다. 이러한 결과는 본 조사에 이용된 화상분석법, 형광흡광도 측정법 및 유세포분석 기법 등 모든 조사 방법에서 동일하게 확인되었다. 특히 3가지 측정 방법 중 유세포 분석법은 측정의 신속성, 신뢰성 및 정확성을 담보할 수 있는 유용한 방법으로 판단된다. 따라서 유세포 분석기를 이용한 NO 측정은 향후 바지락의 생리적 병리적 특성을 확인하는데 유용한 마커로써 이용될 수 있을 것으로 기대된다.22Nkc

    Images that Accompany Human -A Study on the Mobility of Digital Cinema-

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    Evolution of TypeII Antifreeze Protein: its origin and positive selection mechanism

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    The type II AFPs consist of two subtypes, Calcium-dependent and Calcium-independent AFP. It is unclear whether they have a single or multiple origins. In this study, we made an attempt to investigate the phylogenetic relationships of the type II AFPs with sequence data, using MrBayes and PAML. The results show that the type II AFP are monophylogenetic, and that they have evolved through the positive selection mechanism. The positively selected sites are located not only the region homologous with CaBS (Ca2+-binding site)) in C-type lectin(the upper half), but also the lower half of the AFP molecule. These results suggest that the lower half be involved in ice-binding, supporting the hyphothesis based on quantum mechanics (Cheng Y. et. al., 2002), and site directed mutation (Loewen MC. et. al., 1998).1
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