Towards high-throughput 3D insect capture for species discovery and diagnostics

Digitisation of natural history collections not only preserves precious information about biological diversity, it also enables us to share, analyse, annotate and compare specimens to gain new insights. High-resolution, full-colour 3D capture of biological specimens yields color and geometry information complementary to other techniques (e.g., 2D capture, electron scanning and micro computed tomography). However 3D colour capture of small specimens is slow for reasons including specimen handling, the narrow depth of field of high magnification optics, and the large number of images required to resolve complex shapes of specimens. In this paper, we outline techniques to accelerate 3D image capture, including using a desktop robotic arm to automate the insect handling process; using a calibrated pan-tilt rig to avoid attaching calibration targets to specimens; using light field cameras to capture images at an extended depth of field in one shot; and using 3D Web and mixed reality tools to facilitate the annotation, distribution and visualisation of 3D digital models.Comment: 2 pages, 1 figure, for BigDig workshop at 2017 eScience conferenc

Tecnologias de imagem usadas na pesquisa entomológica

Anualmente, centenas de animais, entre eles os insetos, são capturados e mortos em prol dos avanços científicos, muitos deles que tem por objetivo a própria conservação da diversidade biológica. Entretanto, nas últimas décadas, com o apoio de muitos grupos de defesa dos animais, muitos cientistas têm pensado em estratégias e alternativas procedimentais que possam minimizar ou acabar com essa perda de vidas em prol dos avanços científicos. Por outro lado, muitos cientistas não acreditam ser a tecnologia capaz de mudar como as coisas já são feitas. Por esse motivo, foram elencadas as tecnologias de captura de imagem que podem substituir as formas mais convencionais de estudos entomológicos, a saber, as que utilizam imagens comuns (como o Reconhecimento de Padrões em Imagens, a os diferentes tipos de Modelagens em 3D e a Fotogrametria), e as que criam imagens em três dimensões (como o Escaneamento a Laser, a Infererometria Holográfica Digital, a Ultrassonografia e a Tomografia Computadorizada). Foi feita uma analise de cada uma, para verificar a aplicabilidade delas em pesquisas científicas e como foram os resultados das pesquisas que já as utilizaram, e que ressalvas a elas podem ser feitas