基于GC-MS的植物代谢组学研究

代谢组学是系统生物学的重要组成部分。在众多代谢组学分析技术中,气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术较为成熟,分辨率高、灵敏度高、重现性好,拥有大量标准质谱图数据库且成本相对低廉,很早就应用到植物代谢组学研究领域,迄今仍然是主要分析平台之一。现从GC-MS技术的核心原理、衍生化方法以及数据采集、分析和数据库等方面介绍了GC-MS植物代谢组学分析技术。同时,综述了该技术在基因功能研究、植物代谢遗传机理、植物抗逆、生物技术和生物育种中的应用

植物代谢组学数据分析和数据库

植物代谢组学是近年发展起来的进行植物生物学研究的新兴学科,目前的难点和热点是数据分析和信息挖掘。现针对植物代谢组学数据分析和信息挖掘过程中涉及的几个主要方面进行了概述,内容包括数据特点、分析流程、软件和数据库。系统地介绍了植物代谢组数据分析预处理、常用统计分析原理和适用条件、数据分析中的注意事项、常用软件和数据库的优缺点,最后探讨了植物代谢组数据分析的问题和新发展动态

用气相色谱-质谱联用比较牛耳草代谢物的提取方法

通过比较不同的提取方法对牛耳草新鲜和脱水叶片中代谢物的提取效率,旨在建立一种可以有效鉴定并分析牛耳草脱水过程中关键小分子代谢物的种类和含量变化的方法,为研究植物耐脱水分子机制提供技术方法。本研究以气相色谱-质谱联用(GC-MS)为分析方法,对复苏植物牛耳草代谢物提取方法进行比较。从提取总色谱峰数目、提取效率、代谢物保留时间和提取效率稳定性等方面比较甲醇溶液(A法)和甲醇-氯仿-水溶液(B法)两种提取方法的提取效果。对牛耳草新鲜样品提取结果表明,B法提取的总色谱峰数目多于A法;对9种共有代谢物的提取效率比较结果表明,B法的提取效率高于A法;对10种色谱峰的保留时间和提取效率的方法学考察结果表明,两者保留时间RSD(相对标准偏差)值均小于1%,A法提取效率的RSD值≤10%的比例为50%,B法的为100%。A法对干样的提取色谱峰数目远少于鲜样,而B法对干样的提取色谱峰数目和鲜样没有显著差异,保留时间RSD值均小于1%,提取效率的RSD值与鲜样没有差异,稳定性良好

药用植物代谢组学研究

代谢组学是全局性研究小分子代谢物的一门科学,是系统生物学的重要组成部分,广泛应用于中医药复杂体系。代谢物是药用植物代谢合成的产物,是中药发挥疗效的物质基础。随着本草基因组计划的实施和中药合成生物学的发展,药用植物代谢组学研究将会迎来蓬勃发展。该文介绍代谢组学技术近几年的研究进展,以及药用植物代谢组学研究的主要内容,包括药用植物鉴别和质量评价,品种选育和抗逆研究,代谢途径解析,代谢网络、代谢工程研究及合成生物学研究。通过整合本草基因组,转录组和代谢组学等研究,最终为药用植物品种选育、创新药物研发和质量安全性评价奠定基础

基于超高压液相色谱－四极杆串联飞行时间质谱技术的烟草代谢组学分析方法

对影响烟草代谢物提取的4个关键因素(溶剂、提取方式、提取时间、提取温度)在3个水平上进行了正交设计,确立了最佳提取方法;对色谱和质谱部分的实验条件进行优化,建立了基于超高压液相色谱-四级杆串联飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOF/MS)平台的烟草代谢组学分析方法。方法可检测到2445个色谱峰,提取及分析的重现性较好

基于超高压液相色谱-四极杆串联飞行时间质谱技术的烟草代谢组学分析方法

对影响烟草代谢物提取的4个关键因素(溶剂、提取方式、提取时间、提取温度)在3个水平上进行了正交设计,确立了最佳提取方法;对色谱和质谱部分的实验条件进行优化,建立了基于超高压液相色谱-四级杆串联飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOF/MS)平台的烟草代谢组学分析方法。方法可检测到2445个色谱峰,提取及分析的重现性较好

新中国成立70年来我国植物代谢领域的重要进展

代谢物在维持植物正常生长发育和抵御各种逆境胁迫中都发挥着重要作用.新中国成立70年来,我国科学家在基础代谢、青蒿素等植物活性天然产物的挖掘、植物代谢途径的解析及其生物学功能、植物活性成分的代谢工程及生物合成、代谢网络及其功能等植物代谢领域取得了一系列创新性研究成果,促进了我国植物代谢领域的迅速发展,提升了我国植物代谢研究的国际影响力,为取得更多突破性的研究成果奠定了基础