Effect of essential oil against bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi in in vitro conditions

Bu çalışmada bitki uçucu yağlarının farklı uygulama, doz ve sürelerde Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi'ye karşı antibakteriyel etkileri araştırılmıştır. Diske uygulama ve süspansiyona karıştırma yöntemleri uygulandığında kekik (Thymus vulgaris), bergamot (Citrus bergamia), sarımsak (Allium sativum), karabaş, (Lavandula stoechas), karanfil (Caryophyllus aromaticum) ve okaliptüs (Eycalyptus globus) uçucu yağları diğerlerine göre daha etkili olurken, besi yerine uçucu yağların eklenmesi uygulaması etkisiz bulunmuştur. Uçucu yağ dozu arttırıldıkça antibakteriyel etkinin de arttığı tespit edilmiştir. Farklı sürelerde uygulanan uçucu yağların tamamında 24 saat sonra yapılan ekimlerde bakteri popülasyonunda değişiklik olmazken, 0, 1, 3 ve 6 saat sonra yapılan ekimlerde bakteri popülasyonunda önemli derecede azalma gözlenmiştir. Bütün uygulamalar sonucunda, besi yerinde Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi'ye kekik uçucu yağının antibakteriyel etkisinin en yüksek oranda olduğu saptanmıştır. Kekik uçucu yağı yanında bergamot, karabaş ve okaliptüs uçucu yağları da patojene etkili olmuşturThe antibacterial effect of essential oils of thyme (Thymus vulgaris), bergamot (Citrus bergamia), garlic (Allium sativum), french lavender (Lavandula stoechas) clove (Caryophyllus aromaticum), eucalyptus (Eycalyptus globus) against Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi were investigated. When essential oils were applied by dropping on absorbent paper disks and mixing with bacterial suspension thyme, bergamot, garlic, french lavender, clove, eucalyptus essential oils have been found effective more than others. It is detected that as the dose of essential oils increased, the antibacterial effect increased. Bacterial population did not change after 24 h growth in different treatment of essential oils at different times, but relative decrease in bacterial population at 0, 1, 3, and 6 h growing were observed. Especially, thyme essential oil showed the highest antibacterial effect, in all of the applications in different doses. Thyme was the most effective essential oil. Bergamot, lavender and eucalyptus essential oils followed the thyme essential oil, respectively

Prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in Tekirdag

2nd International Workshop on Bacterial Diseases of Stone Fruits and Nuts -- APR 21-24, 2015 -- Izmir, TURKEYSweet cherry (Prunus avium L.) is one of the most important fruit trees grown in Tekirdag. Bacterial canker which reduces the yield and quality of sweet cherry fruit and causes death of trees was investigated. For this purpose, a survey study was conducted in 2012-2013, and 129 plant tissue samples were collected from symptomatic trees. As a result of survey studies, bacterial canker was determined in all orchards, and the disease prevalence rate was determined as 17 to 57%. Severity of disease was measured as 20 to 85% in Tekirdag province depending on orchards. Totally, 41 bacterial strains of Pseudomonas syringae were determined by using classical and molecular identification tests, 23 out of 41 yielding. The identity of the 23 strains Pseudomonas syringae pv. morsprunorum and 18 strain Pseudomonas syringae pv. syringae were confirmed by applicans of the expected size 650 bp and 752 bp, respectively.Int Soc Horticultural Sc

Kiraz Dal Yanıklığı Etmenlerinin Tanısı, Fenotipik Ve Genotipik Karakterizasyonu

Kiraz (Prunus avium L.) Tekirdağ’ da yetiştirilen önemli bir meyve türüdür. Kirazda verim ve kaliteyi düşüren, ağaçları kurutan kiraz dal kanseri hastalığı etmen(ler)i bu çalışma ile araştırılmıştır. Tekirdağ ili kiraz bahçelerinde 2012-2013 yıllarında gerçekleştirilen sörvey araştırmaları sonucu 135 hasta bitki örneği belirti gösteren ağaçlardan toplanmıştır. Tekirdağ ilinde sörveylenen bahçelerin tümünde hastalık %20-57 oranında yaygın olduğu, hasta ağaçların %20-85 oranında hastalık şiddetine sahip olduğu tespit edilmiştir. Laboratuarda yapılan izolasyon çalışmalarsonucu bu örneklerden 60 adet Pseudomonas syringae izolatı elde edilmiştir. Yapılan LOPAT testleri sonucunda izolatlar oksidaz, pektolitik aktivite, arginine dehidrolaz negatif, tütünde aşırı duyarlılık ve levan pozitif olarak değerlendirilmiştir. Ayrıca izolatların GATTa özellikleri ise 29 adet izolat (+,+,-,-) özellik gösterirken, 20 adet izolat ise (-,-,+,+) özellik göstermiştir. Tesadüfen seçilen izolat %62-90 oranında benzerlik göstermiştir. Yapılan fenotipik karakterizasyonda izolatlar 2 farklı kümede toplanmaktadır. Moleküler testlerde kullanılan spesifik primerler ile 29 adet izolat 650 bp tekrarlanabilir bant oluşturarak Pseudomonas syringae pv. morsprunorum ve 20 adet izolat 752 bp tekrarlanabilir bant oluşturması nedeniyle Pseudomonas syringae pv. syringae olarak tanılanmıştır. Genotipik olarak izolatlar birbirinden farklı iki kümeye ayrılmıştırSweet cherry (Prunus avium L.) is one of the most important fruit trees grown in Tekirdağ. Causal disease agent(s) of bacterial canker which reduces yield and quality of sweet cherry fruit and cause death of trees were investigated. For this purpose a survey study was conducted in 2012-2013 and 135 infected plant samples were collected from symptomatic trees. As a result of survey studies, bacterial canker was determined in all orchards, while diseases prevalence rate of bacterial canker was determined as 20-57%, severity of disease was measured as 20-85% in surveyed orchards in Tekirdağ Province. As a result of isolation studies, 60 bacterial isolates of Pseudomonas syringae were obtained. Results obtained from LOPAT, oxidase, pectolytic activity and arginine dihydrolase revealed that all isolates were recorded as negative for oxidase, pectolytic activity and arginine dihydrolase, but were positive on tobacco and levan production. Further GATTa characters of tested isolates were found as(+,+,- ,-) for29 isolates, while 20 isolates were recorded as (-,-,+,+). Coincidentally 62-90% of selected isolates showed similarity. All isolates were separated into two clusters based on their phenotypic characterization. By using specific primers, 29 isolates formed 650 bp repeatable band so identified as Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, 20 isolates formed 752 bp repeatable band so identified as Pseudomonas syringae pv. syringae. All isolates were separated into two clusters based on their genotypic characterization

Characterization of causal agents of bacterial canker on sweet cherry trees in Tekirdağ province

Kiraz (Prunus avium L.) Tekirdağ'da yetiştirilen önemli bir meyve türüdür. Kirazda verim ve kaliteyi düşüren, ağaçları kurutan bakteriyel kanser hastalığı etmen(ler)i bu çalışma ile araştırılmıştır. Tekirdağ ili kiraz bahçelerinde 2012-2013 yıllarında gerçekleştirilen sürvey araştırmaları sonucu 150 hasta bitki örneği belirti gösteren ağaçlardan toplanmıştır. Tekirdağ ilinde surveye dahil edilen bahçelerin tümünde hastalığın görüldüğü hastalık oranının %2057, hastalık şiddetinin ise %20-85 oranında olduğu tespit edilmiştir. Laboratuvarda yapılan izolasyon çalışmaları sonucu, bu örneklerden 60 adet Pseudomonas syringae izolatı elde edilmiştir. Yapılan LOPAT testleri sonucunda izolatlar oksidaz, pektolitik aktivite, arginin dehidrolaz negatif, tütünde aşırı duyarlılık ve levan pozitif olarak değerlendirilmiştir. Test edilen izolatların GATTa özellikleri, Pseudomonas syringae pv. syringae olarak tanılanan 32 izolat için (+ +- -) olarak kaydedilirken Pseudomonas syringae pv. morsprunorum olarak tanılanan 28 izolat için (- -+ +) olarak bulunmuştur. Tesadüfen seçilen izolatlar yağ asidi analizlerine göre %62-90 oranında benzerlik göstermiştir. Moleküler testlerde kullanılan spesifik primerler ile 28 adet izolat 650 bp tekrarlanabilir bant oluşturarak P. syringae pv. morsprunorum ve 32 adet izolat 752 bp tekrarlanabilir bant oluşturması nedeniyle P. syringae pv. syringae olarak tanılanmıştırSweet cherry (Prunus avium L.) is one of the most important fruit trees grown in Tekirdağ. Causal disease agent(s) of bacterial canker which reduces yield and quality of sweet cherry fruit and cause death of trees were investigated. For this purpose a survey study was conducted in 2012-2013 and 150 infected plant samples were collected from symptomatic trees. As a result of survey studies, bacterial canker was determined in all orchards, while the prevalence rate of diseases was determined as 20-57% and its severity estimated as 20-85% in surveyed orchards. As a result of isolation studies, 60 bacterial isolates of Pseudomonas syringae were obtained. Results obtained from LOPAT, oxidase, pectolytic activity and arginine dihydrolase revealed that all isolates were recorded as negative for oxidase, pectolytic activity and arginine dihydrolase, but were positive on tobacco and levan production. Further GATTa characters of tested isolates were found as (+ + - -) for 28 isolates identified as Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, while 32 isolates were recorded as (- - + +), identified as Pseudomonas syringae pv. syringae. Coincidentally 62-90% of selected isolates showed similarity according to fatty asit methyl ester analaysis. By using specific primers, 28 isolates formed 650 bp repeatable band so identified as Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, 32 isolates formed 752 bp repeatable band so identified as Pseudomonas syringae pv. syringae

First Report of Bacterial Leaf Spot Caused by Xanthomonas arboricola Infecting Saucer Magnolia in Tennessee

[No Abstract Available

INVESTIGATION OF THE EFFECT OF PGPR ON YIELD AND SOME YIELD COMPONENTS IN WINTER WHEAT (Triticum aestivum L.)

The plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) that live actively in plant roots and rhizosphere and support plant growth has gained widespread importance in agriculture. This study was carried out to obtain and identify the PGPR isolates from wheat soil and determine their ability and capacity on plant growth and yield. So, they were obtained from soil, and they were identified as Bacillus spp. (B. simples and B. pumilus) by biochemical tests and MALDI-TOF MS (Matriks assisted lazer desorption ionization time of flight massspectrometry). After the wheat seeds (Flamura-85) were treated for PGPR, the field experiment was conducted with inoculated and non-inoculated seeds at the area of the Field Crops Department, Tekirdag Namik Kemal University in 2016-2018. The experiment was arranged in a split-plot design with three replicates for each treatment. In the experiment, some parameters such as plant height (PH), spike length (SL), number of grain per spike (NGPS), grain weight per spike (GWPS), and grain yield (GY) were evaluated and compared between treatments. The study has shown that PGPR treatments support plant growth and significantly increase yield between 9.6% and 29.29% Especially, W3 and W4 strains (B. simplex) were showed a significant effect on the GY. According to the results, we can mention that using the PGPR promotes wheat growth and lead to increasing yield in the wheat. The use of PGPR can give promising results for sustainable and eco-friendly agricultural practices

Identification, genotypic characterization of causal agent of cherry bacterial canker in Marmara region and determination of suspectibility against different compound

Pseudomonas syringae' nin neden olduğu kiraz bakteriyel dal yanıklığı hastalığı kiraz ağaçlarında ciddi ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bu çalışmada 2016-2018 yılları arasında Marmara Bölgesi kiraz üretim alanlarından izole edilen 82 adet izolatın klasik, biyokimyasal, moleküler testlerle tanısı, ERIC-, REP-, BOX-PCR ile genetik karakterizasyonu ve Multi Lokus Sekans Analiz (MLSA) ile filogenetik akrabalığı belirlenmiştir. MLSA çalışmalarında 4 farklı housekeeping (gyrB, rpoDs, rpoDp ve gltA) genleri kullanılmıştır. Çalışma sonucunda hastalıklı bitkilerden izole edilen 63 adet izolat klasik, biyokimyasal ve moleküler testlere göre Pseudomonas syringae pv. syringae olarak tanılanmıştır. MLSA çalışmalarına göre elde edilen Pseudomonas syringae pv. syringae izolatları, Pseudomonas syringae pv. atrofaciens ve Pseudomonas avellane ile yakınlık göstermiştir. İzolatların DNA sekans bilgileri NCBI veri tabanına kaydedilmiştir. Çalışmada hastalık etmenine karşı bakır oksiklorür, bakır sülfat, bakır hidroksit, maneb, mancozeb ve bordo bulamacı (kalsiyum hidroksit+bakır sülfatın) in vitro antibakteriyel etkinlikleri belirlenmiştir. Kullanılan tüm preparatların in vitro bakteri popülasyonun gelişimin engellenmesi üzerinde etkili olduğu belirlenmiştir. Arazi çalışmalarında hastalık gelişimin engellenmesi üzerine bakır hidroksit, bakır oksiklorür, bakır sülfat, fosetyl-al ve bakır tuzları + mancozeb etkinliği araştırılmıştır. Çalışma sonucunda bakır hidroksit kontrole göre hastalık şiddetini %85,72 oranında azaltmıştır.Cherry bacterial branch canker disease caused by Pseudomonas syringae causes serious economic losses in cherry trees. In this study, the diagnosis of 82 isolates, isolated from the cherry production areas in Marmara Region between 2016 and 2018 years, were determined by using classical, biochemical, molecular tests. Genetic characterization and phylogenetic relationship among the isolates were determined by using ERIC-, REP-, BOX-PCR and Multilocus Sequence Analysis (MLSA). Four different housekeeping genes (gyrB, rpoDs, rpoDp and gltA) have been used in MLSA studies. As a result of the study, 63 isolates obtained from diseased plants, were identified as Pseudomonas syringae pv. syringae according to classical, biochemical and molecular analyses. According to MLSA studies, Pseudomonas syringae pv. syringae isolates showed affinity with Pseudomonas syringae pv. atrofaciens and Pseudomonas avellane. DNA sequences of representative isolates were recorded in the NCBI database. In the study, antibacterial activities of copper oxychloride, copper sulphate, copper hydroxide, maneb, mancozeb and Bordeaux mixture (calcium hydroxide+copper sulphate) were also determined in vitro conditions. All preparations used have been found to be effective on in vitro inhibition of bacterial population. In the field studies, copper hydroxide, copper oxychloride, copper sulfate, fosetyl-Al and copper salts + mancozeb were used to prevent disease development and occurrence. As a result of the study, copper hydroxide reduced the disease severity by 85,72% compared to control

Effect of essential oil against bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi'ye in in vitro conditions

Bu çalışmada bitki uçucu yağlarının farklı uygulama, doz ve sürelerde Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi’ye karşı antibakteriyel etkisi araştırılmıştır. Disk ve süspansiyona karıştırma yöntemleri uygulandığında kekik (Thymus vulgaris), bergamot (Citrus bergamia), sarımsak (Allium sativum), karabaş, (Lavandula stoechas), karanfil (Caryophyllus aromaticum) ve okaliptüs (Eycalyptus globus) uçucu yağları diğerlerine göre daha etkili olurken, besi yerine uçucu yağların eklenmesi uygulaması etkisiz bulunmuştur. Uçucu yağ dozu arttırıldıkça antibakteriyel etkininde arttığı tespit edilmiştir. Farklı sürelerde uygulanan uçucu yağların tamamında 24 saat sonra yapılan ekimlerde bakteri popülasyonunda değişiklik olmazken, 0, 1, 3 ve 6 saat sonra yapılan ekimlerde bakteri popülasyonunda önemli derecede azalma gözlenmiştir. Bütün uygulamalar sonucunda, besi yerinde Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi’ ye kekik uçucu yağının antibakteriyel etkisinin en yüksek oranda olduğu saptanmıştır.. Kekik uçucu yağı yanında bergamot, karabaş ve okaliptüs uçucu yağlarıda patojene etkili olmuştur.The antibacterial effect of essential oils of thyme (Thymus vulgaris), bergamot (Citrus bergamia), garlic (Allium sativum), fernch lavender (Lavandula stoechas) clove (Caryophyllus aromaticum), eucalytus (Eycalyptus globus) on Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi were investigated. Thyme, bergamot, garlic, fernch lavender, clove, eucalytus essential oils have been found effective more than others. It is detected that as the dose of essential oils increased, the antibacterial effect increased. Bacterial population did not changes after 24 h growth in different treatment of essential oils at different times, but relative decrease in becterial population at 0, 1, 3, and 6 h growing were observed. Especially, thyme essential oil showed the highest antibacterial effect. In all of the applications in different doses. Thyme essential oil the most effective. Bergamot, lavender and eucalyptus essential oils followed the thyme essential oil, respectively

First Report of Stem Canker of Goldenrain Tree Caused by Lasiodiplodia theobromae in Tennessee and the United States

[No Abstract Available

Identification and biocontrol potential of antagonistic bacterial strains against Pseudomonas syringae pv. tomato

Meeting of the Southern-Division-of-the-American-Pytopathological-Society (APS) -- FEB 09-12, 2020 -- Charleston, SC[No Abstract Available]Amer Pytopathol Soc, So Di